熱帶區

更新世氣候惡化，古北區喜暖動物南遷進入東洋區和熱帶區，但沒有鼴鼠、鹿和熊。

本區分化出來的特有屬有黑猩猩、大猩猩、疣猴、狒狒、非洲黑犀、非洲象等。

特有的類羣有蹄兔目、管齒目、金毛鼴科、象鼩科、土豚科、河馬科、長頸鹿科、珠雞科、鷺鷹科鴕鳥科和非洲肺魚科等。其中長頸鹿科並不起源於非洲，原產歐洲、印度和中國等地，今在其起源地已經滅絕，而保留在非洲併成為特有動物。

本區有一些古區系成分，如蚓蜥、蚓螈、鱺魚和淡水貽貝等在古北區從未發現過它們的化石，但卻見於南美洲（新熱帶區），證明非洲大陸曾是古生代岡瓦納大陸的一部分。

馬達加斯加島動物區系具有顯著的獨特性，幾乎所有熱帶區哺乳動物在這裏都不存在，僅有非洲河豬是晚近時期從非洲大陸遷來的。作為該島的特有類羣有狐猴科、大狐猴科、指猴科、馬島蝟科和擬鶉科、裸眉鶇科、鵑鴗科等。