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基因組文庫
鎖定
基因組文庫是指將某生物的全部基因組
DNA切割成一定長度的DNA 片段克隆到某種載體上而形成的集合。基因組文庫根據DNA 來源又分為
核基因組文庫、
葉綠體基因組文庫及
線粒體基因組文庫。基因組文庫構建時
遺傳信息供體是
基因組DNA,因而無發育時期及
組織器官特異性,在一個完全的基因組文庫中包含着基因組DNA 上的所有
編碼區及
非編碼區序列的克隆; 生物
有機體的每一個基因在文庫中都有其克隆,該克隆的
基因片段裏包括着間隔序列,所以基因組文庫可真實地顯示基因組的全部結構信息。
[1]
基因組文庫(Genomic Library)定義:把某種生物基因組的全部遺傳信息通過
克隆載體貯存在一個
受體菌克隆子羣體中,這個羣體即為這種生物的基因組文庫。
- 中文名
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基因組文庫
- 外文名
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genomic library
基因組文庫定義
用
限制性核酸內切酶切割細胞的整個
DNA,可以得到大量的DNA片段,然後將這些DNA片段與載體連接,再轉移到細菌中去,讓宿主菌長成後進行克隆。這樣,每個克隆的細胞的載體上都包含有特定的
基因組DNA片段,整個克隆羣體就包含基因組的全部
基因片段總和稱為基因組文庫。
基因組文庫文庫最小值
一個理想的基因組文庫要有足夠多的克隆子數,以保證所有的基因都在克隆子羣體中。為了獲得某種基因需要構建的基因組文庫的
最小值可按下面的
經驗公式估算:
N=ln(1-P)/ln(1-f)
公式中,N表示基因組文庫必須的克隆子數;P表示文庫中
目的基因出現的頻率,一般情況下,
期望值為99%,即0.99;f是克隆的DNA片段平均大小與
基因組大小的比值。
基因組文庫克隆載體
常見的用於構建基因組文庫的
克隆載體有
λ噬菌體克隆載體、cosmid克隆載體、
BAC克隆載體、BIBAC克隆載體、PAC克隆載體和
YAC克隆載體。
- 參考資料
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1.
賀淹才.基因工程概論:清華大學出版社,2008