馬傑

2000年本科畢業於清華大學物理系；2003年碩士畢業於清華大學電機與應用電子技術系；2004-2008年在英國布里斯托爾大學化學系從事超高靈敏激光光譜（包括腔衰蕩激光光譜和可調諧激光二極管吸收光譜等）和等離子體化學研究，獲得博士學位。2008-2009年繼續在布里斯托爾大學從事博士後研究。2009-2014年在美國霍華德-休斯醫學中心和康奈爾大學物理系作為博士後高級研究助理，從事單分子生物物理研究。期間主要利用先進的角控光鑷/光學扳手技術，研究了DNA扭矩對於轉錄過程的調控，並首次測量出轉錄過程中的核心分子馬達蛋白，即RNA聚合酶 (RNA polymerase)，所能產生的最大扭矩 (stall torque)，該結果發表於2013年Science期刊上。2014年作為中山大學百人計劃二期引進人才來到中山大學理工學院任教。 ^[1] 

光學和生物物理

主要研究方向: 生物光子學和單分子生物物理 （每年可招博士生和碩士生2-3名）。

將主要開發和利用多種光學手段（包括光鑷、熒光和納米光子學器件等工具），進而在單分子層面上，對重要的分子生物學過程（如轉錄、逆轉錄、複製、DNA重組與修復等）展開高度精細的測量，同時配合理論建模和計算機模擬，揭示並深刻理解重要蛋白的工作原理以及其與核酸的相互作用機制。 ^[1] 

先後在Science，PNAS，Cell Cycle，Transcription， eLife，Opt. Express, Nanoscale, J. Phys. Chem. A， J. Appl. Phys等雜誌上發表文章21篇，其中一作和通訊作者文章17篇，共被SCI引用＞350次，受邀參與翻譯書籍一次。

近年學術論文 [*標記通訊作者，#為共同一作]:

1. "Fluorescence enhancement in an over-etched gold zero-mode waveguide", Meiyan Wu, Wenzhao Liu, Jinyong Hu, Zhensheng Zhong, Thitima Rujiralai, Lidan Zhou, Xinlun Cai, and Jie Ma*,Opt. Express27 (2019)19002-19018

2. "Theoretical study of overstretching DNA-RNA hybrid duplex", Dong-Ni Yang(楊東尼), Zhen-Sheng Zhong(鍾振聲), Wen-Zhao Liu(劉文釗), Thitima Rujiralai, Jie Ma(馬傑)*,Chin. Phys. B, 28 (2019)：068701

3. "Transcription factor regulation of RNA polymerase's torque generation capacity", J. Ma#*, C. Tan#, X. Gao, R. M. Fulbright, J. W. Roberts, and M. D. Wang*,Proc Natl Acad Sci USA, 116 (2019) 2583-2588

4. "Single-molecule angular optical trapping for studying transcription under torsion",Ma, J., Tan, C., and Wang, M.D.*,Methods in Molecular Biology1805, 301-332. (2018) (Springer)

5.“Combining gold nanoparticle antennas with single-molecule fluorescence resonance energy transfer (smFRET) to study DNA hairpin dynamics”, JY Hu, MY Wu,L. Jiang,ZS Zhong,ZK.Zhou, T. Rujiralai and J. Ma*,Nanoscale,10, (2018) 6611

6.“DNA supercoiling during transcription”,J. Ma*, M. D. Wang*,Biophys Rev.(2016) 8 (Suppl 1):S75–S87

7.“Interplay between DNA supercoiling and transcription elongation”, J. Ma, M. D. Wang*,Transcription5, (2014) e28636.

8.“RNA polymerase is a powerful torsional motor”, J. Ma, M. D. Wang*,Cell Cycle, 13, (2014) 337

9.“On the move”, R.A. Forties, J. Ma, and M. D. Wang*,eLife, 2, (2013) e01414.

10.“Transcription under torsion”, J. Ma, L. Bai, M. D. Wang*,Science, 340, (2013) 1580 ^[1]