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芥菜基因組
鎖定
芥菜（Brassica juncea，2n=36，AABB）是十字花科重要經濟作物之一，根據禹氏三角可知芥菜是由蕓薹（Brassica campestris，2n=20，AA）和黑芥（Brassica nigra，2n=16，BB）雜交後加倍形成的異源四倍體。
2016年，中國科學家完成芥菜基因組的測序，研究成果“The genome sequence of allopolyploid Brassica juncea and analysis of differential homoeolog gene expression influencing selection”發表在國際期刊《Nature Genetics》上。
- 中文名
- 芥菜
- 外文名
- Brassica juncea
- 染色體
- 18條
- NCBI登錄號
- GCA_001687265.1
- 組裝水平
- Chromosome
- 科
- 十字花科
- 屬
- 蕓薹屬
芥菜基因組背景
芥菜基因組基因組信息
測序材料為榨菜T84-66，基因組完整性達到85%，採用從頭+同源+轉錄組結合的方法在芥菜基因組中獲得了80050個編碼蛋白的基因，其中有97.8%的基因可以註釋到Nr庫。
芥菜基因組主要結果
- 確定了芥菜的A基因組來源：芥菜和油菜的A基因組來源不同，芥菜（AABB）的A基因組來源於白菜型油菜，油菜（AACC）的A基因組起源於歐洲蕪菁。
芥菜A亞基因組的起源
芥菜基因組延伸
芥菜基因組公佈後，關於芥菜起源問題一直懸而未決。2018年，中國科學家綜合運用基因組學、進化生物學等技術手段，從基因組水平上揭示了芥菜為單一起源，大頭菜（根用芥菜）變種最早在中國分化，明確了芥菜的起源中心在中國，計算出芥菜不同類羣分化形成時間。
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芥菜的起源
- 參考資料
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- 1. 中國農科院等專家完成芥菜基因組解析 ．新華網[引用日期2018-10-29]
- 2. 浙江大學揭示芥菜起源中心在中國 ．中國知網[引用日期2018-10-29]
