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徐書華

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徐書華，復旦大學生命科學學院特聘教授， [4]  萬人計劃/研究員。 [1]  徐書華是中國科學院特聘研究員，中國科學院和德國馬普學會共同支持的青年科學家。他的主要研究領域是人類羣體基因組學。2006年博士畢業於復旦大學，同年入職中科院-馬普學會計算生物學夥伴研究所，歷任助理研究員、副研究員、研究員；2009年建立羣體基因組學研究組（PGG）；2012-2018年擔任德國馬普學會和中科院共同支持的青年科學家小組組長；2013年兼任上海科技大學特聘教授。 [3] 
中文名
徐書華
國    籍
中國
出生日期
1978年2月 [5] 
畢業院校
復旦大學 [3] 
學位/學歷
博士 [3] 
職    稱
研究員

目錄

  1. 1 人物經歷
  2. 2 主要成就
  3. 3 獲獎記錄
  4. 4 社會任職
  5. 5 人物訪談

徐書華人物經歷

2021/07—復旦大學生命科學學院 特聘教授
2015/01—2021/06 中國科學院 特聘研究員
2013/01—2021/06 上海科技大學 特聘教授（兼）
2012/01—2018/12 中科院-馬普計算生物學研究所 馬普青年科學家小組組長
2010/11—2021/06中科院-馬普計算生物學研究所 研究員、博士生導師
2009/11—2021/06中科院-馬普計算生物學研究所 研究組長(PI)
2006/07—2009/11中科院-馬普計算生物學研究所 助理研究員、副研究員 [4] 

徐書華主要成就

研究方向：
羣體基因組學是連接人類進化歷史和藥物遺傳學以及基因治療的橋樑。我們通過在羣體水平進行大規模基因組學研究，瞭解遺傳變異在羣體內以及羣體間的分佈模式，以及弄清影響其分佈模式的各種因素，並試圖闡明遺傳變異在羣體和基因組水平的動態演化機制。同時，通過對基因組範圍大量遺傳變異的研究，揭示其一般性質；尋找到那些偏離基因組一般性質的遺傳變異，建立起遺傳變異與環境及致病因素的關聯；並最終闡明遺傳變異與表型變異以及與內外環境相互作用的關係和機制。 [1] 
獲獎及榮譽：
[1]上海市科技啓明星（2011）; [2]教育部科學研究優秀成果獎（自然科學獎）（一等）（第二完成人）（2011）; [3]全國優秀博士論文（2011）; [4]入選中國科學院青年創新促進會（2011）; [5]復旦大學優秀博士論文（2010.1）; [6]上海市優秀博士論文（2009.12）; [7]中國科學院盧嘉錫青年人才獎（2009-2014）; [8]賽諾菲-安萬特（法國）－上海生科院優秀青年人才獎（2009); [9]明治乳業（日本）生命科學獎（2009） [1] 
代表論著：
[1]Xiong Yang, Shuhua Xu*, The HUGO Pan-Asian SNP Consortium. 2011. Identification of Close Relatives in the HUGO Pan-Asian SNP Database. PLoS One 6 (12): e29502 (10.1371/journal.pone.0029502).
[2]Wenfei Jin, Shuhua Xu*, Haifeng Wang, Yongguo Li, Yiping Shen, Bailin Wu, Li Jin*. 2011. Genome-Wide Detection of Natural Selection in African Americans Pre-and Post-Admixture. Genome Research (doi:10.1101/gr.124784.111).
[3]Wenfei Jin, Pengfei Qin, Haiyi Lou, Li Jin*, Shuhua Xu*. 2011. A Systematic Characterization of Genes Underlying both Complex and Mendelian Diseases. Hum.Mol.Genet. (doi:10.1093/hmg/DDR599).
[4]Haiyi Lou, Shilin Li, Yajun Yang, Longli Kang, Xin Zhang, Wenfei Jin, Bailin Wu , Li Jin*, Shuhua Xu*. 2011. A Map of Copy Number Variations in Chinese Populations. PLoS One 6 (11): e27341.
[5]Shuhua Xu*, Li Jin. 2011. Chromosome-Wide Haplotype Sharing: A Measure Integrating Recombination Information to Reconstruct the Phylogeny of Human Populations. Ann.Hum.Genet. 75 (6): 694-706.
[6]Shuhua Xu*, Shilin Li, Yajun Yang, Jingze Tan, Haiyi Lou, Wenfei Jin, Ling Yang, Xuedong Pan, Jiucun Wang, Yiping Shen, Bailin Wu, Hongyan Wang, Li Jin*. 2011. A Genome-Wide Search for Signals of High Altitude Adaptation in Tibetans. Mol.Biol.Evol. 28: 1003-1011.
[7]Pankaj Jha, Swapnil Sinha, Kanika Kanchan, Tabish Qidwai, Ankita Narang, Prashant Kumar Singh, Sudhanshu S. Pati, Sanjib Mohanty, Saroj K. Mishra, Surya K. Sharma, Shally Awasthi, Vimala Venkatesh, Sanjeev Jain, Analabha Basu, Shuhua Xu, Indian Genome Variation Consortium, Mitali Mukerji, Saman Habib. 2011. Deletion of the APOBEC3B gene strongly impacts susceptibility to falciparum malaria. Infection, Genetics and Evolution 12: 142-148 (10.1016/j.meegid.2011.11.001).
[8]Xiaoyun Cai, Zhendong Qin, Bo Wen, Shuhua Xu, Yi Wang, Yan Lu, Lanhai Wei, Chuanchao Wang, Shilin Li, Xingqiu Huang, Li Jin, Hui Li*, the Genographic Consortium. 2011. Human Migration through Bottlenecks from Southeast Asia into East Asia during Last Glacial Maximum Revealed by Y Chromosomes. PLoS One 6 (8): e24282.
[9]Chumpol Ngamphiw, Anunchai Assawamakin, Shuhua Xu, Philip J. Shaw, Jin Ok Yang, Ho Ghang, Jong Bhak, Edison Liu, Sissades Tongsima*, The HUGO Pan-Asian SNP Consortium. 2011. PanSNPdb: The Pan-Asian SNP Genotyping Database. PLoS One 6 (6): e21451.
[10]Wan Isa Hatin, Ab Rajab Nur-Shafawati, Mohd-Khairi Zahri, Shuhua Xu, Li Jin, Soon-Guan Tan, Mohammed Rizman-Idid, Bin Alwi Zilfalil, The HUGO Pan-Asian SNP Consortium. 2011. Population Genetic Structure of Peninsular Malaysia Malay Sub-Ethnic Groups. PLoS One 6(4): e18312.
[11]Frederick Delfin, Jazelyn M Salvador, Gayvelline C Calacal, Henry B Perdigon, Kristina A Tabbada, Lilian P Villamor, Saturnina C Halos, Ellen Gunnarsdo´ ttir, Sean Myles, David A Hughes, Shuhua Xu, Li Jin, Oscar Lao, Manfred Kayser, Matthew E Hurles, Mark Stoneking and Maria Corazon A De Ungria*. 2011. The Y-chromosome landscape of the Philippines: extensive heterogeneity and varying genetic affinities of Negrito and non-Negrito groups. Eur.J.Hum.Genet. 19: 224-230.
[12]Shuhua Xu*, Sanchit Guputa and Li Jin*. 2010. PEAS V1.0: A Package for Elementary Analysis of SNP Data. Mol.Ecol.Res. 10:1085-1088.
[13]Shuhua Xu, Daoroong Kangwanpong, Mark Seielstad, Metawee Srikummool, Jatupol Kampuansai, Li Jin*. The HUGO Pan-Asian SNP Consortium. 2010. Genetic Evidence Supports Linguistic Affinity of Mlabri — a Hunter-Gatherer Group in Thailand. BMC Genet. 11:18.
[14]The HUGO Pan-Asian SNP Consortium (Co-corresponding author). 2009. Mapping Genetic Diversity in Asia. Science 326: 1541-1545.
[15]Shuhua Xu, Xianyong Yin, Shilin Li, Wenfei Jin, Haiyi Lou, Ling Yang, Xiaohong Gong, Hongyan Wang, Yiping shen, Xuedong Pan, Yungang He, Yajun Yang, Yi Wang, Wenqing Fu, Yu An, Jiucun Wang, Jingze Tan, Ji Qian, Xiaoli Chen, Xin Zhang, Yangfei Sun, Xuejun Zhang, Bailin Wu, Li Jin. 2009. Genomic Dissection of Population Substructure of Han Chinese and Its Implication in Association Studies. Am.J.Hum.Genet. 85:762-774.
[16]Shuhua Xu and Li Jin, 2009. Response to Li et al., Am.J.Hum.Genet. 85:937-939.
[17]Shuhua Xu, Wenfei Jin, Li Jin. 2009. Haplotype Sharing Analysis Showing Uyghurs Are Unlikely Genetic Donors. Mol.Biol.Evol. 26:2197-2206.
[18]Shuhua Xu, Li Jin. 2009. Computational Biology—Review and Prospects. Science (KEXUE). 61(4):34-37.
[19]Yungang He, Shuhua Xu, Chuan Jia, Li Jin. 2009. A design of multi-source samples as a shared control for association studies in genetically stratified populations. Cell Research 19:913-915.
[20]Shuhua Xu, Li Jin. 2008. A Genome-wide Analysis of Admixture in Uyghurs and a High-Density Admixture Map for Disease-Gene Discovery. Am.J.Hum.Genet. 83:322-336.
[21]Shuhua Xu, Wei Huang, Ji Qian, Li Jin. 2008. Analysis of Genomic Admixture in Uyghur and Its Implication in Mapping Strategy. Am.J.Hum.Genet. 82:883-894.
[22]Fuzhong Xue, Yi Wang, Shuhua Xu, Feng Zhang, Bo Wen, Xuesen Wu, Ming Lu, Ranjan Deka, Ji Qian, and Li Jin. 2008. A spatial analysis of genetic structure of human populations in China reveals distinct difference between maternal and paternal lineages. Eur.J.Hum.Genet. 16:705-717
[23]Shuhua Xu, Wei Huang, Haifeng Wang, Yungang He, Ying Wang, Yi Wang, Ji Qian, Momiao Xiong, Li Jin. 2007. Dissecting Linkage Disequilibrium in African American Genomes: Roles of Markers and Individuals. Mol.Biol.Evol. 24:2049-2058. [1] 

徐書華獲獎記錄

入選國家萬人計劃科技創新領軍人才（2021.12）
2021年度上海市生物信息學會傑出貢獻獎（2021）
格致論道科學傳播大使（2021）
Journal of Genetics and Genomics （《遺傳學報》）2020年度優秀編委獎（2020）
英國皇家學會—牛頓高級訪問學者（劍橋大學）（2019～2022）
遺傳與發育協同創新中心2019年度“十大科技進展”（2020）
2019年度中國生物信息學十大進展（2020）
2019年度中國生物信息學十大數據庫（2020）
入選科技部中青年科技創新領軍人才（2018）
中科院院長獎（導師）（2018）
入選上海市優秀學術帶頭人計劃（2016）
入選“中國科學院特聘研究員” -- 特聘核心骨幹（2015）
中國科學院青年創新促進會（首屆）“優秀會員”（2015）
國家傑出青年科學基金 （2015）
國家自然科學二等獎（第2完成人）（2015）
中國科學院上海分院“青年五四獎章”（2015）
上海市遺傳學會傑出貢獻獎（2015）
中國科學院青年創新促進會2012-2013年度“優秀會員”（2013）
上海市第六屆青年科技英才提名獎（2012.11）
入選國家“萬人計劃”第一批“青年拔尖人才”（2013）
中科院青年科學家獎（2012）
中科院上海生科院-美國禮來公司優秀畢業論文導師獎（2012）
中科院上海分院第三屆傑出青年科技人才獎（2012）
教育部自然科學獎（一等）（第2完成人）（2012）
上海市科技啓明星（2011）
全國百篇優秀博士學位論文（2011）
入選首屆中國科學院青年創新促進會（2011）
復旦大學優秀博士學位論文（2010）
上海市優秀博士學位論文（2009）
法國賽諾菲-安萬特-上海生科院青年人才獎（2009）
日本明治乳業生命科學獎（2009）
中國科學院盧嘉錫青年人才獎（2009） [4] 

徐書華社會任職

兼任中國遺傳學會理事、上海市遺傳學會常務理事、上海市人類學會理事；兼任多個SCI學術期刊編委如Molecular Genetics and Genomics共同主編、Scientific Reports、Human Genomics、Hereditas、BMC Genomic Data資深編輯（Senior Editor）。 [3] 

徐書華人物訪談

科學家徐書華：研究亞洲人羣基因組 探秘人類進化奧秘
2018-11-26來源：中國新聞網 鄭瑩瑩
在亞太地區，很少有人像徐書華和他的團隊這樣，十幾年來執着探索亞洲人羣基因遺傳和演化規律的 [2]  。
徐書華是中國科學院特聘研究員，中國科學院和德國馬普學會共同支持的青年科學家。他的主要研究領域是人類羣體基因組學。
徐書華是一箇中國“土生土長”的科研人員，1978年出生的他説自己“生逢其時”，對於科研成長這個過程，內心充滿感恩。
上世紀90年代，他從湖北的一個遙遠山區走出來，1996年進入湖北大學，完成了大學和碩士研究生學習，而後到復旦大學攻讀博士學位，2006年畢業後便進入中國科學院工作。
徐書華帶領的研究組經過多年積累，系統研究了整個亞太地區人羣的遺傳多樣性、遷移歷史和適應性進化，研究水平居亞太前列。他介紹，長期以來，國際領域的生物醫學和遺傳進化研究都主要集中於歐美國家的人羣，中國乃至亞洲的人羣受關注度相對小得多，研究缺乏長期的、系統的積累。本土的人類羣體研究在國際領域也未形成與中國綜合國力相匹配的規模和地位，因此這也是他的團隊和合作者們正在努力的方向。
徐書華介紹，在學術界，他的團隊第一個利用前沿的基因組技術和計算分析手段，在基因組水平上研究了西藏藏族高原人羣的系統演化歷史，“我們研究了一系列人羣，包括：新疆的維吾爾族，西藏的藏族等一批在亞洲人羣遺傳演化中具有重要地位的族羣。”
此外，周邊國家和地區的人羣，包括南亞的印度、巴基斯坦、斯里蘭卡，東南亞的馬來西亞、菲律賓，以及中東的阿拉伯國家等等，徐書華的團隊都有長期關注。
徐書華團隊嘗試闡明這些人羣的遺傳背景以及基因組多樣性形成機制，比如：“這些人怎麼來的，他們為何會出現，當中經歷了什麼，為什麼會攜帶這些遺傳變異？”
“搞清楚這些問題，不僅能讓我們瞭解人類族羣的演化歷史，而且有助於我們理解人類基因組序列的功能和表型意義。有很多遺傳變異你只能在一些特定的少數族羣中才有可能觀察到，繼而進行研究。”他説。
徐書華介紹，基因組學跟語言學、民族關係等領域緊密關聯，羣體基因組學的研究不僅能追溯“我是誰，我從哪裏來”，還對現實的人類健康有重要的參考意義。通過回溯族羣的“基因史”，瞭解多樣化人羣演化的來龍去脈，複雜的遺傳疾病可以得到更好的理解，從而為精準醫學奠定羣體遺傳學基礎。
“今後的精準是建立在大數據基礎上的，過去一種病全世界的人可能用一種藥，未來根據羣體或個人基因組的不同，藥也需不同，比如漢族和少數民族吃的藥不同，南方人和北方人吃的藥也不同，甚至上海和浙江的居民吃的藥都不同。今後的目標是不斷精確，精確到一個特定的小羣體，最終可能一直精確到‘量身定製’的個性化醫療。”徐書華説。
伴隨中國科研實力的總體提升，本土也湧現一批優秀科研人才。作為本土成長起來的科研人才，徐書華説，希望中國能給本土科研人員創造良好的成長土壤，給他們持續、穩定的支撐，讓他們的科研事業能有更多上升的通道、成長的空間。
今後的人生路，徐書華説，很多研究尚在半途中，未來還有很長一段路要走，“至少要10年，才能將前面積累的數據以及不斷增長中的信息，逐步消化，轉變為知識。”
他有個理想，就是把一個個族羣的遺傳背景、起源和演化歷史研究清楚，建立並解析“中華民族基因庫”，為中國乃至世界的生命與醫學研究做一些基礎性工作。
參考資料