氨基酰-tRNA

(aminoacyl-tRNA )氨基酰-tRNA的氨基臂上結合有相應的氨基酸，並將氨基酸運轉到核糖體上合成蛋白質。

氨基酸在進行合成多肽鏈之前,必須先經過活化,然後再與其特異的tRNA結合,帶到mRNA相應的位置上,這個過程靠氨基酰tRNA合成酶催化,此酶催化特定的氨基酸與特異的tRNA相結合,生成各種氨基酰tRNA.原核細胞中起始氨基酸活化後，還要甲酰化，形成甲酰蛋氨酸tRNA，由N10甲酰四氫葉酸提供甲酰基。而真核細胞沒有此過程。

每種氨基酸都靠其特有合成酶催化,使之和相對應的tRNA結合,在氨基酰tRNA合成酶催化下,利用ATP供能,在氨基酸羧基上進行活化,形成氨基酰-AMP,再與氨基酰tRNA合成酶結合形成三聯複合物,此複合物再與特異的tRNA作用,將氨基酰轉移到tRNA的氨基酸臂(即3'-末端CCA-OH)上。

運載同一種氨基酸的一組不同tRNA稱為同功tRNA。一組同功tRNA由同一種氨酰基tRNA合成酶催化。氨基酰tRNA合成酶對tRNA和氨基酸兩者具有專一性，它對氨基酸的識別特異性很高，而對tRNA識別的特異性較低。

氨基酰tRNA合成酶是如何選擇正確的氨基酸和tRNA呢？按照一般原理，酶和底物的正確結合是由二者相嵌的幾何形狀所決定的，只有適合的氨基酸和適合的tRNA進入合成酶的相應位點，才能合成正確的氨酰基tRNA。現已經知道合成酶與L形tRNA的內側面結合，結合點包括接近臂，DHU臂和反密碼子臂。

乍看起來，反密碼子似乎應該與氨基酸的正確負載有關，對於某些tRNA也確實如此，然而對於大多數tRNA來説，情況並非如此，人們早就知道，當某些tRNA上的反密碼子突變後，但它們所攜帶的氨工酸卻沒有改變。1988年，候稚明和Schimmel的實驗證明丙氨酸tRNA酸分子的氨基酸臂上G3：U70這兩個鹼基發生突變時則影響到丙氨酰tRNA合成酶的正確識別，説明G3：U70是丙氨酸tRNA分子決定其本質的主要因素。tRNA分子上決定其攜帶氨基酸的區域叫做副密碼子

一種氨基酰tRNA合成酶可以識別以一組同功tRNA，這説明它們具有共同特徵。例如三種丙氨酸tRNA（tRNAAlm/CUA,tRNAAim/GGC,tRNAAin/UGC都具有G3：U70副密碼子。）但沒有充分的證據説明其它氨基酰tRNA合成酶也識別同功tRNA組中相同的副密碼子。另外副密碼子也沒有固定的位置，也可能並不止一個鹼基對。