傳世第二季

　　黑暗的真相曝光後，Molly的生活被徹底改變。一轉眼六個月過去了，Molly目前正在一家精神病院接受康復治療。當她得知她在太空目睹的奇怪死亡事件再次發生之後，她決定逃出醫院去調查。她與負責調查這些案件的警察兼賞金獵人JD Richter（Jeffrey Dean Morgan）不期而遇。出於某種個人原因，Richter決心不惜一切代價揭開事情事實真相。

　　Richter不相信Molly所説的拿着射線槍的外星人的存在，Molly表示被害人的血樣可以證明自己的觀點，二人調查時發現被害人已經不止一個。

　　為摧毀Ahdu，軍方決定用無人機直接轟炸充滿人羣的酒吧，但是Molly和Ahdu在轟炸之前已經離開，Molly和Richter被捕，Ahdu逃脱。

　　Ethan越來越頻繁的出現對Molly的記憶。Molly被Toby邀請一起研發一種殺死混血種又不傷害到人類自己的病毒。

　　數據顯示，在四個月內有58名孕婦死於生產，這意味着有58個年齡未知的混血體散落在外。混血體近來轉入地下，這令Toby等人十分擔憂。與此同時，病毒小組的工作取得了突破性的進展，他們正在研究新的病毒株。Molly也在試圖查清John的死因，並找回Ethan。Toby幫Molly聯繫到了國土安全局相關負責人，但負責人表示由於Ethan並非人類，Molly想要回Ethan並非易事。

　　Molly發現自己的基因已和外星人的基因結合，她成為了一種跨物種的生物，因此她必須儘快阻止外星人基因的繁衍。可以消滅混血體的病毒已經被成功研製，Lucy識別人類與混血體的工作也得到了認可。與此同時，Ethan找到Ahdu向其索取血樣，Ahdu表明他們來到這裏是為了重建家園。

　　Molly威脅Toby組織一場和平會談，Toby假意妥協離開後，下令通緝Molly與JD。女子染外星基因，即將變為混血體，Toby推測Molly已被感染。

　　謝坡德Shepherd釋放了病毒，許多混血體都被感染了。兒子阿杜Ahdu快要死了。阿瑞斯和特拉不能相信。

　　Molly病重，在隔離病房接受救治，她錄下了視頻日記，為Ethan填補空白。Julie告訴Ethan，Molly很想見他一面，於是Ethan在Julie的幫助下下載關於Molly的記憶。

　　Molly破繭重生，機器人Lucy違規殺人。Toby助外星人逃跑，Molly再被通緝。機器人集體遭控制，Toby被政府定罪。

　　Molly整理John遺物，發現了Calderon的行蹤，Molly在Calderon處得知種種陰謀的幕後黑手竟是Taylor，同時安委會部長聽從了Taylor意見，決定加速生產人工生命。

　　JD解救了自殺未遂的Charlie，得知真相後，Charlie與Molly等人共同研究毀滅Taylor的方案。Taylor命令人工生命全球釋放第一代菌株，地球人遇毀滅危機。

　　外星人同意幫助Molly對戰人工生命，在外星人的協助下，Molly一行人勇闖迷宮，成功阻止了Taylor的邪惡計劃。