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連接酶

鎖定
連接酶英語:Ligase,或稱連結酶結合酶)是一種催化兩種大型分子以一種新的化學鍵結合一起的,一般會涉及水解其中一個分子的團。
中文名
連接酶
外文名
ligase
拼音名
Lian Jie Mei
又    稱
合成酶 連結酶 結合酶
分    類
EC6
EC6子類數
6個子類

目錄

連接酶簡介

ligase
又稱合成酶,能催化兩個分子連接成一個分子或把一個分子的首尾相連接的。此反應與ATP的分解反應相偶聯。在把兩分子相連接的同時發生三磷酸腺苷(ATP)的高能磷酸鍵的斷裂如DNA連接酶等。
連接酶是酶分類中重要的一類(EC 6):6.1形成C-O鍵;6.2形成C-S鍵;6.3形成C-N鍵;6.4 形成C-C鍵。
連接酶的催化反應過程需要Mg離子

連接酶命名

連接酶通常是包括“連接酶”這個字,就如DNA連接酶是將脱氧核糖核酸(DNA)片段連接。其他普遍的名稱包括“合成酶”,因為這些酶是用作合成新的分子,或當它們是將二氧化碳加入一個分子時則稱為“羧化酶”。
需要留意的是“合成酶”是與合酶有所分別,合成酶是會使用三磷酸腺苷(ATP),但合酶不會使用ATP且是屬於裂合酶

連接酶分類

連接酶在EC編號中分類為EC6,並再細分為6個子類:
  • EC6.1包括形成C-O鍵的連接酶
  • EC6.2包括形成C-S鍵的連接酶
  • EC6.3包括形成C-N鍵的連接酶
  • EC6.4包括形成C-C鍵的連接酶
  • EC6.5包括形成磷酯鍵的連接酶
  • EC6.6包括形成N-金屬鍵的連接酶

連接酶DNA連接酶

發現
DNA連接酶最早於1967年由三個實驗室同時發現,經過科學家幾十年的研究發現,目前在病毒細菌和真核生物體內都發現了DNA連接酶,不同類型的DNA連接酶的作用機制不同。一般情況下,根據DNA連接酶催化反應所需的能量來源可以把DNA連接酶分為腺苷三磷酸(ATP)依賴型和煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NAD)依賴型,腺苷三磷酸依賴型DNA連接酶廣泛存在於真核生物、古細菌、真細菌和病毒中,煙酰胺腺嘌呤二核苷酸依賴型DNA連接酶則分佈在古細菌、真細菌和病毒中。
常見種類和作用機制
1、T4DNA連接酶
T4DNA連接酶是目前應用比較多的病毒基因組編碼的DNA連接酶,在基因重組中廣泛使用。噬菌體類型較多,目前研究發現T4噬菌體能夠合成T4DNA連接酶,並且已經能夠從被T4嗜菌體感染的大腸桿菌中提取該酶,此外科學家也已經定位該酶的合成基因,即噬菌體T4的30基因。T4DNA連接酶具有連接黏性末端和平末端的作用,研究人員總結DNA片段的連接過程,認為整個DNA連接反應可以通過三個連續步驟來完成:
(1)ATP通過斷裂最後一個高能磷酸鍵釋放能量,同時產生的AMP和T4DNA連接酶利用ATP水解釋放的能量形成E-AMP複合物;
(2)所形成的E-AMP複合物可以識別DNA雙鏈之前被切開的切口,識別之後AMP會脱離E-AMP複合物並與DNA的5’-P基團結合;
(3)需要連接的另外一段DNA分子片段的3’-OH會攻擊第二步形成5’-P-AMP,3’-OH和磷酸基團殘基發生反應形成磷酸二酯鍵,同時釋放出一個AMP。
2、 真核生物DNA連接酶
真核生物存在3種ATP依賴型DNA連接酶——DNA連接酶Ⅰ、DNA連接酶Ⅲ和DNA連接酶Ⅳ。研究顯示,DNA連接酶Ⅰ和DNA連接酶Ⅳ廣泛分佈於真核生物中,如植物界和動物界,DNA連接酶Ⅲ則主要分佈於脊椎動物中。
目前科學家認為,在真核生物DNA複製過程中,起到連接作用的可能主要是DNA連接酶Ⅰ,DNA連接酶Ⅰ活性的調節與其氨基端有關,在其氨基端靠近活性中心有一個特定的部位,該部位可以通過磷酸化作用來調節DNA連接酶Ⅰ的活性。DNA連接酶Ⅰ的作用就是將DNA複製時複製叉處形成的不連續的後隨鏈(岡崎片段)連接起來。在此過程中DNA連接酶Ⅰ並不是單獨起作用,而是需要和多種蛋白因子密切合作共同完成。在真核生物DNA複製時,後隨鏈是由DNA聚合酶α催化合成的,DNA聚合酶α先催化合成一段引物,然後依賴DNA聚合酶δ與增殖細胞核抗原(持續複製因子),從引物開始合成DNA,然後引物通過降解出去。此外,在損傷的DNA的鹼基修復中,DNA連接酶Ⅰ也同樣起到重要的作用。首先細胞內的特異性核酸內切酶和外切酶特異性識別損傷部位,在DNA單鏈損傷部位的附近進行剪切,切除一段DNA,然後DNA聚合酶以另一條完整的DNA鏈作為模版進行修復合成重新合成這段DNA,最後由DNA連接酶Ⅰ將缺口連接。 [1] 
參考資料