奇境傳説

Alice回到家中，父親告訴她所有人都以為她已經死了。Alice稱自己過去這段時間去了神秘的奇境，還和一隻白兔子（John Lithgow配音）説話，這些「瘋話」很快讓她被關進了精神病院。Lydgate勸説Alice接受特別治療，忘掉所有的痛苦。就在手術即將開始的時候，紅心傑克突然趕來救了Alice。他把Alice帶到白兔子面前，白兔子稱Alice摯愛的Cyrus還活着。白兔子開啓了一個傳送門，三人一起返回奇境。Alice決心找到Cyrus，但邪惡的賈方（Naveen Andrews）和紅皇后（Emma Rigby）卻對她百般阻撓。

愛麗絲宣稱自己知道塞勒斯的魔瓶所在之地，叫傑克一同前去尋找。原來愛麗絲只不過是用塞勒斯的魔瓶作為誘餌，來引誘對手現身。賈方尋找魔瓶未果，紅皇后從兔子處得知魔瓶真正的下落。當愛麗絲找到當年與塞勒斯共同埋葬魔瓶的地點，卻發現魔瓶已經不見了。原來塞勒斯沒有死，他被賈方囚禁着。塞勒斯送信給愛麗絲讓她回家，愛麗絲卻堅持要去找他。

威爾加入了俠盜集團，他擅自從邪惡女巫的城堡中偷走了一個有魔法的穿越鏡，他與女友阿納斯塔西婭通過穿越鏡來到了仙境。塞勒斯成功誘騙賈方和紅皇后派遣豬熊獸去追蹤愛麗絲，最終愛麗絲成功將豬熊獸制服。為了找出是誰偷走了魔瓶，愛麗絲與傑克輾轉找到了能夠重現過去的遺忘繩結。愛麗絲與傑克發現是兔子出賣了他們，將魔瓶交給了紅皇后。

賈方是蘇丹王的私生子，他為了向拋棄自己的父親復仇開始跟隨女巫阿瑪拉學習黑暗魔法。賈方學成後將阿瑪拉變成眼鏡蛇魔杖，而他為了完成咒語四處收集精靈。紅皇后抓到了傑克，麗莎幫助愛麗絲營救傑克。賈方執意要殺死傑克，這讓紅皇后十分為難，原來紅皇后就是阿納斯塔西婭。傑克命懸一線，愛麗絲使用了一個願望來救他。為了逼愛麗絲許願，賈方將傑克變為石頭。與此同時，塞勒斯計劃從牢籠中逃走。

原來傑克就是紅皇后昔日的戀人威爾，兩人穿越到仙境。虛榮的紅皇后讓傑克帶自己混進王宮中參加舞會，誰知國王對紅皇后一見鍾情，國王將她封為皇后，傑克慘被拋棄。紅皇后欺騙愛麗絲從大峽谷取得了仙塵，她用仙塵將傑克恢復人形。同時，塞勒斯施計從囚牢中逃了出來，愛麗絲用偷偷留下的一點仙塵繼續尋找塞勒斯。

賈方來到貝特萊姆精神病院，向醫生打探愛麗絲過往。一年前，失去塞拉斯的愛麗絲回到家，父親不相信她還把她送進精神病院。仙境的黑森林裏，愛麗絲被米堡果林裏的一種花迷失心智，她漸漸忘記了一切。傑克發現了真相，他用愛麗絲珍愛的項鍊喚醒了愛麗絲。塞拉斯逃到懸崖邊遇到了尾隨其後的紅皇后，他毅然跳下懸崖。此時，賈方找到了愛麗絲的父親。

賈方囚禁了愛麗絲父親愛德温，用他的血製成藥劑易容成愛德温樣子。愛麗絲不知塞拉斯已逃走，依舊去塔樓救人。小賈方去皇宮尋找生父，蘇丹王不但不承認他還想溺死他，但賈方倖存了下來。賈方長大後復仇，將老蘇丹王囚禁了起來。假冒的愛德温被識破，賈方用真愛德温威脅愛麗絲，愛麗絲為救父親再次許願。愛德温後悔錯怪女兒，他告知愛麗絲塞拉斯已逃走。

塞勒斯落入陷阱被抓，紅皇后帶着他找愛麗絲，賈方得知受騙製造出雷雨雲追殺紅皇后。愛麗絲來到和塞勒斯生活過的愛巢，塞勒斯隨後也趕到。紅皇后表示願拋棄一切換回傑克，雷雨雲突然追來，傑克被擊中，愛麗絲因許過保護傑克的願望也面臨死亡。愛麗絲曾承諾給傑克一個願望，傑克許願解除愛麗絲的痛苦。塞拉斯獲真正的自由，傑克醒來卻發現自己成了魔瓶中的精靈。

麗莎將傑克從魔瓶中釋放，麗莎有機會讓自己的三個願望變為現實。紅皇后被一羣農夫抓住，農夫們要求紅皇后為當初的殘暴統治付出代價，最終塞勒斯與愛麗絲冒着生命危險救了她。賈方奪取了紅皇后的城堡，並計劃與令人畏懼的強大怪物伽卜沃奇結為聯盟。麗莎許願讓傑克愛上自己，她因這個願望而死去。紅皇后找到了魔瓶，塞勒斯得知自己的兩個哥哥在賈方手上。

賈方用巫術找到精靈在紅皇后身上，伽卜沃奇前去尋找。為了治療母親阿瑪拉的燒傷，塞勒斯不顧詛咒偷走奇蹟之井的水，結果三兄弟被封印在魔瓶中。愛麗絲和塞勒斯一同去仙境尋找奇蹟之井，紅皇后和傑克則尋找白兔幫忙想重奪仙境。愛麗絲幫助塞勒斯找到奇蹟之井，塞勒斯卻無法破除魔咒。伽卜沃奇將紅皇后和傑克囚禁，紅皇后被迫許了三個願望願，傑克重回魔瓶，賈方因此集齊了三個魔瓶。

塞勒斯假意和精靈交易，他和愛麗絲趁亂將羅盤偷了出來。半斤將紅皇后被囚禁的消息通知給愛麗絲，伽卜沃奇被放出的消息令愛麗絲更加恐懼。賈方的咒語無法喚醒傑克，伽卜沃奇也無法讀取傑克的心。伽卜沃奇察覺紅心傑克沒有心，她用紅皇后要挾傑克。愛麗絲在白兔的幫助下穿越到了童話鎮，他們找到傑克的心結果卻被賈方劫走。紅心傑克重新恢復記憶，賈方卻將劍刺進了紅皇后的身體。

賈方用紅皇后威脅傑克幫他找權杖，傑克不得已去尋找愛麗絲。塞勒斯和愛麗絲準備去奇蹟之井，傑克打算暗中偷走權杖，結果愛麗絲不小心墜崖，傑克捨命將愛麗絲救起，愛麗絲想起當時她幫傑克尋找紅心的經歷。伽卜沃奇偷偷找到愛麗絲打算聯合對付賈方，塞勒斯假裝人質被帶進皇宮。阿瑪拉從權杖中出來和賈方對峙在一起，塞勒斯偷魔瓶卻被賈方擊中胸口，阿瑪拉為救兒子不得已施法改變魔法規則。

獲得強大力量的賈方成功讓父親喜愛他，同時強迫Anastasia愛上自己。Alice、Amara和Cyrus逃走之後，賈方囚禁了炸脖龍並召喚一支死亡戰士大軍來為自己效命。與此同時，Alice和白兔子也集合了自己的軍隊來對抗賈方，試圖一勞永逸地解放整個奇境。Alice與賈方在奇蹟井邊擺開對決之勢，大戰一觸即發。