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簡併引物

簡併引物是指代表編碼單個氨基酸所有不同鹼基序列可能性引物的混合物。PCR為了增加特異性，可以參考密碼子使用表，根據不同生物的鹼基使用偏好，減少簡併性。簡併度越低，產物特異性越強，設計引物時應儘量選擇簡併性小的氨基酸，並避免引物3’末端簡併。

密碼簡併性表

氨基酸密碼子數 M、W 1 個；C、D、E、F、H、K、N、Q、Y 2個； I 3個； A、G、P、T、V 4個； L、R、S 6個

（注：選擇使用的肽鏈最好避開有4～6個密碼子的氨基酸）

核苷酸鏈中除出現正常的A、T、G、C四種鹼基符號外還出現如R、Y、M、K等其它字母（其中R=A/G，Y=C/T，M=A/C，K=G/T，S=C/G，W= A/T，H= A/C/T，B= C/G/T，V=A/C/G， D=A/G /T,N=A/C/G/T）。

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