孔宏智

部 門： 系統與進化植物學國家重點實驗室

課 題 組： 進化發育與調控基因組學責任研究組

研究領域： 進化發育生物學、調控基因組學

1995年畢業於西北大學生物系，2000年在中國科學院植物研究所獲得博士學位並留所工作。2002年4月至2004年10月在美國賓夕法尼亞州立大學進行合作研究。主要從事被子植物花的進化發育遺傳學、核基因家族和調控網絡的進化以及植物系統發育和分子生物地理學研究。對被子植物花部結構的多樣性有較為深入的瞭解，熟悉花的發育和核基因家族的進化。主持了國家自然科學基金之青年基金項目“金粟蘭科的系統發育和分子生物地理學研究”、主任基金項目“被子植物中最簡單的花的發育與進化”、面上基金項目“金粟蘭中5個MADS-box基因的功能與進化研究”和重點基金項目“基部真雙子葉植物中A、B、C和E類MADS-box基因的進化”。

1991.09–1995.07 西北大學生物學系，獲學士學位

1995.09–2000.07 中國科學院植物研究所，獲博士學位

2000.08–2003.05 中國科學院植物研究所，助理研究員

2002.04–2004.10 美國賓夕法尼亞州立大學，訪問博士後

2003.06–2006.12 中國科學院植物研究所，副研究員

2006.12– 中國科學院植物研究所，研究員

2007.06– 中國科學院植物研究所，博士生導師

2008.07– 進化發育與調控基因組學責任研究組，組長

北京市第十五、十六屆人民代表大會代表 ^{[1]  [5]}  。

第十四屆全國政協委員、農業和農村委員會委員 ^[6-7] 

中國植物學會執行秘書長。 ^[8] 

中國科學院王寬誠率先人才計劃盧嘉錫國際團隊項目“植物 發育、分化與適應性進化國際團隊”（GJTD-2020-05; 300萬; 2021.01-2023.12）。

國家自然科學基金重點項目“毛茛科植物花瓣蜜距起源和多樣化的分子機制研究”（31930008; 直接經費307萬; 2020.01-2024.12）。

中國科學院基礎前沿科學研究計劃從0到1原始創新項目“葉性器官形狀和結構的複雜化和多樣化：從數學模擬到分子機制的解析”（ZDBS-LY-SM002; 300萬; 2019.09-2024.09）。

中國科學院戰略性先導科技專項（B類）之子課題“花瓣形態和結構多樣化的遺傳基礎”（XDB27010304; 直接經費225萬; 2018.06-2023.05）。

國家自然科學基金“微進化過程的多基因作用機制”重大研究計劃之集成項目“新性狀起源的分子機制和疊加效應研究——以黑種草屬植物花瓣的表型複雜化為例”（91631308; 直接經費275萬; 2017.01- 2019.12）。

國家自然科學基金重點項目“毛茛科植物花瓣形態和結構的適應性進化及其分子機制研究”（31330007; 320萬; 2014.01- 2018.12）。

中國科學院科技創新交叉與合作團隊項目“Eco-Evo-Devo與Genomics創新團隊”（100萬; 2013.01-2015.12）。

國家傑出青年科學基金項目“植物進化與發育”（31125005; 240萬; 2012.01- 2015.12）。

科技部重大科學研究計劃項目“植物減數分裂過程中染色體相互作用的分子機理”之課題“減數分裂共性和特性的分子基礎”（2011CB944604; 428萬; 2011.01-2015.08）。

國家自然科學基金面上項目“重複基因在編碼區分化的機制及其進化意義的研究”（30970210; 35萬; 2010.01-2012.12）。

“花部性狀發育和演化的遺傳調控及其分子機制”，中國科學院知識創新工程重要方向項目（KSCX2-YW-R-135; 100萬; 2007.01-2010.12），主持人。

“基部真雙子葉植物中A、B、C和E類MADS-box基因的進化”，國家自然科學基金委重點基金項目（30530090; 160萬; 2006.01-2009.12），主持人。

“金粟蘭中5個MADS-box基因的功能與進化研究”，國家自然科學基金委面上基金項目（30470116; 21萬; 2005.01-2007.12），主持人。

“植物進化機制的進化發育生物學研究”之子課題“AP3 類MADS-box 基因的功能及其進化研究”，國家自然科學基金委創新研究羣體基金項目（30121003; 35萬; 2005.01-2007.12），主持人。

“植物進化過程中關鍵性狀的進化發育遺傳學研究”，中國科學院植物研究所領域前沿項目（100萬; 2005.12-2008.11），主持人。

“被子植物中最簡單的花的發育與進化”，國家自然科學基金委主任基金項目（30240002; 15萬; 2002.05-2003.04），主持人。

“金粟蘭科的系統發育和分子生物地理學研究”，國家自然科學基金委青年基金項目（30100011; 19萬; 2002.01-2004.12），主持人。

“ 金粟蘭屬植物花部器官的發育與進化”，中國科學院植物研究所繫統與進化植物學開放研究實驗室基金課題（6萬; 2000.01-2002.12），主持人。

“原始被子植物的結構、分化和演化”，路安民研究員主持的國家自然科學基金委重點基金項目（39630030; 100萬; 1997.01-2000.12），參加人。

“被子植物基部類羣的結構、分化和系統學關係”，路安民研究員主持的國家自然科學基金委重點基金項目（30130030; 105萬; 2002.01-2005.12），參加人。

“橫斷山脈地區種子植物區系中的特有現象和物種形成的研究”，楊親二研究員主持的中國科學院資源與生態環境研究重點項目（KSCXZ-SW-101A; 25萬; 1997.01-1999.12），參加人。

“橫斷山區烏頭屬植物物種形成與分化的研究”，楊親二研究員主持的國家自然科學基金委面上基金項目（30070057; 15萬; 2001.01-2003.12），參加人。

“高山松的基因組構成和進化生物學研究”，王曉茹研究員主持的國家自然科學基金委面上基金項目（30070058; 15萬; 2001.01-2003.12），參加人。

1．花的進化發育遺傳學 ^[2] 

採用進化、發育和遺傳手段，研究控制花部器官發生和發育的關鍵基因（如A、B、C和E類MADS-box基因）的數目、結構、表達、功能和進化，揭示新基因、新基因功能乃至新調控體系產生的基本式樣及其與花部結構改變的關係，探討關鍵花部性狀起源和演化的分子機理以及被子植物大類羣的起源和多樣化機制。目前的研究重點是基部真雙子葉植物花部結構的多樣化機制和核心真雙子葉植物花部結構的起源機制。 ^[2] 

2．核基因家族和調控網絡的進化 ^[2] 

利用分子進化和生物信息學研究手段，在基因組的層面上研究核基因家族的結構、變異、起源和演化，揭示調控網絡（regulatory networks）和發育途徑（developmental pathways）中各結點基因和相互作用關係的保守性和變異式樣，探討控制重要生命活動（如蛋白質降解、細胞週期和減數分裂等）的起源、維持和多樣化機制。近年來的研究主要集中在SKP1、F-box、Cyclin和recA/RAD51等基因家族的進化上。

3．植物系統發育和分子生物地理學 ^[2] 

在形態學（廣義）、細胞學和分子系統學研究的基礎上，重建植物類羣（如金粟蘭科）的系統發育，並結合植物地理學和古生物、古地理和古氣候的資料，探討類羣的起源、演化和分佈歷史 ^[2]  。

2017年獲得首屆吳徵鎰植物學獎青年創新獎 ^[3] 

83. Liu P., Zhang X., Mao J., Hong Y., Zhang R., E Y., Nie S., Jia K., Jiang C., He J., Shen W., He Q., Zheng W., Abbas S., Jewaria P. K., Tian X., Liu C., Jiang X., Yin Y., Liu B., Wang L., Jin B., Ma Y., Qiu Z., Baluska F., Samaj J., He X., Niu S., Xie J., Xie L., Xu H., Kong H., Ge S., Dixon R. A., Jiao Y.*; Lin J.*, 2020. The Tetracentron genome provides insight into the early evolution of eudicots and the formation of vessel elements. Genome Biology 21: 291.

82. Duan X., Zhao C., Jiang Y., Zhang R., Shan H.*, Kong H.*, 2020. Parallel evolution of apetalous lineages within the buttercup family (Ranunculaceae): outward expansion of AGAMOUS1, rather than disruption of APETALA3-3. The Plant Journal 104: 1169-1181.

81. Zhang R., Fu X., Zhao C., Cheng J., Liao H., Wang P., Yao X., Duan X., Yuan Y., Xu G., Kramer E. M., Shan H., Kong H.*, 2020. Identification of the key regulatory genes involved in elaborate petal development and specialized character formation in Nigella damascena (Ranunculaceae). The Plant Cell 32: 3095-3112. (Commented by Chris Whitewoods, 2020. A Damascene moment: the genetic basis of complex petals in Nigella. The Plant Cell 32: 3041-3042; recommended by PHYS.ORG: https://phys.org/news/2020-08-uncovering-developmental-mechanisms-elaborate-petals.html)

80. Zhang R., Min Y., Holappa L. D., Walcher-Chevillet C. L., Duan X., Donaldson E., Kong H., Kramer E. M.*, 2020. A role for the Auxin Response Factors ARF6 and ARF8 homologs in petal spur elongation and nectary maturation in Aquilegia. New Phytologist 227: 1392-1405.

79. Jiang Y., Wang M., Zhang R., Xie J., Duan X., Shan H., Xu G.*, Kong H.*, 2020. Identification of the target genes of AqAPETALA3-3 (AqAP3-3) in Aquilegia coerulea (Ranunculaceae) helps understand the molecular bases of the conserved and nonconserved features of petals. New Phytologist 227: 1235-1248.

78. Xie J., Zhao H., Li K., Zhang R., Jiang Y., Wang M., Guo X., Yu B., Kong H.*, Jiao Y.*, Xu G.*, 2020. A chromosome-scale reference genome of Aquilegia oxysepala var. kansuensis. Horticulture Research 7: 113.

77. Liao H., Fu X., Zhao H., Cheng J., Zhang R., Yao X., Duan X., Shan H., Kong H.*, 2020. The morphology, molecular development and ecological function of pseudonectaries on Nigella damascena (Ranunculaceae) petals. Nature Communications 11: 1777. (Recommended by Faculty Opinions: https://facultyopinions.com/prime/737746780 and Plant Science Research Weekly of Plantae; featured article of Nature Communications: https://www.nature.com/collections/jgjcebchgg)

76. Zhang J., Fu X., Li R., Zhao X., Liu Y., Li M., Zwaenepoel A., Ma H., Goffinet B., Guan Y., Xue J., Liao Y., Wang Q., Wang Q., Wang J., Zhang G., Wang Z., Jia Y., Wang M., Dong S., Yang J., Jiao Y., Guo Y., Kong H., Lu A., Yang H., Zhang S.*, Van de Peer Y.*, Liu Z.*, Chen Z.*, 2020. The hornwort genome and early land plant evolution. Nature Plants 6: 107-118.

75. Zhang L.*, Chen F., Zhang X., Li Z., Zhao Y., Lohaus R., Chang X., Dong W., Ho S. Y. W., Liu X., Song A., Chen J., Guo W., Wang Z., Zhuang Y., Wang H., Chen X., Hu J., Liu Y., Qin Y., Wang K., Dong S., Liu Y., Zhang S., Yu X., Wu Q., Wang L., Yan X., Jiao Y., Kong H., Zhou X., Yu C., Chen Y., Li F., Wang J., Chen W., Chen X., Jia Q., Zhang C., Jiang Y., Zhang W., Liu G., Fu J., Chen F., Ma H., Van de Peer Y., Tang H., 2020. The water lily genome and the early evolution of flowering plants. Nature 577: 79-84.

74. Shan H., Cheng J., Zhang R., Yao X., Kong H.*, 2019. Developmental mechanisms involved in the diversification of flowers. Nature Plants 5: 917-923.

73. Yao X., Zhang W., Duan X., Yuan Y., Zhang R., Shan H., Kong H.*, 2019. The making of elaborate petals in Nigella through developmental repatterning. New Phytologist 223: 385-396.

72. Zhai W., Duan X., Zhang R., Guo C., Li L., Xu G., Shan H., Kong H.*, Ren Y.*, 2019. Chloroplast genomic data provide new and robust insights into the phylogeny and evolution of the Ranunculaceae. Molecular Phylogenetics and Evolution 135: 12-21.

71. 王宏哲, 張睿, 程劼, 段曉姍, 趙慧琪, 山紅豔, 孔宏智*, 2019. 花基本結構的多樣性及其分子機制. 中國科學：生命科學 49: 292-300.

70. 陳凡, 錢前, 王台, 董愛武, 漆小泉, 左建儒, 楊淑華, 林榮呈, 蕭浪濤, 顧紅雅, 陳之端, 姜裏文, 白永飛, 孔宏智, 種康, 2018. 2017年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 53: 391-440.

69. Zhang L., Kong H., Ma H., Yang J.*, 2018. Phylogenomic detection and functional prediction of genes potentially important for plant meiosis. Gene 643: 83-97.

68. Harkess A., Zhou J., Xu C., Bowers J. E., Van der Hulst R., Ayyampalayam S., Mercati F., Riccardi P., McKain M. R., Kakrana A., Tang H., Ray J., Groenendijk J., Arikit S., Mathioni S. M., Nakano M., Shan H., Telgmann-Rauber A., Kanno A., Yue Z., Chen H., Li W., Chen Y., Xu X., Zhang Y., Luo S., Chen H., Gao J., Mao Z., Pires J. C., Luo M., Kudrna D., Wing R. A., Meyers B. C., Yi K., Kong H., Lavrijsen P., Sunseri F., Falavigna A., Ye Y.*, Leebens-Mack J. H.*, Chen G.*, 2017. The asparagus genome sheds light on the origin and evolution of a young Y chromosome. Nature Communications 8:1279.

67. Kramer E. M.*, Kong H., Rausher M. D., 2017. Plant evolutionary developmental biology. Introduction to a special issue. New Phytologist 216: 335-336.

66. 王小菁, 蕭浪濤, 董愛武, 王台, 錢前, 漆小泉, 陳凡, 左建儒, 楊淑華, 顧紅雅, 陳之端, 姜裏文, 白永飛, 孔宏智, 種康, 2017. 2016年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 52: 394-452.

65. 山紅豔, 孔宏智*, 2017. 花是如何起源的？科學通報 62: 2323-2334.

64. Huang J., Li Z., Biener G., Xiong E., Malik S., Eaton N., Zhao C. Z., Raicu V., Kong H., Zhao D.*, 2017. Carbonic anhydrases function in anther cell differentiation downstream of the receptor-like kinase EMS1. The Plant Cell 29: 1335-1356.

63. 楊淑華, 王台, 錢前, 王小菁, 左建儒, 顧紅雅, 姜裏文, 陳之端, 白永飛, 孔宏智, 陳凡, 蕭浪濤, 董愛武, 種康, 2016. 2015年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 51: 416-472.

62. Ye L., Wang B., Zhang W., Shan H.*, Kong H.*, 2016. Gains and losses of cis-regulatory elements led to divergence of the Arabidopsis APETALA1 and CAULIFLOWER duplicate genes in the time, space, and level of expression and regulation of one paralog by the other. Plant Physiology 171: 1055-1069. (Commented by Gunter Theissen and Francois Parcy at Flowering Highlights; recommended by F1000Prime: https://facultyopinions.com/prime/726292577; Top Topics from 2016 of Plant Physiology)

61. Yu X., Duan X., Zhang R., Fu X., Ye L., Kong H., Xu G.*, Shan H.*, 2016. Prevalent exon-intron structural Changes in the APETALA1/FRUITFULL, SEPALLATA, AGAMOUS-LIKE6, and FLOWERING LOCUS C MADS-box gene subfamilies provide new insights into their evolution. Frontiers in Plant Science 7: 598.

60. Wang P., Liao H., Zhang W., Yu X., Zhang R., Shan H., Duan X., Yao X., Kong H.*, 2016. Flexibility in the structure of spiral flowers and its underlying mechanisms. Nature Plants 2: 15188. (Commented by Douglas E. Soltis, 2016. Diversification of the flower. Nature Plants 2: 15211.)

59. 孔宏智*, 2016. 生物多樣性事業呼喚對物種概念和物種劃分標準的深度討論. 生物多樣性 24: 977-978.

58. 種康, 王台, 錢前, 王小菁, 左建儒, 顧紅雅, 姜裏文, 陳之端, 白永飛, 楊淑華, 孔宏智, 陳凡, 蕭浪濤, 2015. 2014年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 50: 412-459.

57. Li L., Yu X., Guo C., Duan X., Shan H., Zhang R., Xu G., Kong H.*, 2015. Interactions among proteins of floral MADS-box genes in Nuphar pumila (Nymphaeaceae) and the most recent common ancestor of extant angiosperms help understand the underlying mechanisms of the origin of the flower. Journal of Systematics and Evolution 53: 285-296.

56. Li H., Meng F., Guo C., Wang Y., Xie X., Zhu T., Zhou S., Ma H., Shan H.*, Kong H.*, 2014. MeioBase: a comprehensive database for meiosis. Frontiers in Plant Science 5: 728.

55. Zeng L., Zhang Q., Sun R., Kong H., Zhang N.*, Ma H.*, 2014. Resolution of deep angiosperm phylogeny using conserved nuclear genes and estimates of early divergence times. Nature Communications 5: 4956.

54. Jia R., Guo C., Xu G., Shan H., Kong H.*, 2014. Evolution of the cyclin gene family in plants. Journal of Systematics and Evolution 52: 651-659.

53. 袁明, 瞿禮嘉, 王小菁, 錢前, 楊維才, 王台, 孔宏智, 蔣高明, 種康, 2014. 2013年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 49: 347-406.

52. 孔宏智*, 2014. 從基因組到多樣性. 生物多樣性 22: 1-2.

51. 張睿*, 國春策, 山紅豔, 孔宏智, 2014. 發育重塑與生物多樣性. 生物多樣性 22: 66-71.

50. 國春策*, 張睿, 山紅豔, 孔宏智, 2014. 調控進化與形態多樣性. 生物多樣性 22: 72-79.

49. 錢前, 瞿禮嘉, 袁明, 王小菁, 楊維才, 王台, 孔宏智, 蔣高明, 種康, 2013. 2012年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 48: 231-287.

48. Amborella Genome Project, 2013. The Amborella genome and the evolution of flowering plants. Science 342: 1241089.

47. Zhang R., Guo C., Zhang W., Wang P., Li L., Duan X., Du Q., Zhao L., Shan H., Hodges S. A., Kramer E. M., Ren Y.*, Kong H.*, 2013. Disruption of the petal identity gene APETALA3-3 is highly correlated with loss of petals within the buttercup family (Ranunculaceae). Proceedings of the National Academy of Sciences USA 110: 5074-5079.

46. Kahloul S., El Beji I. H. S., Boulaflous A., Ferchichi A., Kong H., Mouzeyar S.*, Bouzidi M. F., 2013. Structural, expression and interaction analysis of rice SKP1-like genes. DNA Research 20: 67-78.

45. 瞿禮嘉, 錢前, 袁明, 王小菁, 楊維才, 王台, 孔宏智, 蔣高明, 種康, 2012. 2011年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 47: 309-356.

44. Wang B., Zhang N., Guo C., Xu G., Kong H., Shan H.*, 2012. Evolutionary divergence of the APETALA1 and CAULIFLOWER proteins. Journal of Systematics and Evolution 50: 502-511.

43. 孔宏智*, 2012. 生物多樣性是如何產生的？生物多樣性 20: 117-118.

42. Xu G., Guo C., Shan H., Kong H.*, 2012. Divergence of duplicate genes in exon–intron structure. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 109: 1187-1192.

41. 袁明, 王小菁, 錢前, 楊維才, 瞿禮嘉, 王台, 孔宏智, 許亦農, 蔣高明, 種康, 2011. 2010年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 46: 233-275

40. Liu Y., Guo C., Xu G., Shan H., Kong H.*, 2011. Evolutionary pattern of the regulatory network for flower development: insights gained from a comparison of two Arabidopsis species. Journal of Systematics and Evolution 49: 528-538.

39. Zhang Q., Antonelli A., Feild T.S., Kong H.*, 2011. Revisiting taxonomy, morphological evolution, and fossil calibration strategies in Chloranthaceae. Journal of Systematics and Evolution 49: 315-329.

38. Sharma B., Guo C., Kong H., Kramer E. M.*, 2011. Petal-specific subfunctionalization of an APETALA3 paralog in the Ranunculales and its implications for petal evolution. New Phytologist 191: 870-883.

37. 李安, 徐桂霞, 孔宏智*, 2011. F-box基因拷貝數目變異的機制研究：以12種果蠅為例. 生物多樣性19: 3-16.

36. Liu C., Zhang J., Zhang N., Shan H., Su K., Zhang J., Meng Z., Kong H.*, Chen Z.*, 2010. Interactions among proteins of floral MADS-box genes in basal eudicots: implications for evolution of the regulatory network for flower development. Molecular Biology and Evolution 27: 1598-1611.

35. Gao X., Liang W., Yin C., Ji. S., Wang H., Su X., Guo C., Kong H., Xue H., Zhang D.*, 2010. The SEPALLATA-Like gene OsMADS34 is required for rice inflorescence and spikelet development. Plant Physiology 153: 728-740.

34. 薛皓月, 徐桂霞, 國春策, 山紅豔, 孔宏智*, 2010. 擬南芥和琴葉擬南芥中MADS-box基因的比較進化分析. 生物多樣性 18: 109-119.

33. Li H., Liang W., Jia R., Yin C., Zong J., Kong H., Zhang D.*, 2009. The AGL6-like gene OsMADS6 regulates floral organ and meristem identities in rice. Cell Research 20: 299-313.

32. 王台, 錢前, 袁明, 王小菁, 楊維才, 瞿禮嘉, 孔宏智, 許亦農, 蔣高明, 種康, 2010. 2009年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 45: 265-306.

31. Shan H., Zahn L., Guindon S., Wall P. K., Kong H., Ma H., dePamphilis C. W., Leebens-Mack J.*, 2009. Evolution of plant MADS-box transcription factors: evidence for shifts in selection associated with early angiosperm diversification and concerted gene duplications. Molecular Biology and Evolution 26: 2229-2244.

30. 楊維才, 瞿禮嘉, 袁明, 王小菁, 王台, 孔宏智, 許亦農, 蔣高明, 種康, 2009. 2008年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 44: 379-409.

29. Wang X., Kong H., Ma H.*, 2009. F-box proteins regulate ethylene signaling and more. Genes & Development 23: 391-396.

28. Xu G., Ma H., Nei M.*, Kong H.*, 2009. Evolution of F-box genes in plants: different modes of sequence divergence and their relationships with functional diversification. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 106: 835-840.

27. 瞿禮嘉, 王小菁, 王台, 楊維才, 許亦農, 袁明, 蔣高明, 孔宏智, 種康, 2009. 2007年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學報 44: 2-26.

26. Su K., Zhao S., Shan H., Kong H., Lu W., Theissen G., Chen Z.*, Meng Z.*, 2008. The MIK region rather than the C-terminal domain of AP3-like class B floral homeotic proteins determines functional specificity in the development and evolution of petals. New Phytologist 178: 544-558.

25. Quan L., Xiao R., Li W., Oh S.-A., Kong H., Ambrose J. C., Malcos J. L., Cyr R., Twell D., Ma H.*, 2008. Functional divergence of the duplicated AtKIN14a and AtKIN14b genes: critical roles in Arabidopsis meiosis and gametophyte development. The Plant Journal 53: 1013-1026.

24. Zhu X., Chase M. W., Qiu Y., Kong H., Dilcher D. L., Li J., Chen Z.*, 2007. Mitochondrial matR sequences help to resolve deep phylogenetic relationships in rosids. BMC Evolutionary Biology 7: 217.

23. Shan H., Zhang N., Liu C., Xu G., Zhang J., Chen Z.*, Kong H.*, 2007. Patterns of gene duplication and functional diversification during the evolution of the AP1/SQUA subfamily of plant MADS-box genes. Molecular Phylogenetics and Evolution 44: 26-41.

22. Xu G., Kong H.*, 2007. Duplication and divergence of floral MADS-box genes in grasses: evidence for the generation and modification of novel regulators. Journal of Integrative Plant Biology 49: 927-939.

21. 種康, 瞿禮嘉, 袁明, 王小菁, 楊維才, 王台, 許亦農, 蔣高明, 孔宏智, 2007. 2006年中國植物科學若干領域重要研究進展. 植物學通報 24: 253-271.

20. Kong H.*, Landherr L. L., Frohlich M. W., Leebens-Mack J., Ma H., dePamphilis C. W.*, 2007. Patterns of gene duplication in the plant SKP1 gene family in angiosperms: evidence for multiple mechanisms of rapid gene birth. The Plant Journal 50: 873-885.

19. Shan H., Su K., Lu W., Kong H., Chen Z.*, Meng Z.*, 2006. Conservation and divergence of candidate class B genes in Akebia trifoliata (Lardizabalaceae). Development Genes and Evolution 216: 785-795.

18. Lin Z., Kong H., Nei M.*, Ma H.*, 2006. Origins and evolution of the recA/RAD51 gene family: Evidence for ancient gene duplication and endosymbiotic gene transfer. Proceedings of the National Academy of Sciences USA 103: 10328-10333.

17. Kim S.*, Koh J., Yoo M.-J., Kong H., Hu Y., Ma H., Soltis P. S., Soltis D. E.*, 2005. Expression of floral MADS-box genes in basal angiosperms: Implication for the evolution of floral regulators. The Plant Journal 43: 724-744.

16. Li G., Meng Z.*, Kong H., Chen Z., Theissen G., Lu A.*, 2005. Characterization of candidate class A, B and E floral homeotic genes from the perianthless basal angiosperm Chloranthus spicatus (Chloranthaceae). Development Genes and Evolution 215: 437-449.

15. Zahn L. M., Kong H. (equal contribution), Leebens-Mack J. H., Kim S., Soltis P. S., Landherr L. L., Soltis D. E., dePamphilis C. W., Ma H.*, 2005. The Evolution of the SEPALLATA subfamily of MADS-box genes: A pre-angiosperm origin with multiple duplications throughout angiosperm history. Genetics 169: 2209-2223.

14. Wang G., Kong H. (equal contribution), Sun Y., Zhang X., Zhang W., Altman N., dePamphilis C. W., Ma H.*, 2004. Genome-wide analysis of the cyclin family in Arabidopsis and comparative phylogenetic analysis of plant cyclin-like proteins. Plant Physiology 135: 1084-1099.

13. Kong H., Leebens-Mack J., Ni W., dePamphilis C. W., Ma H.*, 2004. Highly heterogeneous rates of evolution in the SKP1 gene family in plants and animals: functional and evolutionary implications. Molecular Biology and Evolution 21: 117-128.

12. Li G., Meng Z.*, Kong H., Chen Z., Lu A.*, 2003. ABC model and floral evolution. Chinese Science Bulletin 48: 2415-2421 (in Chinese); 48: 2651-2657 (in English)

11. Zhang F., Kong H., Ge S.*, 2003. Allozyme variation and population differentiation of the Aconitum delavayi complex (Ranunculaceae) in the Hengduan Mountains of China. Biochemical Genetics 41: 47-55.

10. Kong H.*, Lu A., Endress P. K., 2002. Floral organogenesis of Chloranthus sessilifolius, with special emphasis on the morphological nature of the androecium of Chloranthus (Chloranthaceae). Plant Systematics and Evolution 232: 181-188.

09. Kong H.*, Chen Z., Lu A., 2002. Phylogeny of Chloranthus (Chloranthaceae) based on nuclear ribosomal ITS and plastid trnL-F sequence data. American Journal of Botany 89: 940-946.

08.劉建全, 何亞平, 孔宏智, 2002. 大吳風草屬、假橐吾屬花粉表面紋飾及其分類學意義. 西北植物學報 22: 33-36.

07. Kong H.*, 2001. Comparative morphology of leaf epidermis in the Chloranthaceae. Botanical Journal of the Linnean Society 136: 279-294.

06. Kong H., 2000. Taxonomic notes on Chloranthus henryi Hemsl. and its allies. Acta Phytotaxonomica Sinica 38: 355-365.

05. 錢韋*, 孔宏智, 劉忠, 楊冬之, 2000. 評統一進化理論——與陳繼明先生商榷. 科學通報45: 885-889.

04. Kong H., Chen Z., 2000. Phylogeny in Chloranthus Swartz (Chloranthaceae) inferred from sequence analysis of nrDNA ITS region. Acta Botanica Sinica 42: 762-764.

03. Kong H.*, 2000. Karyotypes of Sarcandra Gardn. and Chloranthus Swartz (Chloranthaceae) from China. Botanical Journal of the Linnean Society 133: 327-342.

02. Kong H.*, Liu J., 1999. Karyomorphology of the genus Pomatosace Maxim. (Primulaceae). Acta Phytotaxonomica Sinica 37: 445-450.

01. Kong H., Yang Q.*, 1997. Karyomorphology and relationships of the genus Circaeaster Maxim. Acta Phytotaxonomica Sinica 35: 494-499.

01. Soltis D. E.*, Albert V. A., Kim S., Yoo M. J. , Soltis P. S., Frohlich M. W., Leebens-Mack J., Kong H., Wall K., dePamphilis C. W., Ma H., 2005. Evolution of the Flower. In Plant Diversity and Evolution: Genotypic and Phenotypic Variation in Higher Plants, Ed. Henry R. J.. CABI Publishers pp. 165-200. ^[4]