疑犯追蹤第四季

一轉眼，六個星期過去了。感謝Root，所有人都有了一個假身份和一份固定的（正式的或非正式的）工作。Reese成為卧底緝毒警察，Shaw當起了百貨公司化妝品售貨員，Fusco仍然可以安心地在紐約警署工作（並非Samaritan忽視他，而是它的觸手暫時無法抵達紐約警署）。Finch則成為了清閒的大學客座教授。通過解救號碼—個電腦工程師，他們找到了一種避開Samaritan監視的通訊方法，這是他們準備反擊的第一步。

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新號碼是一位數學系的高材生，她正在參加一場城市遊戲。但是連主辦方是誰都不知道的遊戲註定兇險萬分，參賽者一個個都像亡命之徒。芬奇開始介入調查，背後的真相浮出水面，幕後操控者竟然是Samaritan，它的目的是為了招募有才華的執行人。無法接受Samaritan為所欲為的芬奇決定反擊，他接受了TM的建議，利用並修復了廢棄的地下鐵路系統。

Finch讓Fusco緊盯最新的可疑對象——一個職業「社交助手」（Professional Wingman，當你初次約會或在社交場合與人搭訕的時候，這種人會以朋友的名義在一旁幫你説話，為你塑造出一個高超的形象）。Fusco很快發現，如何與女人打交道並非他最需要擔心的事情。同時，Root帶着Finch開始了一場“尋寶之旅”，為資源匱乏的小隊找尋裝備和經費支持。

Reese負責保護的一對兄妹成為一宗黑幫案件的調查對象，他在紐約警署的「偵探」工作變得複雜起來，他的卧底身份也受到影響。

機器提供了一名才華橫溢的政治民調專家的號碼，而此人通常都很準確的預測偏偏在這個時候出錯了，Finch不禁懷疑這兩件事之間可能存在某種關聯。與此同時，Reese沒有執行Moreno警長的直接命令。劇中的閃回情節揭示了人工智能的本性以及Finch馴化機器的過程。

一名為人低調的辦公室職員稀裏糊塗地捲入了一起危險的陰謀，因為他喜歡在夜裏假扮“偵探”。當Reese、Shaw和Fusco全力保護他時，Finch則前往香港參加學術活動。他不能冒險暴露自己的真實身份，所以他必須把假身份“堅持到底”。

一夥國際大盜的頭目Thomas的號碼跳了出來，小隊決定讓有着盜賊副業的Shaw卧底進入其中一探究竟。他們很快發現，Thomas的團伙偷出的貨物遠比他們想象的危險，甚至引來了Samaritan和政府ISA特工的關注。與此同時，Root和Finch挫敗了Samaritan利用教育版平板電腦監視就學兒童的計劃。

Reese從兇案組臨時借調到警校擔任戰術教官，同時監視一名與眾不同的女學員。Shaw和Fusco發現她的身份並不單純，她捲入了警察和黑幫的無間道以及Elias和Brotherhood的幫派鬥爭中。同時，Samaritan發現了上一集中國際大盜留下的蛛絲馬跡，並追查到了Shaw的頭上。

Shaw的行蹤暴露，與Samaritan特工Martina展開激戰。Root及時現身救走了Shaw，Fusco也幫助兩人引開了Martina的注意力。而最新的號碼則來自小隊的“老朋友”Elias，這標誌着Brotherhood向Elias的黑幫全面開戰。Reese和Finch竭盡全力保護Elias和他的夥伴們，但最終還是付出了慘痛的代價。一直隱忍的Elias決定向Brotherhood復仇。

Samaritan開始在紐約展示它的力量，先是搶走了“無關號碼”的生意，又在兩天內展現了太平無事和天下大亂兩種城市的形態。為了平息事端，TM通過代理人Root和Samaritan的代理人進行了談判，但以無果而終收場。

Samaritan的野心已不僅侷限在紐約，它攻擊了證券市場，試圖通過製造新的金融危機來影響美國乃至世界。小隊決定全員出動。Shaw去地鐵站尋找一名擁有證交所關鍵密碼的員工，其它三人和Fusco則潛入證交所地下中心機房植入穩定市場的程序。但他們很快被Samaritan的特工包圍。為了救出小隊成員，TM進行了多次實時模擬來選擇逃生方案，並將每一個成員的性格描繪得栩栩如生。在TM的指導下，小隊成員完成了穩定市場的任務，但在逃生電梯口前被Samaritan的特工壓制，生存幾率跌落谷底。此時Shaw的出現成為TM和Samaritan都未能料到的意外因素。為了幫受傷的眾人爭取逃生時機，Shaw做出了驚人的舉動，並使自己陷入生死未卜的境地（Shaw的演員Sarah Sashi由於懷孕而選擇暫時退出劇組，歸期未定）。

本集政府特工的領導Control大媽迴歸，藉助Samaritan指揮ISA特工進行了一場追殺恐怖分子的行動。但在這過程中，她發現政府方面對於Decima公司和Samaritan似乎正在失去控制。TM小隊方面，Reese和Root正在不顧一切地尋找失蹤的Shaw，他們甚至為此綁架了一位重要人物。本集的結尾，根據一條渺茫的線索，傷痕累累的兩人繼續踏上尋Shaw之路。

Reese和Root跟着線索來到紐約郊區的一座小鎮，他們很快發現小鎮看似平靜的表面下隱藏着重要的陰謀。與此同時，Fusco和第8集中的女警Slivia共同調查新的“無關號碼”，一名和人口失蹤有關的中年大叔。本集的結尾，救人心切的Root在行事方針上第一次和The Machine產生了分歧。

機器安排Finch以陪審團員的身份參與一宗謀殺案的庭審，Finch懷疑另一名陪審團員試圖操縱整個訴訟過程。與此同時，Reese漸漸向部門內部的心理專家打開了話匣子。

一名軟件程序員因某種神秘原因重獲新生，Reese必須暗中保護她，但他並不清楚她所面臨的威脅來自她生活中的哪個部分。與此同時，Finch試圖保護年輕黑客Claire免遭Samaritan毒手，誰料到Claire竟主動向Finch求援。

Reese和Finch必須保護聰明絕頂的街頭騙子Harper——這個女孩計劃從一家醫用大麻藥店盜取現金，但她遇到了大麻煩。

一名心理學家試圖用非正統的方式來幫助病人獲得解脱，但這會讓他付出高昂的代價，Reese與Finch決定對他進行保護。與此同時，回憶情節揭示了Finch最好的朋友當年被炸死之後Finch脆弱的精神狀態。

Flint和Bridges合作的非常愉快，同時Harold約好Bridges在咖啡店見面敍舊。Irish和Riley相互寒暄彼此的近況並表示兩個人一定要聊聊治療會的事情，並且Riley意識到Irish一定有事情瞞着他。

Saul被指泄露公司機密而在電視上被曝光，saul一夜之間聲名狼藉。Saul為了給自己討回聲譽發起了絕地反擊，而這一切計劃都被監控着

Reese一行在執行監視任務期間，John坦言自己在兇殺組經常和自己打交道的都是死人，John總結他們這些被監視人的特點就是誰都不知道有事兒找上門了

機器同時收到了Elias和Dominic的號碼，Reese和Fusco在警告 Elias的過程中也被brotherhood抓住。與此同時Finch和Root收到了Shaw的電話，他們繼續開始尋找Shaw.

全國四分之一的電力供應被入侵，機器很快就會完全失去權限。Greer對此很是滿意。　　“修正計劃”即將實施。與此同時，Finch等人緊張地執行任務，努力尋找機器。　　而Harold在襲擊來臨之時也不忘保護他的機器。　　Greer卻表示他要發動的並非襲擊，而是忠誠測試，以一種勝利者的姿態展現在對手面前。