Entrez

它包括核酸，蛋白以及Medline文摘數據庫，在這三個數據庫中建立了非常完善的聯繫。因此，可以從一個DNA序列查詢到蛋白產物以及相關文獻，而且，每個條目均有一個類鄰（neighboring）信息，給出與查詢條目接近的信息。

Entrez中核酸數據庫為：GenBank,EMBL,DDBJ

蛋白質數據庫為：Swiss-Prot,PIR,PFR,PDB

PubMed

基因組和染色體圖譜資料

檢索領域：（Search Fields）

在WWW Entrez檢索系統中，檢索內容被分為許多小的領域，每一個檢索領域包含以下信息：

進入（Accession）：包含進入號

相關性（Affiliation）：包括該檢索領域建立時的相關信息，原作者地址，有時亦有其他作者地址

作者姓名（Author Name）：包含文章作者清單。

E.C號（E.C.Number）：是酶學委員會命名的酶的編號

特徵詞（Feature Key）：描述DNA特徵的關鍵詞

基因符號（Gene Symbol）：基因的標準名稱。

雜誌名（Journal Title）：為檢索條目第一次發表時的雜誌名，該雜誌名是以縮寫形式儲存於數據庫中，如果不清楚雜誌是如何縮寫的可採用List Terms來查看。

關鍵詞（Keywords）：可以使用較特定的索引條目來檢索以上數據庫。類似於醫學光盤檢索。

Medline UID ：是Medline對每一個條目給出的唯一識別標記。

MeSH主題詞（MeSH Terms）：包括 MeSH的主題詞，下級主題詞。

MeSH主要關鍵詞 （MeSH Major Topic）：為檢索條目十分重要的MeSH詞目。

修改日期（Modification Date）：包含該條目進入Entrez的日期，與出版日期一樣，以年/月/日形式出現

頁數（Page Number）：該文章所在雜誌的頁碼。

特性（Property）：一個或幾個關鍵詞，用來描述該序列的類型。

出版日期（Publication Date）：包含文章出版日期以及序列錄入GenBank的日期。

PubMed ID:PubMed對每一個條目給出的識別標記。

物種（Organism）：包含與該蛋白或核酸序列相關物種的學名和俗名。

蛋白質名稱（Protein name）:

Seq Id: 與FASTA識別標記類似，為序列的一種識別標記

物質（Substance）：與該條目相關的化學物質名稱。

文字檢索詞（Text Words）：包含文章中的所有詞，其中：

Medline詞目：標題和文摘

蛋白質詞目：定義，評論，蛋白名稱，蛋白描述

核酸條目：定義，評論，基因名稱，基因名稱

標題檢索詞（Title Words）：在標題中出現的詞，或在描述該條目時出現的詞。

卷（Volume）：刊登該文章雜誌所在卷

使用Medline UID,PubMed ID和 Seq ID進行檢索時，在欄目框中要輸入數字。如要輸入多個數字，中間要用空格或逗號隔開。並選擇相對應的檢索領域。

檢索模式（Search Modes）

www Entrez可以採用幾種不同途徑的檢索方式

名詞列表格式（list term）：當輸入一檢索詞後，Entrez將列出與此相關的該領域中所有標準的檢索詞名稱，此時，可選擇一或多個標準名詞去檢索。

自動格式（automatic）：當輸入一個檢索詞後，即自動檢索，如果輸入的檢索詞超過一個，則Entrez會自動將之組合起來，如果無結果，則可嘗試將這多個檢索詞用“ ”括起來。

閲讀文獻（Viewing Document）

每一個文件都可以有數種閲讀方式，目的各不相同。一般來説，“引文格式（citation）”最適合於閲讀Medline形式的文件；“GenPept” 格式適用於閲讀蛋白質文件；“GenBank”格式用來閲讀核酸文件。

閲讀方式

可單一閲讀，亦可成批閲讀

對於PubMed文章：

引文（citation）格式：包含題目，文摘，MeSH主題詞等

文摘格式：包含題目，文摘

ASN.1格式：文章以ASN.1格式出現

MEDLINE格式：文章以MEDLINE格式出現

GenBank/GenPept格式： 標準的GenBank或GenPept格式

Report格式：GenBank格式

圖形格式（Graphic View）

對於結構文件：

結構總結格式：結構的基本信息，可以看三維結構

ASN.1格式：

對於基因組文件：

圖形格式

ASN.1格式