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eDNA
(生物學名詞)
鎖定
eDNA是指在環境樣品中所有被發現的不同生物的基因組DNA的混合。
- 中文名
- 環境DNA
- 外文名
- eDNA
- 存 在
- 土壤、沉積物、排泄物
- 特 點
- 基因組DNA的混合
eDNA定義
eDNA作用
作為一項技術,分析eDNA的目的就是獲取這些環境樣品中DNA所屬物種的分類學信息和基因功能信息。再講通俗一點,科學家提取環境樣品中的eDNA,就是為了分析這些DNA分別是屬於哪些物種,從而證實在相應環境中存在哪些物種。eDNA的目的,與傳統的動植物分類調查其實是一致的。
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eDNA類型
第一類eDNA類似於對環境的生物多樣性調查,方法是檢測環境樣品中儘可能多的DNA序列,與數據庫比對分析它們所屬的物種分類信息,最終鑑定在這個環境中生活的所有物種,這個方法又被稱為DNA宏條形碼(DNA metabarcoding)。在樣品處理上,DNA宏條形碼使用普通的聚合酶鏈式反應(PCR)或直接霰彈槍法(shotgun strategy)測序,這兩個實驗方法都比較成熟,能夠方便獲得多個DNA序列。
另一類eDNA技術類似於特定生物調查,目標是尋找在環境樣本中是否有單一物種的DNA存在,通常用於研究和追蹤珍稀物種在自然界的分佈。它與第一類DNA宏條形碼的區別在於它並不在意環境中屬於其它物種的DNA,因此在樣品處理上通常使用更精確的定量PCR(qPCR)技術,目標是找到極其少量的目標物種的DNA。
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eDNA應用
2018年4月12日,全球最權威的龜鱉保育組織TSA(國際龜鱉生存聯盟,Turtle Survival Alliance )在官網上宣佈確認全球第四隻斑鱉的存在。美國華盛頓州立大學助理教授Caren Goldberg通過檢測環境DNA(eDNA),確證了該斑鱉的存在。
[1]
2022年10月,安徽省生態環境監測中心在長江幹流(安徽段)和巢湖開展長江流域魚類環境DNA監測。據瞭解,此次監測工作由銅陵、安慶、池州、馬鞍山生態環境監測中心和巢湖管理局環境保護監測站共同參與完成。這也是安徽省首次進行該項監測。此次長江流域的魚類環境DNA監測涉及長江流域多個省份,其中安徽省共設置9個監測斷面(點位),是長江流域水生態考核的有力支撐。長江流域水生態監測工作涉及的指標包括水生生物、水環境、水生境和水資源四大類。其中水生生物包括河流、湖泊中和水庫中的魚類、重點保護水生生物、大型底棲無脊椎動物、浮游動物、水生植被和水華等。巢湖也被列入了監測範圍並設置了監測點位。
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- 參考資料
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- 1. eDNA技術確認全球第四隻斑鱉的存在!未來,在雲南能發現第五隻嗎? .網易[引用日期2018-04-14]
- 2. 越南發現世上現存第四隻斑鱉:通過環境DNA技術確認其存在 .澎湃新聞[引用日期2018-04-15]
- 3. 安徽首次開展魚類環境DNA監測 .百家號.2022-10-20