微生物消化

棲居於消化道內的正常微生物區系對食物的分解作用。各種動物消化道內都棲居有大量微生物，但棲居的部位、微生物的種類和作用有很大差異。肉食動物大腸內雖有大量微生物棲居和繁殖，但這類動物食物的消化和吸收在小腸內已基本完成，因此微生物的作用主要是對未被消化和吸收的食物殘渣進行腐敗和發酵分解。 ^[1] 

反芻動物的瘤胃和單胃草食動物的大腸內有大量微生物繁殖和活動，對於這些動物消化和利用植物性飼料中的營養分特別是粗纖維起着十分重要的作用(見覆胃消化和大腸消化)。有些單胃動物(如馬和豬)的胃、禽類的嗉囊和雜食動物的大腸內也有明顯的微生物消化，在營養過程中可能起一定的作用。 ^[1] 

消化道內微生物的種類很多，並隨動物種類、個體、食物性質等因素而變化，總的説來有細菌、真菌和原蟲三類，正常情況下它們不僅與宿主之間存在共生關係，而且彼此之間也相互依賴、相互制約組成一個相對穩定的微生物區系。微生物的消化作用是靠其產生的酶在細胞外(胞外酶)或細胞內(胞內酶)對食物中的營養分進行分解，其中對蛋白質的分解習慣上稱為腐敗作用，分解產物為肽類、氨基酸、氨、硫化氫、胺類等對糖類(包括纖維素)和脂肪的分解稱為發酵作用，糖類的分解產物為乳酸、揮發性脂肪酸(VFA)、CO₂、CH₄等，脂肪的分解產物為脂肪酸、甘油、膽鹼等。

除分解作用以紙消化道微生物還有合成作用，例如反芻動物瘤胃內的微生物可利用氨合成氨基酸和蛋白質，利用葡萄糖和雙糖合成糖元，還能合成某些B族維生素和維生素K；其他動物大腸內的微生物也能合成B族維生素和維生素K等物質。 ^[1]