寶可夢

劇情圖片

在關都地區有一個叫做真新鎮的小鎮，一個叫做小智的男孩正在電視上熬夜觀看一場寶可夢聯盟對戰。小智的媽媽花子，告訴她的兒子到時間去睡覺了，但是小智不願意去睡覺。因為小智很期待他明天可以從大木博士中領取他的第一隻寶可夢。

不幸的是，在晚上的夢境中，小智把他的鬧鐘當成了精靈球扔了出去。由於鬧鐘損壞的緣故，他第二天早上沒能及時起牀，到達大木博士的研究所時已經遲到了。常見的關都最初的夥伴——妙蛙種子、小火龍和傑尼龜都已經被準時到達的訓練家拿走了，其中一個就是他的勁敵小茂，他拿走的正是傑尼龜。大木博士猶豫地給了一隻不聽話的皮卡丘的精靈球給小智，並且送給了他一個包含所有關都地區已知寶可夢的圖鑑和幾個精靈球給小智。

當小智很興奮擁有自己第一隻寶可夢的時候，皮卡丘卻對小智很不滿意。他們兩個剛開始的友誼非常不穩定。皮卡丘對小智極其不信任而且非常頑固，導致小智需要用他媽媽準備的橡皮手套和晾衣繩去綁住它。更糟糕的事情是，皮卡丘討厭在精靈球裏面待着，所以小智必須拽着繩子，讓皮卡丘全程跟隨他。

在小智試圖捕捉一隻小鳥寶可夢波波的時候，他不小心激怒烈雀羣。在他們從烈雀羣的攻擊中逃跑時，他們跳進了一個池塘。然後被當做大魚被在池塘邊釣魚的小霞釣起。小智借了小霞的自行車去逃脱烈雀羣的攻擊，但是他們在狂風暴雨中摔倒了。最後，小智並沒有其他的選擇，他站在受傷的皮卡丘面前去對抗烈雀羣。這無私的行動説服了皮卡丘去幫助小智，皮卡丘跳到了小智的肩膀上，使用電擊配合雷電將烈雀羣全部擊敗。然而，皮卡丘在攻擊烈雀羣的同時也破壞了小霞的自行車。

然後小智和他幾乎昏迷的皮卡丘準備前往常青市的寶可夢中心，小智看到了一隻金色寶可夢在天空中盤旋。小智拿起寶可夢圖鑑想知道它是什麼東西，卻被圖鑑告知是一隻未知的寶可夢。小智和皮卡丘踏上了前往常青市的路途。

劇情圖片

皮卡丘在與烈雀的激戰後，受傷嚴重，小智帶它趕到附近的常青市，路上遭遇了正在追捕兩位嫌犯的君莎小姐，在通過圖鑑證實了自己的身份後，小智與皮卡丘被君莎小姐送往寶可夢中心。當喬伊小姐在處理皮卡丘的傷勢的時候，小智與大木博士通了電話，告訴大木博士他看到奇怪的寶可夢，但大木博士不太相信他。之後在寶可夢中心等待時，小智遇見了跟過來索取自行車被損壞的賠償的小霞。隨後兩位嫌犯突襲寶可夢中心並造成大停電，火箭隊三人組先介紹了他們，然後嘗試偷取寶可夢中心裏所有的寶可夢。喬伊小姐立即開始傳送中心裏的寶可夢到深灰市的寶可夢中心，而小智和小霞嘗試和火箭隊對戰。寶可夢中心的皮卡丘和小智的皮卡丘合力使用電擊，成功擊敗火箭隊但同時也破壞了寶可夢中心。火箭隊決定跟着小智，偷他的皮卡丘。小霞也決定跟着小智，直到小智賠償她的自行車。之後小智一行人決定穿過常青森林前往深灰市。

劇情圖片

小智收服了綠毛蟲，十分開心。綠毛蟲十分喜歡小霞，然而小霞卻説她討厭蟲屬性寶可夢，讓綠毛蟲很傷心。因為小霞傷了綠毛蟲的心，讓小智感到不愉快，所以小智決定不和小霞一起上路。但小霞仍然因為自行車一事而跟著小智。第二天早上，小智看到一隻比比鳥，於是向比比鳥拋精靈球，但比比鳥把精靈球打走。小智嘗試用綠毛蟲對戰但戰敗，小智再用皮卡丘對戰，成功收服比比鳥。這時火箭隊出現，皮卡丘和比比鳥相繼戰敗，綠毛蟲成功擊退火箭隊，並進化成鐵甲蛹。

劇情圖片

小智一行人繼續在常青森林中繼續前行，小智發現了獨角蟲並派出比比鳥將其擊倒，但正要收服獨角蟲時，一個手持劍的少年武士跳了出來要與小智戰鬥，而獨角蟲也趁空逃走。小智派出比比鳥與少年的凱羅斯對戰，但不敵落敗，隨後小智又派出鐵甲蛹上場，它使用變硬強化自己的防禦，使得凱羅斯由於攻擊它而導致大角破碎。於是武士也派出了鐵甲蛹對戰，因為兩隻寶可夢都不會攻擊招式，它們一直使用變硬招式耗了幾個小時。此時一羣大針蜂突然來襲，並抱走了小智的鐵甲蛹，少年於是帶小智一行人到他家避難。第二天早上，小智嘗試去救回鐵甲蛹，但被火箭隊妨礙。火箭隊的出現令一羣鐵殼蛹進化為大針蜂，並開始攻擊小智一行人。小智的鐵甲蛹擋下了大針蜂的攻擊並進化為巴大蝶。巴大蝶用催眠粉成功令大針蜂睡覺，令小智一行人趁機逃走。之後小智一行人告別了武士向深灰道館前進。

劇情圖片

小智和小霞到達了深灰市，他們遇到了一位賣石頭的奇怪大叔，自稱武能。武能帶小智一行人來到寶可夢中心休息。小智通過中心牆上的海報得知要參加寶可夢聯盟就必須獲得八枚徽章，於是他決定向就在本市的深灰道館發起挑戰。深灰道館的道館館主小剛所使用的大巖蛇完全不被皮卡丘的電屬性招式所影響，使得小智很快輸掉了比賽。為了打敗小剛，小智拒絕了小霞把水屬性寶可夢借給他的好意，選擇了在武能的帶領下給皮卡丘做充電訓練，之後固執地帶着皮卡丘再次踏進深灰道館。小剛首先派出小拳石出陣，小智派出比比鳥迎戰，但因飛行屬性對岩石屬性的劣勢而落敗。隨後小智再次派上皮卡丘，經歷了充電特訓的皮卡丘實力已經今非昔比，將小拳石擊倒，但卻仍然不是大巖蛇的對手。危急關頭，由於皮卡丘的電擊造成道館的噴水裝置漏水，皮卡丘趁機全力反擊，打倒了大巖蛇。就在小智命令皮卡丘給大巖蛇最後一擊時，被突然出現的小剛的弟弟妹妹們阻止。於是小智再次放棄了對戰，帶着皮卡丘離開。

小智和皮卡丘走在路上，想起自己連續兩戰都不能取勝，非常沮喪。這時小剛從後面追了上來，坦然地向小智承認自己的戰敗，送給他象徵挑戰道館勝利的灰色徽章。並告知小智自己一直渴望出去旅行，成長為一名世界頂尖的寶可夢培育家。但因道館的事務以及要照顧年幼的弟妹而不能脱身，所以拜託小智代他完成夢想。此時，武能再度出現並露出真容，原來他竟是小剛離家出走多年音訊全無的父親。小剛於是將道館和弟妹們託付給了父親，愉快地與小智一起踏上修行之旅。

劇情圖片

離開深灰市後，小智一行人來到了月見山，在這裏救下了被一羣超音蝠襲擊的深灰科學博物館的研究員李科，李科帶領小智進入月見山山洞去尋找傳説中能加強寶可夢力量的月之石。在洞窟深處，小智等人發現了一隻持有月之石的皮皮。正當小智準備收服皮皮時，李科勸阻了小智，表示希望給他們一個平靜的生活環境。小智等人跟隨皮皮進入一處神秘的洞窟，見到了聚居於此的大量皮皮。與此同時，火箭隊三人組再度出現，並奪走了月之石。小智他們追擊火箭隊，雙方僵持不下時，皮皮們使用了神秘的招式揮指功，爆發出驚人的力量將火箭隊擊飛，同時一部分皮皮藉由月之石的力量進化成為了皮可西。李科被此情境感染，決定留在月見山與皮皮們一起生活，告別了李科和皮皮們之後，小智一行人離開月見山向下一個道館所在地華藍市進發。

劇情圖片

小智一行人來到了華藍市，小霞卻不知為何似乎不願意來此，在勸説小智離開未果後，小霞獨自一人不知跑到哪裏去了。之後小剛也因事與小智暫時分開。小智獨自來到華藍市的道館，並向這裏的館主——華藍美女三姐妹正式發出挑戰。誰知三位館主毫無戰意，原來她們的寶可夢已被之前來到這裏的小茂等三位來自真新鎮的訓練家打傷而無法戰鬥了。華藍三姐妹的大姐櫻花要把藍色徽章送給小智，卻被突然出現的小霞阻止。小霞道出自己的真實身份，原來她就是華藍道館最小的妹妹，為了成為水屬性寶可夢大師而離家旅行。小霞告訴小智，如果想得到藍色徽章就必須先在對戰中打贏她。小智接受了小霞的挑戰，由於皮卡丘不願與小霞為敵，小智派出巴大蝶和比比鳥應戰。第一戰巴大蝶不敵小霞的海星星，但比比鳥隨後打敗寶石海星扳回一局。這時火箭隊突然現身，並開啓了偷來的抽水機，想要強行奪走皮卡丘以及道館的所有寶可夢。皮卡丘使出電擊將火箭隊打得落花流水。雖然小智和小霞的戰鬥未能分出勝負，但由於皮卡丘保護了華藍道館，櫻花還是授予了小智藍色徽章以示謝意。之後小智一行人踏上前往枯葉市道館之路。

劇情圖片

順利得到兩枚徽章後，小智在旅途中又打敗了某路人訓練家的小拉達，獲得了十連勝。訓練家介紹小智去與開設非公認訓練館，並且已連勝九十八場的小明對戰；小明告訴眾人，他的目標是達成一百連勝，然後就展開修行之旅。之後小明使用穿山鼠輕鬆地連續打敗了比比鳥及巴大蝶，從而將連勝場次增加至九十九場。原本十分得意的小智非常不服氣，參觀了小明的訓練館之後，小智認為小明對於寶可夢的訓練過於殘酷，小明反駁只有這樣寶可夢才能變強，並且這麼長時間它們從未抱怨。兩人爭得不可開交，甚至一度大打出手。就在兩人爭執時，乘虛而入的火箭隊忙亂中將穿山鼠當成皮卡丘偷走了。穿山鼠逃回小明訓練館，小明正式向火箭隊發起挑戰，穿山鼠一招就將火箭隊打飛。終於實現一百連勝的小明關閉了訓練館，與小智握手話別，正式踏上修行的旅途。

劇情圖片

在濃霧中尋找柴火的小智一行人意外發現了一羣學生在欺負另一個叫小淳的學生。他們都是寶可夢研究學校的學生，這個學校的學生也都可以不用收集徽章，畢業後即默認直接獲得參加寶可夢聯盟大賽的資格。小智等人對那羣優等生仗勢欺人的行為極為不滿，但是小淳並無怨懟，還説這種訓練是他們為了畢業而變強的必經之路。小智很討厭這種訓練方式，並去找訓練負責人優等驕子講理。誰知優等驕子是個非常漂亮的女孩，讓小智和小剛對她一見鍾情，被激怒的小霞想要和她對戰。結果小霞的寶石海星居然輸給了岩石屬性的隆隆石。優等驕子之後又出言嘲諷小智與他的皮卡丘，憤怒的小智派出皮卡丘挑戰優等驕子的卡拉卡拉。但由於卡拉卡拉為地面屬性的，皮卡丘的電擊完全無效。之後皮卡丘使出了教科書上所沒有的招式，將卡拉卡拉打倒。優等驕子通過這場對戰收起了自己的囂張氣焰和高傲的性格，決定要從頭開始，她與小淳冰釋前嫌，兩人互相鼓勵。

劇情圖片

小智一行人在森林中迷了路，它們突然發現一隻落單的走路草。小智想要收服它，但被小霞搶先，小霞使用寶石海星順利擊倒走路草，正要收服它時，一隻妙蛙種子衝出來救走了走路草。小智看到自己夢寐以求想要得到的妙蛙種子十分興奮，派巴大蝶與它對戰，但卻不是妙蛙種子的對手。因為過河時吊橋突然崩塌，小剛掉進了湍急的河流，和另外兩人走散。在尋找小剛時，小智和小霞又因為踩中了一個機關而被吊在了樹上。幸運的是，小剛救下他們並帶他們來到一個地方，向他們介紹了照顧受傷寶可夢的小翠。原來此處是專供在戰鬥中受傷的寶可夢療養的地方，而剛才遇見的妙蛙種子便是這裏的守衞。小霞為剛才的戰鬥向走路草道歉，妙蛙種子仍排斥這些訓練家，並攻擊了他們。與此同時，發現療養屋的火箭隊準備搶走這裏的寶可夢。小智與妙蛙種子聯手把火箭隊趕跑，妙蛙種子非常開心，也改變了之前對小智一行人的成見。臨別時，小翠請求小智把妙蛙種子也帶走，讓它好好看看外面的世界。妙蛙種子提出必須先決一勝負，要打贏才能帶它走。於是小智派出皮卡丘打敗了妙蛙種子，順利將其收服。

劇情圖片

小智一行人路遇了一隻受傷的小火龍，想要收服它卻沒能成功，皮卡丘和小火龍交談，得知這隻小火龍原來是有主人的，只是它似乎和主人走散了，一直在等待主人回來接它。在附近的寶可夢中心，小智一行人聽説是一位叫大佑的訓練家因為嫌棄小火龍太弱而拋棄了它，小剛十分憤怒，上前就要與大佑大打出手，被喬伊小姐阻止。就在此時，寶可夢中心外面正下着暴雨，十分怕水的小火龍在大雨中會有生命危險，小智一行人冒雨將奄奄一息的小火龍救了回來。經過一整夜的治療，小火龍已經恢復健康，但是第二天早上，小火龍卻不領情，又自行離開了。還不知道被主人拋棄的小火龍仍然在等待着它的主人回來找它。小智一行人落入了火箭隊的陷阱，皮卡丘也被抓住。小智一籌莫展，眼看皮卡丘就要被火箭隊帶走時，小火龍突然出現，將火箭隊打得落花流水，救出了皮卡丘。而這時小火龍原先的訓練家大佑聽説小火龍變得很強，又回來想把小火龍帶走。小火龍此時終於認清了大佑的真面目，對這個之前曾無情拋棄它的訓練家十分失望，拒絕了再跟大佑回去，反而與皮卡丘一起將大佑打跑。隨後小智收服了這隻已經沒有主人的小火龍，一行人繼續向枯葉市進發。

劇情圖片

小智一行人在２４號道路到枯葉市之間的路上落入了一羣淘氣的傑尼龜挖的陷坑。正當小智爬上來要和它們對戰時，傑尼龜們因為君莎小姐的到來而逃走。君莎小姐告知眾人，這些都是被訓練家所拋棄的寶可夢。由於被主人遺棄，它們對人類極度失望，因而組成了傑尼龜軍團四處胡作非為。另一邊，火箭隊在野餐時，傑尼龜軍團出現將火箭隊綁在了樹上並吃掉了他們的食物。為了確保自己的安全，喵喵和傑尼龜們做了個交易。在火箭隊的幫助下，傑尼龜軍團抓住了小智一行人。而皮卡丘由於落入河中，遭到角金魚的攻擊而受傷。小智為了救重傷的皮卡丘，懇求傑尼龜放他前往城鎮去買治傷藥。而喵喵也在等待和武藏和小次郎歸來以完成作戰計劃。傑尼龜最終答應放小智去買藥，但是以小霞的性命作為要挾，威脅小智如果不按時回來的話就殺死小霞。與此同時，武藏和小次郎洗劫了鎮上的雜貨店，結果歷經艱難才到達的小智反而被當做壞人。這時君莎小姐及時出現為小智解了圍，並帶他抄近路回到傑尼龜軍團的藏身地。終於治好了皮卡丘的傷，而小霞也平安無事。隨後火箭隊出現，搶走了皮卡丘並扔下炸彈，造成了巨大的火災。千鈞一髮之際，小智保護了傑尼龜軍團的首領，這讓傑尼龜非常感動，它發動水槍招式擊穿了火箭隊的氣球，救回了皮卡丘。而傑尼龜軍團之後又通力合作，撲滅了火箭隊造成的大火，由於傑尼龜軍團在滅火上作出了重大貢獻，它們得到君莎小姐的通報表揚，並且任命它們為這一地區的消防隊。小智一行人離開時，傑尼龜軍團的首領悄悄地在後面跟着他們。小智發現了它，並邀請它加入自己的隊伍，於是傑尼龜也成為了小智的寶可夢中的一員。

劇情圖片

小智一行人從森林來到了海邊，期間小霞出言諷刺了小智，稱他想參加寶可夢聯盟大賽實力還遠遠不足，小智於是下定決心要憑藉自己的力量去收服一隻寶可夢。小智一個人來到沙灘上，以樹枝為誘餌，成功地捕獲了一隻大鉗蟹。就在小智自鳴得意時，裝有大鉗蟹的精靈球突然憑空消失。隨後趕來的小剛告訴小智，一個訓練家身上最多隻能同時攜帶6只寶可夢，超過這個數量的都會被自動傳送走。而小智新收服的大鉗蟹如無意外應該是被傳送到了交給他寶可夢圖鑑的人，即大木博士那裏。小智放心不下，想找一個地方跟大木博士聯絡。

之後小智一行人進入了海邊不遠處佇立着的一座發出光芒的巨大燈塔。進入燈塔後，小智給大木博士打了電話。大木博士告訴他們這座燈塔的主人正輝是一位優秀的寶可夢研究家，隨後正輝現身，告訴他們他是在這裏等候着一隻獨一無二，尚無人知的幻之寶可夢的出現。見面後不久，海中的薄霧中隱約顯現出一個極其巨大的身影。就在身影漸漸清晰之時，火箭隊的干擾擾亂了這個身影。最終這隻寶可夢打飛了火箭隊，轉身獨自離去，而它的真面目始終沒有現出。次日早晨，小智一行人告別正輝繼續前往枯葉市，而正輝仍然繼續在燈塔守候着與幻之寶可夢的重逢。

劇情圖片

在經歷了漫長的旅途之後，小智一行人終於抵達了枯葉市，在寶可夢中心短暫休息後，小智和皮卡丘決定前去挑戰道館。但在館主馬志士的寶可夢：皮卡丘的進化形——雷丘的強大攻勢下，皮卡丘被打至重傷，且毫無還手之力。回到寶可夢中心後，護士喬伊提供給小智了一塊雷之石，一旦使用雷之石，皮卡丘便可以進化為雷丘，從而有更大的機會擊敗對手，然而一旦進化，雷丘就再也不能恢復為皮卡丘了。小智左右為難，最後他把雷之石放在皮卡丘面前讓它自行選擇。皮卡丘毅然打掉了雷之石，表示自己絕不進化，要憑藉自己的力量去打敗雷丘。皮卡丘的雄心甚至感動了之前一直跟小智作對的火箭隊，他們專程化妝為皮卡丘加油鼓勁。

小智和皮卡丘再度來到枯葉市道館挑戰，面對雷丘兇狠的攻擊，皮卡丘仍然沒有太多辦法。但它巧妙地利用雷丘因為過早進化，沒有學到高速移動這一弱點，以自身的高速度抓住了勝機。最終雷丘發動了十萬伏特，卻被皮卡丘巧妙地利用尾巴當導線，將電流全部導入大地而絲毫沒有受傷，雷丘自己的能量反而在這一波攻擊後被耗盡了。皮卡丘趁機全力反擊，打倒了雷丘，小智也終於順利獲得橙色徽章。

劇情圖片

小智一行人來到港口，這裏停泊着一艘豪華的郵輪聖特安努號，小智們非常向往登上這艘船，但卻沒有錢買船票。正在眾人沮喪之際，武藏和小次郎化妝成派對女郎送給他們參加船上舉行的寶可夢訓練家派對的招待券，他們不知這是火箭隊的陰謀，便興高采烈地上了船了。

船上的派對熱鬧非凡，小智使用巴大蝶與一位紳士的拉達決鬥，並獲得了勝利。紳士對小智的巴大蝶表示欣賞，想要用拉達來交換，小智一時沒有主意，便稀裏糊塗地答應了紳士的交換請求。而此時小次郎在市場上被一位魚市的老闆欺騙，花大價錢買了一條除了躍起以外什麼本事都沒有的鯉魚王。當派對進行到高潮時，大羣火箭隊隊員出現，要奪走場上的所有寶可夢。在小智的感召下，在場所有訓練家們團結一致，派出大羣寶可夢齊心協力將火箭隊打垮。小智想要派巴大蝶出戰，結果從精靈球內跳出來的卻是拉達，他這才醒悟到自己已將巴大蝶交換出去了。回憶起過去和巴大蝶在一起的日子，小智十分難過，也意識到巴大蝶作為自己收服的第一隻寶可夢，對他的不可替代的意義。於是他找到了之前那位紳士，用拉達再次交換回了巴大蝶。

就在這時，由於遇到強烈的風暴，聖特安努號面臨沉沒的危險。船長帶着乘客們乘坐救生艇緊急逃生。但小智一行人和火箭隊卻昏倒在船艙內不省人事。未能及時逃出的他們隨聖特安努號一起沉入海底。

劇情圖片

小智等眾訓練家在聖特安努號上誤落入火箭隊設下的圈套，在訓練家們共同粉碎了火箭隊的陰謀後，一場可怕的風暴襲來將遊輪破壞。所有人必須儘快逃離聖特安努號。但小智一行人和火箭隊三人組未能及時逃出，被困在船艙內部。由於他們的下落不明，人們誤以為他們已經遇難，君莎小姐帶領眾人為他們舉行了悼念儀式。

為了逃生，滯留在聖特安努號的小智一行人和火箭隊被迫暫時握手言和，協力合作，開始逃生大作戰。小霞利用自己曾組裝過聖特安努號模型、熟知這艘船內部結構的優勢，為大家規劃了一條逃生線路。眾人向上走到船艙的最底部，由小火龍在船底開了一個洞，之後小智一行人利用傑尼龜、海星星等水屬性寶可夢成功逃出。而火箭隊則被鯉魚王拖行着漂浮到了海面上，後被小智派出的比比鳥救起。

第二天，眾人飢腸轆轆，飢餓的喵喵忍不住要吃鯉魚王，結果反而被崩碎了所有牙齒，原來鯉魚王全身上下只有鱗片和骨頭，完全沒有可以食用的部分。氣急敗壞的小次郎一腳把鯉魚王踹進了海里，宣佈再也不要它了。結果就在這一瞬間，鯉魚王進化成為暴鯉龍，並且發動必殺技龍之怒向眾人進行了報復。小智一行人和火箭隊被一起吸進了龍捲風。

劇情圖片

在遭到暴鯉龍的必殺技“龍之怒”的攻擊後，小智一行人和火箭隊飛到了一座無名小島上，小智醒來後才發現自己的精靈球只剩下兩個，皮卡丘、妙蛙種子、傑尼龜、小火龍這四隻寶可夢不知去向，而火箭隊三人組也發現遺失了喵喵、瓦斯彈和阿柏蛇。這座島的另一個地方，與小智走散的皮卡丘發現了小智的精靈球，於是它將小火龍、傑尼龜和妙蛙種子放出，大家聚在一起商量對策。

這時，火箭隊的喵喵也發現了小智的寶可夢，於是它命令阿柏蛇和瓦斯彈上前攻擊。可是阿柏蛇和瓦斯彈拒絕聽從喵喵的指揮，稱它們只服從自己主人的命令。無奈的喵喵只能選擇暫時與皮卡丘等合作，它們一度懷疑自己已被主人拋棄，非常傷心。

在島上，小智一行人、火箭隊以及寶可夢們時常遇到大羣體型巨大的寶可夢們的攻擊，在奔逃的途中，小智們與寶可夢相遇，火箭隊也順利收回他們的寶可夢，而巨型寶可夢則在混亂中被撞毀。原來此地是坂木開闢的一個遊樂園，裏面的巨型寶可夢都是機器人。之後小智一行人終於到達了海濱度假勝地藍普爾其。

劇情圖片

在逃離了寶可夢園之後，小智一行人來到了海邊的度假勝地藍普爾其。小智等人未經允許擅自開著一輛遊艇兜風，卻意外撞毀了它。遊艇的主人柳爺爺十分憤怒，原來這艘遊艇是他買來周遊世界用的，為了賠償損失，小智一行人和他們的寶可夢暫時為遊柳爺爺打工，與鄰近另一家餐廳的主人金婆婆展開競爭。為了幫助柳爺爺實現自己的夢想，小智又在來此旅行的大木博士的建議下舉辦了海邊美女與化妝寶可夢選美大賽，小霞、小茂的女友們以及火箭隊都參加了比賽，最終花子獲得了冠軍。火箭隊受到金婆婆的指使來破壞，卻被自己的中古飛彈打飛，金婆婆也一起被打飛了。柳爺爺駕駛着遊艇展開自己的旅程，小智與母親和大木博士告別後也繼續着自己的修行之旅。

劇情圖片

小智一行人為了搭乘通信船回本土大陸而來到遊町碼頭，卻沒能趕上輪船，沮喪之際，遇見一隻受傷的墨海馬，它似乎拼命地想向眾人傳達什麼信息，於是小霞便將它救起。這時輪船突然沉沒。小智等人將落水人員救起，得知他們是遊町碼頭金婆婆的手下。金婆婆要將珊瑚礁改建成一座豪華度假酒店，但是珊瑚礁是瑪瑙水母的居住地，這次施工嚴重破壞了水母們的生存空間，因此大羣瑪瑙水母對人類進行了報復。金婆婆為了趕走長期騷擾工程的瑪瑙水母，出資聘請能人，火箭隊三人組也聞風而來。但在火箭隊的行動之下，其中一隻瑪瑙水母被三杯醋砸中受到刺激，進化為十分巨大的毒刺水母，小智等人派出了自己的寶可夢與水母們對戰，但均不是毒刺水母的對手。毒刺水母控制了喵喵的身體，借喵喵之口向人類傳達了它們的不滿。皮卡丘乘着比比鳥穿越瑪瑙水母們的封鎖來到毒刺水母面前與它交流，但勸説無效，反而激怒了毒刺水母。就在毒刺水母要使出殺招之前，小霞不顧安危跑到了房頂上，懇求毒刺水母帶領大家回到海里，並保證人類已經吸取了教訓，今後會與它們和平共處。在小霞的勸説下，毒刺水母最終離開。而小霞也收服了墨海馬。

劇情圖片

以金黃市為目標的小智一行人乘船抵達港口的一個小鎮——少女峽，這裏正在舉辦夏日的廟會。小智三人決定在廟會好好放鬆，而火箭隊也在廟會撿路人遺失的錢。這時海邊突然出現一位謎之美女的身影，小剛和小次郎對她立刻一見鍾情。但不知為何，這個美女很快就又消失了。眾人在廟會上遇見一個自稱是占卜師的老婆婆，老婆婆警告小剛和小次郎近期不能接近美貌女子，否則會招致災難降臨，一度引發小霞和武藏的強烈不滿。

廟會上，鎮長向眾人展示了一幅只在夏日廟會展出的畫作，小剛和小次郎見到後十分吃驚，因為這幅畫上的少女與他們在碼頭所見到的一模一樣，鎮長稱此畫畫的是兩千多年前的一位等待征夫歸來的少女，而由於她一直沒有等到心上人的歸來，最後變成了一尊石像，而此石像至今仍佇立在海邊。小剛被這個傳説吸引，於是獨自一人跑去了海邊，直到夜深仍未歸來。小智想要去找小剛，卻因寶可夢中心的門禁而被喬伊阻攔。而火箭隊的小次郎也被疑似謎之少女的幽靈勾引走。

次日，小智和小霞四處尋找失蹤的小剛；另一邊武藏和喵喵也在尋找去向不明的小次郎。雙方相遇後，小剛和小次郎突然一起從房門中摔出，並且意識不清。皮卡丘用電擊使兩人恢復了正常，這時占卜的老婆婆再度出現，稱小剛和小次郎都已被少女幽靈附體，而自己有一種符咒可以與之對抗。無奈之下，小智等人花錢買下大量符咒貼滿了整座房子，但到了晚上，少女幽靈還是出現了，並強行帶走了小剛和小次郎。追逐中，武藏用火箭彈攻擊了少女幽靈卻完全不起作用。而小智則用寶可夢圖鑑調查出這個幽靈和之前的占卜師都是鬼斯所假扮的。之後小智用皮卡丘、小火龍、傑尼龜和妙蛙種子，火箭隊派出喵喵、阿柏蛇和瓦斯彈與鬼斯對抗，但在鬼斯的變身術之下均敗下陣來。逼得小霞甚至想用大蒜和十字架來對付鬼斯。混亂之中，天漸漸亮了，鬼斯聲稱由於幽靈寶可夢無法在白天活動，於是只能被迫消失。小智一行人和火箭隊把這些事拋之腦後，愉快地參加了廟會的慶典活動。

劇情圖片

在去金黃市的路途中，小智一行人來到了海邊的峭壁。他們看見了滿天的巴大蝶，原來此時正值巴大蝶的產卵季節，訓練家們都把巴大蝶放出來讓它們找尋伴侶，然後飛過海洋去產卵。小智於是也放出了自己的巴大蝶。小智的巴大蝶相中了一隻粉色的巴大蝶，向它表演舞蹈求愛，但卻遭到了冷酷拒絕。小智三人盡力鼓勵巴大蝶振作起來，還把它精心打扮了一番，但那隻粉色的巴大蝶對小智的巴大蝶仍然愛理不理。這時，火箭隊來襲並大量捕捉巴大蝶，粉色的巴大蝶也一起落入網中。為了拯救大家並博得粉色巴大蝶的芳心，小智的巴大蝶挺身而出與火箭隊交戰。它先是撞破了網子救出了被俘獲的巴大蝶，接着又與皮卡丘聯手，將火箭隊的直升機擊毀。巴大蝶的英勇終於幫它贏得了粉色巴大蝶的芳心，後者接受了它的求愛。巴大蝶告別了小智，將飛越大洋產卵。

劇情圖片

小智一行人為了挑戰第四間道館而來到了金黃市，途中武藏和小次郎化裝成了熱舞女郎，將皮卡丘搶走，並把小智等三人監禁了起來。就在眾人一籌莫展之際，一個神秘的小女孩突然出現，用超能力打敗了火箭隊並將小智一行人和皮卡丘救出，小智想向她表示感謝，女孩卻像謎一般地突然消失。

當小智來到道館後發現，原來這個女孩竟然就是金黃道館館主——娜姿的娃娃。小智用皮卡丘挑戰娜姿，娜姿派上的凱西在戰鬥中進化成為勇基拉，它會使用強大的超能力，皮卡丘完全不是對手。小智他們被娜姿用超能力變成了玩具大小並被傳送至娜姿房間的玩具箱中作為懲罰。這時一位神秘男子突然出現，使用超能力將他們救走。神秘男子告訴小智，要打敗娜姿就必須去紫苑鎮的寶可夢塔收服幽靈寶可夢，才能於勇基拉對抗。於是小智決心前往紫苑鎮。

劇情圖片

為了迎戰娜姿的超能力屬性寶可夢，小智決定去紫苑鎮的寶可夢塔收服幽靈寶可夢。但是寶可夢塔裏處處透着恐怖詭異的氣氛，進入的小智一行人被各種不可思議的靈異事件捉弄，來到塔內的餐廳，發現這裏的餐具都會攻擊他們，而跟蹤而來的火箭隊三人組也吃盡了苦頭。從塔裏逃出後，小智重整旗鼓決定再度進入，小霞和小剛卻説什麼也不敢進去了。於是小智只能自己帶着皮卡丘和小火龍再次進入塔裏。

在塔中，小智遇到了幽靈寶可夢的鬼斯、鬼斯通和耿鬼，原來它們特別喜歡逗人發笑，於是組成一個搞笑小分隊，試圖通過各種誇張滑稽的表演來讓人發笑。小智表示這種低級的搞笑水準他完全笑不出來，對它們打擊很大。當小智想抓住它們的時候，卻被吊燈給砸昏，鬼斯通讓他和皮卡丘靈魂出竅。

幽靈們帶着小智和皮卡丘從塔外帶到它們的遊樂場，小智理解了它們的用意並不是故意想嚇唬別人，而只是在塔裏很寂寞想找個玩伴而已。皮卡丘很快就和幽靈寶可夢們玩到了一起，而小智則表示他還有更重要的事要完成，所以不能留在這裏陪它們。幽靈們很傷心，但還是放小智和皮卡丘離開。小智經此事後決定放棄捕捉幽靈寶可夢，而似乎跟小智玩得很開心的鬼斯通跟着他跑了出來。於是小智決定帶鬼斯通去挑戰娜姿。

劇情圖片

小智帶着新加入的幽靈寶可夢鬼斯通回到了金黃道館，準備再度向娜姿發起挑戰。正當小智和娜姿的比賽開始時，鬼斯通卻突然消失的無影無蹤。小智不得已想另派一隻寶可夢暫時上場，但其他寶可夢都不敢應戰。小智只能拼命想要逃離道館，而小霞和小剛卻因未能及時而逃出，被氣急敗壞的娜姿用超能力變成了娃娃。就在娜姿打算把小智和皮卡丘他們也變成娃娃之際，之前的神秘男子再度出現，用瞬間移動帶着小智逃離道館。

神秘男子告訴了小智有關娜姿的過去，原來他就是娜姿的爸爸。娜姿自幼沉溺於超能力的世界裏，並因此變得冷酷無情，甚至與自己的父母反目，而那個曾搭救小智一行人的小女孩便是娜姿的另一重人格。小智希望救出被變成玩偶的小霞和小剛，被告知必須得打倒娜姿才行。小智找到了正在捉弄火箭隊三人組的鬼斯通，為了救出夥伴，小智懇求鬼斯通幫他的忙。然而鬼斯通似乎不置可否。

小智鼓起勇氣第三次挑戰娜姿，但鬼斯通在緊要關頭卻又不見蹤影。就在小智快要絕望時，皮卡丘挺身而出接下了這一戰，但由於勇基拉會使用自我復原，皮卡丘的電擊起不到多大效果。這時鬼斯通突然出現，向娜姿扮鬼臉，又點燃一個炸彈大鬧了一場。娜姿被鬼斯通逗得開懷大笑，而與娜姿有着心電感應的勇基拉也因倒地捧腹大笑而無法戰鬥了，小智因此獲得了這場比賽的勝利。之前被變成玩具的小霞、小剛以及娜姿的媽媽都恢復了正常，小智也獲得了金色徽章，而鬼斯通則留在金黃道館陪伴娜姿。

劇情圖片

小智一行人正在野外用餐時，一隻野生的猴怪來找食物。剛剛得知小茂等人已獲得5枚徽章的優異成果的小智急於收服猴怪，卻反倒激怒了它，不僅自己遭到攻擊，寄出多張明信片才抽中的獎品帽子也被奪走。為了搶回帽子，小智一行人與猴怪展開了追逐戰。這時火箭隊三人組突然橫插一槓，激怒了猴怪使其暴走進化為火暴猴。面對憤怒的火暴猴不依不饒的攻勢，小智也燃起了旺盛的鬥志，下決心一定要收服它。小智先後派出皮卡丘、傑尼龜、妙蛙種子，但在強勢的火暴猴面前均敗下陣來。最終小火龍使出了招式“憤怒”，終於擊倒了火暴猴，小智搶回自己的帽子的同時，也順利地收服了火暴猴。

劇情圖片

小智一行人來到玉虹市，小霞和小剛被一家香水店所吸引，想要去購買香水。小智對此很不滿，説香水是沒有意義的，自己不需要那種東西。因此而激怒了香水店的店長莉佳，並被趕了出去。小智隨後一個人趕往玉虹道館挑戰，結果卻因為曾經説了香水的壞話而被拒絕入場。另一方面，想要竊取珍貴的香水而潛入道館的火箭隊三人組也被發現，並被當做小偷逐出。為了進入玉虹道館並贏得徽章，小智在火箭隊的引誘下與他們合作。火箭隊把小智打扮成女孩子混入道館，結果卻被皮卡丘認了出來。而道館館主正是之前那家香水店的店長莉佳，小智向她發起了挑戰。

莉佳接受了小智的挑戰，並先後派出蔓藤怪、口呆花迎戰，與小智的妙蛙種子和小火龍互有勝負。但莉佳壓軸派出臭臭花，小智的寶可夢無人能夠抵擋濃重的惡臭味。就在小智無計可施之時，火箭隊出現盜走了道館生產的香水，並扔下炸彈引發火災。小智幫忙撲滅了大火，並奮不顧身衝入道館將被困在火海中的臭臭花救出，莉佳十分感激，將彩虹徽章交給小智。

劇情圖片

小智一行人來到了唷唷唷喔區，遇到了一位把小智錯認為自己兒子的母親，並從她和君莎口中知道了最近連續發生兒童走失的事件，小智決定幫助她們找回失蹤的孩子們。而寶可夢中心的喬伊小姐也告訴他們，近期中心的寶可夢們也都變得無精打采、萎靡不振。君莎小姐用探測儀查出寶可夢們是受到了一種強大的睡眠波的干擾，眾人追蹤睡眠波至樓頂，在那裏意外地發現了一個“寶可夢愛好者俱樂部”，這個俱樂部有一隻催眠貘和一隻引夢貘人。一位成員告訴他們，這個俱樂部因為多數成員受到失眠的困擾，因此需要藉助引夢貘人的力量來幫助他們入睡。小智指出正是引夢貘人發出的催眠波影響到了寶可夢，大家十分慚愧，意識到自己似乎犯了錯誤。

小霞對引夢貘人很感興趣，於是試圖讓引夢貘人催眠她，結果在睡眠波的作用下，動作行為變得很像小海獅。之後小霞一個人跑走，小智和小剛連忙跟了上去，小霞跑到一個公園，大家在這裏意外地發現失蹤的孩子們都在這裏模仿着各種寶可夢的動作。小剛指出，孩子們包括小霞在內都在引夢貘人的催眠下被變成了寶可夢。這時俱樂部成員提出讓催眠貘來解決這個問題，於是小智等人把小霞帶回到俱樂部，催眠貘果然成功地喚醒了小霞。

之後眾人決定把催眠貘帶到公園解救被催眠的孩子們，這時火箭隊三人組出現試圖搶走催眠貘和引夢貘人，但被小智挫敗。催眠貘使孩子們恢復了神智，清醒過來的孩子們都回到了父母身邊。同時寶可夢中心的寶可夢也都重新恢復了活力。喬伊小姐拜託小剛照顧一直被頭痛困擾的可達鴨，小剛對可達鴨並不感興趣，讓小霞去收服它，但小霞也不喜歡這只不機靈的可達鴨。結果小霞被石頭絆倒，她的精靈球從包裏掉了出來，可達鴨碰觸到精靈球的按鈕，結果被吸入精靈球，就此成為小霞的寶可夢。

劇情圖片

小剛帶領小智一行人來到美容街，來尋找一家由小雪（被寶可夢飼育家協會連續四年評為超優級飼育家）開的店。小剛見到自己崇拜已久的超級飼育家小雪後十分興奮，想要拜她為師。但是小雪似乎並沒有什麼信心。原來火箭隊三人組也在美容街上開了一家店，而自從他們的美容店開張後，寶可夢美容的風潮改變了，導致小雪的店顧客也來越少。而經不住誘惑的小霞則帶着可達鴨跑去火箭隊的店做美容，結果被火箭隊扣押，以她為人質要求交換皮卡丘。為了解救小霞，同時贏回顧客，小智和小剛決定幫助小雪和火箭隊進行戰鬥。而皮卡丘和小拳石都被瓦斯彈的泥漿攻擊糊住了眼睛無法作戰，小雪於是放出了六尾，使出火焰旋渦將火箭隊打倒。同時告訴顧客，寶可夢最重要的是內在而非華麗的外表，讓大家都對寶可夢的內涵有了重新的認識。經過此事後，小雪重拾信心，決定也去進行修行。臨別前，她將六尾拜託給小剛撫養。

劇情圖片

在淺紅市的郊外，小智一行人遇到了一隻格鬥屬性寶可夢——快拳郎。小智想要收服它，派出的皮卡丘卻被快拳郎輕易打倒。這時，快拳郎的訓練家，來自鬥魂道館的扇鬥先生出現了。原來扇鬥為了能奪取P1大賽的冠軍，離開家和快拳郎訓練。他的女兒愛美請求小智無論如何想辦法擊敗扇鬥，讓她的父親能回家去。於是，小智決定用最近收服的火暴猴參加P1大賽以打倒快拳郎，讓扇鬥清醒。而小剛也決定使用小拳石參加此次大賽。

比賽正式開始，第一場由小智的火暴猴對抗腕力，但火暴猴不敵，被扔出場外。千鈞一髮之際，小智衝上去用身體接住了火暴猴，使火暴猴深受感動，重新上場後，火暴猴瘋狂反撲，最終打倒了腕力。另一邊，同樣覬覦本次P1大賽金腰帶的火箭隊三人組綁架了飛腿郎的訓練家——巨人，並搶走他的飛腿郎參加比賽。面對飛腿郎的攻擊，小剛的小拳石完全不敵受了重傷，小剛無奈之下選擇了棄權。

隨後飛腿郎和扇斗的快拳郎相遇，面對快拳郎靈活的閃避步伐，飛腿郎的攻擊完全踢不到它。這時喵喵暗中把膠水塗在格鬥場的地板上，粘住了快拳郎的腳，讓它無法移動，結果連中數腳。愛美不忍心看到父親的寶可夢受欺負，挺身而出要保護它。目睹女兒此舉，扇鬥既感動又慚愧，果斷宣佈棄權，父女二人言歸於好。

決賽在火暴猴與飛腿郎之間展開了爭奪，火箭隊為贏取冠軍又暗中使壞，派喵喵在場地下面安裝了一個爆炸裝置。但這一陰謀被皮卡丘察覺，皮卡丘向小智示警無果，於是自己潛入場地下拆除了爆炸裝置。火箭隊作法自斃，引爆後被自己的爆炸裝置炸飛。而火暴猴抓住機會以一記精彩的“地球上投”贏得了最終的勝利。扇鬥對火暴猴表示了欣賞，想讓它留在這裏接受特訓，從而成為P1的明日之星。火暴猴含淚與小智一行人告別。

劇情圖片

小智一行人來到了工業城鎮黑雲市，這時皮卡丘突然感到身體不適，開始從臉頰漏電。小智帶他去寶可夢中心治療，這裏的喬伊小姐態度非常懶散，工作漫不經心，引發了小智的不滿。喬伊告訴小智皮卡丘所患的是電氣老鼠的感冒，只需休息一晚就可痊癒。這時全市突然停電，醫療無法正常進行。為了救皮卡丘，小智跑去電廠查看原因。在那裏似乎感覺到有什麼東西跟着他們，眾人被嚇得半死，結果發現是一隻小磁怪，它似乎對皮卡丘有着濃厚的興趣。由於小磁怪是完全由無機物構成的無性別的寶可夢，大家對此完全無法理解。這時大量臭泥突然出現，原來停電的原因是大量的臭泥佔據了發電廠，造成發電機不能使用。同時它們還在拼命地向發電廠內的人們發起攻擊，皮卡丘拼命地電擊，但效果不佳。這時出現了很多小磁怪和三合一磁怪，一起發出強力的電磁波攻擊，終於趕走了這羣臭泥，使電力供應系統恢復了正常。而小智則收服了它們的首領臭臭泥，由於臭臭泥的味道實在太臭，小智便把它傳送去了大木博士的實驗室。而皮卡丘恢復健康後，身體不再帶電，小磁怪也就不再纏着它了。

劇情圖片

小智一行人在山裏面迷路了。走在顛簸的山路上，突然間，他們聽到了一聲爆炸聲。他們循聲而去，發現是一個大壩的施工工地。小智得知工頭正在招募厲害的寶可夢訓練家去驅趕干擾施工的地鼠們。正當小智也躍躍欲試準備加入時，勁敵小茂出現了。並再一次嘲諷了小智，小智十分不滿，暗中下定決心要壓倒小茂。 監督水庫施工的工頭召集眾訓練家消滅地鼠，訓練家們面對成羣的地鼠紛紛投出精靈球，但寶可夢們不知為何都不願從精靈球中出來，包括小智和小茂也無計可施。由於寶可夢們不願與地鼠戰鬥，無奈的訓練家們漸漸散去。到了晚上，小智一行人意外發現許多地鼠和三地鼠在山上的森林中植樹，這才意識到一旦建成水庫，整個森林都會被洪水淹沒，寶可夢們都會失去自己的家園。地鼠對水庫工程搞破壞就是為了保護森林，而寶可夢們都清楚這一點，所以拒絕戰鬥。這時火箭隊帶着剛剛進化的阿柏怪和雙彈瓦斯出現，結果被地鼠打敗。水庫工頭也認識到了自己的錯誤，毅然決定中止施工。

劇情圖片

小智一行人在經過一個個陷阱機關後，終於來到了淺紅道館。這是一個忍者屋，館主忍者阿桔答應了和小智的對決。火箭隊的再次亂入中斷了比賽。小智能否如願以償地得到得到粉紅徽章？

劇情圖片

小智一行人來到了拉拉美族聚居的草原，從拉拉美族少女富子處得知，村子將舉辦一個寶可夢賽跑。比賽前一天，富子意外的摔傷導致無法參賽。身為冠軍候選人的富子講希望寄託給了小智。小智能不負期望嗎？富子摔傷的原因又是什麼？

劇情圖片

小智一行人來到寶可夢保護區，因為企圖收服野生的寶可夢而被君莎逮捕。在説明情況後，小智得到了原諒並要求幫助君莎擊退正在偷獵袋獸的火箭隊……

劇情圖片

小智一行人在狩獵地帶遇到了那裏的管理員。管理員在辦公室裏告訴了小智狩獵地帶的捕捉規定。小智注意到了辦公室裏的一張照片——裏面是年輕時候的管理員與一隻傳説的寶可夢迷你龍的合影。管理員拒絕透露任何關於迷你龍的事。而這時，屋頂上的火箭隊也聽到了這個好消息……

劇情圖片

從原野回到城市的小智一行人來到了一座長20公里的大橋。這座橋連接了對岸的陽光鎮。因為還在施工中，他們只有通過單車才能過橋。可是資金不足的小智無法買車。就在這時，他們在寶可夢中心接到了往陽光鎮送藥的任務，而且可以借用單車。小智三人終於再度啓程。

劇情圖片

突降暴雨，小智一行人在野外尋找避雨處，他們找到了一棟大房子。在裏面，他們遇到了一隻百變怪和它的訓練家伊美蒂。雖然百變怪擁有獨特的變身招式，但是這隻百變怪似乎不能完美變身，面孔仍是百變怪。就在小智準備幫助伊美蒂訓練時，火箭隊再次出現……

劇情圖片

小智一行人在森林裏面休息。突然，皮卡丘發現了一隻看着自己的皮卡丘。小智的皮卡丘追了過去。這是一個野生的皮卡丘族羣，就在他們要接受小智的皮卡丘時。小智的出現把野生的皮卡丘們驚跑。這些皮卡丘能否接受小智和他的皮卡丘呢？小智的皮卡丘又會不會加入這些夥伴呢？

劇情圖片

在一棵大樹下，小智一行人發現了一隻掛有銘牌的伊布，旁邊還放有水和食物。小智決定把它送回銘牌所指示的地方。他們來到了史頓鎮並找到了伊布主人的地址。那裏正在舉行一個關於進化的園會，而主角正是這隻失蹤的伊布。但是伊布的主人太一似乎很不願看到伊布回來，這是怎麼回事呢？

劇情圖片

旅途勞頓，小智一行人來到一個小山村找尋食物。可是當地的麪包店、飯店全都不提供食物。就在此時，村中的一位老人接待了他們，並告訴他們當地的食物短缺是因為乾旱。在多雨的年份河道竟會乾涸，小智一行人決定順着河道調查。結果他們發現，是一隻睡著的卡比獸擋住了水的流動。小智和夥伴們要叫醒卡比獸……

劇情圖片

小智順路來到黑暗市，一個在白天街道都十分冷清蕭條的小鎮。剛進鎮裏，小智等人就被幾個小孩扔石頭騷擾。他們似乎討厭寶可夢訓練家。不一會兒孩子的家長——一家餐廳的老闆趕到了。在餐廳裏，小智瞭解的這個城鎮會如此衰敗，就是因為城裏的兩家寶可夢道館為了獲得寶可夢聯盟的承認成為黑暗市的正式道館而互相鬥爭。為了阻止紛爭，小智又要捲入麻煩當中……

劇情圖片

小智一行人來到了一個嘉年華節，他們打算好好玩一玩。正當小智和小剛在跳舞時，小霞發現了魔術師馬健，一個剛剛被助手拋棄的魔術師。被再三請求後，小霞當了馬健的助手，可是他的魔術過於糟糕以致被老闆開除。為了使馬健重拾信心，小智等人想盡辦法幫助他……

劇情圖片

小智一行人來到松藻鎮採購藥品和食物。緊跟在小智後面的火箭隊三人組卻出了一些問題，喵喵突發高燒難以行動。就在武藏和小次郎決定撇下喵喵時，清美出現並治好了喵喵。喵喵十分感動，表示要報答清美。此時，小智一行人來到清美家的中藥鋪採購，回家的清美向小智提出挑戰，因為她想要讓自己的派拉斯進化。這一次，想要幫助清美的小智一行人和火箭隊會怎麼做呢？哪邊會成功？

劇情圖片

小智一行人來到了沙漠中的霓虹鎮，這裏以賭場和很少睡覺易暴躁的人出名。而此時胖丁也跟着小智來到了鎮子上，它能否讓當地的人們有一個好的睡眠呢？

劇情圖片

小智一行人來到了大傻谷，與宿敵小茂相遇，原來小茂和其他人都是為了發掘大傻谷的寶可夢化石而來。因為火箭隊的搗亂，小智落入大傻谷地底下，並在那遇見菊石獸、化石盔等遠古寶可夢……

劇情圖片

皮卡丘突發疾病，小智一行人將其送往醫院治療，並在杜醫生和吉利蛋的幫助下擊退了火箭隊……

劇情圖片

小智一行人來到了某個村落路口，發現了小次郎的尋人啓事並被帶到了小次郎的家。但真相卻是小次郎的父母設計將小次郎騙回家並要求他與魯美嘉結婚。不過小次郎的卡蒂狗將小次郎救出，小次郎道出離家出走的真相。小次郎打敗魯美嘉後，重歸火箭隊。

劇情圖片

小智和小剛幫小霞打水去，在落單的小霞面前，一隻罕見的寶可夢，大葱鴨出現了。小霞想要在小智和小剛來前收服它，於是開始追逐大葱鴨。在叢林中追着追着，小霞撞上了一個少年，起來後大葱鴨也不見了蹤跡。小霞和小智、小剛匯合才發現包已經被調換。失去了所有的寶可夢的小霞要怎麼找回來呢？神秘的大葱鴨為什麼會出現？那個少年又是怎麼回事？

劇情圖片

小智一行人在旅途中來到某座城市的寶可夢中心，在這裏小智收到了大木博士的訊息。大木博士幫小智升級了寶可夢圖鑑。吃飯的時候，小智一行人談論起了在大傻谷得到的寶可夢的蛋，一旁火箭隊偷聽到這個消息，然後趁機搶走了這枚蛋。小智一行人在找到火箭隊時，喵喵正在照顧着蛋。在雙方爭奪蛋的時候，蛋孵化了，原來這是波克比的蛋。之後為了爭奪波克比，小智、小霞、小剛、喵喵進行了比賽。誰會贏得這次的比賽？誰又能得到波克比？

劇情圖片

在旅程中，戰鬥必不可少。小智用妙蛙種子打贏了一個登山男後，妙蛙種子似乎陷入了奇怪的狀態，周圍的鮮花居然盛開！把妙蛙種子送到寶可夢中心檢查後，小智從喬伊處得知這是妙蛙種子進化前的徵兆。而且馬上在不思議花園就會有一個妙蛙種子的進化盛典。妙蛙種子是否能成功進化呢？

劇情圖片

小智一行人與火箭隊都來到了玩偶鎮。恰逢娃娃節，小霞和武藏開始了大搶購。在商場，她們聽説了有娃娃節娃娃女王比賽，獲勝者將得到一整套娃娃。就是衝著娃娃，小霞和武藏在同伴們的支持下開始了賽程。到底誰能戰到最後呢？

劇情圖片

到了兒童節，小智一行人路過一家幼兒園。裏面的管理員誤將小智當做要來幼兒園陪孩子們過節的訓練家。得知約定要來的訓練家沒有來，小智決定讓寶可夢陪孩子們玩。就在孩子們玩的高興時，有一個孩子卻悶悶不樂。他想見到喵喵。這究竟是怎麼回事呢？

劇情圖片

在森林中行走時，小智忽然聽見有人在喊抓小偷。這時一個手持手槍的男子出現，皮卡丘不敢上前制服他。突然，一隻卡蒂狗撲向男子並打飛了手槍。皮卡丘才上前將男子電暈。原來，這只是警犬的一個模擬演習。小智想讓皮卡丘也變得像卡蒂狗那樣勇猛，於是請求君莎警官讓皮卡丘體驗一天的警犬訓練……

劇情圖片

正在野餐的小智突然間覺得有人在盯着他。原來那是一位寶可夢攝影師，叫做阿徹。阿徹想要拍攝一張最好的皮卡丘的照片，但是皮卡丘因為害羞無法露出自然的表情。阿徹不知為何堅持要拍下皮卡丘的照片。他能照出完美的照片嗎？他又為什麼一定要拍攝皮卡丘呢？

劇情圖片

因為小霞説小智得到徽章是依靠運氣。不服氣的小智要和小霞決鬥。這時，阿徹推薦小智去參加寶可夢檢定考，這是可以直接獲得寶可夢聯盟參賽資格的途徑之一。鬥志蓬勃的小智是否能通過考試？會有怎麼樣的題目等著他？

劇情圖片

有一家培育屋新開張，眾多寶可夢訓練家因為廣告宣傳前往那裏寄存寶可夢。小霞為了讓可達鴨變得聰明，表情不再呆滯，也將其寄存到了新開的培育屋。來到一家餐廳，因為得知給廚師看了可達鴨就能免費用餐，小霞返回培育屋，卻看見正門已關。小智一行人隨即潛入裏面，發現這些寶可夢竟然被關在籠子裏。這個培育屋為什麼這樣對待寶可夢？

劇情圖片

小智為了得到第七枚徽章而來到了紅蓮鎮，但卻從一個喜歡講謎語的大叔那裏得知紅蓮道館因遊客眾多而關閉了。在從火箭隊手中救下寶可夢研究所後，大叔告訴了小智道館的位置。等待小智的將會是怎樣的挑戰？

劇情圖片

小智的紅蓮道館首戰以失敗告終。為了應對道館嚴酷的岩漿環境，小智需要一隻強力的火屬性寶可夢。他把全部希望寄託在了還不聽自己指令的噴火龍身上，道館挑戰賽能否取勝？

劇情圖片

小智一行人在趕赴快要出發的船時，遇到了求救的卡咪龜。跟隨着卡咪龜，小智一行人來到不知名小島上的龜寶可夢王國。島上的眾龜全部不明原因地昏睡過去，火箭隊趁機來搶走龜王水箭龜……火箭隊與龜羣的大戰就此展開……

劇情圖片

小霞的墨海馬似乎因為缺乏運動而身體不適，因此小霞決定順路回一趟家。到了華藍市，小智一行人發現華藍道館要舉辦水中芭蕾，而主角由小霞來扮演。小霞勉為其難接受了主角的工作。另外，火箭隊準備在水中芭蕾表演時奪取水屬性寶可夢。這場演出會成什麼樣子呢？

劇情圖片

在城市裏休整中的小智一行人被出現的皮皮吸引了而去追趕皮皮，回來發現東西全被偷了。警察局門口也聚集了大量物品被偷的受害者。為了找出真相，小智和外星人研究員平田開始搜尋“外星人”……

劇情圖片

小智為了奪取最後一枚徽章再次來到常青市。在道館門口他遇見了小茂。小茂已經得到十枚徽章並且要向常青道館發起挑戰，結果他被一個未知的寶可夢打敗。小智進入道館後，發現館主竟然是火箭隊……

劇情圖片

在回真新鎮的途中，小智發現並準備捕捉一隻魔牆人偶。這時，一位馬戲團團長到來並表示需要魔牆人偶來為自己的魔牆人偶打氣。在小剛的説服下，小智扮演魔牆人偶進行表演，卻意外地被火箭隊抓走……

劇情圖片

小智一行人在海岸看見了一隻拿著聖誕老人靴子的孤單的迷唇姐，她似乎找不到回聖誕老人島的方法了，小智決定幫助迷唇姐回家。而火箭隊的武藏堅信在自己小時候迷唇姐扮演的聖誕老人偷走了自己的娃娃，從而跟隨小智要報復聖誕老人。這個聖誕節聖誕老人還能否去送禮物呢？

劇情圖片

小智一行人被風雪阻礙而待在雪山當中，為了拯救皮卡丘，小智與小剛等人分散。小智要怎樣與寶可夢們共同度過寒冷，越過雪山呢？

劇情圖片

小智一行人來到大木研究所詢問寶可夢聯盟比賽的地點和日程。大木博士向小智一行人和小茂介紹了寶可夢研究所的工作。就在此時，火箭隊三人組也從研究所後院偷偷溜進來了……

劇情圖片

小霞和小剛跟隨花子前往比努旅行，計劃做特訓的小智在大木研究所得知大木博士想請教在比努的西野森教授呆呆獸和大舌貝是如何進化這個問題，於是也前往比努。此時，西野森也正在研究這個問題……

劇情圖片

來到比奴市的小智在海上衝浪。就在他因為腳抽筋遭遇危險時，衝浪手敏川特和他的皮卡丘救了小智。敏川特在等待即將來臨的超大海浪，大星期二。這時，火箭隊偷走了兩隻皮卡丘……

劇情圖片

小智打算去山上做獨立訓練，花子拜託小智順便去村雨植物園帶些草藥回來。來到植物園，小智得知植物園園長林子的臭臭花就算用了葉之石也無法進化。到來的大木博士指出進化之石是假的，他也在追查販賣假進化之石的火箭隊一夥……

劇情圖片

備戰寶可夢聯盟的小智和陪同的小霞、小剛在湖邊露營區訓練。他遇見了一位雷丘的訓練家克子和一名電影導演南野。南野要在湖邊拍攝一段電影。為了選出和女主胖可丁配戲的寶可夢，小智等人還有火箭隊開始了激烈的競爭……

劇情圖片

導演南野邀請小智一行人前去好萊塢觀看他的新作首映，火箭隊也跟隨他們前去。到了好萊塢，喵喵似乎想起了它不為人知的傷心往事……

劇情圖片

想要獨立訓練的小智聽説最近在米亞查山發現了四天王中的希巴，於是就和小霞、小剛前往米亞查山向希巴大師尋求寶可夢的“大秘技”。在山中，小智一行人在被巨大大巖蛇襲擊時，被希巴所救。於是小智就跟着希巴，求他傳授“大秘技”……到底什麼是“大秘技”呢？真的存在“大秘技”嗎？

劇情圖片

小智和小剛在山中進行寶可夢對戰使得山岩崩塌，一處古代遺蹟顯露出來。一羣考古學家趕到向他們解釋了古代石板的語言。在晚上，火箭隊的搗亂導致超古代耿鬼和超古代胡地紛紛解除封印，開始大打出手。小智等人面對巨大的寶可夢根本束手無策。怎麼平息這場戰鬥並封印超古代寶可夢呢？

劇情圖片

小智一行人在前往石英高原的路上遇到了一位嘎啦嘎啦的訓練家。他向小智發起挑戰，卻要求輸的一方交出所有徽章。小智打敗他後才知道，這位訓練家齋藏的八枚徽章被火箭隊偷了。為了幫齋藏找回徽章，小智開始尋找他的宿敵火箭隊……

劇情圖片

小智一行人即將到達寶可夢聯盟的比賽場地，石英高原。他們正好趕上了大會的聖火傳遞活動，並且參與了火炬傳遞。因為聖火來自傳説的寶可夢火焰鳥，火箭隊想搶聖火賣錢，於是在聖火傳遞的途中搗亂。小智用盡全力保護聖火併和火箭隊展開戰鬥……

劇情圖片

寶可夢聯盟石英大會的比賽正式開始，為了備戰即將開始的第一場比賽，小智從大木博士那裏傳送回了大鉗蟹。小智的第一場比賽在水之場地，對手是一個狂妄自大愛表演魔術的訓練家多武。面對成竹在胸的多武，小智派出了從未用過的大鉗蟹，他是否能通過第一場比賽？

劇情圖片

隨着小智的傑尼龜擊敗尼多力諾，第二回合在岩石場地的比賽以小智獲勝而告終。在下一場比賽之前，小智要去寶可夢中心恢復寶可夢的體力，但是寶可夢中心人太多。小智上了火箭隊的當，來到假的寶可夢中心，皮卡丘被搶走。最後小智一行人還是將被搶走的皮卡丘奪了回來。第三場比賽是在冰之場地進行。小智要繼續在石英大會的賽程中高歌猛進。

劇情圖片

第四回合比賽開始，小智親眼見證了小茂輸給了吉木，開始對自己的結果產生了一些憂慮。小智的第四場比賽是在草之場地，首發妙蛙種子順利地打敗了對手的前兩隻寶可夢。對手第三隻被認為最厲害的寶可夢竟然是看上去弱不禁風的喇叭芽，可是就是這隻寶可夢，讓小智陷入了苦戰。

劇情圖片

小智的母親花子和大木博士在飯店請小智一行人吃飯，在飯店的電梯裏，小智結識了一位參賽選手阿弘。出了飯店，小智聽到有一個必要的寶可夢健康檢查，在交出所有寶可夢之後，那些工作人員才露出真實身份——火箭隊，並攜帶精靈球逃走。小智和同樣被騙的阿弘一起追趕火箭隊。

劇情圖片

即將開始和好友阿弘的第五場比賽，小智一行人突然接到了阿弘的電話要小智出去見面。小智欣然前去，卻發現那是火箭隊的詭計。火箭隊纏着小智，不讓他前去比賽，可是比賽時間眼見着就要到了……

劇情圖片

第五場比賽落敗的小智意志消沉，小霞和眾人勸説仍不見好轉。這時，阿弘的第六場比賽即將開始，小智前往觀戰。結果阿弘惜敗於對手。小智和阿弘在湖邊見面，見到阿弘雖敗卻仍鬥志不減，小智不禁反思起來。石英大賽圓滿落幕，小智和小霞、小剛一起回真新鎮。

劇情圖片

回到真新鎮，迎接小智的是一場盛大的慶功宴。在宴會上，火箭隊依舊前往搗亂，企圖搶走皮卡丘。小智靠著被激怒的噴火龍救下了皮卡丘。事後，大木博士拜託小智一行人前往橘子羣島的岱柑島取回內木博士的特殊精靈球，小智欣然應允。剛出真新鎮，小智遇上了一羣烈雀和波波族羣爭奪地盤，為了救出被大嘴雀圍困的波波們，小智派出自己的比比鳥，帶領野生的波波和比比鳥抗爭。過程中，比比鳥進化為大比鳥。為了保護波波們，小智將大比鳥留在族羣中。

劇情圖片

小智一行人為了前往岱柑島而在便利店採購，他們在店裏的抽獎中幸運地抽中特獎，三人直飛岱柑島。他們上了飛艇，發現飛艇十分破舊，而且操縱飛艇的竟然是火箭隊三人組。他們能平安到達岱柑島嗎？

劇情圖片

小智一行人終於來到岱柑島，他們在喬伊的指引下找到了內木的寶可夢研究所，並且在研究所的後院觀賞到了許多與圖鑑上的樣式不同的寶可夢。為了幫助內木，並且加深自己對於這些獨特的寶可夢的瞭解，小剛決定留下來。返程時，當小智和小霞來到飛艇站時，迎接他們的竟是一艘嶄新的飛行船……

劇情圖片

小智和小霞隨著飛艇降落在澎柑島，他們看見三個不良少年在欺負一隻拉普拉斯。就在小智要為了救拉普拉斯而與不良少年戰鬥時，一位寶可夢觀察家小建出現暫時打斷了戰鬥。不良少年被小智趕跑，小智一行人也將拉普拉斯送至寶可夢中心治療。而此時，火箭隊也看中了這隻拉普拉斯，他們要搶走拉普拉斯。拉普拉斯的命運究竟如何？

劇情圖片

小智一行人乘坐拉普拉斯來到夏幹島，為了挑戰橘子聯盟，小智向道上的夏幹道館發起挑戰。令小智意外的是，道館的比賽不同於以往的對決，而是比寶可夢招式的熟練度。面對從未嘗試的比賽方式，小智陷入了苦戰。

劇情圖片

小智、小霞和小建剛到金柑島，就看到一羣寶可夢準備攻擊人類。接著，就連小智的皮卡丘和小霞的波克比也開始對眾人充滿敵意。小智一行人和君莎開始調查這個事情。另一方面，火箭隊的喵喵也變得不正常，武藏、小次郎跟蹤喵喵，發現事情的原因是火箭隊另外兩名成員亞馬多、小三郎和他們的催眠貘。不料武藏、小次郎的寶可夢也全都被控制。為了報仇並奪回寶可夢，武藏、小次郎開始了和小智及君莎的合作……

劇情圖片

在前往椪柑島的途中，小智拾到了一個裝有寫着尋求水晶大巖蛇信息的漂流瓶。抵達椪柑島後，小智一行人巧遇了漂流瓶的主人正美和她的哥哥阿功，瞭解到阿功希望通過水晶大巖蛇召到靈感，他們決定和阿功一起找尋水晶大巖蛇。聽説水晶大巖蛇傳聞的火箭隊三人組也開始搜尋水晶大巖蛇……

劇情圖片

小智一行人被漩渦卷至平柑島，他們在島上看到了一隻粉紅獨角犀牛。在一番折騰後，小智從當地的君莎的口中得知，這座島上的寶可夢因為食用平柑果，全部是粉紅色的。尾隨至此的火箭隊看上了珍稀的粉紅色寶可夢，準備大肆捕捉這裏的寶可夢。小智和君莎要如何收拾火箭隊和他們造成的亂局？

劇情圖片

小智一行人乘坐拉普拉斯向下一個島前進時，一艘快艇路過。跟隨快艇，小智他們得知這是一個考古團隊，他們要來富拉四號島找尋化石寶可夢化石盔的化石。在進發的途中，似乎一直有人在暗中阻止考古隊前往發掘。最後，小智抓住了這個搞破壞的人，他勸大家不要破壞小島，否則會有災難發生……

劇情圖片

聽説有寶可夢的表演，小智一行人上了寶可夢豪華郵輪，這上面表演為寶可夢配音的表演秀。一位年輕的演員凱兒似乎和她的寶可夢雷丘相處的有些問題。小智被請求幫助凱兒和雷丘，然後火箭隊出現，企圖奪走船上的寶可夢。

劇情圖片

在哈撒島，小智一行人遇到了另一位水屬性寶可夢訓練家小椿，她救起了小霞落水的可達鴨，她告訴小霞可達鴨有進化的徵兆。小霞和小椿進行寶可夢對決，對戰中小霞發現自己的可達鴨似乎進化為哥達鴨了……

劇情圖片

小智一行人正在橘子諸島航行，突然，他們看見了一位喬伊飛快地向前划着船。小智緊跟其後，追至一座小島。這位喬伊護士是為這些野生的寶可夢做巡診，而獨自留在這座無名島上。喬伊提供小智一行人的飲食並治療了疲憊的拉普拉斯。為了報答恩澤，小智一行人決定幫助喬伊診療……

劇情圖片

來到奈普魯島挑戰奈普魯道館的小智一行人在岸邊遇見了一位叫小丹的訓練家。他和小智一起進入奈普魯道館，卻發現一塊告示，必須靠自己的力量爬上山才能比賽。小智和小丹開始爬山。到了山上，小智才知道小丹就是奈普魯道館的館主。等待小智的是一場三回合的比試，小智結果如何呢？

劇情圖片

小智一行人來到了盛產文旦的果實七島，他們因為小誤會而認識了島上負責種植果實的奈奈。這時，他們看見一隻飢餓的卡比獸正大肆吃着文旦。沒有辦法阻擋它，它很快就把第一座島的文旦全部吃完了。沒有滿足的卡比獸開始遊向第二座島。因為這隻大胃王卡比獸，果實七島陷入了前所未有的危機……

劇情圖片

小智一行人來到了斯達奇島，大木博士告訴小智這裏有新發現的古代橘子聯盟冠軍獎盃。當小智第二天前去參觀時，發現獎盃被火箭隊偷走了。為了奪回獎盃，小智一行人跟隨火箭隊來到一艘幽靈船……

劇情圖片

火箭隊三人組試圖在海上搶奪皮卡丘卻再次失敗，三人被傑尼龜的水槍打飛。火箭隊的喵喵飛到了神秘貓之島，島上的人把喵喵誤當成幸福的喵喵神。為了防止自己的幸福被幹擾，喵喵派人將登上島的小智一行人和武藏、小次郎趕下島去。就在喵喵享受幸福時，島上的民眾要求喵喵使用聚寶功這個喵喵不會的招式，甚至為了讓喵喵學會聚寶功，將喵喵扔至競技場。喵喵真的能得到幸福嗎？

劇情圖片

小智一行人來到有大量昆蟲寶可夢的馬科特島，他們看到了一隻身受重傷的飛天螳螂。小智企圖收服它卻失敗了。小建利用毛球的催眠粉抓住了飛天螳螂並送至寶可夢中心。另一方面，武藏因為髮型被飛天螳螂羣破壞而和小次郎將飛天螳螂們抓獲。為了救那些飛天螳螂，小建新收服的飛天螳螂不顧身上的傷而出發了……

劇情圖片

小智一行人發現了一座長滿樹果的小島。有充足的食物，小智決定給寶可夢放個假，他們把所有的寶可夢放了出來。本決定放假的火箭隊卻因為看見了小智等人的寶可夢而放棄休假，有準備對寶可夢下手。疏於防範的小智一行人會被火箭隊得逞嗎？

劇情圖片

小智剛到小橘子島就連續遭遇了幾場比賽，連續的勝利讓小智得意忘形了。這時，他和小霞、小建遇見了四天王中的科拿小姐，小智立刻向科拿發出挑戰，但沒有被迴應。在和其他人的交戰中，小智的噴火龍失控，科拿使用呆殼獸穩定了噴火龍，也讓小智認識到科拿的能力。觀摩了科拿的示範比賽，小智仍想和科拿比賽，結果又會如何？

劇情圖片

來到洋貝拉市的小智一行人先遇到了一位在尋找尼多蘭的女生，後遇到一位尋找尼多朗的男生，之後發現他們倆的寶可夢相愛了，可是兩位訓練家的關係卻相當惡劣。為了把相愛的兩隻寶可夢撮合到一塊兒，憧憬戀愛的小霞要用手段讓兩位訓練家和好。她做得到嗎？

劇情圖片

為了前往柚子道館，小智一行人來到大平原。突然間，烏雲湧起，雷陣雨轉眼就來了，這時一名放牧小磁怪的牛仔佛得出現，給小智一行人提供了避雨的場合。附近城鎮的君莎打電話説城鎮因為電光而停電了，希望小磁怪們過來幫忙。正當佛得出發時，火箭隊登場搶奪小磁怪。小智和佛得趕走了火箭隊，但佛得受傷，將差事託付給小智。小智能否成功完成運送小磁怪的任務？

劇情圖片

橫穿小橘子島的小智一行人終於抵達比格市，卻因為火箭隊的陷阱而落入大都會的下水道。在下水道里，小智的妙蛙種子被一個怪物掠走。小智等人剛從下水道爬出來，就被君莎逮捕。聽説下水道怪物的傳聞，被釋放的小智更迫不及待要救妙蛙種子。可是市長卻不惜封住下水道也不準人進下水道，這是為什麼？小智的妙蛙種子能否得救？

劇情圖片

小霞在柚子島海邊救了柚子道館館主阿義的妹妹瑪莉，在阿義向小霞表達謝意並請她跳舞時，小智向他挑戰。阿義要先測試小智寶可夢招式的熟練度。小智完美通過測試並得到約定，第二天進行比賽。當夜，阿義和瑪莉誠摯邀請小霞留在柚子道館。小霞是否會離開小智的團隊？小智能不能得到第三枚徽章呢？

劇情圖片

小智一行人來到大椪島後中了火箭隊的陷阱。皮卡丘被火箭隊抓走並和喵喵連在一起。就在火箭隊得意之時，喵喵和皮卡丘被大比鳥抓走。喵喵和皮卡丘掙脱大比鳥，卻完全找不到回去的路了……

劇情圖片

小智一行人在海上航行時遇見了一位寶可夢訓練家小英。小英向小智發起了挑戰。小英使用的是一隻蚊香泳士，靠着強大的實力贏了小智的皮卡丘。小智派出尚無法控制的噴火龍，結果噴火龍被蚊香泳士的冰凍光束冰凍了，生命垂危。小智不顧輸了比賽，一心搶救噴火龍。噴火龍能被救過來嗎？第二次戰鬥他能夠戰勝小英嗎？

劇情圖片

小智一行人剛來到蜜柑島，就遇上了一起火災。小智的傑尼龜和小霞的海星星前往滅火，但是火勢過大。幸好卡咪龜消防隊趕到，救出了小智和小霞並撲滅了大火。小智的傑尼龜不服氣，要和卡咪龜比試。火箭隊這時將傑尼龜和卡咪龜消防隊還有皮卡丘全部掠走了。可是這時，城裏又發生火災了……卡咪龜消防隊被劫走了，火災能否及時撲滅呢？

劇情圖片

小智一行人因為海流而滯留在香橘島一週，食物幾乎都吃完了，就在他們在野外找食物時，草屬性寶可夢訓練家小順向小智發起了挑戰，餓昏了的小智不小心派出了卡比獸，還把它的精靈球摔壞了以至於無法收回卡比獸。聽説最近的寶可夢中心在山的另一邊，小智一行人開始努力把睡得正香的卡比獸拖到山的另一邊去……

劇情圖片

小智一行人來到榴柑島，小智被一位女士當成了自己的兒子。火箭隊駕駛機器人前來突襲，小智和女士合力打敗了火箭隊。原來這位女士是琉璃道館的道館館主，這是小智在橘子聯盟前的最後一個目標了。道館的比賽要求是雙打，面對從未進行過的比賽，小智將如何應對？

劇情圖片

小智一行人在海上遇見了一位開潛水艇的老爺爺，他在跟隨一大羣鯉魚王。小智跟隨他到甜柑島，才知道他是寶可夢觀察家綠河，是為了觀察鯉魚王的迴游和進化而來的。同為觀察家，小建決定幫助綠河，解開鯉魚王的進化之謎。火箭隊為了組建暴鯉龍軍團準備對鯉魚王下手，他們會得逞嗎？

劇情圖片

小智和小建吸入了霸王花的麻痹粉，高燒不止。小霞通過圖鑑知道要尋找阿西蕾水草來治療他們。與此同時，武藏也因為吸入霸王花的麻痹粉而讓小次郎和喵喵出去找阿西蕾水草。敵對的雙方在池塘邊碰面了，為了拯救同伴，雙方都不惜拼命一戰。到底哪一邊能夠成功救下同伴？

劇情圖片

終於，小智一行人來到了柑橘島，向橘子聯盟的勝利者杯發起了最後的挑戰。小智要和一位帶有快龍的首席訓練家勇次進行6對6的全員大對決。首次進行的比賽形式，強大的寶可夢，小智會如何應對呢？

劇情圖片

小智在橘子聯盟勝利者杯的比賽中，使用巧妙的戰術，用和寶可夢的默契成功擊敗了首席訓練家勇次的前五隻寶可夢。勇次的第六隻寶可夢快龍終於登場了。和最終的勝利者杯僅一步之遙，但是面對強大的寶可夢快龍，小智能否用剩下的四隻寶可夢戰勝它，取得勝利呢？

劇情圖片

小智一行人在海上航行時，發現了一羣拉普拉斯，就在小智的拉普拉斯靠近時，拉普拉斯羣立刻逃離了。小智在附近的寶可夢中心聽説是盜獵團所為，就連火箭隊也被盜獵團所傷。為了保護拉普拉斯，小智決定徹底擊破盜獵團。

劇情圖片

小智一行人要來到凸橙島搭乘通信船，但是凸橙島被封鎖了，連接島的橋樑也突然發生了爆炸。小智乘小船來到島上，他們發現島上城市完好，但是沒有一個人，取而代之的是一大羣會爆炸的頑皮雷彈。面對一觸即發的危險，小智他們會怎麼處理呢？

劇情圖片

小智終於回到了自己的家鄉，真新鎮。他在家裏意外的見到了老朋友小剛。小智和眾人來到大木研究所將GS球交給大木博士，火箭隊卻突然襲擊研究所。就在小智等人都被困住時，小茂回來了……

劇情圖片

小智和小茂開始戰鬥，小茂使用的未進化的伊布把皮卡丘擊敗了。戰後，小智從大木博士那裏得知了小茂前往城都地區挑戰寶可夢聯盟，決定也要前往。大木博士順便讓小智帶着GS球去檜皮鎮交給精靈球鑄造師鋼鐵。小建表示要留下來做大木博士的助手。小智、小霞和小剛再次一起開始了新的旅程。

劇情圖片

小智一行人來到了若葉鎮，前去登錄城都聯盟大會。因為負責登錄的喬伊去了空木研究所，小智也前去研究所。他們得知為新人訓練家準備的小鋸鱷被偷走了，於是前往搜尋。果然，犯人又是火箭隊三人組……

劇情圖片

開始新的旅程的小智一行人遇到了持有菊草葉的新人訓練家，奈奈。奈奈是一個棒球球迷，因為小智説了她所喜歡球隊的壞話而向小智提出挑戰。小智使用噴火龍輕鬆地擊敗了奈奈的三隻寶可夢。難過的奈奈被火箭隊挑釁，決定再和小智比一次，這實際是火箭隊的陷阱……

劇情圖片

小智在一片正在枯萎的森林中發現了一羣赫拉克羅斯，正當小智要收服它們時，森林警備隊的森男出現阻止了他。他告訴小智因為未知的原因，森林中的凱羅斯開始離開自己的領地而侵佔赫拉克羅斯的領地了。為了弄清這個原因，小智和森男前往調查。果然，這還是火箭隊在作怪。

劇情圖片

小智一行人在一座小山谷中發現了一隻年幼的頓甲。正當小智要收服它時，它的主人衣其小姐出現阻止了小智。知道這裏的頓甲有找尋瑪瑙的能力，火箭隊抓住了這隻年幼的頓甲。為了拯救頓甲，小智、小剛、小霞決定幫助衣其小姐。

劇情圖片

小智一行人在迷惑森林中迷路了，偶遇的小茂告訴他們要通過森林必須藉助咕咕的力量。小智追逐一隻咕咕來到租賃咕咕的鈴金的家。得知只剩下一隻無法獨當一面的咕咕，小智還是租了。這隻咕咕不僅不能驅散迷惑森林的幻覺，還很膽小。小智能否順利穿過森林呢？

劇情圖片

小智一行人來到了以街頭表演出名的東門鎮並決定要去看看錶演。他們看見了兩隻跳舞的美麗花。它們有一個動作一直做不好，小智想幫助美麗花的主人阿麗練習那個動作好參加鎮上的表演大賽。可是火箭隊仍舊屢屢妨礙小智等人。美麗花們能學會最後的動作嗎？

劇情圖片

來到圓絲蛛鎮的小智一行人被圓絲蛛的絲包裹了起來。小智從君莎那裏得知，有號稱“二代貓八”的怪盜在附近作案，而且君莎還邀請小智一起辦案。這時，一封犯罪預告書被發現，小智能否守護盜賊覬覦的寶物？

劇情圖片

小智一行人在天母鎮遇見了一隻有錢人家的布魯。在它的主人金婦的豪宅中，小剛發現布魯並不快樂。這時，火箭隊溜進了金婦的庭院。布魯似乎對喵喵的尾巴十分喜愛，一直咬着不放。為了把布魯送回主人手中，小智再度和火箭隊交手……

劇情圖片

小智一行人在鹿角鎮公園中看見了一隻受傷的小驚角鹿。小剛正要為它處理傷口，忽然一羣驚角鹿向小智一行人衝了過來。在警察局，小智一行人再一次看見鹿羣，不過小剛發現這只是小鹿造出的幻影。小剛治好小鹿，依依不捨地和小鹿分別。這時火箭隊卻盯上了小鹿……

劇情圖片

小智一行人在旅行的途中遇見了一隻野生的菊草葉。小智想要收服它，而且菊草葉也想向小智發出挑戰。這隻菊草葉一直不服輸，直到遍體鱗傷。小智急忙把它送到寶可夢中心。看見充滿鬥志的菊草葉，火箭隊也想將它納入自己的麾下。到底誰會得到這隻菊草葉？

劇情圖片

在吉花市的河邊，小智的GS球被野生的沼王搶走，正當好不容易奪回GS球的小智要收服沼王時，君莎逮捕了小智一行人，因為沼王對於吉花市來説特別重要。沼王只是喜歡拿走圓形物品，第二天這些物品都會在出現在河上。之後，GS球再一次被沼王搶走的小智決定跟蹤沼王一查究竟。

劇情圖片

小智一行人正要過一座橋，不料橋突然崩塌。他們正巧遇上芭瓢蟲的訓練家小誠，小智借用芭瓢蟲過了河。小誠也邀請小智觀看她的芭瓢蟲的工作，為果樹授粉。火箭隊出現搶走了小誠操縱芭瓢蟲的笛子，並擾亂芭瓢蟲使它們離開小誠。小智要幫忙找回芭瓢蟲。

劇情圖片

深夜趕到寶可夢中心的小智一行人受到了寶可夢護士——一隻熱情過度的幸福蛋的照顧。因為幸福蛋的手忙腳亂，小智餓着肚子睡覺了。同樣飢餓的火箭隊來到寶可夢中心偷食物，武藏驚訝地發現寶可夢中心的幸福蛋竟然是自己在寶可夢護士學校的同學。因此，幸福蛋幫着火箭隊搬運食物。第二天，當喬伊責怪幸福蛋偷食物時，火箭隊又帶着食物回來了。他們要幹什麼呢?

劇情圖片

小智一行人來到了桔梗市的一所寶可夢學校並向那裏的同學展示了自己的寶可夢。就當學生們要組織前往喇叭芽之塔參觀時，一名學生——小翔搶走了小智的精靈球並要收服皮卡丘。小翔被小智追上時，他把喇叭芽誤當成皮卡丘收服了。火箭隊再次來搶皮卡丘，卻被打飛至喇叭芽之塔。一個更大的陰謀在塔裏面誕生了。

劇情圖片

小智在前往桔梗道館的途中被火箭隊搶走了皮卡丘，桔梗道館的道館館主阿速救下了皮卡丘。來到桔梗道館，小智要面臨的是一場三對三的比賽，對手是想成為鳥寶可夢大師的阿速，小智會如何應對？

劇情圖片

小智一行人在河邊遇到一隻有主人的瑪力露，它十分愛哭。火箭隊開車前來捉走了皮卡丘和瑪力露，瑪力露因此大哭，而車子也在哭聲的影響下失去了控制。最終火箭隊一行被炸飛而瑪力露和皮卡丘也將落入河中，這時，小霞跟着下去救兩隻寶可夢，瑪力露的主人也趕到了。當小霞上岸時，她已不知道小智他們在何處了……

劇情圖片

在小智一行人在路邊午睡時，火箭隊駕駛着用他們全部積蓄造的怪怪阿柏號機器人向小智前進。在火箭隊出來休息時，小霞的波克比和一隻尾立溜進了機器人駕駛室並開啓了機器。小智和火箭隊都想阻止機器人的前進，結果皮卡丘和喵喵也進到了機器中，機器仍停不下來。眼見着機器人要駛向一座城鎮，小智他們能否讓機器人及時停下呢？

劇情圖片

小智在山谷中遇到了使用噴火龍的紀珂，紀珂要帶領小智一行人前往噴火龍山谷。小智的噴火龍載人飛行的能力不強，而且在噴火龍山谷之中又被裏面的噴火龍多次打敗。但是這樣，噴火龍似乎鬥志仍不減，它要留在噴火龍山谷鍛鍊自己以成為世界最強的噴火龍！

劇情圖片

小智一行人在陽光鎮的郊外遇到千紗小姐。千莎帶小智一行人回到家裏，並向他們介紹了向日花怪選美比賽。看到千紗想要派去參賽的向日花怪無精打采，小智決定幫助千紗，在喵喵的翻譯下，小智解決了向日花怪的心情問題。這下千紗能拿到選美大賽的優勝嗎？

劇情圖片

在一次和從補習班回家的少年的對決中，小智的菊草葉和對手的拉達都已受重傷，這時小智想換皮卡丘上場。菊草葉因此不高興了。寶可夢中心的喬伊試圖為菊草葉進行心理治療，但是並不奏效。菊草葉趁大夥兒睡覺時離開了，皮卡丘為了拉回它也跟了出去。外面既有兇暴的野生寶可夢，又有火箭隊的搜捕，小智的菊草葉能夠安全地被找回嗎？

劇情圖片

向檜皮鎮進發的小智一行人遇見了梓美和她的毽子草們並跟她來到了她的氣象小屋。在擊退火箭隊的騷擾後，梓美髮現一個大龍捲風向小屋吹來。龍捲風不僅破壞了小屋，還把毽子草吹散。小智一行人開始幫助梓美找回毽子草。

劇情圖片

小智一行人中了火箭隊的陷阱，就在這時，自稱天蠍人的男子和一隻天蠍救了他們。來到附近的天蠍鎮，小智在一家玩具店找到了天蠍人的扮演者阿永和他的女兒由香。阿永想讓由香承接他的天蠍人稱號卻被拒絕。火箭隊再次襲擊並困住了小智和阿永，這時，天蠍少女出現了……

劇情圖片

小智一行人在野餐時遇見了一羣咩利羊，並來到了咩利羊主人愛蓮的家。愛蓮的女兒香蓮想要參加寶可夢聯盟，但是愛蓮因為女兒太小而阻止。在放牧時，火箭隊出現搶奪咩利羊和皮卡丘，香蓮要在媽媽面前證明自己的實力而與火箭隊一戰。

劇情圖片

小智在森林中遭遇了巨鉗螳螂的偷襲，原來這是一位訓練家村正想確認小智的能力。來到村正的道場，村正希望小智能通過和兒子新吾戰鬥讓他了解戰鬥不是看着電腦整理資料。但是新吾卻自負地拒絕挑戰。火箭隊前來偷竊新吾的資料而被新吾打跑，這時新吾終於答應了和小智的戰鬥。一邊是用數據戰鬥，一邊是熱血沸騰的指揮，到底誰會贏？

劇情圖片

小智在森林裏聽説了森林中有火球鼠，就不顧一切地和皮卡丘一起搜尋起來。火箭隊造了一個鐵甲喵喵機器人前來捕捉皮卡丘，在火箭隊的追逐下，小智以外地發現了火球鼠。這時另一位訓練家要和小智爭奪火球鼠，而火箭隊也要得到火球鼠。到底火球鼠會歸屬於誰呢？

劇情圖片

小智一行人終於來到了檜皮鎮，這裏遭遇了大日照。跟隨而來的火箭隊為了找水挖到了呆呆獸之井，他們想捕捉這裏的呆呆獸。小智為了完成任務去找鋼鐵先生，卻被告知他去了呆呆獸之井，小智趕到呆呆獸之井，發現了一位被火箭隊打敗的大叔。小智再次和火箭隊交鋒了。

劇情圖片

小智一行人來到鋼鐵先生的家把GS球交給鋼鐵，但是鋼鐵先生也表示自己不知道這個球。此外，為了讓鋼鐵先生幫忙製作一些有特殊功效的精靈球，小智一行人隨千惠來到後山採摘球果。但在山上等着小智的是火箭隊的陷阱……

劇情圖片

小智終於來到檜皮道館進行挑戰，這間道館的道館館主是專攻蟲屬性寶可夢的阿筆。比賽開始，小智使用的他現在唯一的火屬性寶可夢火球鼠，但卻因它一直無法燃起鬥志而處於下風。面對強大的對手和無法攻擊的寶可夢，小智要如何作戰？

劇情圖片

進入櫟樹林的小智一行人看見了正在訓練大葱鴨的燒炭屋學徒尚人。因為不願聽從尚人的指揮使用居合斬，大葱鴨逃離了尚人，但是它又被火箭隊盯上了。瞭解了詳情的小智決定派出所有寶可夢幫忙尋找大葱鴨。大葱鴨能找到嗎？

劇情圖片

聽説了葉之鎮有寶可夢交換會，小智一行人決定去看一看。在那裏，小智贏得了肯泰羅大戰。他們新認識的訓練家阿德想和別人交換自己的果然翁，但是一直沒有人願意交換。與此同時，火箭隊在使用假的寶可夢交換機騙取訓練家們的寶可夢。果然翁能否成功交換？火箭隊的陰謀又會如何繼續呢？

劇情圖片

恰逢神奇寶貝消防大賽，小智也準備參加比賽。在賽前準備時他遇見了橘子羣島的拉塞爾和他的卡咪龜隊以及首次參賽的君莎和她的傑尼龜隊——小智的傑尼龜曾是它們的老大。傑尼龜們似乎很緊張，但只要有小智的傑尼龜指揮，它們就十分出色。為了傑尼龜隊的勝利，小智讓自己的傑尼龜重回傑尼龜隊，以幫助它們成為冠軍消防隊！

劇情圖片

小智一行人在烏波的保育園遇到了娜娜和她的烏波們。娜娜因為她的母親摔倒而要去醫院，將烏波暫時交給小智一行人照顧。好不容易將淘氣的烏波們帶到水池的小智等人發現還有一隻烏波沒有來，那隻烏波竟然跑進了森林，還偷吃了火箭隊的食物。火箭隊又動了搶奪的念頭……

劇情圖片

火箭隊想要過大巖蛇洞窟，他們準備搶奪小霞的寶可夢。胖丁突然出現並用唱歌，催眠了火箭隊和小智一行人，跟隨火箭隊的布魯也被催眠並塗鴉。生氣的布魯搶走了胖丁的麥克風，並追上了火箭隊。小智一行人看見難過的胖丁，決定幫胖丁找到麥克風。武藏和小次郎想留下布魯，害怕被咬尾巴的喵喵則賭氣離開火箭隊……

劇情圖片

小智在森林中休息時發現包包不見了，來到附近的城鎮，發現喬伊剛買的火腿也被偷了，而且兩個現場都有相同的腳印。為了找出小偷，小智一行人設了一個圈套。結果，那些小偷出現了，它們是戴魯比。

劇情圖片

小智一行人在釣魚時，一隻突然出現的小鋸鱷引起了小霞和小智的注意。兩人同時使用誘餌球扔向小鋸鱷，雖然抓住了它但是卻不知道那個精靈球屬於誰。為了公平地決出小鋸鱷的歸屬權，小智和小霞決定進行戰鬥，贏的人得到它。

劇情圖片

小智在一所寶可夢中心聽説有個強大的訓練家在找人挑戰，在一座橋的橋頭，他們遇見了那位使用盔甲鳥的訓練家。她的盔甲鳥輕鬆地擊敗了小剛的六尾，接着小智使用火球鼠向她挑戰，結果火球鼠一直處於劣勢。火箭隊的襲擊打斷了比賽。為了讓火球鼠變得更強，小智開始了特訓。

劇情圖片

小智一行人在湖邊休息時，小鋸鱷找到了一隻瑪力露麗，小鋸鱷十分喜歡瑪力露麗，但瑪力露麗並不喜歡它。原來這隻寶可夢是寶可夢演藝團的明星，不知因為什麼而常常逃跑。火箭隊盯上了這隻瑪力露麗，並把它和皮卡丘一起偷走了。為了救心愛的瑪力露麗小鋸鱷堅持追了下去。

劇情圖片

在櫟樹林中的小智一行人遇到了一直在試圖捕捉一隻顏色特異的貓頭夜鷹的阿酉。小智也想要捕捉這隻貓頭夜鷹，但是由於貓頭夜鷹太過聰明，小智根本無法抓住它。火箭隊聽到了這個消息，使用大型的機器人抓住了貓頭夜鷹。小智奮不顧身地將貓頭夜鷹救了出來，和寶可夢們合力打敗了火箭隊。被救出的貓頭夜鷹向小智提出了挑戰，在贏得挑戰後，小智成功收服了這隻異色貓頭夜鷹。

劇情圖片

小智一行人把所有的寶可夢放出來休息，卻被火箭隊全部抓走。這時，一大羣圈圈熊突然出現，暴走的它們意外地將被抓住的寶可夢解放出來，可是卻也氣勢洶洶地衝了過來。忙亂中，小霞和小次郎一起逃跑，武藏和小智、小剛呆在了一起。昔日的敵人在圈圈熊的追擊下要怎樣逃出森林並且和同伴匯合呢？

劇情圖片

小智一行人在森林中遇見一隻麒麟奇和它的訓練家傑莉。在進行對戰輸給小智後，傑莉帶着小智來到超能鎮，鎮上的居民都使用超能力屬性寶可夢驅趕鬼斯通。這時，小智他們聽説有一隻不怕超能力屬性的耿鬼正在朝鎮子移動，他決定和傑莉一起阻止這隻巨大的耿鬼。

劇情圖片

在寶可夢中心，小霞聽説了寶可夢占卜書的事，小智一行人隨即來到一家寶可夢培育屋購買占卜書。受占卜書的影響，小霞因為被指出屬於暴鯉龍而十分憤怒，就連襲擊的火箭隊三人組也被她的海星星打飛。撿到占卜書的武藏指出小次郎對應的寶可夢是火焰鳥，這使小次郎產生了極大的自信，他帶領武藏和喵喵前往搶劫培育屋，卻被同是火箭隊的亞馬多和小三郎抓住了。怒火未息的小霞來找培育屋詢問情況，她和小智、小剛發現了裏面的秘密，準備趁火箭隊內鬥時救走被騙的寶可夢。

劇情圖片

終於來到滿金市的小智一行人在看到道館休假的通知後，決定前往百貨公司。正當他們不知如何前往時，一位皮皮的訓練家，小茜熱情地為他們帶路。幾經周折後，他們終於到了百貨公司。小智救回被火箭隊偷走的皮皮後得知小茜就是道館館主，隨即向她挑戰。首戰滿金道館，小智在打倒小茜兩隻寶可夢的情況下，被小茜最後一隻寶可夢——大奶罐逆轉擊敗三隻寶可夢而告負。

劇情圖片

首戰失利的小智在道館館主小茜的帶領下來到一座大奶罐牧場，小智想要了解大奶罐以找出擊敗它們的方法。火箭隊在偷竊食物被阻止後，開動滾筒機器前來偷大奶罐。小智指揮寶可夢，用巧妙的戰術趕走了火箭隊。這時，小智似乎想到了什麼，他向小茜再一次發起挑戰。面對可以一挑三的大奶罐，小智真的有把握能贏嗎？

劇情圖片

小智因為獲得了標準徽章而受到滿金市的廣播電台的邀請，前往滿金電台進行廣播採訪。火箭隊也化妝為嘟嘟利堂的演員潛入收訊塔，並無意中破壞了廣播劇的錄音帶。小智一行人和火箭隊在廣播台的請求下幫忙重錄廣播劇。

劇情圖片

小智在自然公園聽説這裏在舉辦捕蟲大賽，於是也報名參加，他在裏面遇到了同樣參賽的奈奈。活力充沛的奈奈指揮菊草葉到處作戰，使得菊草葉十分疲倦，想要逃離奈奈，奈奈在小霞的教導下認識了錯誤。火箭隊抓住了小智和皮卡丘，為了救小智，奈奈的菊草葉開始進化了……

劇情圖片

朝緣朱市進發的小智一行人被河流擋住了去路，河上的橋樑正在修建無法通過。沿着河岸走，他們遇見了一位正撐着一隻船的老漁民。老人開出了條件：只要給他看樹才怪，他就送小智一行人過河。正在他們在山中搜尋那隻稀有的寶可夢——樹才怪時，他們看見了兩位研究人員在山上爭論樹才怪的屬性問題。小智加入了他們的研究並找到了一隻樹才怪，他們要親自弄清樹才怪是什麼屬性的。

劇情圖片

小智一行人來到了阿露福遺蹟遇到了大木博士，他的一位學生佐竹請大木博士來見證一個關於寶可夢化石的大發現：生活在史前的被認為已經滅絕的水屬性寶可夢其實一直存活至今。突然地，遺蹟內的研究設施的用水突然中斷了，小智等人發現原來這是火箭隊通過抽水捕捉菊石獸造成的。小智要保護這些稀有的化石寶可夢。

劇情圖片

在一座小鎮附近，小智救了一隻被大嘴雀追趕的波波。原來這是一隻波波店的波波，小智把波波送還給他的主人小渡。這時波波店收到傳訊，前往衝野島送藥品的波波還沒有到，小渡和小智一行人決定去調查，結果居然又是火箭隊在搗亂。

劇情圖片

為了躲避一場暴風雨，小智一行人跑進了一幢在山崖邊上的古堡。原來這是一間診療所，醫生安娜小姐運用寶可夢的能力為人們診療。小剛為了幫安娜，讓自己的超音蝠也利用超音波為病人做診療。闖入偷盜食物的火箭隊三人組被小智撞見，小智等人開始追火箭隊，小剛和安娜在追逐火箭隊的過程中和火箭隊一起落入古堡的地下迷宮。在機關重重的地下迷宮，小剛和安娜開始依靠超音蝠的力量尋找出口。

劇情圖片

看見了小智的妙蛙種子的戰鬥，一位格鬥道場的掌門看上小智的妙蛙種子的格鬥素質，想要讓妙蛙種子與孫女的戰舞郎決鬥，企圖點醒孫女格鬥術上的迷思。就在妙蛙種子與戰舞郎準備對戰時，士郎帶着飛腿郎來踢館。三兩下就被士郎的飛腿郎打倒，比賽就要分勝負時，火箭隊的出現打斷了比賽並使比賽延期。為了打倒飛腿郎，妙蛙種子與戰舞郎展開特訓。

劇情圖片

小智一行人在叢林的温泉放出所有寶可夢休息，正在玩球的菊草葉、火球鼠、小鋸鱷卻為了追逐滾出去的球，越跑越遠，到最後竟然迷路了。這時候火箭隊的武藏正在和小次郎與喵喵到處找温泉，無意中碰到三隻追球的寶可夢，以為温泉就在附近，一直跟在後面。結果火箭隊和三隻寶可夢誤進山洞而走失了。

劇情圖片

小智一行人來到了釣金魚王大賽，小智和小霞都報名參加了。小霞遇到了一位使用蚊香泳士的訓練家時夫，他的蚊香泳士欺負了小霞的蚊香君，還嘲笑小霞的寶可夢弱小。小霞咽不下這口氣，決定要在釣魚大賽中擊敗時夫。火箭隊也準備正式參賽。大賽結果會如何呢？

劇情圖片

小剛在檢查電子信箱時，發現送給自己六尾的寶可夢飼育家小雪要來參加一個寶可夢選美大賽。小剛決定把六尾還給小雪，並幫助小雪參賽。與此同時，火箭隊也準備參賽，只不過因為順序過後，再次出來搗亂。選美大賽會如何進展下去呢？

劇情圖片

因為吃了太多，小智突然覺得肚子痛。這時一位老人出現了，他給了小智幾顆藥丸。小智服用後立刻好轉了。小智等人來到這位自稱叫做壺壺老人的家中，發現他使用壺壺來製藥。小智得知顏色不同的壺壺可以做出神奇的藥，他決定跟隨老人的喇叭芽波奇一起尋找壺壺。

劇情圖片

小智一行人在途中遇見了小茂，小茂的伊布已經進化成月亮伊布了。在來到一家寶可夢中心不久後，小智所在的城鎮突然停電。仔細調查後發現是火箭隊佔據了發電廠才會使鎮上電力都消失了。為了使城鎮恢復供電，小茂第一次決定與小智合作。他們能擊敗火箭隊的新型機器人嗎？

劇情圖片

小智一行人在途中遇見了一個男孩士郎和安瓢蟲，他是森林巡邏隊的見習生。這時火箭隊突然出現把波克比和皮卡丘抓走了。士郎和小智在強風中拼命追逐火箭隊，他們有辦法救出波克比和皮卡丘嗎？

劇情圖片

小智一行人在森林中用午餐時發現了一隻果然翁，他們下意識地開始尋找周圍是否有火箭隊，結果有一大羣果然翁出現了。原來他們來到了果然翁之村，當天正是果然翁的慶典。擁有果然翁的火箭隊也受到了熱情的招待。這時，有三個不良青年來搗亂，可是根據習俗，村子裏在慶典當天不能進行寶可夢對戰。正當他們大肆搗亂而小智一行人束手無策時，火箭隊自願打破規則與三人對戰。

劇情圖片

小智一行人在寶可夢中心再次遇見了百變怪的訓練家伊美蒂，得知她現在已經有第二隻百變怪了，被她稱作百變瓢。不過這隻百變怪的變身後的大小一直保持原樣。看見這隻百變怪，火箭隊又想到了一個陰謀，他們要偷走這隻百變怪。小智他們能夠破解這個陰謀嗎？

劇情圖片

在河邊休息的小智一行人看見河對岸金婦的布魯跑了過去。接着，小智一行人遇見了金婦和她的僕人。金婦為了找布魯而外出旅行，無意中身體變得十分強壯。布魯找到了火箭隊的喵喵並咬了它的尾巴，聽到喵喵説它討厭布魯後變得無精打采。小智和金婦找到布魯並來到寶可夢中心，布魯在診療時逃跑。等小智再次找到布魯時，它已經進化了。

劇情圖片

正在湖邊休息的小智和小剛突然聽到去散步的小霞的尖叫聲，他們立刻趕了過去。原來是一片灌木叢中藏着一隻阿利多斯。然後，淺紅道館道館館主阿桔的妹妹阿雅正在這裏訓練。跟隨阿雅，小智一行人來到寶可夢忍術學園並且獲得了試入學一天的招待。寶可夢忍術到底是什麼呢？

劇情圖片

小智一行人遇見了小廣和他的蜻蜻蜓。小廣和他的蜻蜻蜓感情非常好，但是蜻蜻蜓常惡作劇把鎮上的玻璃都震碎，這讓家裏開玻璃店的小廣傷腦筋。在鎮上居民和他父親的勒令下，小廣將蜻蜻蜓放歸野生環境。沒想到火箭隊把他放歸野生環境的蜻蜻蜓帶走並且利用它來破壞玻璃，再從中謀利。到底小智等人有辦法把蜻蜻蜓搶回來嗎？

劇情圖片

在去緣朱市的途中，小智一行人看見了很多草屬性寶可夢，並且遇見了一位使用毽子花的少年，小實。小實提出請求讓小智和他對戰，但是輸給了小智。小實邀請小智一行人到家並告訴他們草屬性寶可夢錦標賽的事。興致勃勃的小智也打算參加，並且是以冠軍為目標。在大賽上，實力強勁的小智幾乎是以壓倒性的實力打敗對手進入決賽，最終戰上，他的對手竟然是前一天敗給自己的小實。小實和毽子花並沒有放棄，而是奮力一搏。

劇情圖片

小智一行人來到一處果園。沒想到果園主人安珠誤以為皮卡丘是偷水果的小偷，幸好小智等人查出原來是皮丘們餓的受不了才偷吃。小智想辦法讓皮丘們能在果園中幫安珠的忙。此時，火箭隊又跑出來想把果園中全部的水果搶走。皮丘們勇敢地跑出來要保護果園。到底小智他們有辦法阻止火箭隊的計劃嗎？

劇情圖片

小智一行人突然受到火箭隊的攻擊，雖然勉強把火箭隊給趕跑了，但是這時波克比卻不見了。只留下波克比和神秘的寶可夢的腳印。到底小智等人有辦法找回波克比嗎？

劇情圖片

小智一行人抵達緣朱市後，小智直奔緣朱道館，但是他們竟然迷路了，把燒焦塔當成道館冒然闖入。突然間小智看見塔內燃起大火，原來這是塔內的鬼斯和鬼斯通在作怪。這時，使用耿鬼的道館館主松葉救出了小智一行人。尾隨而至的火箭隊搶走了皮卡丘和波克比，正在逃跑時被耿鬼打敗。皮卡丘和波克比被成功救下。

劇情圖片

小智在緣朱市道館的比賽開始了，緣朱道館的道館館主松葉的寶可夢是難纏的幽靈屬性寶可夢。雖然打敗了對手第一隻寶可夢鬼斯，可是火球鼠和皮卡丘卻一個一個被打倒。只剩下最後一隻貓頭夜鷹，面對王牌——耿鬼未出，還有兩隻寶可夢可用的松葉，小智仍然堅持不到最後關頭絕不投降，他的堅持還能持續多久呢？

劇情圖片

在匆匆吃完飯後，小霞注意到一張海報上寫着正在舉辦一個茶道會。這時，她發現了一隻伊布，伊布的主人櫻花隨即趕來。茶道會就在櫻花的家中舉辦，櫻花也邀請三人蔘加。在茶道會上，小霞瞭解到櫻花和自己一樣是姐妹中的幺妹，而且櫻花想和小智等人一起旅行並希望小霞跟姐姐求情。櫻花最後加入了小智的隊伍嗎？

劇情圖片

小智在休息時整理自己的徽章，這時三隻黑暗鴉出來似乎在為小智等人表演。突然間，黑暗鴉從放鬆警惕的小智旁搶走了他的三枚徽章。好不容易得來的徽章被搶走，小智在後面拼命追趕，可是狡猾的黑暗鴉總是能躲過。就在小智的皮卡丘電擊命中擊落黑暗鴉時，火箭隊又出現了。小智能否順利拿回徽章？

劇情圖片

小智一行人在旅行的途中發現天空出現了不可思議的景色，據説這種現象是好幾年才會出現一次的。為了解開這個謎，小智一行人和旅行家蘆谷先生決定前往那片天空下的鐵炮池調查。在這片天空下的荒地裏，住着一羣沒有水也能生存的鐵炮魚。跟隨而至的火箭隊又出現了，並且想把鐵炮魚一次抓走。小智他們能保護鐵炮魚羣的棲息地不被火箭隊破壞嗎？

劇情圖片

小智一行人在一片森林中前進，他們聽説了森林中存在特別兇惡的寶可夢。夜晚，小智一行人在一間無人小屋睡覺，他們聽到屋外的聲響而出門查看，回來後小霞發現牀上有一隻熊寶寶。被熊寶寶可愛的外表迷惑，小霞留下了它。跟隨小智一行人的熊寶寶，不停地偷吃他們的食物，還栽贓給小智的寶可夢們。因為熊寶寶有着可愛的外表，小霞深信不是它乾的。最終，小智一行人發現了熊寶寶的作案現場……

劇情圖片

在前往淺葱市的路上，小智一行人和他們的老朋友，攝影師阿徹相遇了。阿徹告訴小智他想抓拍一隻傳説中的寶可夢，急凍鳥。這時，從天空突然落下來一大塊冰塊，冰塊裏面是一隻凍僵的向日種子。為了救向日種子，小智將其帶到了附近的一家旅館。這家店的老闆和老闆娘每年的結婚紀念日都會和一大羣向日花怪拍紀念照，而這一天正好是他們的金婚紀念日，但是因為氣候，向日花怪已經找不到了。小智和阿徹決定找回向日花怪，並幫夫婦倆拍金婚紀念照。

劇情圖片

隨同小徹尋找急凍鳥的小智一行人在吃午餐時，三隻小山豬突然出現並吃了小霞的食物。這三隻小山豬是温泉專家樹男用來尋找温泉的，不知怎麼的小山豬最近一直無法準確定位温泉的方向。想要泡温泉的武藏搶走了小山豬並也想用它們找到温泉，她會得逞嗎？小智和樹男能救出小山豬嗎？

劇情圖片

小智一行人追尋急凍鳥來到白雪山，他們發現了被凍成冰塊的胖丁。把胖丁救出來後，小智一行人帶着胖丁一起尋找急凍鳥，他們先來到了當地的寶可夢中心。另一邊，想要在山上設陷阱的火箭隊被暴風雪困在山上，之後被急凍鳥送至寶可夢中心。小智從君莎口中得知急凍鳥的傳説，決定和阿徹前往拍攝。聽到這個消息的火箭隊尾隨其後。最終，小智和阿徹在暴風雪中的山路盡頭被急凍鳥所救，火箭隊也趁機開始捕捉急凍鳥……

劇情圖片

小智一行人在山間行走時突然遇到岩石崩塌。千鈞一髮之際，三隻風速狗和它們的主人救了小智一行人。風速狗的主人小遙和小裕正要前往前方的城鎮，遞送作為第二天舉行的火屬性寶可夢錦標賽優勝者獎品的火之石，得知小智與他們順路，還好心地提出載小智一程。就在他們途中休息時，火箭隊偷走了火之石。為了答謝小遙和小裕，小智一行人幫忙要奪回火之石。

劇情圖片

小智一行人在草叢中遇見了一位正在尋找土龍弟弟的少年小翼，聽説因為在其所住的城鎮發生土龍弟弟的大量出現時他恰好在外探親，所以現在鎮上的孩子就只有他沒有土龍弟弟。小智一行人決定幫助小翼找到一隻土龍弟弟。正在他們剛剛找到之際，火箭隊出現了。在第一次搶奪小智的寶可夢被打飛後，火箭隊改變了目標，他們要把孩子們的土龍弟弟全部偷走。小智一行人及孩子們能夠防止火箭隊偷走寶可夢嗎？

劇情圖片

去淺葱市途中的小智一行人再次遭遇火箭隊的埋伏，皮卡丘被裝進了一個只有用鑰匙才能打開的堅固橡膠盒子裏。小智雖然搶到了裝皮卡丘的盒子，打開盒子的鑰匙卻在不小心落水而不知去何處的果然翁身上。兩邊都開始尋找果然翁。但是每次被找到時，果然翁又莫名其妙地走遠了。這一場追逐賽會是哪一方勝利呢？

劇情圖片

小剛突然生病病倒了。小智和小霞為了慎重起見，決定停下來紮營來照顧小剛。但是煮飯、洗衣、照顧寶可夢這些平時小剛做的工作對小智和小霞來説既多又麻煩。正當小智手忙腳亂時，火箭隊又跑來偷襲小智他們。小智和小霞能夠度過難關撐到小剛痊癒嗎？

劇情圖片

小智一行人來到了一個小村鎮，從當地的訓練家口中得知這裏第二天要舉辦一個“寶可夢相撲大賽”。聽到有大賽舉辦的小智立刻決定要參賽。為了滿足大賽的要求：參賽寶可夢體重必須超過80kg，小智從大木博士那裏傳送來了卡比獸。首次參賽的小智會獲得怎樣的成績呢？

劇情圖片

向淺葱市前進的小智一行人經過一座山嶺時，皮卡丘突然變得無精打采。這時，一位自稱能和寶可夢交流老先生，藍賈先生告訴小智皮卡丘的電力被山體吸取了。藍賈帶小智來到他的小店並提供給他自行車式發電機給皮卡丘充電，並答應不收小智的費用。之後君莎趕來準備以欺詐罪逮捕藍賈，這時他們遭到了煙霧彈襲擊。煙霧散去後，藍賈不見了。藍賈到底能不能和寶可夢溝通？他是個壞人嗎？

劇情圖片

小智一行人在休息時，小剛的大嘴蝠不知為何飛走了。追着大嘴蝠，小智一行人發現了一位考古學家小夏正在調整一台儀器。得知小夏在尋找一座地下神殿中的黃金面具和錫杖，小剛幫忙修好了儀器，還派出大嘴蝠定位了地下神殿的位置。偷聽到此事的火箭隊搶先一步挖進神殿，武藏帶上面具並手持錫杖，她似乎獲得了控制寶可夢的能力。小智一行人和小夏進入神殿後，武藏控制了小智的皮卡丘和小剛的小拳石、大巖蛇，但無法控制大嘴蝠。小智一行人只能依靠大嘴蝠的力量，他們能救回寶可夢嗎？

劇情圖片

小智一行人來到了一座建築物全是用白色石灰石建成的小鎮，這裏有三隻圖圖犬正在到處塗鴉。正在居民誤以為小智一行人是圖圖犬的主人而要求小智賠償時，圖圖犬的訓練家，一位老人出現並答應了賠償。前來的記者認出了這位老人就是藝術家卡斯巴斯奇亞先生。跟隨老人來到家中，小智一行人得知卡斯巴斯奇亞希望圖圖犬再作出一幅奇蹟般的畫，這個機遇什麼時候才能來臨？

劇情圖片

小智一行人來到了某個沒有寶可夢中心的城鎮，他們準備在當地的公園裏面露營。就在小剛在公園取水時，一隻尼多娜過來飲水，隨後追來的女訓練家被石頭絆倒。就在她摔倒之際，小剛救了她。另小智和小霞意外的是，這個女孩姬香對小剛一見鍾情，還邀請大夥兒來她家用晚餐並住宿。頭一次被女生追求的小剛能夠把握機會嗎？

劇情圖片

小智一行人在一片山坡上休息，並且放出了他們的寶可夢。小智帶着菊草葉出去散步，他們來到一間門開着的小屋。好奇的小智剛帶着菊草葉進去，門就關上而且再也打不開了。皮卡丘聞聲而來，跟隨而至的小霞和小剛幫忙去找管理員。同時小智準備和菊草葉一起前往地下室三層尋找控制室。他們能夠順利逃出這間無人密室嗎？

劇情圖片

小智一行人在小溪旁的平地上休息並準備午餐，小智放出了所有寶可夢。由於看到小智過於激動，月桂葉幾次不小心地使用了撞擊將小智撞倒。吃飯前，小智怕被月桂葉撞翻了飯菜而叫月桂葉離開。可是吃完飯後，小智怎麼也找不到月桂葉了。另一邊，春奶奶救下了因為傷心而落水的月桂葉並將它留在自己的草藥園。小智能否找回月桂葉？他會怎樣來取得月桂葉的喜愛？

劇情圖片

小智一行人遇到了叫伊莎米的少年，他想以寶可夢雜耍等其他方面為目標而不斷努力。但是他的個性很內向，因為自己的天然雀訓練不出預測未來的能力而對於公開表演更加沒有信心。這時火箭隊又出現了，並且把伊莎米的天然雀搶走了。小智到底能否幫伊莎米把天然雀搶回來呢？伊莎米又能否大膽的在觀眾面前表演呢？

劇情圖片

小智一行人在旅途中遇見了正在做熱氣球練習的小飛，並隨小飛來到家中，還見到了他的父親天馬。得知第二天有一個熱氣球大賽，小智急着要參加，天馬借給小智一個皮卡丘樣式的熱氣球。另外，火箭隊的喵喵得知消息後，向武藏和小次郎提出了要堂堂正正地用熱氣球決勝的要求，武藏、小次郎嘴上答應了，卻仍然揹着喵喵下手了。這場比賽會因火箭隊和小智一行人的加入發生什麼事件？

劇情圖片

小智一行人來到某座城市，他們看見有一羣女孩在追人，這時，一名穿着神秘的男子跑過來讓小智替他暫時保管一個包裹，然後就被女孩們追着逃走了。包裹自己打開了，裏面竟是一隻寶可夢迷唇娃。小智要幫迷唇娃找到那位訓練家，布萊得比德。他們來到一座劇場，那裏即將進行布萊得比德的見面會。可是就當他們要把迷唇娃還給比德時，卻遭到了經紀人的阻撓。這是怎麼回事呢？

劇情圖片

小智一行人在湖邊露營，小智醒來時看見一隻鑽角犀獸在水中游泳，當小智叫大夥來看時，鑽角犀獸已經消失。接着，他們來到一座巖山附近並遇見一位女孩。她要在巖山中開穴道。可是在穴道最裏面會有滲水使得普通的地面屬性寶可夢無法工作。她拼命地追逐那隻不怕水的鑽角犀獸，小智他們也幫忙捕捉，沒想到火箭隊又出現了，還把鑽角犀獸給搶走了。到底小智他們能成功捕捉鑽角犀獸嗎？

劇情圖片

小智一行人來到一座飛行船總站，一艘巨大的豪華飛行船曼德布魯號剛剛在這裏降落。船上有人尋找寶可夢的醫生，身為飼育家的小剛自願前往。找醫生的是兩位年輕富有的小姐，她們的變隱龍在小剛的照顧下很快康復了。這時，跟隨而來的火箭隊盯上了船上的財物。小智一行人能否阻止火箭隊的惡行？

劇情圖片

小智一行人來到了以治療水屬性寶可夢聞名的新玉池，小霞對這裏寶可夢中心的喬伊小姐十分崇敬。和喬伊進一步交流後，小智一行人驚訝地發現這裏的喬伊竟然十分討厭水屬性寶可夢，這令小霞大失所望。這其中有什麼原因？不敢觸碰水屬性寶可夢的喬伊如何治療它們？

劇情圖片

在前往淺葱市的路上，小智一行人再次遭遇了火箭隊的襲擊，皮卡丘被抓住，小次郎放出雙彈瓦斯使用煙幕逃走。小智派出火球鼠並點燃了煙幕，皮卡丘被救回但火球鼠和火箭隊都被炸飛。小智趕到寶可夢中心，當地的喬伊告訴他傳説沙漠中有塊可以治療寶可夢的綠洲，受傷的寶可夢會自己回到訓練家身邊。不放心的小智還是跑去尋找那片傳説中的綠洲。在沙漠的深處，受傷的火球鼠和喵喵被三地鼠帶走了，它們來到的是一片到處是寶可夢的綠洲……小智能否找回火球鼠？火箭隊又會引發什麼麻煩？

劇情圖片

終於來到了淺葱市，小智立刻奔向道館。來到道館的他遇到了一位自稱道館館主阿蜜的女生，於是道館挑戰立刻開始。對方的大巖蛇似乎不怕水槍，小智的小鋸鱷很快敗下來。就在小智派皮卡丘上場時，真正的道館館主阿蜜來了。她告訴小智暫時不能進行對戰。這是怎麼回事呢？

劇情圖片

來到湛藍市後，小智一行人先幫可夏取得了電龍的藥品，接着小智要去挑戰湛藍道館了。在海岸邊，他們看見了一位和豪力對打的中年男子，聽説小智要去湛藍道館挑戰，就跑着步帶小智一行人去。原來這位大叔就是湛藍道館的道館館主阿四。面對格鬥類型的道館，小智會如何應戰？

劇情圖片

小智一行人在船上和火箭隊開始了戰鬥，雙方都被炸飛。落入海中的小智一行人雖然放出了水屬性寶可夢，但是強大的漩渦還是讓他們無法前進。這時，他們被太陽珊瑚和毒刺水母救上了一艘船。在船上，小智一行人遇見了路過的空木博士。乘船來到青巖島的庫加市，他們從空木博士那裏瞭解到了漩渦島杯的水屬性寶可夢比賽，小智和小霞都決定參賽。

劇情圖片

以漩渦島大賽為目標，展開漩渦島之旅的小智一行人途中遇到叫做飛太的青年，並得知了大波波島的事情。這個島上生活着體型是普通的三倍以上的巨大波波，因為體型過大它們已經失去了飛行能力。在這不可思議的島上，到底發生什麼事了呢？這些波波中有一隻正常的波波，它似乎並不甘願失去飛行能力，它要朝着太陽，飛向從未有寶可夢到達的高空。

劇情圖片

前往芝拿鎮的小智一行人乘纜車到達青湖。幸運的他們趕上了島上一年一度的燈籠魚的遷徙活動，燈籠魚要從大海中回到山中的出生地產卵。小智一行人和阿義及他的父親一起護送燈籠魚前進，結果還是遇見了火箭隊。在一陣騷動後，火箭隊被趕跑，但是小智與阿義和其他人在混亂中分開了。他們能否將燈籠魚送抵目的地？

劇情圖片

來到黃巖島的美奇市的小智一行人在海邊看見了一棟被海浪衝走的屋子，上面困住了一位小女孩。小智一行人奮力救下了小女孩，之後她的家人趕到。原來這是一個建在太陽珊瑚巢穴上的屋子，最近因為有一隻新的太陽珊瑚出現，把其他的太陽珊瑚全嚇跑了，房屋才滑入海中。於是，小智一行人開始幫忙尋找失蹤的太陽珊瑚們。他們把所有太陽珊瑚找回嗎？

劇情圖片

小智一行人錯過了開往赤巖島的通訊船。就在他們準備去寶可夢中心時，他們遇見了一位叫露佳的女子。露佳答應開船送小智前往赤巖島。在船上，小智注意到了露佳船上的尋寶圖，原來這是銀色羽毛的所在地。得知尋寶地點的小智急不可耐地要前往尋寶。而偷聽到他們對話的火箭隊也準備跟隨小智以搶奪他們找到的寶藏。小智能順利找出並拿走寶藏嗎？

劇情圖片

小智一行人終於來到漩渦島大賽的舉辦地——赤巖島。這地方爆滿了像小智等人一樣過來挑戰的寶可夢訓練家。第二天大賽的預賽就要開始了，鬥志高昂的小智等人不知背後有可疑的黑影在追蹤他們。後來才曉得，這出現在小智等人面前的可疑人物，原來是寶可夢訓練家八郎，他卻提出拜託小智等人陪他打一場的要求。比賽結束後，他的鐵炮魚如願以償地進化成了章魚桶。

劇情圖片

漩渦島杯比賽的決賽終於拉開了序幕，小霞和小智分別要面對強大的對手。為了湊夠兩隻水屬性寶可夢，小智從大木博士那裏傳來了巨鉗蟹。小智第一場比賽的對手派出了刺龍王，面對強大的龍屬性，小智的小鋸鱷該如何應戰？小霞第一場則是對戰經驗豐富的訓練家張造，她能否贏得比賽？

劇情圖片

贏得漩渦島杯比賽的決賽第一場比賽的小智和小霞竟然在第二場比賽中相遇了，同樣直指冠軍的兩位好友在比賽場上也當仁不讓。在小智的第一隻寶可夢小鋸鱷輸給了小霞的蚊香君後，小智只剩下巨鉗蟹，他會如何應對這位最熟悉的對手？另外，火箭隊看上了麻亞手中的“大海之魂”的寶珠，還發犯罪預報給主辦方，他們能否偷走“大海之魂”？

劇情圖片

結束了漩渦島杯比賽的小智一行人要前往鯧魚鎮以返回淺葱市，走在路上的他們落入了陷阱之中。就在一旁的火箭隊得意地前去查看時，卻也掉進了陷阱中。這時一位女生出現救起了大家，並向小智一行人道歉，她希望小智一行人和火箭隊能幫她一個忙。因為有大餐作為獎勵，所有人都答應了。來到地鼠之村，小智和火箭隊得知原來這個村子用來耕作的地鼠被小偷盯上了，村中只有老年人，所以才請訓練家們來幫忙趕走小偷。火箭隊這次也決心要認真幫助村子，他們和小智一行人的合作會怎樣呢？

劇情圖片

小智等人之前在海底的沉船中發現了銀色之羽，後來到了銀巖島的卡沙多市後，看見林立街頭的土產店都在販賣小島的特產，銀色之羽商品。途中，小智等人遇到了飾品店老闆百合子，而到她的店裏參觀。店中排列的許多美麗裝飾品都是用只有銀巖島才能採集得到的銀岩石做的。據説用這種石頭做出的裝飾品有護身符的作用。島民們深信的銀色之羽，到底隱藏着什麼樣的力量？

劇情圖片

小智一行人追蹤傳説的寶可夢而來到衝島，他們遇見了小智的勁敵——同樣來衝島的阿弘，並和他一起搜尋那隻寶可夢。他們見到了一位海邊的少年修一，他表示不知道傳説的寶可夢，可阿弘覺得修一在遮掩什麼。另一方面，火箭隊的南波博士也在策劃一個針對傳説的寶可夢的陰謀。這隻神秘的寶可夢到底是什麼？

劇情圖片

火箭隊的亞馬多和小三郎抓走了小銀。因為找不到自己的孩子，大的洛奇亞開始暴走並威脅到了漩渦島的城鎮。為了拯救城鎮，小智盡全力説服了洛奇亞並和它定下約定，一定把小銀救出來。少年們開始搜索火箭隊的藏身處。武藏和小次郎想和亞馬多等搶功勞，也打算潛入基地破壞。小銀能否獲救？

劇情圖片

小智一行人和阿弘決定盡他們最大的能力從火箭隊手中救回小銀，但是被火箭隊打敗而關進了秘密基地中。沒有被抓的修一決定獨自前往救援大夥兒，他剛從秘密基地的通風管道潛入基地內部時，就被火箭隊的隊員發現並抓住了。就在危險關頭，武藏和小次郎出現並帶走了修一。在小智這邊，南波博士驕傲地將計劃告訴給了小智一行人，並要向他們展示打敗他們的裝置，他要用小智的皮卡丘做實驗。小智一行人的命運究竟如何？和洛奇亞的約定還能否實現？

劇情圖片

為了返回淺葱市，小智一行人來到赤巖島的鯧魚鎮。在這裏，小智和淺葱道館的阿蜜約好第二天戰鬥。可是小智卻錯過了當天的最後一趟定期船。在一位老人口中，他們得知有一家叫做咕咕航空的航空公司可以幫他們前往淺葱市。 他們到那時，才發現剛才告訴他們消息的老人竟然就是航空公司的飛行員，飛鷹。在小智一行人的幫助下，飛機勉強起飛。他們剛起飛不久，才發現已經進入了一片暴風雨區域，而不遠處，火箭隊三人組的氣球也被困在了烏雲中並且向飛機求救。飛鷹讓小智把火箭隊救上了飛機。在小智一行人以及他們的寶可夢的協助下，飛機終於降落在了淺葱市。

劇情圖片

小智正準備前往淺葱道館挑戰時，途中遭遇了火箭隊的巨大果然翁機器人的襲擊。在危難關頭，阿蜜的大鋼蛇出現並救下了被抓住的皮卡丘，摧毀機器人並趕走了火箭隊後，小智隨即和阿蜜前往道館進行比賽。比賽是2對2的形式。阿蜜首先派出了小磁怪，小智則派皮卡丘上場，並且憑藉速度的優勢擊敗了阿蜜的小磁怪。阿蜜接着派出了第二隻寶可夢——大鋼蛇。皮卡丘很快被對手的鐵尾命中而落敗。只剩下一次機會，小智派出了可以剋制鋼屬性的火球鼠。雖然屬性上佔優勢，但大鋼蛇憑藉沙暴接挖洞的戰術防禦噴射火焰的同時予以反擊，使得火球鼠一直處於被動。小智要如何打破對手的戰術，贏得這枚徽章呢？

劇情圖片

小智得到了大木博士一個奇怪的請求：大木博士實驗室的部分寶可夢似乎在互相爭鬥，而大木博士無法平息它們的紛爭。在知道小智的妙蛙種子有豐富的調解寶可夢的經驗後，大木博士請求小智傳送妙蛙種子。雖然妙蛙種子到後很快就平息了紛爭，但只要它離開，爭鬥又立刻開始。小智是否捨得與陪伴他時間最久的一個夥伴分開呢？

劇情圖片

以卡吉鎮為目標的小智一行人再次來到了緣朱市。小霞和櫻花約好了再次見面。櫻花的伊布已經進化為太陽伊布了。因為櫻花的姐姐們要去一位來緣朱市的舞蹈家那裏上課，只好由櫻花招待大家。櫻花提出了要和小霞戰鬥的請求，小霞接受了挑戰。櫻花的四位姐姐在舞蹈家處學習，但這兩位舞蹈家竟然是火箭隊的武藏和小次郎。他們的目標是抓住所有的伊布進化形還有皮卡丘，他們會得逞嗎？

劇情圖片

小智一行人聽到了鈴鐺塔上傳出鈴鐺的聲音而前去調查，他們巧遇了緣朱道館的道館館主松葉和他的好友水京。松葉和水京發現鈴鐺塔頂層的透明鈴鐺被盜了，這些鈴鐺只會在鳳王來到時響起。盜走鈴鐺的原來又是火箭隊三人組，他們想利用透明鈴鐺召來鳳王。因為一直無法使鈴鐺發出聲音，武藏失手打碎了一隻鈴鐺。這時，森林裏的所有寶可夢開始躁動，它們開始大舉向緣朱市進攻，並用吐絲將所有建築包裹起來。小智和松葉要如何化解這場災難呢？

劇情圖片

小智一行人在前往卡吉鎮的途中再次遇見了小茂，他正在和他的風速狗為一個比賽而練習。小智決定他也要參賽並贏過小茂。他從當地的寶可夢培育屋主人那裏得到了比賽用的繮繩，並開始和月桂葉一起進行訓練。這時，火箭隊來到培育屋企圖搶走培育屋的蛋。小智和月桂葉配合將蛋奪回，並且找到了比賽的感覺。第二天，寶可夢競速賽開始，宿敵之間再次針鋒相對，到底誰能獲得勝利？

劇情圖片

小智一行人在一家寶可夢中心休息，當他們醒來時，小智注意到他之前在培育屋得到的寶可夢的蛋不見了。正在小智等人為尋找蛋焦急萬分時，喬伊請來了自稱名偵探的君莎幫忙。但是君莎看似自信十足的推理卻根本沒有任何幫助，不過誤打誤撞地撞見了來寶可夢中心偷食物的火箭隊三人組。蛋是被火箭隊偷了嗎？

劇情圖片

經過漫長的孵化過程，小智的寶可夢的蛋終於孵出了寶可夢——小小象。就在這時，火箭隊出現想要搶奪了小小象。就在小智救小小象的過程中，小小象被皮卡丘誤傷而逃走。小智一行人開始尋找小小象。

劇情圖片

正前往卡吉鎮小智一行人再次路遇火箭隊的襲擊。按照慣例，火箭隊被打飛。因為多次失敗，火箭隊三人組開始反思失敗的原因，最終還是得出是實力的原因，他們打算抓大量的寶可夢來擴充實力。這時，他們遇見了火箭隊的挖角人員並被勸説加入火箭隊，感到莫名其妙的武藏和小次郎發現他們竟然已經被火箭隊的名冊中開除了。於是，他們決定為了再次加入火箭隊，再次向小智一行人下手。

劇情圖片

小智一行人在經過一個山谷時，遇到了濃霧而一時迷路了。就在他們不知去向何處時，一位帶着九尾的少女來到並邀請眾人前往她的家宅。少女熱情的招待他們並邀請小剛留下來照顧這份家業。可是小智和小霞通過種種跡象覺得這位叫洛珂的少女十分蹊蹺，但被其深深吸引的小剛絲毫沒有懷疑。濃霧中的豪宅究竟有什麼問題？

劇情圖片

剛剛從洞窟穿越斯里巴吉山的小智一行人剛出洞口就遇見了一隻無畏小子。無畏小子痛過惡作劇搶走了小剛的寶可夢食物。就在小智試圖搶回食物時，空手道王信彥出現了。信彥是湛藍道館道館館主阿四的弟子，現在在外修行。他向小智一行人介紹了無畏小子惡作劇的情況，並想要得到這隻實力強勁的無畏小子。這時，無畏小子再次在附近的農場惡作劇。周圍的居民已經無法忍耐。小智一行人和信彥要如何解決這個問題？

劇情圖片

小智一行人在路上誤和火箭隊一起落入了火箭隊挖的陷阱中，從而意外地來到了地下的一處隧道。他們遇見了一位天然鳥的占卜師問天，並觀看了天然鳥占卜的過程。但是天然鳥的對於天氣的占卜能力似乎並不好。雖然如此，天然鳥關於第二天會有特大洪水襲來的預言仍另問天擔憂。面對發生洪水極低的可能性，問天、小智一行人和火箭隊會如何行動？

劇情圖片

在前往卡吉鎮的途中，皮卡丘和波克比突然變得十分虛弱。正在疑惑的小智一行人突然發現了不遠處的憤怒之湖中有一隻紅色的暴鯉龍也顯得不對勁。之後，一羣火箭隊的隊員趕到，企圖捕捉暴鯉龍並抓住發現他們的小智一行人。這時，寶可夢搜查官，關都四天王的冠軍阿渡登場並救了小智一行人。阿渡給小智指出去卡吉鎮的路，並讓他不要再回來，接着他孤身一人潛入了火箭隊的內部。對紅色暴鯉龍放心不下的小智，還是下定決心，要把被火箭隊抓走的暴鯉龍救回來。他們能成功嗎？

劇情圖片

小智一行人救援失敗並被火箭隊關在了基地的牢籠中。正當他們無計可施的時候，負責看管他們的武藏和小次郎想要乘機搶奪皮卡丘，卻被小智利用機會逃了出來。阿渡趕到，並讓快龍將火箭隊的這個基地摧毀。阿渡帶着小智一行人去追試圖將紅色暴鯉龍運回火箭隊總部的辰己一干人。在小智和寶可夢的奮戰下，終於救下了紅色暴鯉龍。但是身心受創的暴鯉龍大發雷霆，開始暴走而大肆破壞。趕走了火箭隊的阿渡和小智要在暴鯉龍到達卡吉鎮前阻止它。

劇情圖片

小智一行人終於來到了卡吉道館，卻發現大門緊鎖。門口遇見的大媽西瑪告訴他們道館館主柳伯在郊外瀑布下修行，並帶小智一行人去找柳伯。柳伯見到把皮卡丘放在外面的小智，斥責他只以情感來培育寶可夢是錯誤的並拒絕進行正式的道館對戰。小智為了説服柳伯和他戰鬥而跟隨他進了森林，卻遇上了火箭隊的襲擊，兩人不慎跌入深谷。在危難關頭，小智使用寶可夢救了自己和柳伯，也讓柳伯承認了小智對寶可夢的感情。在深谷之中，他們找到了一個柳伯的長毛豬的腳環，這究竟是怎麼回事呢？

劇情圖片

小智和柳伯約好進行正式的道館對戰。比賽是2v2的單打形式，柳伯派出的第一隻寶可夢是白海獅，小智則用對抗冰屬性有利的火球鼠。然而，兼有水屬性的白海獅通過潛入水中屢次避開了火球鼠的噴射火焰，還使用冰凍光束差點擊敗火球鼠。火球鼠使用火焰融化凍結自己的冰後，小智竟一反常態，命令火球鼠跳入水中。水中誘敵的戰術奏效，火球鼠用高速星星將白海獅打出水面並以噴射火焰將其打敗。柳伯的第二隻寶可夢是長毛豬，長毛豬使用猛撞就輕鬆地擊敗了火球鼠。面對強大的對手，小智會如何迎戰？他能否奪得這枚徽章？

劇情圖片

贏得了第七枚徽章的小智立刻向着最後一間道館的所在地煙墨市前進。一行人來到一片開闊的草原，草原中間有一顆巨大的樹。這裏有大量野生的美麗花和霸王花，同樣由臭臭花進化而來的兩種寶可夢關係並不好，為了搶奪地盤雙方打的不可開交。小智讓月桂葉暫時分開了美麗花和霸王花。一位研究員塞加將眾人帶到他的研究所並向他們陳述了情況。小智和小霞希望結束紛爭但又不傷害任何一方，他們要怎麼做？

劇情圖片

小智一行人來到了一片火山區域，這裏是熔岩蝸牛的聚居地，他們的路被一隻正在睡覺的巨大的熔岩蝸牛擋住了。為了通過，小霞向用水屬性寶可夢將其打跑，可這隻熔岩蝸牛十分厲害，打敗了小霞的蚊香君。就在這時，一位火屬性寶可夢訓練家亞克西出現，他嘲笑了身為水屬性寶可夢訓練家的小霞，並向她發起挑戰。挑戰還沒開始，巨大熔岩蝸牛再次出現，亞克西想要收服它，派出了火伊布。但是熔岩蝸牛輕易地就將火伊布打敗，這使亞克西很沮喪。小智一行人想要幫助亞克西收服這隻熔岩蝸牛。

劇情圖片

小智一行人在森林中遇見了身為寶可夢魔法師的小璃，小璃想要借用皮卡丘的十萬伏特實現能瞭解寶可夢心情的魔法。為了見證這一沒有人使用過的魔法，小智一行人決定幫助小璃蒐集魔法所需的素材。他們最終能湊齊素材，使魔法成功嗎？

劇情圖片

小智為了早日到達煙墨市而想走捷徑，結果在森林中迷路了。在遭受火箭隊的襲擊後，皮卡丘因為用電過度似乎很虛弱了。羽莎出現了並帶着小智一行人前往一個神秘的湖，因為湖底的水晶的作用，這個湖的水能恢復電屬性寶可夢的體力。火箭隊再次出現想要搶走水晶，所有的電屬性寶可夢的電力都在被火箭隊吸走。就在此時，傳説的鳥寶可夢，閃電鳥出現並捨身救了其他的寶可夢，打飛了帶着水晶的火箭隊，自己也因電力耗盡而倒下。小智能否追回水晶並救閃電鳥？

劇情圖片

小智一行人來到了一個城鎮，他們遇見了綺菲洛和她的兩隻寶寶丁。綺菲洛在為即將舉行的演唱會做着準備。然而火箭隊也盯上這一對十分可愛的寶寶丁，並在演唱會上搶走了寶寶丁。為了追回寶寶丁，小智、小霞和綺菲洛一起去追火箭隊，留下小剛撐場。他們能及時救回寶寶丁嗎？

劇情圖片

小智一行人在一個湖泊再次遇見火箭隊三人組，就在小智和火箭隊的戰鬥一觸即發時，呆呆獸和寺院的修行者雅子的出現使雙方停止戰鬥。雅子向眾人介紹了這個呆呆獸湖和呆呆獸寺院，並邀請眾人前往寺院做修行。得知小茂完成了艱難的修行，小智鬥志昂揚，也要做最難的修行。而火箭隊三人組嘴上答應了修行，卻心懷鬼胎。呆呆獸寺院裏新來的兩組人會在寺院鬧出什麼事來？

劇情圖片

小智一行人得知大木博士即將和胡桃小姐去離他們不遠的匯比鎮進行錄音活動，也前往匯比鎮。在匯比鎮得知此消息的火箭隊三人組想到了一個作戰計劃：由小次郎假扮大木博士，武藏假扮胡桃，喵喵和果然翁假扮製片人來匯比鎮蹭吃蹭喝。第二天，真正的大木博士一行人和小智一行人同時到達了。見到真正的大木博士，火箭隊依然堅稱自己是真的。為了區分出誰才是真正的大木博士，小霞提議進行比賽篩選出真正的大木博士。

劇情圖片

旅行中的小智一行人突然注意到夜空中一個不明物體急速追落在離他們不遠的山後，不明物體中有一個東西掉下來砸中了小智的小小象。小智一行人前往調查，發現這是一隻皮寶寶。這時，突然出現了兩名不明人士，他們要帶走皮寶寶。緊接着，火箭隊也出現並同樣要奪取皮寶寶。察覺危險的小小象帶着皮寶寶向不明物體墜落的位置跑去，想把皮寶寶送回它來的地方。小智一行人一邊緊跟着小小象，一邊阻擋兩股勢力的追捕。墜落的不明物體是什麼？遭遇兩撥人的圍堵，皮寶寶能脱險嗎？

劇情圖片

小智一行人來到了一座城鎮，他們遇見了一位厲害的寶可夢訓練家安治，他已經使用蚊香泳士連勝七場了。遇見這樣的對手讓小智和身為水屬性寶可夢訓練家的小霞都想與之一戰。小霞派出蚊香君對戰，結果不敵對手。小智的月桂葉也僅僅和打了多場的蚊香泳士打成平手。火箭隊盯上了這隻強大的寶可夢，並用詭計騙走了安治裝有蚊香泳士的精靈球，強迫蚊香泳士為他們戰鬥。小智一行人要幫助安治一起奪回蚊香泳士。

劇情圖片

小智在一位訓練家的指引下前往競技公園以進行更多的寶可夢對戰訓練。興致勃勃的來到公園的小智發現這一天公園裏面似乎沒什麼人，但是由火箭隊三人組裝扮的工作人員仍然安排了小智的對戰。火箭隊想要假扮訓練家，通過使用競技公園的寶可夢擊敗小智並搶走皮卡丘。面對即將對陣的未知的強大對手，小智又會有怎樣的戰術呢？他能贏得比賽嗎？

劇情圖片

小智一行人和他們的寶可夢吃過飯後在湖邊休息。小霞的蚊香蛙皇在附近散步時被一位叫奈美的訓練家誤當成自己的蚊香蛙皇帶走了。小智一行人醒來後發現小霞的蚊香蛙皇不見了，但是他們找到了另外一隻蚊香蛙皇。跟隨這隻蚊香蛙皇，小智一行人找到了奈美，但是奈美請求小霞借給她蚊香蛙皇以幫她贏得啦啦隊比賽，因為她自己的蚊香蛙皇似乎並不想當啦啦隊的指揮。這到底是怎麼回事呢？

劇情圖片

小智一行人為了抄近路前往煙墨市而進入了冰雪小徑。在遇到火箭隊的潑水襲擊後，小智雖然打飛了火箭隊，但是小剛因為冰水而發燒了。將小剛送進冰雪小徑內部的一家寶可夢中心進行治療後，小智、小霞和寶可夢中心的喬伊發現洞穴內的温度開始上升。為了找到温度上升的原因，他們三人離開寶可夢中心前去調查。但這一切都是火箭隊的詭計，他們要偷走這裏所有的冰屬性寶可夢。

劇情圖片

前往煙墨市的小智一行人在湖邊遇見了一隻迷你龍，這是煙墨道館道館館主小椿的寶可夢。道館的工作人員卡布請求小椿例行去進行一年一度的淨化龍之牙的儀式，但是小椿要保護這隻即將蜕皮的迷你龍完成蜕皮。而這時，火箭隊出現，武藏要搶走迷你龍，迷你龍會順利地蜕皮嗎？

劇情圖片

小智按照約定和小椿進行道館戰。小椿派出的第一隻寶可夢是刺龍王，小智使用皮卡丘迎戰。面對水屬性兼具龍屬性的刺龍王，皮卡丘的電氣系絕招和電光一閃似乎都無法對對手造成傷害。於是小智用貓頭夜鷹換下了皮卡丘，想通過超能力屬性絕招擊敗對手。但刺龍王憑藉高速移動使得貓頭夜鷹的催眠術無法命中。就在貓頭夜鷹被對方的水炮命中時，倉庫的警報響起。原來是火箭隊三人組偷走了道館祖傳的龍之牙。為了躲避小智和小椿的追捕，火箭隊逃進了龍之聖域。

劇情圖片

小智一行人和小椿、卡布追捕火箭隊三人組來到龍之聖域，但是他們發現守護龍之聖域的快龍幫助火箭隊逃跑了。就在這時，小智的噴火龍出現了，跟隨而來的還有紀珂和麗莎。火箭隊被快龍帶到龍廟，並得知龍廟中有重要的寶物，於是闖進龍廟而意外地引發了火災。看見龍之聖域失火的快龍逆鱗立起而暴走，開始攻擊火箭隊並使火情擴大。強大的快龍已經完全混亂，甚至攻擊正在救援的小智一行人。小智和小椿聯手要讓快龍冷靜下來，他們要怎樣做呢？

劇情圖片

奪回了龍之牙後，小智和小椿再次開始道館戰鬥。面對已經對陣過的刺龍王，小智派出了臨時更換過來的卡比獸迎戰。憑藉超強的體力，卡比獸擊敗了刺龍王。體力消耗過大的卡比獸在小椿的第二隻寶可夢——暴鯉龍的攻擊下倒下。考慮到屬性上的優勢，小智派上了皮卡丘。皮卡丘雖然有速度和屬性的優勢，但在暴鯉龍的強大攻勢下也只是艱難取勝。小椿最後的寶可夢是哈克龍，並且一上場就輕鬆地擊敗皮卡丘。同樣剩最後一隻寶可夢的小智派出了剛剛重逢的噴火龍。兩強相爭，誰會是最終贏家？

劇情圖片

得到城都地區全部的八枚徽章後，小智正準備向白銀大會進發。這時，火箭隊登場並偷走了小智的所有徽章。為了奪回徽章，小智一行人和小椿、卡布在森林中搜捕火箭隊。武藏將徽章交給了果然翁，自己和小次郎去引開小智等人。可是果然翁卻意外地弄丟了裝着徽章的盒子。小智和火箭隊都在尋找這些徽章，誰能先找到？這些徽章去哪了？

劇情圖片

在返回若葉鎮的途中，小智一行人看見海邊有舉辦水中芭蕾表演，於是前往觀看。原來這是一座私設道館，龍宮道館。擅長水屬性寶可夢的道館館主龍司十分敬仰華藍道館的華藍三姐妹，這讓小霞很不服氣，提出要和龍司戰鬥。小智也不會錯過這個機會，用小鋸鱷向龍司挑戰，結果被對方輕易的打敗了。小霞和龍司的戰鬥又會有什麼結果呢？

劇情圖片

正在返回若葉鎮的小智一行人接到空木博士的聯絡，請小智前去寶可夢海洋研究所去取一枚寶可夢的蛋。來到海洋研究所的小智一行人發現研究所的所長成美小姐正在觀測研究拉普拉斯。而出現在小智一行人眼前的拉普拉斯羣正是在橘子諸島與小智分別的拉普拉斯的族羣。正當小智和拉普拉斯為他們的重逢而玩耍時，火箭隊抓住了其他的所有拉普拉斯並用潛艇把拉普拉斯們帶走了。這些被帶走的拉普拉斯命運會如何？

劇情圖片

小智得到的寶可夢的蛋孵化出了一隻幼基拉斯，但是這隻幼基拉斯的狀態很不對勁，體温低得異常。他們將幼基拉斯送到了附近的寶可夢中心，喬伊小姐也對幼基拉斯的情況束手無策，只能通過加熱器維持幼基拉斯的體温。在小智向空木博士後的第二天早上，空木博士、大木博士和小智的媽媽一起來到寶可夢中心，兩位博士很快將幼基拉斯治好，但是幼基拉斯仍然對不願與這個世界互動。小智要如何打開這隻幼基拉斯的心扉呢？

劇情圖片

小智一行人來到了森林中的一片温泉區。他們見到了一位在等待捕捉炎帝的訓練家，尚也，並被告知炎帝即將會來到這裏。就在小智一行人和他們的寶可夢們在温泉玩耍時，火箭隊出現並將小智和他的寶可夢騙上了卡車，但是小智藉助寶可夢的幫忙很快逃出了車子。在小智和尚也進行完寶可夢對戰後，火箭隊再度出現，並企圖奪走温泉中的所有寶可夢。火箭隊的機器因為操作不當失靈，火箭隊被擊飛但留下了一個大龍捲風。突然，炎帝現身並止住了龍捲風。想要捕捉炎帝的尚也立刻與炎帝開始戰鬥，結果會是如何？

劇情圖片

小智一行人按照導遊書的引導前往一片美麗的湖邊用午餐，但是當他們到那時，發現這並不像他們想象的那麼美。這個“湖”幾乎已經乾涸，大量的呆呆獸都無精打采地趴在附近。小智一行人接着遇見了愛麗絲和提雷斯，他們是來研究湖中的呆呆王傳説的。他們告訴小智等人呆呆獸戴上了王者的信物就可以進化成呆呆王，並帶領其他的呆呆獸和呆殼獸前往“呆呆獸樂園”，但是呆呆獸的速度太慢，在沒有拿到王者的信物前就會被大舌貝咬至進化成呆殼獸。不過就在這時，愛麗絲的呆呆獸想要過去嘗試戴上王者的信物，它會成功嗎？

劇情圖片

小智一行人在森林中發現了一隻電擊怪。火箭隊三人組突襲小智將幼基拉斯和電擊怪抓走。正當小智一行人追逐火箭隊時，他們遇見了小智的一位勁敵奈奈，她在叢林裏尋找那隻電擊怪。得知電擊怪被火箭隊抓走後，奈奈也跟隨小智追尋火箭隊。另一邊，電擊怪帶着幼基拉斯從火箭隊的氣球上逃了下來，火箭隊在尋找兩隻寶可夢的時候遇見了鯉魚王大叔，小次郎被迫拿出大食花去跟鯉魚王大叔交換會使用甜甜香氣的口呆花以引誘寶可夢。口呆花將電擊怪、幼基拉斯及小智一行人吸引過來，對戰中小次郎被迫放棄了他第二隻進化來的大食花，隨後火箭隊三人組也被打飛。

劇情圖片

小智一行人抵達了一所位於白銀山山麓的寶可夢中心並和空木博士取得了聯繫。接着，他們在上山的途中，小智和一名使用鴨嘴寶寶的訓練家千一進行對戰。小智派出的火球鼠雖然有速度的優勢，但是仍被鴨嘴寶寶的爆裂拳打敗。暗中觀察的火箭隊發現這裏的訓練家有許多強大的寶可夢，於是他們搶走了所有的寶可夢，小智為了保護幼基拉斯也被帶走，但是幼基拉斯卻沒有被捉住。火箭隊準備用卡車運走得到的寶可夢，並把小智綁住扔在一座屋子內。現在能救大家的只有還可以自由活動的幼基拉斯，這隻十分消極的幼基拉斯能否成功救出其他的寶可夢和小智？

劇情圖片

正前往白銀山頂的小智一行人看見天空突然出現奇怪的波動，一個未知圖騰掉下來砸中了小霞。這個未知圖騰似乎很虛弱。小霞表示剛才的碰撞使她看見了未知圖騰的心情，她看到了一個不可思議的地方。經過小智的幼基拉斯的一個晚上的照顧，第二天一早，未知圖騰似乎已經恢復了。火箭隊突然襲擊，在混戰中火箭隊三人組被擊飛，但是小智一行人也被傳送到了一個奇怪的世界，在這裏皮卡丘和波克比都變得十分巨大。之後他們意識到了他們現在在幼基拉斯的內心世界，小智也進一步瞭解了幼基拉斯的過去。他們用盡全力將被冰封起來的幼基拉斯的心給解放了。之後，他們回到了真實世界。幼基拉斯也開始接受小剛和小霞。在接受了小智的感謝後，未知圖騰也回到了它的世界中去。

劇情圖片

在得到了幼基拉斯的信任後，小智一行人來到了白銀山上的寶可夢保護區，這裏是幼基拉斯的故鄉。他們並不知道他們已經被寶可夢獵人兄弟跟蹤了。隨後，幼基拉斯的母親，班基拉斯出現，但將小智一行人誤當成偷獵者而瘋狂地攻擊他們。幼基拉斯使用刺耳聲使班基拉斯平靜下來，可這時，寶可夢獵人兄弟登場並困住了班基拉斯。由於寶可夢獵人兄弟的機器十分強大，班基拉斯及小智都被困住了。寶可夢保護官武藤的趕到使獵人兄弟只帶走了班基拉斯，小智要求他們和武藤一起把班基拉斯救出來，小剛也派出了叉字蝠追蹤獵人兄弟的行蹤。班基拉斯能否成功得救？幼基拉斯是否會離開小智呢？

劇情圖片

終於來到白銀大會的舉辦地，白銀鎮的小智一行人首先來到了鳳王院。這裏是白銀大會的聖火採集的地方，但不知為什麼過了很久都沒有火炬跑者出來。由於，波克比跑進了院中，小智一行人也進去了鳳王院。他們瞭解到，原本存放鳳王的火焰的神廟被狃拉佔據了，由於狃拉的領地意識，其他人無法靠近。為了取得聖火，鳳王院的工作人員請了不少的訓練家幫忙但都無濟於事。小智想要嘗試進去取火，但是被狃拉的手下，豪力和腕力趕了下來。這時，一名從豐緣地區來的訓練家葉越也要幫忙，他想要收服狃拉。但是眾人第一次上去，仍被狃拉靈活的攻擊給打下來了。同樣被狃拉打敗的火箭隊也準備得到狃拉，但是武藏表示要用狃拉換掉喵喵，這讓喵喵不願幫武藏而導致計劃失敗，三人組被打飛。最後，葉越派出了小智的圖鑑尚無法辨認的寶可夢火焰雞，並且很快擊敗了狃拉並將其收服了，火炬傳遞得以開始。

劇情圖片

在到達白銀鎮後，小智遇見了他的勁敵小茂。小茂同樣參加了白銀大賽並揚言要再比賽中打敗小智。 在選手村休整後，小智前往參加選考會。小剛告訴了小智選考會的規則。小智的第一個對手是吉花市的三郎，小智派出了皮卡丘對陣對手派出的大尾立。大尾立的速度加上挖洞的戰術一度讓皮卡丘處於劣勢。就在大尾立使用頭錘要給皮卡丘最後一擊時，皮卡丘抓住機會跳到大尾立背上，並使用強力的十萬伏特加電光一閃擊敗了大尾立。經過了所有的選考賽後，小智最終打進了預賽，同時他也看到了勁敵小茂和葉越也成功晉級。 當晚，小智和皮卡丘因為睡不着而到湖邊散步，正好遇見小茂。小茂再次與小智立下要在大賽打敗對方的誓言。 第二天，白銀大會的開幕式即將開始。小智和皮卡丘在等待入場時，被化妝後的火箭隊騙走並偷走了皮卡丘。小茂趕到救了小智並和小智共同追擊火箭隊。火箭隊在逃跑的時候將火炬跑者撞傷，皮卡丘也因碰撞得救。小智指揮皮卡丘將火箭隊擊飛，並且代替火炬跑者前往點燃聖火台。白銀大會正式開幕！

劇情圖片

小智開始了H組預賽聯盟的比賽。在他了解過同組的兩名對手後，他遇到了其中的一名對手，也是即將對戰的對手小萌。小萌是來視察敵情的，就在她準備和小智來個對戰時，火箭隊出來搶走了小智的皮卡丘和小萌的六尾。小智拼盡全力，不僅救下了意外摔下陡坡的小萌，還奪回了兩隻寶可夢，這讓小萌對小智十分欣賞。由於小萌使用的基本是火屬性寶可夢，小霞建議小智使用水屬性來對應她。小智立刻從大木博士處傳送來了巨鉗蟹，但是由於意外，巨鉗蟹被霹靂電球電倒以至於無法立刻比賽。就在此時，君莎小姐帶着傑尼龜趕來協助小智。得到傑尼龜的小智信心十足。預賽第一場小智能否順利拿下？

劇情圖片

小智在白銀大會上的下一個對手是來自若葉鎮的純一，他十分期待這場比賽的到來。小智的妙蛙種子和傑尼龜一起玩時，與純一的大竺葵和瑪力露麗起了矛盾，以至於引來了君莎小姐，不過幸好有葉越和小茂幫助解圍。 小智和純一的比賽開始，小智使用皮卡丘先贏了對手的瑪力露麗，卻接着被對手的三合一磁怪連續擊敗了皮卡丘和火球鼠。只剩下妙蛙種子的小智將如何應付三合一磁怪和純一最強的寶可夢大竺葵呢？

劇情圖片

進入白銀大會決賽圈的小智終於要遭遇他從小到大的勁敵小茂了。為了戰勝小茂，小智整夜未眠，一直在思考對戰的策略。小茂的寶可夢幾乎什麼類型的都有，而且都培育的十分強大。決賽圈的比賽是雙方都用六隻寶可夢的比賽，新的規則，老的對手，這場比賽會如何發展？