潘多拉

傑奎琳·周（賈克斯）（Jacqueline “Jax” Zhou）的父母於新波特蘭市的殖民區遭到外星人攻擊身亡，幾個月之後，她來到了地球艦隊訓練學院。在那裏，她收到唯一在世的親人——她的叔叔多諾萬·奧斯本（Donovan Osborne）教授的邀請入學。賈克斯被告知她父母的死亡還在調查中，於是她開始尋求奧斯本的助教贊德·杜瓦爾（Xander Duvall）的幫助。在經歷了第一天不尋常的課程之後，賈克斯與一個名叫“阿特里亞9號”（Atria 9）的阿達爾的克隆人成為了朋友。“阿特里亞9號”還帶她認識了她的同學格雷格·李（Greg Li）和托馬斯·詹姆斯·羅斯（Thomas James Ross）。賈克斯還認識了扎特爾駐地球大使的兒子拉倫（Ralen），拉倫的父親是他們星球中在戰後第一個來到地球的外星人。

一個阿達爾的領導人在校園裏公開宣稱要奴役克隆人，阿特里亞對此很憤怒卻沒有成功阻止他的演講，因為學院提倡言論自由，而且阿達爾是重要的戰略盟友。然而，阿特里亞並未放棄，她又組織了一場示威，終於將搜索者克雷斯頓·哈貝爾（Creston Hubbell）和三個長得和她一樣的克隆人轟下了台。在戰艦帶着外星人從新波特蘭回來後，奧斯本教授讓贊德對“捷列什科娃”進行了秘密調查，賈克斯懷疑父母的死與之有關。搜索者哈貝爾的克隆人在出逃後找到了阿特里亞，並希望她可以去支援阿達爾正在進行的反抗運動。阿特里亞讓這個克隆人留下來取代自己，獨自前往了阿達爾。

凱德·柯林斯（Cade Collins）少校講述了一個關於德里克·賈沃斯基（Derek Jaworski）上尉的故事，德里克·賈沃斯基和他的船員為了制止扎特爾人的進攻，炸燬巡洋艦“海鷹”（Sea Hawk）並犧牲了自己。就在這時，凱德·柯林斯看到了拉倫，突然毫無徵兆地勃然大怒。在分析了拉倫衣服上的血漬之後，格雷格發現凱德的憤怒是一種叫做“略迪恩”（Ryodyne）的藥物引起的。然而，在得知測試結果之後，奧斯本卻讓賈克斯和格雷格不要慌張，一切都在他的掌握之中。與此同時，拉倫承認自從他來到學院，一直有人欺負他，賈克斯發誓一定要懲罰那些人。

賈克斯、皮拉爾、拉倫和他們的同學阿瓦爾和瑪格達被認為是學院裏表現最優的新兵，贊德被委任和他們一起去附近的星球執行一次訓練任務。一行人到達之後便受到了變種人的攻擊，這時諾里斯（Norris）出現了，她是一個科學家。諾里斯説這些變種人曾經都是她的同事，他們是因為被細菌感染才變成這樣的，她還告訴他們帕拉萊克斯工廠裏的每一個人都被感染了。贊德堅持認為他們需要先回到學院，然後再製定一次救援任務，但是卻被告知他和學生們已經都被感染了。在做了一系列的血液測試後，他們發現拉倫並沒有受到影響，瑪格達體內已經產生了抗體。

在一次與皮拉爾共同執行的訓練任務中，贊德進入了“捷列什科娃”爆炸後的廢墟，為奧斯本取回飛行數據記錄儀。由於擔心任何與扎特爾相關的證據都會引起另一場戰爭，奧斯本命贊德要保守這個秘密，直到黑匣子被解碼。因此當賈克斯問為什麼他和皮拉爾進入“捷列什科娃”的殘骸時，贊德爾只能説這個任務是機密。同時，托馬斯對早已疏離的父親比利·D（Billy D）的到來感到十分驚訝。比利·D和他的新女友蒂爾妮（Tierney）一起來到學院，並承認自己是為了從學院的文物館中偷取一個價值連城的藝術品“金度水晶”（Jindoo Crystal），以此償還賭債。托馬斯儘管很不情願，但最後還是同意了幫助他們。

在拒絕了杰特（Jet）提供的有機生物升級並在課上使她的競爭對手薩麗卡·拉森（Sarika Larson）當眾出糗之後，皮拉爾暈倒在了教室裏。醫生檢查後並未發現她的硬件有何異常，但是薩麗卡還是有一些異常的舉動。儘管如此，薩麗卡還是堅持説自己無大礙，甚至還為贊德舉辦了一個生日派對。在派對進行到一半時，賈克斯在她們的宿舍裏看見皮拉爾將她所有的有機生物植入物拿出，查看它們是否正常。賈克斯懷疑皮拉爾的界面源代碼出現了問題，她發現有一個軟件漏洞為她的數據流提供了通道。賈克斯和拉倫讓皮拉爾斷開連接後，去尋找最可疑的嫌疑人傑特，杰特承認他只是裝作有高級的有機生物技能，其實他的植入物是假的。

背景設置在2199年，角是別稱“潘多拉”的賈克斯，喪失雙親後的她在地球的太空訓練學院開始了新生活，與桑德、拉倫、皮埃爾等人有着如親人般的友誼。足智多謀的賈克斯與朋友們一同學習如何應對外星人的威脅。一天，一位來自傳奇太空戰鬥巡洋艦“海鷹”號的老兵向賈克斯和格雷格透露了一個令人震驚的消息，並且這條重要線索將引領着賈克斯找到殺死她父母的真兇。當有一天女主的真實身份被揭露時，她不得不得面對自己可能是“人類救世主”又或是“毀滅人類的存在”。“潘多拉“將用自己的經歷證明，有時最大的風險會帶來最大的回報，且團隊的力量遠大於個人的力量，向觀眾傳達了一種積極向上的人生態度。

假期到來了，當朋友們選擇去度假的時候，賈克斯選擇留在學校學習和休息。奧斯本發現帕拉萊克斯正在研發新武器，命桑德前去調查。同時，奧斯本希望賈克斯和哈蘭·弗萊德的女兒科迪莉亞（Cordelia）的舊情會對這次任務有所幫助，於是讓桑德帶上賈克斯一起去“狂喜7號”，科迪莉亞正在那兒慶生。

賈克斯、桑德和拉倫在看見了扎特爾準備對地球開戰的軍隊後，用傳送門逃到了另一個星球上，這裏有一個廢棄的地球殖民地。桑德讓拉倫説出所有關於這場即將到來的入侵的信息，然而拉倫卻説他完全不知情，並且透露出這應該是扎特爾的反對派所為。為了與地球通信，桑德在殖民地中搜尋可以用來構造臨時通信設備的物件。

賈克斯和她的朋友們正在一起慶祝他們的順利返回，桑德突然到來，並以摧毀“捷列什科娃”的罪名逮捕了拉倫。儘管奧斯本教授堅持説軍事法庭是公平的，但是拉倫的父親薩拉贊（Salazen）大使還是和兒子的妻子瑪塔（Matta）一起來到了法庭上，為拉倫辯護。賈克斯堅持認為拉倫是無辜的，但是桑德卻因為拉倫隱瞞自己婚姻之事而擔心賈克斯對他過於信任。

在地球艦隊訓練學院慶祝110週年之際，學生和教職員工正準備參加停戰日舞會，以紀念地球與扎特爾之間的和平協議。賈克斯發現了桑德和拉倫兩個人對自己的情感。同時，拉倫的妻子瑪塔要求從他們的包辦婚姻中獲取更多的利益。當桑德表示自己想邀請賈克斯去舞會時，奧斯本阻止了他，桑德對此很不滿，甚至用辭職來表示抗議。

奧德薩·弗萊德向父親保證她會收拾她詭計多端的姐妹們。同時，薩麗卡操縱了賈克斯的核心記憶，試圖讓她相信自己在潘多拉被釋放出來之前已經回到了學院。奧斯本和拉倫則意識到他們面對的賈克斯其實是潘多拉。儘管受到了最終判決的威脅，但是拉倫還是拒絕逃離，並拉上妻子瑪塔一起前去拯救自己的朋友們。與此同時，佩夫尼教授來到阿達爾支援反抗軍，阿特里亞則出人意料地表示效忠搜索者哈貝爾。