崔雋

2012/10-至今 中山大學，生命科學學院，教授

2011/10-2012/09 美國衞理會醫院研究所，博士後

2009/08-2011/10 美國貝勒醫學院, 博士後

2007/09-2009/07 美國貝勒醫學院, 交流博士生

2004/09-2009/06 南京大學，生命科學學院，博士

2000/09-2004/06 南京大學，生命科學學院，學士 ^[1] 

申請人長期從事固有免疫系統識別和調控、信號轉導機制與疾病相關性研究，在實驗生物學（特別是分子免疫學）和計算生物學（生物信號傳導網絡的數學模型建立）領域均做出了多項傑出工作，已發表學術論文20餘篇，其中第一作者和通訊作者文章13篇，包括Cell, Immunity, Nature immunology，Cell research，Biophysical Journal等頂級雜誌，撰寫書目章節2篇，論文影響因子累積150以上，引用累積已達300多次，並擁有相關專利1項。

（1）調節型Nod樣受體（Regulatory Nod like receptor）蛋白分子的發現及其在固有免疫中的關鍵負向調控作用的系統研究。申請人成功克隆了一系列調節型Nod分子（NLRC5, NLRX1 及NLRP4），並發現它們不同於之前學術界所瞭解的Nod分子（例如Nod1, Nod2, NLRP3），而是通過負向調控細胞內的炎症反應和抗病毒反應，維持細胞的穩態平衡。申請人首次發現Nod家族蛋白成員NLRC5能夠特應性結合IKK分子及RIG-I/MDA5分子，在不同的生理環境下，分別抑制機體的炎症反應和抗病毒反應，起到“一石二鳥”的負向調控作用，並以第一作者身份將這一工作發表在2010年的Cell雜誌上，這項工作被Science網站及Nature immunology雜誌分別推薦和評論，並被引用90餘次。申請人還參與發現並研究了另一調節型Nod分子NLRX1在Toll樣受體激活的炎症反應中的調控作用及分子機制，並於2011年以並列第一作者身份在Immunity雜誌上發表了相關工作。最近，申請人發現NLRP4分子是一個新型的I型干擾素途徑負調控分子，NLRP4能夠在病毒感染中，特異性地結合到活化的蛋白激酶TBK1分子上，並通過招募E3泛素化連接酶DTX4，導致TBK1的泛素化及降解，從而達到對於TBK1介導的抗病毒反應的選擇性負向調控。該項工作於2012年以申請人為第一作者發表在國際頂尖雜誌Nature immunology上。

（2）固有免疫中關鍵調控分子TAK1在中性粒細胞中的關鍵負向調控作用研究。 申請人及研究組其他成員通過構建TAK1特異性細胞缺失小鼠模型，意外地發現TAK1分子在中性粒細胞內，對於Toll樣受體介導的NF-κB及MAPK信號通路的活化不僅不是必須的，反而起到了關鍵的負向調控作用。利用中性粒細胞特異性缺失TAK1的小鼠模型，申請人發現缺失TAK1分子的中性粒細胞具有更強的NF-κB及MAPK活性，並且保持高水平的炎症因子的釋放。部分相關成果已發表在2012年的Immunity（並列第一作者）雜誌上。

（3）利用計算生物學方法對於線粒體凋亡網絡的系列模擬和分析研究：申請人利用常微分方程組（ODE）對該信號轉導網絡進行數學建模和計算機模擬分析，發現Bcl-2蛋白通過其特殊作用方式形成生物開關模式（Bio-switch），調控細胞的生存和死亡。此外，申請人及研究組其他成員創造性的利用細胞自動機（Cellular Automation）模擬了相關蛋白在線粒體膜上的隨機移動和演化過程，進一步證明了該開關模式的存在及作用機制。該工作發表在該領域的權威雜誌Biophysical Journal上（並列第一作者）， 並在2011年被Cell雜誌上的綜述文章總結並討論（Cell (2011, 144: 926-939)）。此後，申請人與其研究組連續發表5篇論文，通過系統生物學和計算機模擬的方法詳細分析和闡述了線粒體凋亡網絡的具體調控模式及和其他信號通路的crosstalk，該系列工作分別發表在BMC Bioinformatics（通訊作者）、PLOS ONE（第一作者）等學術雜誌上，形成了一個完整的對於細胞內信號轉導網絡的數學建模及分析體系。 ^[1] 

1. Tingzhe Sun,Jun Cui and Pingping Shen. Mathematical models of cell fate decision: implications for ROS and p53. Acta Biophysica Sinica. 2012, 28, 392-395.

1. Jun Cui, Yinyin Li, Liang Zhu, Dan Liu, Zhou Songyang, Helen Y Wang and Rong-Fu Wang. NLRP4 negatively regulates type I interferon signaling by targeting the kinase TBK1 for degradation via the ubiquitin ligase DTX4. Nature Immunology. 2012 13(4):387-95. (First authorship)

1. Yanzheng Tong,Jun Cui, Qingtian Li, Jia Zou, Helen Y. Wang, and Rong-Fu Wang. Enhanced TLR-induced NF-κB signaling and type I interferon responses in NLRC5 deficient mice. Cell Res. 2012 Apr 3. doi: 10.1038/cr.2012.53. [Epub ahead of print] (Shared first authorship)

1. Alagbala Ajibade A, Wang Q, Cui J, Zou J, Xia X, Wang M, Tong Y, Hui W, Liu D, Su B, Wang HY, Wang RF. TAK1 Negatively Regulates NF-κB and p38 MAP Kinase Activation in Gr-1(+)CD11b(+) Neutrophils. Immunity. 2012 Jan 27;36(1):43-54. (Shared first authorship)

1. Xiaojun Xia,Jun Cui, Helen Y. Wang, Liang Zhu, Satoko Matsueda, Qinfu Wang, Xiaoang Yang, Jun Hong, Zhou Songyang, Zhijian J. Chen and Rong-Fu Wang. NLRX1 negatively regulates TLR-induced NF-κB signaling by targeting TRAF6 and IKK. Immunity. 2011, 34, 843-853. (Shared first authorship)

1. Jun Cui, Liang Zhu, Xiaojun Xia, Helen Y. Wang, Xavier Legras, Jun Hong, Jiabing Ji, Pingping Shen, Shu Zheng, Zhijian J. Chen, and Rong-Fu Wang. NLRC5 Negatively Regulates the NF-kB and Type I Interferon Signaling Pathways.Cell. 2010, 141, 483–496. (First authorship)

1. Tingzhe Sun, Chun Chen, Yuanyuan Wu, Pingping Shen andJun Cui. Modeling the role of p53 pulses in DNA damage- induced cell death decision. BMC Bioinformatics. 2009,10:190. (Shared corresponding authorship )

1. Cui J, Chen C, Lu H, Sun T, Shen P. Two independent positive feedbacks and bistability in the Bcl-2 apoptotic switch. PLoS ONE. 2008 Jan 23;3(1):e1469. (First authorship)

1. J. Cui, C Chen, H. Lu, P. Shen. Modeling of the mitochondrial apoptosis network. International Journal of Bioinformatics Research and Applications. 2008. 4 (2): 172-187. (First authorship)

1. Chun Chen,Jun Cui, Haizhu Lu, Rui Wang, Shuai Zhang, Pingping Shen. Modeling of the role of a Bax-activation switch in mitochondrial apoptosis decision. Biophysical Journal, 2007, 92: 4304-4315 (Shared first authorship)

1. Jun Cui, Shuai Zhang, Chun Chen, Dan Zheng, Pingping Shen. Evaluation of the function of Granzyme mediated antiviral system through a mathematical model. Toxicology Mechanisms and Methods.2007.17(7): 409-420(12). (First authorship)

1. Chen C,Cui J, Zhang W, Shen P. Robustness analysis identifies the plausible model of the Bcl-2 apoptotic switch.FEBS Lett. 2007 Oct 30;581(26):5143-50.

1. Xiaofeng Bao, Jun Cui, Yuanyuan Wu, Xiaodong Han, Cheng Gao, Zichun Hua, Pingping Shen. The Roles of Endogenous Reactive Oxygen Species and Nitric Oxide in Triptolide-induced Apoptotic Cell Death in Macrophages.J Mol Med, 2007. 85:85-98.

1. Y Wu, J Cui, X Bao, S Chan, DO Young, D Liu, and P Shen, Triptolide attenuates oxidative stress, NF-kappaB activation and multiple cytokine gene expression in murine peritoneal macrophage. Int J Mol Med 2006. 17: 141-50. (Shared first authorship)

1. Ting Chen, Jun Cui, Yan Liang, Xiaoban Xin, D. Owen Young, Chun Chen, Pingping Shen, Identification of human liver mitochondrial aldehyde dehydrogenase as a potential target for microcystin-LR. Toxicology 2006. 220: 71–80. (Shared first authorship)

1. Ting Chen, Qingsong Wang,Jun Cui, Wei Yang, Qian Shi, Zichun Hua, Jianguo Ji, Pingping Shen, Induction of apoptosis in mouse liver by microcystin-LR: a combined transcriptomic, proteomic and simulation strategy. Molecular & Cellular Proteomics. 2005, 4.7: 958-974 (cover paper)

1. Q. Shi, J. Cui, J. Zhang, F.X. Kong, Z.C. Hua, P.P. Shen, Expression modulation of multiple cytokines in vivo by cyanobacteria blooms extract from taihu lake, China. Toxicon. 2004, 44: 871–879.

1. Chun Chen, Jun Cui, Shuai Zhang and Pingping Shen, Decoding the Bax-activation switch module of mitochondrial apoptosis: Analysis through deterministic and stochastic modeling, 7th Frontier Science Symposium, 23-26 Nov., 2006, Taibei, Taiwan, 22.

2. 陳春, 崔雋, 張帥, 沈萍萍, Bcl-2 家族蛋白調控線粒體外膜通透性的細胞自動機模擬. 生物信息學中的智能計算理論與方法研究, 黃德雙等編. 中國科學技術大學出版社. 2006, 194-200.

1. 陳春，崔雋，沈萍萍。細胞凋亡、MOMP 與Bcl-2 家族蛋白。中國科技論文在線。

2. 張帥，崔雋，沈萍萍。細胞凋亡中的鈣離子調控。細胞生物學雜誌，2007年29卷6期。（並列第一作者）

1. Tingzhe Sun, Meihong Cai, Jun Cui and Pingping Shen. Evaluation of Coupled Nuclear and Cytoplasmic p53 Dynamics. Interdisciplinary Research and Applications in Bioinformatics, Computational Biology, and Environmental Sciences, edited by Limin A Liu and Dongqing Wei, IGI Global. 2011, 103-116.

2. Tuo Deng,Jun Cui, Christopher J. Lyon, Nan Zhang, Helen Y. Wang, Rong-fu Wang, and Willa A. Hsueh. Inflammasomes and Obesity. Obesity. Inflammation and Cancer, edited by Andrew J. Dannenberg and Nathan A. Berger, Springer. 2013, 25-60. ^[1] 

2012年入選中山大學“百人計劃”

2011年獲全國百篇優秀博士論文提名

2011年獲美國專利 NLRC5 AS A TARGET FOR IMMUNE THERAPY (20110229560) ^[1]