水落石出

東環市郊外發現一具被肢解的女屍，精神病人武瘋子起初被認為是兇手，可是後來卻因為證據不足而被否定，誰知在這個節骨眼上，武瘋子卻又病發，殺了一個出租車司機；但是重案隊全體同志在隊長範剛的帶領下，經艱苦細緻的偵查，找到了被藏匿的受害人頭顱和四肢，確定了被害人的身份並鎖定了重大犯罪嫌疑人龍飛；可是，在他們取得確鑿證據之後，龍飛卻被診斷為精神分裂症，不負刑事責任，他們又同包庇犯罪的不法分子展開了更為艱苦的鬥爭，最終伸張了正義，使罪犯受到應有的懲罰。案件結束後，喊振江開始和出租車司機的遺孀林秀明交往；而納淨雲也不得不處理更棘手的事情——他的親妹妹納淨潔來到東環找工作，卻和女友周菁芳不對付。

大光公司董事長魏明君來報案説自己的座駕丟失，恰好其死對頭——恆大公司的徐氏兄弟也來報案車子丟失的事情，範剛便將兩個案子合併調查，最終眾人成功偵破了高級轎車被盜案，魏董找回了自己的車，但是徐氏兄弟卻因為買了贓車而賠錢，徐氏和魏明君的矛盾越來越深。而納淨潔又開始鬧事，還撮合納淨雲和法醫苗青在一起，使納淨雲和周菁芳的戀愛之路愈發不順。魏董設宴欲拉攏範剛，但是範剛並不願意和魏董同流合污。

韓大力報案自己的媳婦被拐，偏偏又有一對父母報案自己的女兒失蹤。重案組趕到青川，在當地警察和一位少年的幫助下，最終解救出了被拐婦女並將相關涉案人員一網打盡；但是，韓大力的媳婦卻和外人有了孩子，重案隊雖然完成了任務，但卻對後續問題痛心不已。案破後，林秀明向喊振江提出停止交往。

重案追逃行動開始，納淨雲和周菁芳聯手，先是利用親情的力量成功抓捕逃犯江橫，接着又來到監獄抓住了自作聰明的逃犯江順；劉夢陽和喊振江先是被騙來到深圳，二人還為了搭火車不得不騙深圳警方，但最後還是將逃犯“地老鼠”抓捕；範剛和王彤兵分兩路來到東北一個小煤礦，最後在當地警方的幫助下抓住了逃犯潘學章，範剛還順道抓住了另一個逃犯許強山，並和雁門來的警察程堅成為了好友。

追逃行動結束後，喊振江意外救下了被欺負的林秀明，林秀明也開始認可喊振江。王彤和技術員白英奇在郊遊的時候意外發現了一個製毒廠的痕跡；這時，納淨潔又鬧事險些被迷姦，重案隊憑藉分析推理併案開始尋找毒品來源。誰知道劉夢陽卻意外入獄，眾人在二次追蹤後發現牢頭是毒品涉案人員，劉夢陽被洗清冤屈後，重案隊又順藤摸瓜抓捕陸有成，並派女偵察員周菁芳陪同陸有成進入製毒集團內部，誰知周菁芳險些喪命。最終，重案隊聯手南都警方在南都打掉了一個特大的製毒工廠。案破後，納週二人戀情加深。

機關辦公樓連連被盜，其中一起居然被盜現金48萬元；局裏認為此案和3年前未結的盜竊案件極為相似，於是要求重案隊全力偵破；案子破獲後，罪犯高俊交代了背後隱藏的大規模賭博活動，重案隊再出奇兵，將賭博集團摧毀；最終，高俊由於立功改判12年有期徒刑（原判20年），他向重案隊請求告知妻子不要涉嫌賭博，重案隊應允。

徐氏兄弟的大哥徐強在一次宴會中被殺，重案隊很快把目光引向同徐氏兄弟有仇的魏明君，然而卻沒發現任何線索；徐氏兄弟的二哥徐壯接手恆大公司，並以提供職位為由拉攏重案隊，納淨雲架不住妹妹，只得同意把她送到恆大公司任職，範剛也和李局設計通過為範剛侄子找工作的理由將一名偵查員安插入徐氏兄弟身邊；然而怪事接連發生：徐壯遭遇槍擊，魏明君手下大成被殺，徐氏兄弟的老三徐剛險些遭遇暗算。為了徹底追查，雁門警方派出警察程堅加入魏明君的公司進行卧底；後來，重案隊發覺偵查被引入了歧路，但是徐剛卻搶先發現了真相，徐壯見狀綁架魏明君和跟蹤而至的納淨潔，想殺死徐剛再嫁禍魏明君從而徹底解除後患；最後在眾人的幫助下，重案隊救下魏明君、徐剛和納淨潔並抓捕徐壯等涉案人員。案子破後，徐氏黑惡勢力被徹底消滅，魏明君因為在這場鬥爭暴露出了許多違規經營的問題而瀕臨破產並遭受相關部門調查，納淨潔正式認可了周菁芳和納淨雲的戀情，喊振江也和林秀明喜結連理。在喊振江的婚禮上，範剛帶着全體重案隊隊員宣誓一定舍小家為大家，與犯罪鬥爭到底。