阿南站

2003年，站舍進行改建，並將車站大堂由原來位於地面站舍改為設於架空橋上。亦因而成為了在德島縣內唯一一個架空站舍。大堂設有售票處、旅遊中心、自動售票機等設施。車站現時設有東西閘口，其中西閘口部分可算是站舍的延伸區域，包括了便利店和洗手間，並有扶手電梯及樓梯通往二樓售票大堂；東閘口則純作出入口之用，設有升降機及樓梯通往二樓。

另外，位於地下和二樓間的閣樓，是JR四國阿南事務所的所在地。

設有側式月台及島式月台各1個，但島式月台最外邊的部分並不設上下客，部分月台邊沿有圍上欄杆，該月台只用作列車臨時停泊及保線之用，而在這軌道之外，亦再有一條停泊軌道，實際上，供乘客使用的只有2面2線。1號月台位於側式月台上，最大可容納5輛列車，而島式月台上的2號月台，有效長度也達4輛。未興建架空站舍時，月台和站舍間靠向阿波中島站的平交道連接，站舍架空化後，各月台均能以升降機或樓梯到達。平交道因而封閉，只讓職員有需要才使用。