浴火危城

1910年，沙皇俄國境內，兩個獵人發現一具慘死的屍體，經檢查發現死者是得鼠疫而死。為防止鼠疫在俄國境內蔓延，沙俄當局下令將在俄國境內的中國勞工驅趕回國。

早晨姜達明叫郭爾丹起牀趕路，發現郭爾丹已死。姜達明在萬分痛苦之中送別了郭爾丹，繼續往哈爾濱逃亡。沙俄駐哈爾濱領事和海關關長尤里金想借鼠疫爆發使沙俄軍隊進入哈爾濱，以達到佔領中國領土的目的。

留學英國劍橋大學醫學院的伍連德博士在英文報刊上得知東北發生鼠疫，主動請纓前往制止瘟疫蔓延。一籌莫展的防疫大臣施肇基大喜過望，立即趕赴天津陸軍醫學院聘請伍連德為“大清防疫總醫官”，親自把伍連德送上火車。

伍連德和助手林家偉乘貨車連夜趕到哈爾濱，此時，縣太爺姚仲亭正準備焚燒疫情重災區傅家甸，掩蓋疫情真相。危急時刻，伍連德及時趕到，制止了這場滅絕人性的大火，挽救了傅家甸百姓的生命。

警察巡長穆德惠抓了個行騙的“一貫道”叫索利家，卻引火燒身，姚仲亭毒死索利家，嫁禍於穆德惠。伍連德懷疑其中有詐，積極相救。他利用各種關係挖出索利家屍首，經過化驗，索利家確實是中毒身亡。行刑之際，穆德惠得救。

俄國醫院院長普里諾夫號稱“疫病專家”，他欣賞麗達醫生的清純美麗，不斷糾纏麗達，向她示愛，都被麗達婉言拒絕。伍連德對中醫中藥的探究獲得了修德堂老郎中修起的理解和信任。

伍連德為了弄清鼠疫的源頭，讓穆德惠尋找疫病屍體，進行解剖。“入土為安”是祖上的規矩，給死人“開腸破肚”更是聞所未聞。這種破壞祖宗習俗、大逆不道的做法，遭到村民一致反對。為解疫情源頭之惑，伍連德堅持必須解剖屍體。

穆德惠很快找到一具剛剛得瘟疫死亡的寡婦屍體，伍連德立即趕往死者家中，正解剖死者屍體，被村民發現，憤怒的村民投擲石塊擊打伍連德。混亂中，穆德惠保護着伍連德逃出傅家甸，解剖失敗。

此時，老中醫修起的兒子修暮良急匆匆跑來告訴伍連德老烏吉去世了，伍連德趕到修德堂開始解剖烏吉屍體，終於在老烏吉肺中得到了重大發現，找到了鼠疫桿菌，並且發現這種病菌是可以通過呼吸傳染的。

伍連德讓防疫總站製作了大量的口罩，請修德堂熬製中藥保肺湯免費分發給百姓，預防鼠疫傳染。在此防疫的關鍵時刻，熬製保肺湯的藥材遭土匪搶劫。俄領事和海關關長尤里金拜訪伍連德，意在借防疫為名，派兵進駐哈爾濱。

沈家李賬房知道自己貪污的事情敗露，急忙向姚仲亭求助。姚仲亭對沈家女兒沈秀蓮早有色心，卻遭沈秀蓮怒斥，姚仲亭懷恨在心，遂將姜達明關入大牢。

穆德惠接到市民舉報，得知姜達明被姚仲亭抓進大牢，立即通知伍連德，伍連德趕往道台府解救姜達明。新任李道台宣佈上方旨意，免去姚仲亭和那道台的職務，聽候處理。

穆德惠接到市民舉報，得知姜達明被姚仲亭抓進大牢，立即通知伍連德，伍連德趕往道台府解救姜達明。新任李道台宣佈上方旨意，免去姚仲亭和那道台的職務，聽候處理。

俄國公使到府上拜訪福親王，投其所好送上古玩，趁機遊説福親王向攝政王進言撤換伍連德大清總醫官之職，讓法國教授麥斯尼接任。

麥斯尼在沙俄士兵的護衞下逼迫伍連德讓出總醫官的職位。伍連德解釋無效，為國家主權據理力爭。深夜，哈爾濱的市民和商人聚集在防疫總站，懇求伍連德不要丟下深受鼠疫危害的百姓，不要離開哈爾濱。

麥斯尼在沙俄士兵的護衞下逼迫伍連德讓出總醫官的職位。伍連德解釋無效，為國家主權據理力爭。深夜，哈爾濱的市民和商人聚集在防疫總站，懇求伍連德不要丟下深受鼠疫危害的百姓，不要離開哈爾濱。

尤里金急匆匆來到領事館，告訴領事他們精心栽培的代理總醫官麥斯尼臨死也沒在“同意沙俄出兵哈爾濱”的文書上簽字，致使沙俄吞噬哈爾濱的計劃全盤落空，於是決定派人綁架伍連德。

麥斯尼受傳染死亡令朝廷有了應付洋人的託詞，讓伍連德繼續擔任總醫官。喜訊傳來大家萬分高興，施肇基親自帶來一批軍醫醫學院學生，支援伍連德防疫救災。伍連德召開全哈爾濱防疫大會，安排全市防疫工作。

為了挽回敗勢，尤里金命令姚仲亭協助普里諾夫抓住姜達明做試驗，在疫苗研究上壓過伍連德，爭奪防疫的主動權。

過度勞累使伍連德咳嗽起來，大家勸他檢查並休息，他不以為然，仍然堅持工作。助手林家偉強行為他檢查，發現伍連德被傳染上鼠疫。

姚仲亭為討好尤里金，將麗達綁架交給普里諾夫，普里諾夫勸她離開伍連德，被麗達痛斥一番。姜達明闖人普里諾夫醫院辦公室，用槍逼迫普里諾夫立即放了麗達。

沙俄公使抗議朝廷，告伍連德派人闖入俄國醫院，打死俄國土兵。事有蹊蹺，施肇基主動請求到哈爾濱調查此事。施肇基看望染上鼠疫的麗達和受槍傷的姜達明。

伍連德終於發現疫情居高不下的傳染源是因俄國教學沒進行處理的屍體引起，於是下令對俄國醫院、教堂等地進行搜查，清理屍體，割斷傳染源，引起俄國人的抵制。