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代謝組
鎖定
- 中文名
- 代謝組
- 外文名
- Metabolome
- 類 別
- 動態整體
- 含 義
- 代謝物質
代謝組基本介紹
針對於代謝物組學技術,2010年之前主要瓶頸在於可以鑑定的代謝物種類較少,通常在100種以內,所以就喪失了組學的價值。隨着技術的發展,現在的代謝組學實測可以達到300種代謝物以上,近期的研究一直呈上升趨勢。
代謝組學檢測的技術路線通常是首先使用液相色譜(氣相色譜)在一定壓力下,代謝物由於分子量和電荷不同,從而在塔板柱中流動的速度不同,從而將不同分子量的代謝物分離開,而後串聯質譜儀,根據分子的荷質比不同從而在質譜儀中的飛行偏轉角度不同,導致落點不同,根據不同的落點信息,與數據庫進行比對,從而確定代謝物的種類。故而在代謝組學裏面,數據庫是否完備就成為鑑定代謝物種類的關鍵。通常做法是使用標準代謝物進行液質聯用,記錄其信息形成數據庫。然後待測樣本在進行液質聯用的時候就會形成屬於自己特有的峯形,與數據庫比對後就可以確定其種類及相對含量。
代謝組分類
檢測代謝物的中類從大類主要分為:Amino acid(Glycine, serine and threonine metabolism;Alanine and aspartate metabolism;Glutamate metabolism;Histidine metabolism;Lysine metabolism;Phenylalanine & tyrosine metabolism;Tryptophan metabolism;Valine, leucine and isoleucine metabolism;Cysteine, methionine, SAM, taurine metabolism;Urea cycle; arginine-, proline-, metabolism等),Peptide(Dipeptide;gamma-glutamyl等),Carbohydrate(Fructose, mannose, galactose, starch, and sucrose metabolism;Glycolysis, gluconeogenesis, pyruvate metabolism;Nucleotide sugars, pentose metabolism等),Energy(Krebs cycle;Oxidative phosphorylation等),Lipid(Essential fatty acid;Medium chain fatty acid;Long chain fatty acid;Carnitine metabolism;Bile acid metabolism;Glycerolipid metabolism;Lysolipid;Monoacylglycerol;Sphingolipid;Sterol/Steroid等),Nucleotide(Purine metabolism, (hypo)xanthine/inosine containing;Pyrimidine metabolism, thymine containing; Valine, leucine and isoleucine metabolism等),Cofactors and vitamins(Ascorbate and aldarate metabolism;Hemoglobin and porphyrin metabolism;Pantothenate and CoA metabolism;Tocopherol metabolism等),Xenobiotics(Benzoate metabolism;Chemical;Drug)等,代謝物實測合計300種以上,廣泛應用於醫學、農業、製藥、食品等行業中。