基元

motif 指構成生物體的大分子上局部區域構成特徵性序列以適應大分子之間相互結合(或吻合)的基本結構單位稱作基元。有時也稱作模塊或模式。如鋅指、亮氨酸拉鍊、螺旋-轉角-螺旋和螺旋-環-螺旋等。這些基元結構是解決基因轉錄調控的途徑之一，也是生命科學中的重要研究課題之一。

基元，基序或模序（motifs or modules，模體符）在許多蛋白質中，有兩個或三個具有二級結構的肽段在空間上相互接近，形成一個特殊的空間構象，稱為模序。有的將這種規則的二級結構的聚集體稱為超二級結構，它們可直接作為三級結構的“建築塊”或域結構的組成單位，是蛋白質發揮特定功能的基礎。

類型：αα、ββ、αβα、鋅指結構、亮氨酸拉鍊

在反式作用因子的結構中，基序一般指構成任何一種特徵序列的基本結構，作為結構域中的亞單元，其功能是體現結構域的多種生物學作用。

反式作用因子的DNA結合結構域(DNA binding domain)中的幾種常見基序：

①螺旋/轉角/螺旋（Helix-turn-helix,HTH）基序

兩段螺旋被一短的轉角結構分開，其中一段螺旋為DNA識別螺旋。

同源異形結構域(Homeodomain，由同源異形盒編碼)中含有HTH基序。具有Homeodomain的轉錄調控蛋白在胚胎髮育和正常細胞分化的基因表達調節中有重要作用。

②鋅指(Zinc finger)基序

由肽鏈的保守序列中的一對組氨酸加一對半胱氨酸(His2/Cys2)或2對半胱氨酸(cys2/cys2)與一個鋅離子形成配位鍵，這些氨基酸對之間的多膚鏈成環狀突出並折迭成指形結構，多個指結構常串聯重複。

鋅指族轉錄因子以二聚體形式同DNA上的順式調控元件結合。

含鋅指基序的轉錄因子：與GC盒結合的SPl、類固醇激素受體家族，抑癌蛋白WT1等。

③亮氨酸拉鍊(Leucine-Zipper)基序

由一段每隔6個a a 就有一個Leu的伸展肽鏈組成，這些週期性出現的Leu都位於α—螺旋的同—側面，因此兩條均含Leu拉鍊基序的蛋白質通過亮氨酸側鏈的相互作用形成二聚體。

具有亮氨酸拉鍊基序的轉錄因子：原癌基因C-Jun/C-fos(APl家族)。

④螺旋-環-螺旋(Helix-loop-Helix，HLHt)基序

由2個α螺旋間隔一個非螺旋的環(loop)組成。如原癌基因產物C-myc及其結合蛋白Max。

(二)組成光學掩模版陣列中的任一部分。可用作製造單個集成電路的功能層，或供測試用。