染色質免疫沉澱

ChIP還被用來確定基因組上與組蛋白修飾相關的特定位點（即組蛋白修飾酶的靶標）。 此方法的簡要過程是：細胞裂解液裏的蛋白和相關染色質暫時結合；染色質(DNA)-蛋白複合物被剪切，與所研究蛋白相關的DNA片斷被選擇性免疫沉澱；相關DNA片斷被純化，順序被測定。一般認為這些DNA順序在活體內與所研究蛋白結合 ^[1]  。