數碼寶貝03馴獸師之王

松田啓人，稍微有點率真，是個極普通的小學五年級男生，現在最喜歡的東西就是數碼暴龍。對他來説，與朋友玩數碼暴龍的Card Game及在上課時偷偷地把自己創作的數碼暴龍畫在筆記簿上是最大的樂趣！那個就和某個地方的十分熱愛數碼暴龍的少年一樣的啓人，他竟在某日偶然得到了一樣能把他的命運大大改變的神秘對象，那就是以往從未有人見過的不思議的藍色的卡片藍卡。因為藍色的卡片的力量而變形的讀卡機，就在把藍卡放在讀卡機讀進去的瞬間，在啓人的眼前冒險之門已經打開了。 在畫面上顯示出裂開了的數碼蛋。之後從天空降下光柱。啓人在心中有種確實的預感所以便前往光柱。在那裏等待着啓人的是，啓人所想象出來的數碼暴龍．基爾獸。啓人歡喜地走向基爾獸，但是……

基爾獸吐出來的火焰竟把混凝土的牆壁開了個洞。啓人想到自己也可能會遭到攻擊而十分害怕，跟着的一剎那啓人所看到的是……基爾獸天真無邪地向他笑。知道基爾獸並無敵意的啓人，總算可以真正的安心下來。但是啓人真正的麻煩現在才開始。把體形龐大的基爾獸隱藏實在是一大苦事。啓人利用紙皮箱掩飾把它帶回家。第二天，啓人把基爾獸藏在公園然後上學，但是,基爾獸竟然偷偷地跟着啓人的後面！基爾獸的出現令學校陷入恐慌。聽見騷亂的啓人，也拚命地尋找基爾獸，而基爾獸並不知道啓人的心情而繼續玩耍。這時，在啓人面前出現個知道數碼暴龍的神秘少年説啓人沒資格做馴獸師 啓人受到傷害及信心盡失，但最後也被基爾獸的天真無邪所救回，啓人及基爾獸一邊跨越困難及一邊逐步逐步地成為真正的朋友。但是在回公園的路上，基爾獸受到突然的攻擊。襲擊啓人他們的就是妖狐獸及它的拍檔留姬。

留姬單方面向啓人宣戰，雖然啓人不允許戰鬥，但基爾獸竟無視啓人的説話開始向妖狐獸反擊。啓人看到基爾獸的眼裏仍然存有野生的光輝。因李健良的幫助而中斷了戰鬥，但啓人也因基爾獸露出鬥爭本能的樣子而受到不少的衝擊。留姬一口咬定數碼暴龍是為了戰鬥而存在的，而李健良則視數碼暴龍為朋友及重視它們。啓人也因2方面的正反意見的考慮而煩惱，只怕會失去基爾獸。然後就在未知道答案前，在地下停車場，留姬又向啓人宣戰，李健良加入阻止2人的戰鬥，捲入戰鬥的大耳獸因受到攻擊的衝擊而進化成加魯哥獸。失去理性的加魯哥獸不斷亂槍掃射，就連李健良也不能制止。而那個槍口正向着留姬對準，就在這千鈞一髮的瞬間，基爾獸緊急地撲向加魯哥獸而救了留姬。

雖然並沒有發生危險的事情，但李健良的表情卻很生硬。與啓人天真無邪地憧憬進化相對照，李健良不允許大耳獸再次進化。第二日，正當李健良及大耳獸與啓人一起回家時，在他們面前突然出現一片異常的霧。分開逃跑的啓人去找基爾獸，那霧就算李健良他們逃到哪裏也追到那裏，簡直就像生物捕捉獵物那樣，然後就在李健良他們被追得走投無路的面前，一隻數碼暴龍終於實體化。它的樣貌令李健良不由得嚇得喘不過氣來……那正是令他的內心深深殘留着創傷的過去事件的主角--金剛獸！金剛獸襲擊過來，大耳獸又不准許進化，後面趕到的啓人和基爾獸也不斷受到攻擊。最後，李健良用卡片使大耳獸戰勝了金剛獸。

在啓人他們的學校最近竟然發生了不可思議的事情，操場上竟然有人用石灰鬍亂塗鴉。犯人不明的這個事件成為了怪談及加鹽加醋地不斷在師生間流傳開去。再加上有傳言指那與先前基爾獸的調皮是同一犯人所幹的更令啓人坐立不安。不過在接着的星期日，犯人意外地弄清楚了。因要到白兔小屋值班而來到學校的啓人，在操場的一角偶然找到的是古樂獸。原來那個塗鴉正是古樂獸為了和小朋友們一起玩耍而照着足球場的線所畫的。啓人與李健良商量後決定要為古樂獸找一個相稱的拍檔，在互相知道的人選中開始找尋候補，但是因他們的一長一短總也不能決定。到底啓人他們能否平安無事地為古樂獸找到合適的拍檔呢？還有在瞞着啓人與古樂獸出外玩耍的基爾獸的面前新的數碼暴龍也出現了。

在晚上到學校玩耍的基爾獸及古樂獸的面前邪魔獸實體化了。與邪魔獸細小的身體不成比例的強力的攻擊令基爾獸他們很痛苦，而拯救了這個危機的就是留姬以及她的拍檔妖狐獸。雖然在危險時出手相助，但啓人始終也不能理解留姬把數碼暴龍當作道具般使用的態度。他要説服留姬數碼暴龍是生存着的，而留姬則完全聽不進腦。留姬的學校的上課參觀日。為了發泄對在上課中途早退了的母親的不滿，留姬歡喜地走入那偶然找到的數碼領域。但是所出現的數碼暴龍卻意料之外的強勁，而發生了要藉助啓人等人的幫助的最壞的結果。如果可以進化的話自己1個人也可勝出。留姬的煩燥指向經歷無數次戰鬥也不能進化的妖狐獸。妖狐獸為了進化而尋找新的敵人，1個人徘徊在晚上的城市，在它面前一隻否定拍擋存在的謎之數碼暴龍站立阻擋。挑撥妖狐獸的謎之數碼暴龍的目的到底是？還有在妖狐獸不在期間，另一方面的留姬也遭到新的數碼暴龍的毒牙迫近。

曾經在無數的候補中被選為留姬的拍檔，妖狐獸誓要成為最強的數碼暴龍。但是對無論怎麼戰鬥也不能進化的妖狐獸，留姬的焦燥也越來越厲害。就在這時候初次的危機襲擊2人，犧牲自己去守護留姬的妖狐獸的姿態大大動搖留姬的心。然後就在2人的心相通的瞬間，妖狐獸出色地實現了九尾狐獸的進化。某日基爾獸造了個不可思議的夢。那是一個基爾獸會離開啓人走去另一個世界的夢。啓人從基爾獸口中得知這夢而感到不安，於是找李健良及留姬討論，但從2人得來的是出乎意料的嚴酷意見。本來數碼暴龍就不該存在於這個世界。由數據所生的事物最終會返回數據。對2人那樣的説法啓人背耳不聽，只希望能和基爾獸繼續在一起。但是這個願望卻違背了他，恐布的事情終於現實化了。在啓人的眼前基爾獸的身體開始分解為數據了。基爾獸變成數據及消失了。到底啓人能否再次與基爾獸見面呢？為了取回基爾獸，啓人的冒險開始了。

在啓人的眼前基爾獸變成數據及消失了。雖然受到衝擊但啓人仍相信數碼器連繫着兩人，並出發去拯救基爾獸。而啓人的這模樣也深深地打動李健良及留姬的心並開始協力。初次合力的3人，在異空間出色地成功救出基爾獸。就這樣看來啓人與基爾獸應該會更加緊密的互相連繫，但是面向書桌入迷的啓人，先前還拚命的揮動鉛筆，當然是做他的數學計算，實則是數碼暴龍繪圖。畫下基爾獸進化後的想象圖，又大又強的身體，頭上長有2只角，而它的名字就是大基爾獸。但是在啓人越來越期待基爾獸的進化時，一出乎意料的新聞飛進了他的耳內。最近，在中央公園據説有一個以驚嚇情侶為樂的調皮者。啓人最先就想起基爾獸及顯得很擔心。聽到“犯人是小朋友”的目擊口供後總算安心了點，而老師及警察的巡邏則變得越來越嚴密。假如基爾獸被警察抓住的話。不安的想法佔據着胸口，啓人穿梭於老師及巡視的警長並奔跑於晚上的城市。但是等待着總算跑過的啓人的卻是，基爾獸那意想不到的説話。由小小的誤解所引發的啓人與基爾獸的初次龜裂。在團體合作凌亂的2人前，強敵．邪龍獸的利爪迫近。到底啓人與基爾獸能否跨越這九死一生的危機呢？在西新宿的夜空裏大基爾獸的咆哮正在迴響。

以驚嚇情侶為樂的真正犯人原來是小妖獸。啓人對自己懷疑基爾獸感到羞愧，看到在戰鬥中被弄得慘不忍睹的基爾獸終落下淚來。而回答這情感的是基爾獸進化成大基爾獸，把強敵邪龍獸出色地打倒了。但是，在西新宿的夜空裏迴響的野生的咆哮。失去理性露出狂暴本能的大基爾獸的模樣令啓人覺得十分恐布。好不容易才能看見的進化。不斷自責沮喪的啓人的眼睛又再次浮現出眼淚。不過當接觸那些眼淚的瞬間，大基爾獸變回平時天真無邪的表情了。2人高興地互相擁抱。但可惜的是那完全沒有解決問題，身體直至何時仍是大基爾獸。在啓人面前的是為大基爾獸的巨大體形而煩惱。再這樣下去連家也入不了，還很可能會給人發現。為了變回原本的基爾獸的模樣，啓人想出這個那個的作戰，但是到底大基爾獸能否變回原本的基爾獸呢？啓人與基爾獸的二人三足的大奮鬥開始了。

啓人為了令大基爾獸變回基爾獸而進行大奮鬥。雖然想出來的作戰及特訓怎也沒有，但啓人拚命的情感終於感動了上天，令大基爾獸平安地變回基爾獸。但今次的事件也衍生出新的疑問。數碼暴龍的進化到底是什麼回事？數碼暴龍的進化是什麼回事？留姬比誰人更在意這個疑問。完全沒有累積經驗，也沒有讀取其它數碼暴龍數據的基爾獸也可進化，留姬怎也不能理解。當夠強便可進化。留姬一直也這麼相信，而與妖狐獸一起重複無數次無情的戰鬥。但是那樣並不能説明基爾獸的進化，就連妖狐獸第一次的進化也是……進化是什麼回事？自己與妖狐獸的關係又是？總也找不出答案的留姬向妖狐獸無理的發怒了。完全不能理解那樣的留姬的心，妖狐獸很困惑。然後闖入這2人的裂縫的白影也俏俏地靠近留姬。力量就是一切。冰惡魔獸為了得到更強大的力量而企圖要把留姬成為其拍檔。在追求力量時與妖狐獸之間開始萌生出友情。面對困難的選擇留姬所得出的答案是……

數碼暴龍是什麼回事？進化又是什麼回事？冰惡魔獸的魔爪正俏俏地靠近開始抱有疑問的留姬。為了令留姬成為其柏檔，冰惡魔獸驕傲地展示那些過去打敗過的數碼暴龍的標本。過去的自己就如冰惡魔獸般只追求強勁，留姬受到不少的衝擊。雖然因妖狐獸及啓人的活躍而得救了，但是留姬卻不能整理其心情，不理會妖狐獸地獨自走了。濃霧突然在十字路口擴散。感到將有數碼暴龍出現的大耳獸進入戰鬥狀態，但李健良卻堅決地不允許。正當李健良要無理地把撒嬌的大耳獸帶回家時，數碼領域就在他們的眼前實體化了。然後就在數碼暴龍完全實體化的一刻，山木發出的Yuggoth把數碼領域以及數碼暴龍一同消除了。大耳獸十分不滿數碼領域被消滅。雖然李健良不斷哄它，但卻察覺到自己並不能解答大耳獸經常提出的質問：“……喂，阿健，為什麼我不可以戰鬥呀？”大耳獸是朋友。不想看見朋友廝殺。但大耳獸卻很想戰鬥。否定戰鬥即是，否定它是數碼暴龍。李健良對一直所追求的自己與大耳獸相遇的意義開始動搖。但是命運並沒有給予他時間找出答案，2人再次捲入戰鬥之中。該被Yuggoth消滅的的數碼暴龍竟再次出現了。誓要向人類報復，在城市暴走的這隻數碼暴龍。只有自己與大耳獸才能守護人們。在極限的狀況下李健良好不容易得出的結論是？現在就是抉擇的時刻。

為了從暴走數碼暴龍之中守護人們，因為只有自己與大耳獸才能做到。阿健終於憑着自己的意思決意戰鬥。迴應這想法的大耳獸進化成加魯哥獸，把強敵武士獸出色地打倒了。稍微有一點理解自己與它相遇的意義，大耳獸與阿健的羈絆更加緊連。但是正有一個人影用嚴肅的臉看着他們，那就是，等待放學回家的啓人及阿健的太陽眼鏡男子。目擊了他們在警衞下戰鬥，他就是網絡管理局的山木。山木忠告啓人及阿健別再玩那些危險的遊戲，雖然他只説了這些，但山木的説話卻令啓人他們留下不祥的預感。另一方面已經1人的馴獸師留姬，依然不能整理其心情。即使分離也始終擔心妖狐獸的事。儘管知道只要叫一聲妖狐獸便會回到她身邊，但始終不能開口。妖狐獸也一樣抱着不能乾脆解決此事的情感。為了埋沒失去留姬的空白，妖狐獸不斷重複那些證明自己強勁的戰鬥。但是留姬所看見的這個妖狐獸的模樣卻是，1人戰鬥的妖狐獸已不需要自己，再次不理它了。雖然互相想着對方，但留姬及妖狐獸卻擦身而過。2人再也不能成為拍檔了嗎？還有接觸啓人他們的山木的真意是？各人的命運已大大的變動起來了。

與留姬訣別後的妖狐獸繼續着只有自己1人力量的孤獨戰鬥。雖然留姬很擔心妖狐獸，但認為妖狐獸已不需要自己所以就不理它。但在戰鬥快將勝利的那一刻，妖狐獸的動作停止了……就連妖狐獸也想着留姬，開始抱着是否還要狐單1人地戰鬥的疑問了。乘着那一瞬間的空隙鳥人獸作出突然的反擊。留姬完全沒有考慮會被妖狐獸攻擊到的危險奮身撲出去，妖狐獸也進化來回應這情感。跨越這危機後的留姬及妖狐獸相互的心情終變得有多少坦率，再次開始步向拍擋之路了。啓人及基爾獸在夜晚的城市與狂暴的數碼暴龍．黑暗蜥蜴獸戰鬥。但當作出必殺一擊時，啓人他們被照明燈的光照到了。接踵而來的是催淚彈的攻擊。啓人因這些突如其來的事情而驚呆，而在其面前出現的是管理局的山木。側看着黑暗蜥蜴獸的回收工作，山木再次忠告啓人別再玩這些危險的遊戲。雖然抱着必死的心保護基爾獸，但山木滿載自信的姿態在啓人的心內刻下了大大的恐布。接着在啓人自身中也對作為馴獸師開始產生微妙的變化……進化的畏懼。覺醒了野生本能的大基爾獸，完全聽不到自己的聲音。不能忘記初次進化的那個時候的事的啓人，對基爾獸的“我想變強”的坦率説話不能夠同意。而且自先例的那件事後博和他們的不偷快狀態，能分擔這心情的人一個也沒有，啓人更加陷入困境了。管理局的調查把陷入事件的啓人置之不理，穩步而順利的繼續着。到底啓人能否再次站起來作為馴獸師呢？還有，終於要發動的數碼暴龍捕獲指令。山木的王牌「殺害」到底是什麼來的？現在，禁斷的大門快被打開了。

與朋友的擦身而過，山木的出現，再加上進化的畏懼。一次全揹負這些形形色色的問題的啓人自信盡失，抵受不了作為馴獸師的壓力。但是啓人得到了基爾獸親切的鼓勵，“啓人，我們是朋友”的這句説話令啓人重拾勇氣，相信基爾獸，以及相信作為馴獸師的自己，2人發誓要一起成長。但是就在這個時候，山木他們要把數碼暴龍一掃而空的計劃也到了實行的時刻了。然後終於，在夜空中冒起的藍色旋渦。全部在網絡上存在的數碼暴龍也被捲入，完全地把數據分解的狂暴之牙，殺害。山木滿足地仰望着殺害把所有有意識的數碼暴龍一一排除。雖然不能接受山木那對所有數碼暴龍都有敵意的做法，但啓人只能仰望着那些不斷被捲入旋渦而失去性命的光芒。但是就在這時，任何人也預測不到的事態發生了。旋渦的中心出現了巨大的柱。山木因預料之外的事故而有所動搖。在附近一帶響起的神秘聲音告訴了一件駭人聽聞的事件，山木的行動把通道打開了。證明這説話的就是降到地上的巨大數碼暴龍。要把數碼暴龍消去的殺害，諷刺的是結果卻把數碼暴龍來到現實世界的通道打開了。出現了的強敵迷企羅獸壓倒性的力量，先後把九尾狐獸及加魯哥獸擊敗。然後就在迷企羅獸的攻擊襲擊大基爾獸的瞬間，在啓人的身體內劇痛亂竄。那正是大基爾獸的痛楚。共有痛楚的事實令啓人重新覺悟作為馴獸師的使命，在藍卡的力量下大基爾獸得以進化成機械基爾獸，戰勝了迷企羅獸……啓人成功的進化成完全體，把迷企羅獸打倒了。但這並沒有完全解決問題。為了要從現實世界鬧事的數碼暴龍中守謢人們，啓人、李健良及留姬這3人決心組成一個隊伍。

為了對抗在現實世界鬧事的數碼暴龍，啓人他們組成馴獸師隊伍。但當要實行時步伐總是不能一致，啓人巡邏的邀請由於李健良及留姬因事先有約而不能巡邏。就在這時突然邀請啓人的是博和他們的5年2班的同學。另一方面李健良及留姬因各自的事情而外出。留姬在等待地下鐵時突然感到異樣。接着的瞬間，巨大的蛇型數碼暴龍實體化了。留姬追蹤那數碼暴龍。李健良也匯合，但在敵人的實力前亦只能被迫苦戰。而且可依靠的啓人及基爾獸還沉迷在同學的遊戲中，就在馴獸師迎接了冷不防的危急關頭時，因小妖獸意外的幫助而得以成功匯合。雖然很危險但也獲得了初次的勝利。

旅遊車抵達澱橋小學，因今日是啓人他們這級的露營日。在這羣快樂的小朋友之中的啓人他們好像有些奇異的舉動，原來李健良建議帶同基爾獸它們一起去露營。雖然途中有幾次差點兒被發現，但幸得博和及健太的幫助啓人及基爾獸終也能勉強的矇混過去。然後這次露營雖然會冒冷汗，但該會很快樂的吧。D-Ark出現了一些反應，想把大耳獸帶到自然之中休息。阿健把那拿不定主意的新敵人真達羅獸的出現看漏了。但是真達羅獸卻在一夜之間把全城的電力吃光，強大地成長起來了。阿健對自己的失誤不斷自責。為了保護李健良，啓人鼓勵他。2人同心合力地與真達羅獸戰鬥，誓要守謢和平的露營。

阿健從健太手中得到了一張卡。這張看似是一張極普通的卡，但當阿健放進D-Ark SLASH過的瞬間，它卻變了作藍卡。為了追查藍卡的秘密，阿健與啓人便去尋找先前卡的主人。不過最後只得知在秋葉原撞上一名男子後便多了這張卡。加上阿健的父親．鎮宇在與他討論時開始呈現的奇異態度，越來越多的謎題出現了。 到底藍卡誕生的真相是？追求謎題的阿健終於到達了父親．鎮宇那令人吃驚的過去。然後出現了從數碼世界而來的新刺客。藍卡的光輝將會把戰鬥引導往超速的世界。

在尋找藍卡的謎的阿健他們的面前出現了強敵波夷羅獸和伐折羅獸。面對加魯哥獸的危機，阿健拋開迷惘SLASH那張藍卡。加魯哥獸進化成完全體音速獸，以驚異的速度作為武器，擊破它們兩個。戰鬥終結後，阿健從父親．鎮宇口中得知了數碼暴龍誕生的秘密。不過就在同一時間，該已被打倒的伐折羅獸接觸了留姬及妖狐獸。伐折羅獸指示妖狐獸要與它一起走。妖狐獸接受了邀請，留下“也有些事只有數碼暴龍才會知道”的這句話後便和伐折羅獸一起在夜晚的黑暗中消失了。突然要跟隨母親到模特兒事務所。在那裏等待留姬的是預料之外的試鏡。穿起不習慣的洋服，不能容忍的對着鏡頭。留姬對這些始料不及的事情感到不知所措，及很不開心。再加上強烈的閃光令留姬感到恐布，留姬終於撞開攝影師及離開攝影室了。 留姬單手拿着D-Ark獨自在傍晚的新宿彷徨。不過始終也找不到想找的妖狐獸。妖狐獸是不會不回來的。抱着這不安心情而又沒任何辦法的留姬只有返回家中，而等待着她的是，阿健打來的1個電話，得知發現伐折羅獸的消息，留姬便急速往競技場。到底與伐折羅獸共同行動的妖狐獸的真正用意是？今晚，在月光沐浴的美麗戰士要誕生了。

妖狐獸與伐折羅獸一起消失了。留姬等了很久妖狐獸也不回來，感到很不安。但是妖狐獸的真正用意是為了知道神將的目的。不為了數碼暴龍之神，而選擇了與留姬一起依自己的意志生活的妖狐獸，終於進化成完全體道士獸，打倒了伐折羅獸，與留姬的羈絆緊加緊連了，給人類覺得可愛有什麼好開心的。小妖獸看見古樂獸在街上被女孩們圍着便慣常地説出這些憎惡的説話。不過當不開心的小妖獸用火球追趕那些女孩時，突然傳出了低沉的笑聲。 直覺上被人罵作蠢才，小妖獸便衝入剛發生的數碼領域。在那裏等待着小妖獸的是新的神將．因陀羅獸。因陀羅獸從容的府視着逞強的小妖獸，最後突然説出了一句帶有衝擊性的説話。小妖獸也與其它的數碼暴龍同夥，終歸是人類所飼養的數碼暴龍。雖然留姬與妖狐獸的登場得以避免了對決，但因陀羅獸的説話令小妖獸受到很大的衝擊。小妖獸因沒法宣泄的怒火爆發，在城中任意的來回鬧事。最後終於鬨動至警察出動，自尊心受到傷害。小妖獸拚命地隱藏的過去到底是？小妖獸因因陀羅獸的存在，現在要展開狐單一人的無謀戰鬥了。

你也是人類所飼養的數碼暴龍……因陀羅獸的説話令小妖獸的自尊心受到傷害，拒絕妖狐獸他們的幫助，投身了孤單一人的無謀戰鬥。因抱着我想變強的想法而令小妖獸抵得住因陀羅獸的攻擊，即使腳步不穩也繼續站起來。然後就在絕望的狀況中，小妖獸終於睹上一切作出了最後的攻擊。小妖獸賭上一切的突擊。但仍不能令因陀羅獸受到任何傷害。就在小妖獸終於用盡力量快要被因陀羅獸讀取的時候，由都庁發射出來的波動捉住了因陀羅獸。 那就是山木製作出來為了對抗神將的新武器。受到傷害的因陀羅獸逃進了殺害球之中。雖然啓人他們不太清楚狀況，但總算逃過了危險的場面。另一方面的山木雖然覺得不不完善，但今回的成功也令他的自信加添了不少。 但和平的時間並不能長期持續。再次出現的因陀羅獸在首都高開始鬧事。因陀羅獸輕輕地退避大基爾獸們的攻擊，及壓倒自衞隊。接着連卡也全部丟失，即將迎接九死一生的危機時，博和拿出了一張卡給啓人。那是一張自制的藍卡。最後的希望是自制的藍卡。博和、啓人的情感會傳達到基爾獸嗎？創造奇蹟吧，友情的CARD SLASH。

樹莉為了成為馴獸師而向留姬請教了卡的使用方法。之後，獅子獸這數碼暴龍就在樹莉的眼前實體化了。樹莉堅決相信這一隻獅子獸就是自己的拍檔數碼暴龍。

西新宿一帶發生了地震。啓人及阿健也有一種討厭的預感。 基爾獸感到有數碼暴龍。突然噴出一團霧，把每個公寓區全部包圍起來了。人們在抱怨。在濃霧消散後卻出現了一隻十分巨大的數碼暴龍。它就是毘羯羅獸。基爾獸它們即使進化來應戰也不是對手。毘羯羅獸一邊破壞明治通道一邊前進。 山木打算使用殺害。但因那些在那裏的小朋友可能也會被捲入，所以鎮宇反對。不過除此之外便再沒有其它方法了。

殺害起動了。不過就連完全體們也敵不過。留姬也不知該用哪張卡，而阿健則認為卡內有着自己所相信的力量，若果相信便可把力量經數碼器傳達。 得到了卡的力量的道士獸及音速獸形勢逆轉。但是，數碼暴龍們仍感到力量便抽走。正因為山木的殺害起動了。 另一方面，摩虎羅原來是神將的一員，摩虎羅獸，它取出寶玉，奪取了殺害。就在殺害要悲慘的崩潰時，山木獨自留下。 毘羯羅獸注入了從天空的方格傳來的可怕力量後，再次開始進攻。啓人因基爾獸他們進化、變得很強而很辛苦，阿健説，啓人和機械基爾獸的力量是共有的，而毘羯羅獸也再次向着他們朝來。

數碼世界的出現，令到現實世界陷入大混亂。數碼暴龍的災害也成了國家的重大問題。山木看見這些新聞感到很失落。不過，麗花開導他説“有些事只有山木才能做到”。在絕望的深淵中苦惱的他的答覆是……啓人他們為了解決這個事態，決心出發往數碼世界。他們各自向家人介紹了自己的數碼暴龍後，傳達了將會在明日踏上旅程。

啓人他們進入了數碼世界及其地帶之中。一個用雙筒望遠鏡便可看見一個反轉的日本地圖的世界。好不容易才到達的地方竟是一望無際的荒野。啓人在那裏豎立了一支旗。首先要找找看有沒有人造的東西，用望遠鏡看見了一條類似天線的物體，便以此為目標步行。但這只是一堆岩石。而且那裏還有野生數碼暴龍的攻擊。

留姬、博和及健太被光吹飛了。不省人事、醒來後，看見現實世界球變得很細小。已經被吹飛到很遠了。附近有一些民房，但沒有門及窗，屋蓋低低的圓圓的。怎麼看該也是為了對抗強風而設的。風又颳起，各式各樣的東西被吹起，撞向房子。結果他們再次被吹飛，三人飛到了公公獸及婆婆獸這兩夫婦所住的房子。就在大家把因強風而弄歪的門壁弄好時，公公獸及婆婆獸的大戰開始了。

啓人他們在找尋留姬等人，但即使去到哪裏始終也找不到。就在這時，大耳獸發現了一條泥人獸的村落。村落很荒蕪，不知為何滿地車痕。接着出現巨大的電單車，並衝向啓人他們。這電單車不知為何沒人在駕駛。電單車轆過泥人獸後，便離去了。在啓人他們的面前出現了泥人獸的族長，得知那巨大電單車已多次襲擊這裏。它們想找駕駛電單車的人，但車上根本就沒人。另一方面小妖獸到了一個濃霧的世界。在那裏出現了狛犬姿態的招杜羅獸，尋找想變強的人。雖然小妖獸齒口否認，但其實內心是很想的。招杜羅獸向小妖獸發放一道光，在那裏有拍檔2個小朋友。在村落那裏巨大的電單車又再次開始襲擊泥人獸它們了。

留姬、博和、健太及妖狐獸在旗那裏等待，但總是沒人回來。留姬於是遺下博和及健太，走去找尋其它同伴。被遺下的2人感到不安，所以也追上留姬了。另一方面，啓人他們覺得留姬他們説不定會在旗那裏等候，所以回來。不過那裏已經沒人。但是基爾獸嗅到了妖狐獸的氣味。留姬他們又被光之柱吹飛，發覺自己來到一個齒輸不停轉動的地方。一個壞了的齒輪，短針在轉動，但長針則停了。秒針雖然發出聲音，不過只是在指着相同的地方。留姬不經意地碰了那秒針，那秒針便突然動起來了。住在那裏的時鐘獸和齒輪獸這兩隻數碼暴龍發出絕望的哀號。秒針走動的同時大地轟嗚，接着轉動的齒輪都停了。這時鐘原來是一個封印。封印解開後，出現了超龍獸。留姬令妖狐獸進化成九尾狐獸來應戰，但形勢不利。接着出現了一隻陌生的數碼獸，而這隻數碼獸的搭檔令留姬等人大吃一驚。

啓人他們來到了一個扭曲了的單色世界。人數又回覆到先前那樣。喜歡Card Game的啓人能與憧憬的遼相會而感動。另一方面因留姬為了什麼，而獨自留在齒輪的世界。啓人他們先要做的是在這單色的世界等待她。之後，啓人他們到達城堡，看來那裏沒人使用，於是便在那裏睡一覺了。另一方面古樂獸一面向不同的數碼暴龍打聽啓人他們在哪，一面尋找，但一直找不到。接着墮天地獄獸出現，雖然停留了一會，但又再次走了。啓人他們發現乘着頞你羅獸的摩虎羅獸。雖不知道古樂獸是否在那裏，但也追着它去。

與留姬走散了的啓人他們，返回先前的旗那裏，但那支旗竟然沒有了。啓人他們頭頂的現實世界球發出光輝，光之柱便縱橫不斷的亂走起來，啓人他們得找個地方閃避。在現實世界的山木的計算機收到了一封由啓人寄出的E-mail，寫着“我們大家都很好”，竟是從數碼世界傳來的E-mail。至於走散了的留姬與妖狐獸。數碼精靈突然出現，並拉着留姬到一條小河。在留姬被激流沖走時拋出樹枝拯救她的竟是古樂獸。基爾獸嗅到古樂獸的氣味。在一片沙塵滾滾後，留姬、妖狐獸及古樂獸出現，他們終於再會了。可是他們並不知道該怎麼返回現實世界。啓人他們迷惘時，九尾狐獸察覺到墮天地獄獸的正體就是小妖獸，但墮天地獄獸卻否定。現實世界正進行殺害的測試，不知為何殺害竟不能停止。接着山木及麗花出現，而啓人他們躲在道士獸的結界而熬過了激烈的沙漠風暴。道士獸好不容易張開結界，光之柱不斷移動，啓人、阿健及大耳獸都被吹飛到不知哪去了。殺害雖然停止，但他們又再次分離了。

與啓人分開了的基爾獸等人。突然所站的地方液體化，健太、博和、樹莉、留姬、妖狐獸及基爾獸都跌下去，降落到一個怪蛙獸對每次安杜路獸壞了都得修理感到厭煩。怪蛙獸運送着大木桶，可是內裏放着的卻是博和、健太、獅子獸、妖狐獸、基爾獸及及留姬。怪蛙獸在運送貢物給八頭蛇獸時，獅子獸他們佷有氣勢的飛出來。八頭蛇獸説喝酒再沒比喝酒能變得強，它的強勁力量復活了。樹莉後悔給八頭蛇獸喝酒，得博和及守衞獸的鼓勵，樹莉嘗試CARD SLASH，消滅了八頭蛇獸。最後博和竟然成了守衞獸的馴獸師。

啓人他們到達了水中。在陽光刺眼的藍天下，黑色外表的MIB也在。啓人他們怎麼樣也不能脱身。當看熒光幕時發現山木傳來的E-Mail，寫着“沒事便最好了。祈望奮勇戰鬥”。在眾人的父母面前山木出現，從計算機可看到啓人傳來的E-mail。向父母問好。Send E-mail的機器被水弄濕了竟也能動。這裏的水根本不是真正的水。今次，潛入水中也沒濕。成功了。被指導的出口在強行通過時竟有觸電的感覺。一行人出了出口後好不容易才走到水之宇宙。在那裏數碼精靈不斷輪流飛舞。相信該是閲覽室的地方浮着一艘與巨大的D-Ark很相似的物體。在那裏有一位不思義的男人．水野，開始説出一件不思議的事情。

小春因大耳獸的不在而感到寂寞。當在公園遊玩時，落入了突然出現的地帶。在那裏有一隻很大“兔子”的數碼暴龍。另一方面，乘着交通工具在水世界移動的啓人他們，大耳獸聽到小春的聲音。啓人他們降落到數碼世界。鎮宇對山木説了一段話：“我們已經沒有了，創作那些可以自行進化的人工知能。那時我們充斥着幼稚的雄心壯志。不竟如何侵犯神的領域也是不該的，但是SHIBUMI卻抱着不同的想法。”“李先生，那是！”鎮宇因山木的叫聲而仰起頭。小春在滑梯頂。不過，那裏出現了地帶。在地帶中的小春，在那深處的方舟的窗口中看見大耳獸。

啓人與阿健他們從黑大耳獸口中得知了古樂獸該會在四聖獸的領域。啓人説要往那裏去，而阿健則心情不好。因為妹妹小春也在。在阿健躊躇時突然響起了一道爆炸聲。在閃光與煙霧中響起了引擎的聲音。正是墮天地獄獸。變成究極體的墮天地獄獸，要實踐與神將的約定，到來打倒基爾獸他們。音速獸拚命的攻擊對墮天地獄獸來説就像蚊叮一樣。然後那槍口對準着啓人他們。啓人用盡全身氣力呼叫“基爾獸──”。啓人的聲音到達遠處的大基爾獸，由那道光之柱傳來的。大基爾獸毫不猶豫地跳進去了。就在啓人他們千鈞一髮間，大基爾獸他們趕到來了。不過，就連九尾狐獸及守衞獸的攻擊也傷不到它。就在墮天地獄獸給予九尾狐獸致命一擊時，獅子獸從後抓住它。因為教導墮天地獄獸的緣故，墮天地獄獸的爪無情地貫穿獅子獸的胸膛了。因憤怒而忘我的啓人為了進化，一道閃光突然出現，就像啓人那巨大的分身，滅世龍獸出現了，不斷地向墮天地獄獸攻擊。

大基爾獸進化成究極體了。不過，那巨大的猛獸模樣，完全超乎啓人的想象。全因獅子獸被殺，那憤怒而驅使的進化。這異常進化的究極體滅世龍獸，已經聽不進啓人的聲音了。那力量令大地裂開，附近一帶也被波及，那力量竟凌駕於墮天地獄獸，它的存在就只是要不斷進食。就連摩虎羅獸也感受到那場力量的衝突正威脅這個世界。就在從旁干涉時，竟被墮天地獄獸量子分解而被吸收了。瀕死的九尾狐獸為了阻止他們的戰鬥而進化成道士獸。不過也與音速獸一同被量子分解吸收。阿健運用機智使用“假身”卡，用分身替換而成功脱身，但完全體的力量被墮天地獄獸吸收了。不斷吸收力量的墮天地獄獸因不能承受力量的反衝而開始暴走，竟壓倒滅世龍獸。滅世龍獸被打敗，啓人很擔心它，而墮天地獄獸無情的槍彈正要迫近他。

基爾獸真正的究極體．紅蓮騎士獸誕生了。那就是基爾獸與啓人一體化後的騎士姿態。紅蓮騎士獸腳蹴大地，向墮天地獄獸展開激戰。二頭究極體熾烈的戰鬥展開了。在這機會下，朱雀獸向招杜羅獸落下命令，把那個雖是神將，卻成為了啓人等人的同伴的黑大耳獸打倒。還有獨個兒，因地面的分裂而與大家分離在別的小島上，心情鬱鬱不樂的樹莉。就連2大究極體那樣熾熱的激戰，也不能映進眼簾。阿健看見小春不斷抽泣地緊握D-Ark。在啓人及基爾獸之間，一道光落下，從光中出現了新的D-Ark。

從南大門起，無數拱形的門一直線伸延至遙遠的彼方。啓人他們留下博和、健太、守衞獸及小春，向朱雀獸的居所朱雀門前去。感受到朱雀門內駭人的“憤怒”，基爾獸露出鋭齒呻吟，九尾狐獸的毛全部豎起。伴着像大地震的振動，巨大的鳥型數碼暴龍朱雀獸那巨大的身影出現了。它就是四聖獸．朱雀獸。它的龐大身軀令眾人啞然。對於要取回古樂獸的啓人他們來説，古樂獸本來就是這地方的東西。轉為啓人攻擊，但對巨大的朱雀獸而言卻絲毫不動。相反朱雀獸的一擊便把眾人吹飛了。朱雀獸的業火，不僅數碼暴龍，連留姬他們也一拼攻擊。眾數碼暴龍以自身為盾堅決保護眾小朋友。機械基爾獸及道士獸因受到損傷而站不起來，而音速獸也傷痕累累地勉強站起來強抗。

撒多格杜獸的攻擊也不行，赤紅的光從瓦礫的山的內部向四方發放，朱雀獸以不死鳥的姿態再度出現。眾人對於他的不死身啞口無言，但也得繼續戰鬥。竭盡全力進化並再度出擊，勉強地支撐着。不過已經再沒有辦法了。此時上空的厚雲發光，雷像矛般飛射，並於某處落下。從雲中出現的是，巨大的，非常巨大的青色的龍，四聖獸．青龍獸。啓人他們從青龍獸口中得知了一件震驚的事實……“白虎門”。那是一個山水畫的世界。機械龍獸抱着阿遼，飛跳到瀑布旁的岩石。機械龍獸感受到非常強大的氣息，於是便向那裏前去。那裏有四聖獸的一員．玄武獸。玄武獸為四聖獸白虎獸而留守在這裏。而機械龍獸所感受到的強烈氣息並不是玄武獸，而是從背後的谷底所發出的。白虎獸該是在和什麼東西進行熾烈的戰鬥。谷底好像有什麼來路不明的東西開始行動。

真正敵人原來是消除數碼暴龍的程序．帝厲魔(D-Reaper)。垃圾是理所當然的，但接着連數碼暴龍也會被消去。四聖獸加強警戒。另一方面悲痛欲絕的樹莉，始終沒法忘掉失去獅子獸的悲傷。啓人他們對於如何與帝厲魔(D-Reaper)戰鬥感到苦惱。帝厲魔(D-Reaper)為了得到進化的力量而侵略數碼世界，那力量之源就是古樂獸。要快些拯救古樂獸才行。那裏已經有人乘着數碼暴龍來了。他就是乘着機械龍獸的秋山遼。

啓人他們得到四聖獸強力的幫助，終於救出古樂獸。不過，帝厲魔(D-Reaper)的泡刮到空中，眾人再次籠罩在緊張之中。真正敵人全力攻進來了。下定決心的四聖獸圍着古樂獸的四周，古樂獸的身體也急速上升。然後古樂獸進入暝想，它額上的三角標記開始發出金色的光輝。接着很多數碼精靈從四周集結，化成光之女神的姿態，把古樂獸抱於胸中。光輝不斷增強，在女神腕中的古樂獸要變回本來的姿態。另一方面在新宿，山木他們利用Hypnos想把啓人他們送返現實世界，一直在準備。山木發E-mail至啓人的掌上型機械，叫他們乘坐Ark（方舟）返回現實世界。若然找到Ark的光之軌道的落點，啓人他們便能返回現實世界了。

阿健的父親他們得到了世界各地的人們的幫助，終於成功送出方舟．Ark，並出現在數碼世界中的啓人他們的面前。已經沒有時間了。為了返回現實世界，啓人他們怱忙地乘上Ark，但是仍看不見留姬及妖狐獸的身影。留姬他們找小妖獸去了。Ark低沉地説要升高一點，於是便開始上升。為了搜尋還沒回來的留姬，阿遼及機械龍獸便飛了出去。軌道繪出弧線，一直伸延至現實世界球。還沒載上所有人的Ark開始慢慢地上升了。

啓人他們從數碼世界平安回來，與各自的家人離開東京。樹莉因沒人接送，啓人便送她回松元。在回程時，啓人從電視新聞中得知了新宿的超高速大廈郡正被一片赤黑起伏的帝厲魔（D-Reaper）所侵蝕。留姬及阿健也從新聞中看見此事。不過阿健的父親．鎮宇勸告他：今次的異常現象便交給大人來處理吧。兩人雖然想到新宿，但又想留在親人身邊，內心不斷地爭扎。啓人乘坐電車返回東京。預定在八王子轉車，返回父母被疏散到的逗子那裏。不過他很擔心新宿的情況。啓人為了去那裏而感到苦惱。電車終於到達八王子了。

啓人他們終於回到西新宿了。在那裏出現了他們從沒見過的謎之生物。莫非是帝厲魔（D-Reaper）？至少那不是數碼暴龍。不過，很奇怪地那些所謂的攻擊並沒幹什麼，只是在不斷髮出電子音，不斷觀察啓人他們。另一方面，小妖獸憑着昔日拍檔所留下的便條，希望找回它的拍檔。當然，小妖獸是不懂讀那些字的。於是它便託城市裏的人為它讀字，但大家當聽見是數碼暴龍便恐慌起來，根本沒人讀那些字。在小妖獸不知如何是好的時候，一把不可思議的老人聲音傳出了。

啓人看見的真的是樹莉嗎？啓人因疑惑而打電話給松元的家。原來樹莉在松元的家失蹤了。而且是和啓人看見樹莉同一時間的。一名少女獨自在新宿走廊奔走。她那黑色Gothic & Lolita的服裝露出雪白的肌膚。還有一隻巨大的狗陪着她跑。一回頭看時，竟有許多水母模樣的帝厲魔（D-Reaper）使徒。

啓人他們得到篤賓犬獸的幫助，終於能進化成究極體。各人心中也有不同想法，現在他們在現實世界實現了究極進化。面對着巨人的帝厲魔（D-Reaper）地帶的泡，紅蓮騎士獸他們各自使出必殺技，不斷攻擊。當以為敵人收縮，帝厲魔（D-Reaper）最上部突然伸長出球體，迫近紅蓮騎士獸。紅蓮騎士獸被可怕的帝厲魔（D-Reaper）捉住了。

在南新宿的大廈屋頂，斗篷飄揚展現颯爽的究極體正義獸出現了。當它得知啓人他們陷入困境時，便匆忙奔去了。留姬看見它那爽朗的揮手動作，便認定了正義獸的真正身份了。另一方面，被吸進帝厲魔（D-Reaper）地帶的啓人，他在那裏聽見樹莉的聲音。但其實那是帝厲魔（D-Reaper）使徒。它用樹莉的姿態用説話打擊啓人。就在啓人的意識離他越來越遠時，基爾獸的聲音從他耳邊響起了。

樹莉被“命運”的惡夢打擊。母親的死及獅子獸的死重疊一起，令她受盡痛苦。這全都是命運，是不能逃避的。此時山木與Wild Bunch的成員緊急進行提升Ark的開發。若然完成，便一定能能打倒帝厲魔（D-Reaper）。帝厲魔（D-Reaper）的心臟部位位於都庁。可是瀕死的墮天地獄獸還有樹莉都在那裏。

在帝厲魔（D-Reaper）的中心Kernel-Sphere，無數電線綁着墮天地獄獸令它動彈不得。樹莉仍然目無表然地蹲坐着。Kernel-Sphere開始大幅膨脹，變成巨大的模樣俯視都庁。另一方面，紅蓮騎士獸他們開始一齊攻擊。撒多格杜獸、狐姬獸及正義獸全力攻向帝厲魔（D-Reaper）。而紅蓮騎士獸則颯爽的乘着葛拉尼，飛向樹莉所在的Kernel-Sphere。另一方面的墮天地獄獸也拚命地掙扎。它為了贖罪，奮不顧身要拯救樹莉，用盡全身氣力扯掉那些綁着它的電線。

在帝厲魔（D-Reaper）地帶中，清醒的樹莉被模仿自己的帝厲魔（D-Reaper）迫得很痛苦。古樂獸拚命拯救樹莉。樹莉的哭叫聲到達紅蓮騎士獸體內的啓人。此時都庁發出激烈的地嗚聲，帝厲魔（D-Reaper）開始呈現出單眼女神像的姿態。啓人當然沒有膽怯。但一進入泡中便會解除究極體的形態，到底該怎辦才好？

數碼網格線在上空打漩，製造出一個細小的地帶。各數碼暴龍解除究極體的形態。阿健取出SHIBUMI所制的紅卡，若SLASH那卡便能在帝厲魔（D-Reaper）中戰鬥。不過那張卡只有一張。啓人、阿健、留姬及阿遼舉起自己的數碼器，準備讓紅卡飛入。

樹莉把數碼器指向帝厲魔（D-Reaper）的牆壁，數碼器便射出耀眼的光芒。樹莉大喊自己新的領悟。“自己的命運是由自己決定的！”此時，紅蓮騎士獸正在和帝厲魔（D-Reaper）展開壯絕的生死決戰。儘管把它們一隻只地打倒，但仍無法靠近樹莉所在的地方。接着樹莉的數碼器好不容易打破牆壁。但這個時候，一團赤黑的黏液流進室內，液體填滿了樹莉所在的球體，奪去了她逃走的地方。