神盾局特工第二季

　　 1945年，卡特特工帶領咆哮突擊隊攻陷九頭蛇基地，繳獲一大批不明物品，其中一個叫方尖碑，存檔編號為084。現在，084號不明物品被政府收繳，新任局長科爾森帶領新的特工小組，欲從政府手中奪回方尖碑。上任不久，科爾森派出幾個手下執行任務，幾個手下在執行任務的過程中遇到同樣想要奪取方尖碑的吸收人-克里爾，吸收人為九頭蛇工作，可以將身體變成任何接觸過的物體，科爾森的幾個手下雖然個個身手了得，但還是損失了一名特工。殺手逃離現場的時候留下了一些不明物質，科爾森的幾個手下拾起不明物質返回總部報到。一行人拿着身份卡片穿越總部設置的層層障礙到達核心機要室，科爾森只願意跟梅見上一面。其它幾個手下見梅獲得榮譽與科爾森見面，人人臉上升起羨慕的神色，其中一人憤憤不平也想跟科爾森見上一面。梅來到辦公室中見到了科爾森，科爾森向梅詢問之前行動遇到神秘殺手的經過，神秘殺手刀槍不如非常了得，科爾森暫時無法知道此人的姓名和背景身份，不過，神秘殺手被子彈擊中的時候留下一些不明物品，科爾森的一個手下經過化驗，赫然發現不明物品分離出了一些血液，血液自然來自神秘殺手，經過海量身份名單搜尋，神秘殺手的身份終於曝光。此人名叫克里爾是一名反動人員，克里爾擁有不凡的金屬變化能力，肢體接觸到任何金屬物體都會變成同樣的金屬性質，科爾森與手下人研究克里爾的時候，克里爾正坐在家中不斷變化自己的身份。經過一番摸除排查，科爾森發現克里爾會去一所校園襲擊一名長官，長官接到神盾局的電話不以為然，提醒神盾局的人無需保護他，他的身邊有許多身手不凡的保鏢，對付一般的恐怖份子綽綽有餘。不過長官想錯了，克里爾不是一般的恐怖份子，他擁有特異能力不是凡人，長官身邊的保鏢根本不是克里爾的對手。雖然長官不願意神盾局的人趕來保護他，但科爾森還是派出幾個手下火速趕往校園，幾人來到校園的時候正好遇到克里爾襲擊長官，幾個名鏢衝着克里爾開槍，克里爾安然無恙抓起路邊的鐵鏈向科爾森的一個手下襲來，手下人不敵克里爾迅速後退，另外幾人趁機向克里爾射出一種超強電流的子彈。克里爾中彈跪在地上無法動彈，強大的電流令他喪失了行動能力。長官有驚無險被帶回神盾局審訊，科爾森來到審訊室親自審訊長官。長官已經脱下軍服，衣着普通如同一名囚犯被科爾森審訊。克里爾逃出神盾局尋找充滿神秘力量的物品，科爾森派出幾個手下來到一處倉庫尋找神秘物品。一名女隊員離開幾個夥伴來到一處箱子旁邊找到了神秘物品，潛伏在倉庫中的克里爾現身搶奪神秘物品，女隊員轉過身子對着克里爾的身子擊出幾拳，克里爾平安無事站在當場。女隊員意識到克里爾刀槍不入，心中升起一計轉回身子拿出神秘物品想襲擊克里爾，克里爾看着女隊員拿起神秘物品，心中一緊就想後退，女隊員拿着神秘物品忽然感受到一股強大的力量吞噬她的手臂，不等她回過神來，神秘物品發出光芒大有即將運行之勢，在克里爾驚訝的目光中，女隊員痛苦萬分蹲在地上無法扔掉神秘物品，顯然該物擁有吸食功能無法輕易甩掉。幾個隊員聞訊趕了過來，克里爾心知不能久留，趕緊轉過身子逃走。隊員們見女隊員手臂陰黑一片像是被什麼東西腐蝕，眾人趕緊離開倉庫帶着女隊員往基地方向趕去，基地中有高科技設備的醫療人員，女隊員回到基地才有活命的希望。負責送女隊員回基地的是一個男隊員，二人坐在車上一個痛不欲生，一個崩緊神精向基地方向開車。女隊員無法承受神秘物品的侵蝕力量，痛不欲生要求男隊員砍斷她的手腕，男隊員非常理解女隊員的處境，勸説女隊員再忍忍，只要趕到醫院，醫生一定可以有辦法救回女隊員。 讓男隊員萬萬想不到的是，克里爾忽然出現在公路中心擋住了汽車，汽車撞在克里爾身上翻了幾個跟斗支離破碎，女隊員死在了車上，她的手腕斷在車外，克里爾來到車外拿拾起神秘物品，在男隊員恐懼的目光中揚長離去。

　　梅看到受傷的亨特，給了他一把工具講自己從翻掉的車解救出來，梅準備追殺克里爾，但是庫爾森命令她不要固執己見。斯凱告知庫爾森自己在方尖碑上看到了複雜結構，但是庫爾森並不在意。亨特被扔在了路邊，此時托爾伯特出現，將他帶走。菲茲看到正在研究的飛機隱形設備，但是失語症讓他不能夠正常交流，菲茲因此十分受挫，大家都擔心他回不到從前了。托爾伯特和亨特談條件，亨特答應只要托爾伯特能夠給自己兩百萬和哈特利一個體面的葬禮，自己就將庫爾森交給托爾伯特。斯凱找到庫爾森，表達出勤的意願，聽説哈特利和愛達荷已經犧牲之後，堅持要去擒拿克里爾，庫爾森讓斯凱去打包好哈特利的物件。菲茲因為隱形飛機的事情自責不已，突然間在打印機處看見了克里爾的檔案。克里爾正在餐館裏等人，服務員不小心碰到了他的胳膊，最後整個人變成了鋼鐵。在外跟蹤的梅想要報告庫爾森，庫爾森命令她現在就歸隊。亨特責怪庫爾森沒有保住哈特利和愛達荷，但是庫爾森直言都是哈特利自己的錯。斯凱正在收拾哈特利的遺物，看到了哈特利和她姐姐的合影。此時亨特趕到，拿走了哈特利的媽媽送給哈特利的一條項鍊。菲茲看到克里爾的檔案，想出了能夠暫時對付克里爾的方法。克里爾回到自己的據點，試圖治好自己胳膊上因為方尖碑留下的傷口。約翰聯繫到克里爾，命令他立馬前往第二個交接點。克里爾因為約翰不顧自己死活十分生氣，此時蕾娜出現，拿出了卡拜恩寶石。蕾娜聯繫到庫爾森，告知他自己在卡拜恩寶石上安裝了追蹤設備，這樣就可以找到克里爾。通過追蹤，庫爾森定位了克里爾，克里爾正在和接頭人交易，此時亨特突襲了自己的隊友，打算自己獨自去殺了克里爾，但是亨特並沒有得逞，而裝有方尖碑的箱子在混亂中被蕾娜帶走。菲茲提示自己之前已經設計出了能夠中和克里爾力量的設備。

克里爾追殺亨特，庫爾森及時趕到，講菲茲設計的裝備嵌入了克里爾的背後。哈特利的葬禮上，亨特將那條項鍊還給了哈特利的母親。庫爾森邀請亨特能夠加入神盾局為自己效力，亨特答應。菲茲意識到西蒙斯其實已經消失，自己看到的西蒙斯只是一個幻象。斯凱意識到庫爾森最近不正常，梅找到庫爾森，庫爾森在牆上刻出了方尖碑上的複雜符號，而梅則拍了照。斯凱的父親讓蕾娜拿起方尖碑，蕾娜十分害怕，但是方尖碑並沒有傷害她，斯凱的父親讓蕾娜找到斯凱。庫爾森找到托爾伯，將克里爾交給他。庫爾森希望能夠能夠和托爾伯特達成交易，但是托爾伯特覺得神盾局的設備並不夠先進，此時神盾局的隱形飛機出現，帶走了庫爾森，托爾伯特看得目瞪口呆。

　　霍特懷爾博士正在洗腦神盾局33號探員，希望她能夠屈服於九頭蛇。早上六點，西蒙斯起牀之後去九頭蛇的實驗室工作。上級領導特金命令她趕快做完手頭的工作。梅正在訓練探員斯凱，亨特過來問斯凱是否有上過神盾學院，斯凱回答沒有。亨特試圖跟斯凱聊天，梅將他趕走。梅看到庫爾森回來，便問她去見托爾伯特的情況，庫爾森説情況並不妙。西蒙斯的上級要向巴克希彙報進展，西蒙斯無意間看到了吉爾的檔案。吉爾正在馬克拉什藏身，而九頭蛇已經派人去追蹤他，吉爾知道後，立馬使用自己的冰凍技能將九頭蛇的人冰凍。西蒙斯回到家，突然間發現又人藏在自己家裏，原來此人正是庫爾森。庫爾森此行是為了聽西蒙斯的工作報告。西蒙斯向庫爾森報告了九頭蛇想要招募吉爾的情況，庫爾森希望孤僻的西蒙斯能夠在九頭蛇阻止交到朋友，但這恰好是西蒙斯所不擅長的。庫爾森希望能夠在九頭蛇之前找到吉爾，希望曾經和吉爾事同學的菲茲能夠幫忙。斯凱正在拷問沃德，我的提到九頭蛇如果不能夠成功招募那些天賦異稟的人的時候，便會毀了那些人。吉爾正在卡薩布蘭卡港口，使用自己的超能力將海水凍結。西蒙斯正向和特金先生交朋友，巴克希派人來調查西蒙斯。幸好西蒙斯巧妙地回答了巴克希的問題，巴克希懷疑西蒙斯曾經是神盾局的探員。為了能夠評估西蒙斯對九頭蛇的衷心，巴克希命令西蒙斯前去招募吉爾，神盾局也出發去尋找吉爾。菲茲意識到大家都將他矇在鼓裏，而身邊的西蒙斯只是自己的幻覺。菲茲來到了關押沃德的房間，為了報復沃德帶個自己的傷害，菲茲在沃德的隔間裏製造了低壓環境來折磨沃德。西蒙斯一行人來到卡薩布蘭卡港口，神盾局也空降到港口。斯凱找到吉爾，希望能夠説服他加入九頭蛇，但是吉爾並不願意。菲茲通過和沃德的對話意識到吉爾之前就是九頭蛇的僱員，只是暫時性失控而已。梅為了防止亨特不能受控制，先擊倒了亨特，梅開槍準備殺了吉爾，吉爾追着西蒙斯，巴克希成功再次洗腦了吉爾，命令吉爾能夠凍住梅一行人，此時斯凱朝吉爾開槍，吉爾掉入海里。為了表明自己的衷心，西蒙斯幫巴克希躲過一槍。斯凱告訴梅現在吉爾的屍體一直沒有被發現，而且實則庫爾森將西蒙斯置於如此危險的境地。庫爾森找到菲茲，責備他不應該差點殺了沃德。經此一役，巴克希徹底對西蒙斯解除了戒心，打算提拔西蒙斯。斯凱找到沃德，希望沃德能夠提供更多的信息給自己，最後沃德提到斯凱的父親其實還活着，斯凱離開。

　　一名教父來到一座教堂裏面，相關工作人員將教父領到教堂一處秘密房間，房間裏面有一幅年代久遠的古畫，教父推測古畫至少誕生於十五世紀。一幅古畫對於教父來説不足為奇，教父更希望相關工作人員能展示更新奇的東西，在教父的提示下，相關工作人員將古畫另一面翻轉過來，教父往古畫背面仔細一看，赫然發現背面出現了一些圖案。古畫引起神盾局的注意，領頭者庫爾森親自出馬帶着梅特工來到存放古畫的樓房參加活動，活動現場人來人往，庫爾森與梅特工扮成一對親密的情侶步入活動現場，梅特工與一些男士談話尋找機會偷古畫，庫爾森來到客廳外面悄悄跟其它手下通話，手下人在通話過程中聽到一陣爽郎的笑聲傳出來，庫爾森意識到是梅特工在客廳與人談笑風生，結束通話之後回到客廳與梅特工繼續尋找機會偷古畫。梅特工跟負責保管古畫的要員談話，庫爾森趁機拿起手機替兩人照相，手機表面上看起來跟普通手機沒有區別，實際上庫爾森在拍照的時候已經攝下了要員的視網膜形狀。拿着保管要員視網膜形狀的手機，庫爾森與梅特工離開客廳來到地下室成功打開存放古畫的大門，兩人走進密室中分頭行動，梅特工來到一間房子外面發現屋中有人，屋中的女人低頭像是在做什麼事情，梅特工衝進屋中與女人博鬥，女人身手不凡與一個男伴合力制服梅特工，梅特工昏倒在地上不省人事，女人穿上梅特工的衣服往臉上粘好一種高科技裝備變化成梅特工。假梅特工離開地下室回到神盾局找庫爾森，庫爾森正跟幾個手下在談話，假梅特工將庫爾森喚到房間秘談，庫爾森與假梅特工乘車離開基地，一路上假梅特工還伸手搭在庫爾森手背上以示友好，庫爾森見假梅特行為異常，心中升起警疑與假梅特工來到一幢樓房中。假梅特工在談話過程中被庫爾森下套露出真實面目，庫爾森在談話過程中見假梅特工喜歡喝咖啡，立即猜到眼前的假梅特工並非真的梅特工，假梅特工還沒回過神來便捱了庫爾森一拳頭。真梅特工甦醒過來發現自己已被綁在一張椅子上，一個男人站在梅特工面前殺氣騰騰躍躍欲試，梅特工怒目瞪視男子，男子脱下外衣拿起一根閃爍着電光的電線向梅特工臉上探去。假梅特工與庫爾森陷入到激鬥中，庫爾森雖然已經識破假梅特工的身份，但卻處於下風被假梅特工步步緊逼。真梅特工掙脱繩索制服了男子，假梅特工在樓房中跟庫爾森激斗的時候，真梅特工趕了過來幫助庫爾森與假梅特工博鬥，假梅特工身手了得緊逼真梅特工，真梅特工被假梅特工摁倒在桌上，假梅特工得意洋洋認為真梅特工必敗無疑，真梅特工順手抓到電線電死了假梅特工。危險終於解除，梅特工與庫爾森坐在房中談話，對於庫爾森識破假梅特工身份的原因，梅特工百思不解，庫爾森見梅特工糾結於他如何識破假梅特工的身份，輕描淡寫將之前跟假梅特工聊天的經過説了一遍，假梅特工在聊天的時候無意中向庫爾森透露她喜歡喝咖啡，事實上真梅特工最討厭的食物就是咖啡，庫爾森一聽假梅特工喜歡喝咖啡當場便識破了對方的身份，後來真梅特工趕來幫助庫爾森殺死了假梅特工，如果不是真梅特工來得及時，庫爾森也許已經死在假梅特工手中。與梅特工談完假梅特工，庫爾森繼續談論古畫的事情，古畫除了本身的價值以外還包含其它秘密，畫的背面有一些圖案急需被破解。雷納從樓房中走出來回到車上，車上放着一份報紙，報紙上面出現關於古畫的新聞，雷納瞟了一眼報紙發現汽車後座坐了一個男子，男子面無表情坐在後座上，看起來不懷好意，雷納吃了一驚想離開駕駛室，車外又走進來一個男子坐在後座上。面對突如其來的情況，雷納嚇得坐在駕駛室中不敢動彈。進入汽車的後座男子自稱丹尼爾，丹尼爾殺氣騰騰看着雷納，提醒雷納之前拿過他的一些東西，他來找雷納就是為了拿回屬於他的東西。雷納只覺丹尼爾説的話莫明其妙，丹尼爾提醒雷納必須歸還東西，否則她的性命將會不保。

　　九頭蛇使用新研發的武器襲擊正在舉辦婚禮的海軍，殺死了其中把人。得知此情況的庫爾森正在等西蒙斯能夠給神盾局送來信息。雷納找到斯凱的爹，希望能夠拿回方尖碑，但是斯凱的爹並不同意，詢問是誰要拿走方尖碑，雷納答應是懷特霍爾，斯凱的爹不同意送走方尖碑，因為這是最後找回斯凱的唯一希望。巴克希召集西蒙斯開會，而懷特惠爾正是會議主持人。懷特惠爾將自己最新的計劃公開，詢問西蒙斯的意見，西蒙斯的回答讓懷特惠爾印象深刻。斯凱看着古畫背後的符號，亨特建議她去找沃德揭秘。沃德告知斯凱雷納認識斯凱的爹。沃德告訴畫背後的符號是加勒特刻上去的。雷納在九頭蛇大樓裏看見西蒙斯，西蒙斯正將信息傳送給神盾局，在一旁的雷納看在眼裏。庫爾森懷疑西蒙斯是外星人，這時候雷納打來電話約見庫爾森。巴克希來到實驗室，直言實驗室裏有間諜，西蒙斯被懷疑，但是最後在特金的抽屜裏找到了和神盾局聯繫的證據，特金被帶走。雷納和庫爾森見面，庫爾森希望雷納能夠將方尖碑給他。雷納將西蒙斯是九頭蛇間諜的照片給庫爾森看。由於特金和西蒙斯是實驗夥伴，巴克希懷疑是西蒙斯栽贓給特金。作為刪掉照片的交換條件，雷納想要帶走斯凱去見她的親生父親，庫爾森並沒有答應。看到此景，斯凱想要衝出去阻止庫爾森，但是梅將她攔住。雷納將西蒙斯的照片發給了九頭蛇的所有僱員，西蒙斯被人追殺，沒想到被卧底在九頭蛇的芭比所救。雷納眼看自己計劃失敗，想要投靠神盾局，但是庫爾森並不答應。庫爾森希望雷納能夠將斯凱的爹的地址告訴他，然後利用雷納設法接近懷特霍爾。斯凱在地下室的地板上看到了她父親的照片，庫爾森趕來。在外面監視這一切的斯凱父親眼見自己的親生女兒憎恨自己，怒火中燒。西蒙斯回到神盾局，看見菲茲，倆人終於團聚。而芭比探員正是亨特的前妻，看到自己的父親是壞人，斯凱決定要捉拿自己父親。庫爾森將自己畫的符號顯示給斯凱看，斯凱迴應自己知道這符號背後的意義，其實是一幅地圖。斯凱的父親來到九頭蛇見懷特霍爾，把方尖碑交給懷特霍爾，希望能夠聯手毀掉神盾局。

　　托爾伯特將軍正在電視上講述神盾局給世界安全帶來的威脅，突然間九頭蛇衝進會議室，傷害了現場的的議員，而且還冒充事神盾局。此時電視上正在報道神盾局攻擊政治議員的事，庫爾森看到報道立馬意識到就是九頭蛇的陰謀，先派梅一行人去東京找製造生化武器的增田，而西蒙斯則負責去九頭蛇總部找有關生化武器的硬盤資料。西蒙斯和斯凱正在討論沃德，梅衝進來説是九頭蛇的陰謀。庫爾森派亨特和前妻芭芘一起行動，但是亨特並不願意。沃德的哥哥原來就是托爾伯特的上級，看到托爾伯特如此行事不利，竟然被神盾局偷襲，十分生氣，要自己親自出馬消滅神盾局。 亨特和芭芘兩人聊天，不歡而散。菲茲正在自言自語，西蒙斯進來。西蒙斯從九頭蛇總部偷來了關於生化武器的硬盤。 西蒙斯告知硬盤在運輸過程中損壞了，菲茲提供幫忙。斯凱找到沃德，希望沃德能夠提供關於他哥哥的信息。沃德知道自己的哥哥心狠手辣，並不合作。梅一行人到達東京，芭芘找到增田，希望能夠看一眼生化炸彈。九頭蛇的人發來信息告知增田芭芘就是神盾局的探員，亨特十分擔心芭芘的安全，衝了進去擊斃了增田。菲茲覺得西蒙斯在自己需要的時候離開了神盾局，不願意再接受現在的西蒙斯。庫爾森找到沃德哥哥克里斯蒂安的辦公室，通知沃德現在被關押在神盾局的地下室。斯凱找到沃德，沃德告知克里斯蒂安事心口不一的人。沃德告知是九頭蛇的人殺害了斯凱的母親，而庫爾森已經和克里斯蒂安達成協議，將沃德轉交給克里斯蒂安關押，而克里斯蒂安會撤回對神盾局的控訴。菲茲和麥克正在翻看之前的資料，西蒙斯發現了和懷特霍爾有交集的貝克爾斯。在比利時，貝克爾斯抓住了神盾局的一名探員，此時亨特一行人進來和九頭蛇大打出手，成功幹掉對方。 西蒙斯找到麥克，麥克覺得都是因為西蒙斯的來開才讓菲茲變成今天的樣子。亨特准備離開神盾局，芭芘和他一番交談。沃德被轉交給克里斯蒂安，而克里斯蒂安也在電視上公佈了自己的弟弟就是九頭蛇的一員。

　　一名在紐約的神盾局探員將陌生人帶回家，沒想到陌生人身上竟然有方尖碑一樣的紋身，最後這名陌生人殺掉了這名探員。庫爾森正在牆上刻畫，這時候斯凱進來，兩人希望能夠找到這畫背後的意義。庫爾森得知沃德已經逃脱，梅一行人正在費城跟蹤沃德。沃德知道自己被跟蹤，立馬逃跑。庫爾森知道紐約的探員被殺害的事情後，發現這名探員的屍體上竟然被刻上了方尖碑上的圖案。庫爾森決定屍檢這名探員，看能不能找到兇手的線索。沃德已經乘坐大巴來到了亞特蘭大，接着搭乘大巴去了達拉斯。在大巴上，沃德搭訕了旁座的一名女生，原來這個人就是庫爾森派來跟蹤的芭芘，沃德立馬掉頭去了開往波士頓的大巴。西蒙斯屍檢結果判定是兇手為了完成某種儀式，才會在死者身上刻畫。西蒙斯還發現死者血液裏有GH-325,為了能夠找出兇手，庫爾森決定親自進入記憶儀器找出記憶。庫爾森回憶中正在和死去了斯蒂文森探員談話，而且裏面一共有6位病人。在記憶中，和庫爾森談話的人都畫出了方尖碑上的圖案。沃德成功逃往波士頓，九頭蛇聯繫沃德，希望雙方能夠合作。庫爾森回憶起了所有的畫面，最後還有一個病人活着，庫爾森決定親自去找到此人。庫爾色找到最後一名病人漢克，準備將此人帶回神盾局並希望能夠找回漢克的記憶。但是漢克並不記得前世的記憶，這時候兇手出現，將庫爾森和漢克兩人都綁了起來，兇手拷問庫爾森方尖碑上圖文的意義，但是庫爾森也並不知道，正在兇手準備殺了庫爾森的時候，漢克掙脱，斯凱和麥克趕到現場，救下了庫爾森。庫爾森和兇手代裏克在漢克家裏找到了方尖碑上圖案的最後一片，原來方尖碑上的圖案是一座城市的地圖。庫爾森意識到九頭蛇也在試圖解開這個謎底，神盾局一定要趕在任何人之前找到這座城市。沃德打電話給斯凱，告知自己即將和庫爾森見面。而在這之前，沃德會先解決和自己哥哥之間的恩怨。

　　1945年，奧地利，萊茵哈特博士使用方尖碑做實驗，希望能夠解密出方尖碑的秘密。萊因哈特發現了一個能夠在方尖碑下存活的中國女人。懷特霍爾找到斯凱父親，期望能夠解密方尖碑。庫爾森派芭芘拷問巴克希，但是巴克希並不願意透露。巴克希無意中透露懷特霍爾和70年前的懷特霍爾有關係。庫爾森帶人來到夏威夷。西蒙斯找到了關於萊因哈特的資料，發現懷特會兒和萊因哈特有聯繫。1945年，萊因哈特被美國抓獲，乞求第二次機會。萊因哈特解釋方尖碑的存在就是為了征服人類。斯凱父親提議可以將懷特霍爾帶到方尖碑中城市的寺廟。沃德綁架了他哥哥克里斯蒂安，沃德責怪克里斯蒂安當年的水井事件，兩人為此時爭執。菲茲竭盡全力要完成庫爾森交代的任務，西蒙斯發現1945年的萊因哈特就是現在的懷特霍爾，梅發現當年萊因哈特當年就被關押在神盾局的“老鼠”監獄。九頭蛇將萊因哈特救出監獄，九頭蛇也找到了當年逃過方尖碑的中國女人，而此人經過多年後仍然青春永駐。芭芘拷問巴克希，告知巴克希神盾局已經知道了懷特霍爾的過往，巴克希自殺。在沃德的逼迫下，克里斯蒂安挖開當年的水井，沃德逼迫克里斯蒂安承認當年的水井事件，克里斯蒂安承認當年是為了自己的私信逼迫沃德將托馬斯推下水井。庫爾森一行人轉戰澳大利亞，希望能夠攻破軍隊基地的網絡。庫爾森遭到九頭蛇的埋伏，特里普中彈，此時斯凱父親出現，聲稱自己是醫生。庫爾森相信，斯凱父親揭露了自己的身份，將特里普的生命作為交換來見斯凱。萊因哈特和那個中國女人交換了所有的器官，使自己自己重獲新生。沃德找到懷特霍爾，原來沃德已經殺死了自己的哥哥和父母。亨特和芭芘兩人舊情復燃。斯凱找到了方尖碑城市。懷特霍爾向斯凱父親介紹了沃德，原來那個中國女人就是斯凱的母親。

　　雷納被九頭蛇跟蹤，可被神盾局的特工解救並稱：“庫爾森找你”雷納被關押在神盾局的飛機上，並告訴斯凱本劇一直以來成謎的藍色外星人來自克里，也是他們留下了方尖碑，用以挑選出值得統治地球的人。另一邊，尋找方尖碑上的城市的庫爾森小組找到了通往神秘城市的通道，那裏以鬧鬼著稱。通往秘密城市的洞很深，有100英尺。放下去的無人機也沒了信號，他們讓邁克下去察看，可沒想到邁克碰上了外星筆記，發了瘋一樣。被解救上來後，只説了句：“跑！”就變了個人似的，到處傷人。還好芭芭拉用電棍將邁克擊倒，可邁克掉入了深洞，庫爾森命令立即封鎖隧道，“那不是邁克！”而另一邊飛機上，神盾局的飛機竟被九頭蛇的昆式戰機圍攻。沃德要求將雷納和斯凱跟他走。因此沒有炸掉神盾局的飛機。特工33（偽裝成梅的人）跟懷特霍爾報告情況，可剛報告到沃德沒有炸掉神盾局的飛機時，懷特霍爾要求特工33下令她的手下去炸飛機。

　　九頭蛇欲將神盾局的飛機炸掉，可梅機智的躲避了九頭蛇的襲擊並返回秘密城市。斯凱被沃德帶到九頭蛇總部，斯凱見到了她的爸爸，她的爸爸告訴斯凱自己加入九頭蛇的真正原因——是為了報復懷特霍爾，這天終於到了。庫爾森小組發現九頭蛇在一座劇院裏挖洞，想要進入秘密城市。懷特霍爾要斯凱將方尖碑拿起，竟安然無恙。菲茲、西蒙斯、特里普穿着防護服進入秘密城市安放炸彈，而斯凱竟開槍打傷沃德！庫爾森把懷特霍爾殺死了，可斯凱的爸爸説：“你搶了我的東西！”便打得不可開交。雷納拿着方尖碑進入了秘密城市，凱和庫爾森前去追趕，特里普趕忙去拆炸彈。雷納、凱、特里普被關閉在一個封閉的空間，只見方尖碑立在一個圓柱上，打開了，一朵晶體展現出來，隨後便發出一個衝擊波，不一會兒，他們就變成了石塊，可斯凱成功掙脱，但特里普就碎石般的瓦解了。一個沒有眼睛的人説：“有新人來了！”

　　神盾局消滅了懷特霍爾，特里普因此犧牲。神盾局的每個人都遭受了重創，斯凱暫時被隔離。九頭蛇專局正在商量如何選擇下一個九頭蛇頭目，巴克希此時被拘禁在神盾局。雷納轉化成了邪惡勢力，殺掉了西蒙斯帶領的數據收集小隊。梅探員和庫爾森設局讓巴克希上當，以為自己被九頭蛇解救。亨特假裝自己是九頭蛇的人，巴克希放下防備，立馬聯繫了九頭蛇專局。西蒙斯發現雷納的基因組被外星球的異物感染，她懷疑斯凱也被外星異物感染。雷納找到斯凱的父親，憎恨他讓自己變成了現在這幅醜陋模樣。斯凱的父親得知斯凱已經化繭成蝶之後，十分開心。雷納希望斯凱的父親能夠幫助自己，但是他並不合作。亨特將巴克希送到九頭蛇專局，芭比和他聊天。芭比坦承自己和麥克曾經參加過互助小組。西蒙斯希望庫爾森能夠派人消滅雷納，斯凱知道這件事之後擔心不已。雷納企圖自殺，菲茲懷疑斯凱也變成了非人類。斯凱生氣之下突然爆掉頭上的燈。神盾局利用巴克希殺掉了九頭蛇的高層，巴克希知道後十分憤怒。菲茲拿到斯凱的基因檢測結果，發現她的基因和以前大相徑庭。但是菲茲替斯凱保守住了秘密，斯凱感動不已。雷納因為自己的醜陋模樣傷心不已，正在她放棄時戈登將她帶走。

　　斯凱被外星人追殺梅在訓練斯凱，斯凱擔心自己過於用力而傷害了梅，菲茲也在一旁提醒她。亨特和芭芘兩人商量未來，麥克找到庫爾森，庫爾森直言可以將他調到外勤。此時葡萄牙來消息，庫爾森趕往發現了之前的老同事希芙女士，但是她已經完全喪失了關於過往的記憶。斯凱在網上找到一段希芙的視頻，發現了她和一名陌生男人在碼頭打鬥的場面。庫爾森打算立馬尋找該陌生男人。芭芘和斯凱在醫院找到了該陌生男子的蹤跡，沒想到該人力量十分強勁，斯凱因為生氣而發作，突然間整個房間震顫。斯凱將自己所見告知庫爾森，庫爾森十分好奇該人是誰。斯凱想要把自己變異的消息告訴庫爾森，但是菲茲建議她等對比結果出來再説。梅查到重要信息，原來該陌生男人就是克里人達克。達克就是來找發生了變異的人，斯凱知道紙包不住火，心裏十分擔心。此時神盾局因為斯凱的原因突然震顫，斯凱坦白自己也發生了變異。希芙想要將斯凱帶走，但是庫爾森並不願意交出她。梅將斯凱轉移走，希芙和達克立馬前去追蹤斯凱。西蒙斯發現斯凱和雷娜的基因對比，菲茲撒謊騙她。斯凱無法控制自己，梅在一旁安慰她。庫爾森説服希芙不要帶走斯凱，希芙答應。神盾局的人在處理因為斯凱留下的爛攤子，菲茲將斯凱的情況告訴了西蒙斯。斯凱為了避免傷害別人，便決定要將自己關起來。

　　 斯凱的父親為了能夠和神盾局抗衡，便召集很多之前被神盾局列入名單的危險分子，其中的人要麼智商超羣，要麼力大無窮。斯凱逐漸能夠控制自己的內心，但是庫爾森和梅還是十分擔心，於是梅便去請了自己的心理醫生前夫來給斯凱做心理測評。一開始斯凱十分抗拒心理測評，但是逐漸向梅前夫吐露自己內心其實十分害怕，她怕自己對神盾局的安全造成威脅。斯凱的父親帶上召集的手下前去神盾局的牢監裏釋放了關押的極度危險分子，一行人開車前往庫爾森的故鄉威斯康辛。庫爾森和芭芘前往牢監，發現囚犯已經被劫走，而且斯凱父親還在牆上留下了“繼續戰鬥”的字跡。庫爾森心裏明白一場戰鬥即將來臨。庫爾森得知斯凱的父親在威斯康辛之後，便立馬帶上芭芘前往。梅得知庫爾森要和斯凱的父親決鬥之後，便立馬準備前去應付。此時斯凱出來，表示願意幫助神盾局與自己的父親為敵。斯凱的父親來到一所高中，讓其中的一個超能力者弄暈了整個學校的學生。他以此來威脅庫爾森，庫爾森只有和斯凱父親當面對質。此時梅突然帶着斯凱出現，並拿槍指着斯凱威脅她父親。斯凱父親擔心斯凱的安全，梅趁機解決了危險分子。亨特被麥克關押在洗手間，亨特不明白為何麥克要對自己這樣，麥克解釋自己正在為神盾局的另一股勢力效力。

　　 梅的前夫勸神盾局暫時隔離斯凱，為了整個神盾局的安全。庫爾森和梅商量之後決定將斯凱轉移到一個小木屋，飛機上庫爾森和斯凱一番對話，試圖委婉的解釋自己的決定，斯凱對於自己被隔離十分生氣。科爾森給了斯凱一雙西蒙斯研發的手套，它可以幫助斯凱控制自己的能量。庫爾森希望她能夠原諒自己，並且承諾一定會想辦法將她解救出來。在懷特霍爾被殺死之後，沃德和33號探員聯手，他試圖幫助33號探員找回自己。33號探員為了感謝沃德對自己的幫助，試圖易容成沃德喜歡的斯凱，但是沃德拒絕，他和33號探員商量去找現在被博爾特扣押的巴克希。33號探員和沃德使用最新的易容技術變成博爾特的老婆潛進了基地，博爾特發現隊裏面出現了內鬼之後十分生氣，發誓要找出內鬼。沃德也趁機進入了基地，33號探員進入了巴克希所呆的牢房。 巴克希告知了33號探員關於她被九頭蛇洗腦之前的過往，她得原名叫做卡拉。 梅詢問麥克關於亨特的情況，麥克假稱現在還沒有亨特的消息，梅將信將疑。亨特知道芭芘在為新的神盾局效力之後，而自己只是芭芘的利用品而已。他心碎不已，希望芭芘能夠和自己一同離開，但是卻被芭芘拒絕。亨特試圖逃離，但是卻發現無路可走，芭芘四處尋找亨特。菲茲詢問斯凱的所在，但是庫爾森並沒有回答。菲茲詢問西蒙斯是否是她的意見讓斯凱離開。博爾特告知庫爾森33號特工和沃德潛入了自己的基地，庫爾森保證自己一定會將沃德抓住的。庫爾森對於斯凱感到十分虧欠，梅和庫爾森都不相信麥克，麥克也意識到自己可能會有大麻煩。芭芘建議讓自己重新回到神盾局，新的神盾局領導不置可否。卡拉和沃德決定要給巴克希洗腦，為自己所用。

　　當年神盾局受到九頭蛇的攻擊，麥克失去了自己的隊友蒂姆。神盾局所在的母艦已經淪陷，芭芘和麥克還在做垂死的掙扎。芭芘告訴梅並沒有找到亨特，梅和庫爾森都已經懷疑麥克和芭芘。斯凱和西蒙斯視頻，西蒙斯感到十分孤獨。菲茲對於斯凱被隔離起來十分不開心，而且將怒氣發在了西蒙斯身上。庫爾森懷疑麥克，詢問麥克的意圖。麥克坦言自己為神盾局工作，庫爾森立馬指使人包圍了麥克。梅發現芭芘背叛了自己，便和芭芘打了起來，但芭芘逃走了。斯凱在小木屋裏試了西蒙斯的手套，她試圖聯繫西蒙斯，但是卻沒有聯繫上。此時戈登來敲門，斯凱打開了門。兩人一席長談，戈登詢問斯凱關於自己異能的感受，斯凱覺得十分難受。戈登告訴斯凱他能夠幫助斯凱掌握自己的異能，斯凱有點心動，稍後戈登消失。西蒙斯設法抓住了芭比，麥克找到菲茲。庫爾森在芭比的身上找到了弗瑞交給芭比的任務: 重建神盾局，庫爾森在等待梅的迴音。“真正的神盾局”控制了神盾局，他們希望能夠找到斯凱。斯凱在小木屋裏回想自己和戈登的談話，她脱下了西蒙斯為她做的手套，嘗試着控制自己的力量，她成功的控制了水流。菲茲和西蒙斯被控制，羅伯特和庫爾森當面對質。羅伯特懷疑庫爾森對斯凱的所作所為是為了組建異能人軍團。斯凱接到了梅的電話，梅告知斯凱神盾局正在追蹤斯凱。斯凱試圖逃跑，正當芭比和“真正的神盾局”特工準備槍殺了她的時候，她使用了自己的超能力震飛了對方。斯凱召喚戈登出現，戈登將她帶走。

　　在來世，斯凱醒來後發現自己半裸着在接受治療。一旁的戈登向斯凱解釋到這是林肯（特殊能力為：電）在為其治療。林肯自稱自己是斯凱的過渡人，將幫助斯凱完成身體和心靈上的過渡，之後會有導師教導控制自己的能力。幾天之後，斯凱發現蕾娜也在來世，斯凱激動中試圖用自己的能力殺死蕾娜，這時，斯凱的導師（母親）出現阻止斯凱。斯凱表示要離開，導師希望斯凱能夠給予她幾天時間教導斯凱。與此同時菲茲發現有人正在試圖打開立方體，於是去實驗室發現是珍瑪在為新神盾局工作。失望的菲茲決定離開神盾局，在接受搜查後，菲茲拿過珍瑪遞過來的揹包，直奔機場。菲茲在揹包中發現了立方體，原來這一切都是為了珍瑪為了掉包立方體，讓菲茲帶出去而演的戲。科爾森與亨特在後援的幫助下奪取了一輛空客，決定去墨西哥找沃德，獲取關於異人族的信息，想要營救斯凱。

　　七年前，庫爾森和梅被分配到抓捕一個俄國超能力者的下落。同時，他們商量着一項秘密行動。芭芘詢問梅是否知道庫爾森的秘密，梅拒絕回答。嘉穎和斯凱聊天，嘉穎勸斯凱好好掌控自己的能力，便讓她對着一座山練習。斯凱的力量之強大，竟然讓對面的雪山崩塌，斯凱也對此十分驚異。庫爾森找到間諜，現場一片混亂。斯凱的訓練十分順利，斯凱詢問林肯關於嘉穎，但是林肯也不知道更多細節。芭芘想要説服梅將計劃説出來，但是梅拒絕合作。戈登正在給蕾娜訓練，但是蕾娜並不願意再躲在籠子裏。蕾娜覺得自己和斯凱相比，實在是運氣太差。嘉穎繼續訓練斯凱，斯凱想起了自己小時候在寄養家庭的慘痛經歷，她還提起自己在神盾局的經歷。嘉穎提起斯凱的生氣，原來她就是斯凱的母親，斯凱突然間不知所措。斯凱的母親提起之前斯凱消失後自己所經歷的恐懼和絕望。梅回來和西蒙斯碰面，梅安排西蒙斯去尋找新的神盾局的秘密。梅正在外面和庫爾森一起執勤，上級不同意梅單槍匹馬進去救人質，梅一意孤行，衝進去救人。西蒙斯提到庫爾森有秘密沒有告知梅，梅知道後也不敢相信。 梅立馬要求西蒙斯打開工具箱，西蒙斯合作。蕾娜想要離開自己的房間，但是戈登並不同意。嘉穎邀請斯凱和她父親一起吃飯，斯凱勉強答應。在吃飯的時候，斯凱父親提到她已經26歲了。

　　菲茲將工具箱帶走，庫爾森和亨特接應。斯凱的父親卡爾和嘉穎談話，他希望嘉穎能夠重歸過去。斯凱覺得那晚的晚餐還不錯，所以她並不希望嘉穎將卡爾送走，斯凱想要和嘉穎就此談談。芭芘和麥克在訓練，兩人就庫爾森的事情一番商量。西蒙斯向梅坦誠自己複製了工具箱，而真的工具箱在菲茲的手上，梅也將這件事情告訴了芭芘。庫爾森找到33號特工，就此找到了沃德。庫爾森和沃德談條件，沃德答應。菲茲因為庫爾森和沃德合作而十分生氣，幾乎要和沃德動手。斯凱找到嘉穎商量關於卡爾，嘉穎不答應將卡爾繼續留下去。沃德將巴克希介紹給庫爾森，斯凱找到卡爾，他十分開心。斯凱説服嘉穎將自己和卡爾一同離開來世，兩人相談甚歡。巴克希進入了新的神盾局的總部。斯凱偷了路人的一部電話，通知梅自己現在正在地球上，梅立馬定位斯凱。原來九頭蛇也在尋找斯凱，庫爾森十分擔心。林肯跟隨斯凱，卡爾得知自己要被排氣之後十分生氣，將林肯摔了出去。巴克希帶領九頭蛇來找斯凱，他們一行人被包圍。庫爾森立馬出動找斯凱，此時巴克希出現，將林肯和異能戰士都打倒。庫爾森和沃德見到了斯凱，但是戈登出現帶走了她。庫爾森假裝投降，闖進了“真正的神盾局”。

　　蕾娜做夢夢到了林肯和戈登，斯凱和卡爾回來找嘉穎，卡爾責備嘉穎就這麼流放自己。戈登想要回去找林肯，但是他已經被九頭蛇找到。庫爾森和羅伯特見面，庫爾森和他談條件。斯凱想要就會林肯，但是嘉穎害怕回為此付出代價，蕾娜決定要自己親自去救林肯。林肯想要逃走，巴克希和九頭蛇頭領商量該怎麼處理林肯和死亡戰士。庫爾森想要先潛入九頭蛇，原來就是菲茲和亨特。庫爾森將沃德帶回了神盾局，庫爾森發現死亡戰士已經被九頭蛇處理了。庫爾森任然相信巴克希，覺得只有這樣才能夠打入九頭蛇。庫爾森打算炸燬九頭蛇在北極圈的基地，羅伯特贊成。菲茲和西蒙斯聊天，西蒙斯不贊成帶沃德行動，她想要炸死沃德。梅責怪庫爾森對自己撒謊，庫爾森向梅解釋。斯凱想要戈登去救林肯，但是戈登覺得並不可行，蕾娜説服二人。西蒙斯要跟隨神盾局出戰，此時斯凱出現。大家都十分關心斯凱的情況，庫爾森召集大家開會。沃德看見大家都如此仇視自己，試圖想要為自己開脱。嘉穎和卡爾聊天，嘉穎向卡爾道歉。亨特和麥克聊天，兩人解開心結。九頭蛇試圖攔截神盾局的戰艦，神盾局進入了基地，巴克希為他們提供了情報。西蒙斯為死亡戰士療傷，他告訴斯凱之前林肯被人帶走了，斯凱立馬去救他。斯凱想要救活林肯，但是卻沒用。西蒙斯想要殺了沃德，但是卻誤傷了巴克希。斯凱將林肯帶走，羅伯特對庫爾森的進展十分滿意。

　　庫爾森提議要統一神盾局，羅伯特答應。斯凱陪着林肯，他醒過來之後十分生氣，覺得在神盾局知道他們的存在之後會十分危險。蕾娜預知未來的能力幫助戈登不少忙，她預言到將來他們很可能會被消滅，嘉穎和戈登商量對策。戈登和蕾娜找到可能會消滅他們的戰艦，沒和芭芘出現。嘉穎詢問卡爾關於蕾娜的情況，卡爾覺得蕾娜十分危險。亨特發現了蕾娜和戈登，二人立馬逃走。神盾局決定要使用他們的超級航母來對付這一切。庫爾森詢問斯凱關於林肯的情況，斯凱十分抗拒，最後和梅吵了一架。羅伯特研製了可以定位戈登的系統，他想要消滅異人族，庫爾森覺得這樣要先調查清楚。卡爾因為戈登和蕾娜沒能夠帶回斯凱而十分生氣，斯凱因為自己的尷尬身份而十分迷失。梅和庫爾森因為斯凱的事情而大吵一架。蕾娜預言到神盾局立馬就要來向他們開火了，蕾娜決定要單獨行動。戈登帶林肯和斯凱回去，嘉穎立馬詢問她關於神盾局的情況。神盾局大家都不同意由庫爾森去解決異人族，最後由羅伯特帶頭。卡爾和嘉穎為了保護斯凱的安全，他們決定要和神盾局決一死戰。嘉穎對蕾娜的行為十分不滿，便將她關押了起來。嘉穎決定使用卡爾作為誘餌和神盾局對話，羅伯特和嘉穎對話。嘉穎憎恨當初懷特霍爾對她所做的一切，此時她拿出武器殺掉了羅伯特。

　　嘉穎殺了羅伯特，她拿羅伯特的槍朝自己開了一槍，她出去告訴斯凱是羅伯特朝自己開的槍。戈登劫持了神盾局的戰艦，並且朝嘉穎開火。這一切激怒了斯凱，此時梅趕到，斯凱和梅動手。庫爾森也十分困惑，他覺得羅伯特肯定不會這麼蠢。斯凱為自己夾在嘉穎和神盾局之間十分沮喪，此時她找到蕾娜。蕾娜告訴在將來斯凱會成為他們異人族的領袖，而現在嘉穎只是在誤導族人。庫爾森擔心現在斯凱站在了嘉穎那一邊，梅也不得不低頭。沃德和33號特工劫持了芭比，亨特和菲茲都在找她。斯凱和嘉穎對話，嘉穎希望斯凱能夠和自己站在一起和神盾局作戰。33號特工好奇為何當初芭比會將她出賣給九頭蛇，芭比告訴她自己這麼做是為了要打入九頭蛇。 嘉穎和蕾娜談話，蕾娜告知她自己馬上就要將嘉穎的計劃告訴所有人，嘉穎十分生氣，出手殺了蕾娜。此時斯凱出現，她看到嘉穎殺了蕾娜，她立馬和嘉穎吵了起來。嘉穎派人將斯凱監禁起來，同時處理掉了蕾娜的屍體。庫爾森審問卡爾，原來卡爾此次來就是為了幹掉神盾局。沃德折磨芭比，但是她並不願意向33號特工投降。庫爾森試圖説服卡爾，但是他並不願意相信嘉穎是壞人，此時他暈了過去。在西蒙斯給他注射了腎上腺素後，卡爾變成了怪物。嘉穎的手下出現在神盾局的飛機上，他們幹掉了神盾局的很多人。庫爾森設法困住了卡爾。

　　 麥克找到斯凱，將她從監禁中釋放了出來。嘉穎要求神盾局的人延長密碼的時間，但是沒有人願意投降。亨特和梅尋找芭比，亨特找到芭比，但是沃德在房間裏設置了機關。芭比用自己的身體擋住了槍口。沃德殺了梅卻發現是變臉的33號特工。林肯對嘉穎的所作所為十分沮喪，戈登勸他繼續站在嘉穎這一邊。梅和亨特將芭比帶回神盾局，西蒙斯立馬去搶救她。林肯發現斯凱已經逃了出來，斯凱告訴他所有關於嘉穎的秘密。林肯將晶體的所在地告訴了斯凱，麥克立馬去尋找重鑄的水晶。梅給她前夫打電話，兩人一陣寒暄。西蒙斯向菲茲表白，但是菲茲並不願意在關鍵時候討論私人感情。梅對於庫爾森帶上卡爾而十分生氣，庫爾森堅持卡爾會幫助他們的。麥克找到晶體，此時戈登出現想要找到帶走晶體。庫爾森和菲茲出現，帶來了菲茲研發的干擾器，它可以限制戈登。戈登被困住，麥克和庫爾森出手。斯凱找到嘉穎，希望能夠制止她。嘉穎出手想要殺了斯凱，斯凱反抗，兩人正在爭執間，卡爾出現殺了嘉穎。庫爾森的手因為接觸到晶體而黑化，麥克及時砍掉了他的一隻手。芭比醒來，亨特在一旁陪着她。梅休假出門，卡爾在庫爾森的安排下成了一名寵物醫生，而且他對於過去已經沒有記憶。卡爾和斯凱兩人聊天。斯凱接下庫爾森的交代，西蒙斯和菲茲準備兩人約會。此時突然間晶體從隔間裏出來，將西蒙斯吸了進去。