暗夜男爵

最早出自《名偵探柯南》第68~70集《暗夜男爵殺人事件》，發明者不明，曾經接連不斷地入侵各大企業的電腦，將所有資料全部毀掉，程序相當完善，就算被發現也無法阻止。因為它的神出鬼沒，被大家以工藤優作小説中的神秘角色“暗夜男爵”命名。

後來在第129集《來自黑衣組織的女子 大學教授殺人事件》出現。在本集的最後部分，當灰原哀使用阿笠博士、柯南和她本人共同找回的含黑衣組織全部人員、藥品等相關資料的數據磁盤時，由於灰原着急打開，疏忽之下，忘記了組織所給磁盤裏安裝此病毒的事實。因此資料在打開不久就全部消失。其原因是該磁盤沒有在組織內部的電腦中運行，因此激發該磁盤中的病毒，故所有數據（其中包含阿笠博士電腦中的數據）均被銷燬。

68（70） 暗夜男爵殺人事件（事件篇）

69（71） 暗夜男爵殺人事件（疑惑篇）

70（72） 暗夜男爵殺人事件（解決篇）

129（139）來自黑衣組織的女子 大學教授殺人事件

File.2（總File.72） 暗夜男爵

File.3（總File.73） 可怕的病毒

File.4（總File.74） 面具之下

File.5（總File.75） 蘭的眼淚

File.6（總File.76） 風的惡作劇!?

File.7（總File.77） 落下地點的秘密

File.2（總File.182） 消失的作家