X戰警：天賜

變種人克拉麗絲正在城中上下逃竄，躲避警方的追捕。自從變種人內戰事件後，變種人便被普通人類看作是威脅，無論本身是好是壞，都一概要被關押起來。克拉麗絲因為自己變種人身份而入獄，心有不甘的她，利用自己空間轉移的能力逃了獄。躲避追捕的變種人不只有她，還有洛娜和馬可斯。在逃離時，變種人組織搜尋到克拉麗絲的蹤跡，把她救到了墨西哥的變種人基地裏。然而，洛娜卻因為戀戰而被人抓了。負責變種人案件的檢察官裏德·斯特拉克家裏也發生了極不尋常的事。他家的小兒子安德魯因為在學校被人欺凌，於是和妻子凱特琳來到學校，想要為兒子爭取公道。當他在校長室，威脅校長儘快聯繫作出欺凌行為的學生家長時，一通電話把他叫回了工作崗位。洛娜站在他眼前的透明囚室內，不屑地看着他。裏德看慣了變種人的伎倆，他崇尚以暴制暴的方式。他的以暴制暴不是指身體上的暴力，而是從心靈上，直接摧毀對方的意志，比如這次他拿出了一份醫學檢測，發現洛娜懷孕了，以此來擊潰洛娜的意志。然而，對變種人深痛惡絕的裏德，上天給他開了個玩笑。他的兒子安德魯和女兒勞倫都是變種人。安德魯被同學欺凌後，想跟姐姐一起到舞會好好瘋一把，想發泄發泄。沒想到冤家路窄，在舞會上，安德魯再次遇見了欺凌自己的壞同學。惡霸同學因為欺凌安德魯的事，被父母知道了，自然不會好過。現在看見安德魯，他們絕不就此放過他，把他拉到儲物間裏想為早上的事進行復仇。害怕不已的安德魯，精神近乎崩潰了，失去理智的他，喚醒了體內的潛能。突然，周圍的牆壁、金屬都隨着安德魯的尖叫而變形崩塌。舞會現場變得一片狼藉。勞倫看見安德魯被人拖進了儲物室，立即施展特殊能力放出屏障，想衝進儲物室救出弟弟。在見到弟弟後，勞倫才發現弟弟不僅毫髮無損，他還是造成事故的始作俑者。安德魯和勞倫的變種人身份曝光後，立即引來特勤局的追捕。裏德和凱特琳為了一雙兒女，不得不摒棄之前對變種人的觀念，帶着安德魯和勞倫去求助馬可斯。馬可斯表示可以幫助裏德，但作為交換，他必須幫洛娜逃走。兩人達成了共識，並展開行動。特勤局的隊伍一刻也不讓他們鬆懈，很快便鎖定了馬可斯和勞倫等人，並派出特殊的武器去抓捕他們。在千鈞一髮之際，克拉麗絲利用空間移動的方式轉移了大家，裏德卻晚了一步，進不去新的空間。

一年前，斯特拉克一家正在保齡球館享受着天倫之樂。彼時，勞倫已經發現了自己的變種人天賦，不時地悄悄使用，在遊戲玩樂中作弊。離勞倫他們不遠處，有一位變種人少女，因為能力失控，弄得自己的身體不斷顫抖，遭到了一些頑皮小孩的嘲笑。越被嘲笑，情緒便越難控制，最終變種少女不小心釋放了能力，在球館造成了損壞。當時，專門處理變種人案件的裏德不顧是非對錯，直接就把變種少女“請”出了保齡球館。風水輪流轉，當日不管是非黑白，唯變種人是錯的裏德，今日竟然因為自己的變種人兒女，而被同事們抓了起來。另一邊廂，由於克拉麗絲過度使用能力，現在神志不清。曾經是護士的凱特琳查看了她的情況，認為她的狀態十分糟糕，必須立即送醫。但變種人並沒有醫療福利，尤其他們現在的逃犯身份，去醫院根本是不可能的事。凱特琳雖然會一些急救知識，但巧婦難為無米之炊，沒有藥物和設備，她什麼都做不了。克拉麗絲是為了救他們而受傷的，馬可斯不能看着她死，於是讓凱特琳跟自己一起去診所裏，把藥物偷出來。馬可斯把凱特琳帶到一所偏僻的醫療機構，此處可以向變種人提供醫療服務。馬可斯假裝急病，直接跳過了資料登記的環節，來到了診療室。而凱特琳則假裝是他的女朋友，一起混進診所，再偽裝成護士，在裏面偷取藥物和工具。特勤局的速度比他們想象中還快，不一會兒，追兵便找到診所這兒來，兩人只好立即逃回基地。這時，失去神智的克拉麗絲開始能力失控，一些空間的缺口開始在她身邊出現，而連接的地方正是之前出事的街區。街區此時正被警方封鎖起來，一批批的警員正在現場調查，空間缺口的出現簡直就是送羊入虎口。勞倫利用自己操控空氣的能力勉強把缺口關閉起來，但克拉麗絲的能力釋放太多，勞倫招架不住，終究是被特種部隊闖了進來。基地混入了一場激戰，變種人組織暴露了，大夥兒在迎擊的同時，必須開始做撤離計劃。洛娜被關進一個變種人和普通人的監牢之中。每一個監牢都會出現一些團伙和頭目，變種人被戴上屏蔽能力的跳蚤項圈後，大部分都不是普通人惡霸的對手。洛娜使用不了能力，一開始在監牢中被欺負得很慘。在放風時，獄犯的女頭目想命令洛娜幫她幹活，洛娜不畏強權所迫，施展渾身解數使出了能力，把頭目教訓了一下。然而她這個舉動，卻遭到單獨禁閉的懲罰。克拉麗絲經過凱特琳的治療，脱離了生命危險。而凱特琳和變種人們經歷了一系列的事件後，開始對這些特殊的人種改觀，她決定為了兒女，參與到這場抗爭中來。裏德被關起來後，特請局的人不斷向他施壓，甚至把他的老母親帶回來審問。在這行經驗老道的裏德決定振作起來，他知道特勤局的負責人走投無路，才這麼對自己，他可以把知道的一切都説出來，作為交換條件，他必須走正常的法律流程。對方也不甘示弱，他可以答應裏德，但他的目標，是摧毀變種人組織。

洛娜孤身一人被關押在監獄的獨立房間中，回憶着三年前剛剛和馬可斯戀愛時的片段，以此來獲得心靈的慰藉。哨兵特勤處的傑西·特納剛剛和裏德談好了條件，隨後便來打擾洛娜難得的好心情，想最後給她一個合作的機會。然而，傑西的條件不僅不吸引，甚至讓洛娜覺得有點侮辱。傑西告訴洛娜，如果合作的話，就送她去另一個監獄，但總比送去更糟糕的地方要好。洛娜深信着同伴們一定會來營救自己，對於出賣同伴的想法，她毫無意向。變種人地下組織正在策劃着營救洛娜的行動。洛娜是因為救克拉麗絲而被抓的，因此克拉麗絲十分想幫忙，但她現在還不能完全控制自己的能力。平時能力發揮到最大時，是因為自己熟悉的場景、人物，又或者是遇到讓自己恐懼的事而作出的應激反應。約翰想通過引導，讓克拉麗絲靠自己去操控能力，但時間有限，其他小夥伴感到十分焦急。凱特琳在一旁觀察着變種人們商量事情的手段，認為這樣太暴力了。一向奉公守法的她認為美國是個法治社會，應該求助律師、有能力的政客讓他們幫忙。她的提議剛説出來，便遭到了所有人的反對，包括兒子安迪。儘管很多人都認為她太過於天真，但凱特琳依舊一意孤行，她決定聯繫自己的弟弟丹尼，他在上流社會有不少人脈，希望能幫助自己。安迪和勞拉知道後，便陪母親走這一趟。凱特琳已經很久沒見丹尼了，大家沒有花費太多時間寒暄，便直入主題。丹尼一早便對凱特琳的情況瞭解一二，他很快便表了態，不想趟進這攤渾水，這會影響他的仕途。此時，安迪和表親被丹尼和凱特琳叫到房間裏自己玩遊戲了，三個孩子打打鬧鬧，勞拉突然在社交媒體上翻到了惡霸同學在安迪家門口寫了侮辱性塗鴉的照片。安迪立即按捺不住自己的情緒，能力隨即爆發，不小心在表親的房間裏造成了破壞。正當凱特琳意興闌珊，想再勸勸丹尼時，附近街區的一些居民便圍到了丹尼的家門前，要他把變種人交出來。原來安迪的表親把安迪釋放能力後差點弄壞的雕像拍照發了上網，這事便讓附近的人知道了，凱特琳三人的行蹤被發現了。安迪、勞拉只想逃命，但居民們卻想把他們往死裏打。地下組織的人知道這事後，約翰便立即去救凱特琳他們。然而對方十分兇殘，變種人都不想鬧出人命，他們都希望克拉麗絲能使用自己的能力，幫他們空間轉移。約翰的女朋友為了儘快讓克拉麗絲控制自己的能力，她把自己和約翰的記憶植入到克拉麗絲的腦海中。克拉麗絲一想到“男朋友約翰”正陷入危險，立即自如地使用能力，把大夥兒都移到另一個空間，逃過了居民們的追殺。裏德答應傑西的條件後，便假裝自己逃走了，來到馬可斯之前帶他進行接頭的酒吧，先從酒保下手。此時，傑西把追蹤器放在裏德身上，一直監視着他的行動。裏德順利地混入了酒吧，這時，他遇到了一對變種人母女。這對母女的善良和純真，讓他再一次對變種人改觀了。他突然覺得，可怕的並不是變種人，而是普通的人類。他不想害變種人，於是故意從酒保前往地下組織的車子上跳下來，阻撓傑西的追蹤。

洛娜因為在獄中過於特立獨行，且老是動壞腦筋想逃跑，不斷被哨兵特勤處轉移監房。這次的監房轉移讓她遇到了一位老熟人——害她被抓的裏德。裏德想跟洛娜好好談一談，因為這時的他已經不像以前那樣討厭變種人，但洛娜完全不買他的帳，反而聽見他説連累了馬可斯後，對他更加厭惡了。另一邊廂，變種人地下組織正激烈地討論該不該冒險救洛娜。有部分變種人認為這個行動太危險了，很可能不僅救不出洛娜，還把自己的命也搭進去。馬可斯受不了自私的大家，於是把話攤開來説，告訴在座的人都欠洛娜一份人情，大家都或多或少接受過洛娜的幫助。約翰和他的女朋友索尼婭自然義不容辭地幫忙，而凱特琳知道里德和洛娜現在同坐一條船，於是也同意這次的營救計劃。大部分變種人達成共識後，便開始商量營救的方式。雖然他們可以藉助克拉麗絲空間瞬移的能力，但現在特勤局盯得十分嚴，要找到囚車把洛娜和裏德移走，就必須知道他們的行進路線。為了得知準確的消息，馬可斯不得不找回以前的損友——一個洗黑錢兼販毒集團。馬可斯回到一個骯髒混亂的夜場，想向老熟人求助。此時犯罪集團原來的老大已經退位，目前的負責人士馬可斯的前女友卡門，以前老大的女兒。原本卡門對馬可斯當年拋棄自己還有點懷恨在心，但想到馬可斯的能力，便答應了這個交易。獲知囚車的出現地點後，大夥兒還面臨一個難題，就是要如何把囚車停下來，好讓他們得手。勞拉知道後，立即告訴弟弟安迪，讓他施展能力擔起這個重任。裏德在獄中，向洛娜坦白了一切，併為之前自己的所作所為作出慚愧。雖然裏德之前犯下的過錯無法挽回，但洛娜也明白裏德之前也只是職責所在，於是默默地接受了與他結盟的事。與此同時，克拉麗絲腦海裏不斷浮現和約翰之間的回憶，她不知道這其實都是索尼婭的回憶，只是為了讓她因為在意約翰而更好地施展能力。

變種人組織裏應外合，成功地劫了囚車，把洛娜和裏德救回變種人基地。然而特勤局並不是省油的燈，他們有先進的器材，還有一個替他們效命、叛變的變種人“脈衝”。裏德到了變種人基地後，受到了大家的熱烈“歡迎”。聯絡處的酒保一看見他便給了一拳，為之前裏德在身上放追蹤器，引來特勤局追蹤的事報了仇。大夥兒現在毫不信任裏德，裏德也表示理解，這個心結必須由他自己去解開才行。因為裏德之前的行為，讓他在基地的去留問題產生了爭議。如果大部分人都不同意他留下的話，就要由索尼婭用超能力去改變裏德的記憶，讓他忘記變種人基地的事。克拉麗絲此時和索尼婭在一起工作，她聽見索尼婭的能力後，便想通了一件事。之前索尼婭為了讓克拉麗絲奮不顧身地救約翰，在她腦海中植入了自己的記憶，讓克拉麗絲以為自己和約翰是戀人。但克拉麗絲腦海深處卻隱隱覺得不妥，在得知索尼婭的能力後，她認為自己的記憶可能被做了手腳。變種人組織通過監聽特勤局的通訊設備，得知他們正在部署搜尋變種人基地，立即變得警覺起來。洛娜和馬可斯此時正在外開着車替組織探風，一路上有説有笑，談着屬於兩人的孩子，還有未來。前方不遠處出現的特納和一批特勤局特工打斷了這場愉快的談話，原本馬克斯想繞路逃走，但洛娜卻不依，她用超能力控制車子，正面駛向特納面前，把其他特工都控制住後，便抓走了特納。變種人組織現在又多了一條罪名——綁架特勤局探員。洛娜有此妄舉，一來是為之前的事復仇，二來是想通過他去查探“脈衝”叛變的真相。如果特勤局做了什麼手腳讓變種人產生內訌，那後果將不堪設想。特納被洛娜控制着，不得不面對洛娜的審問。在此期間，特納把自己討厭變種人的原因説了出來。原來在四年前的變種人大戰中，他七歲的女兒格蕾絲在毀滅性的意外中無辜喪生，自此之後他便視所有變種人為仇敵。馬可斯不禁同情特納，但洛娜卻道出了真相——在那次戰爭中，變種人的傷亡更為之慘重，他們其實不相伯仲。哈利在營救洛娜的行動中受了槍傷，凱特琳利用自己的護理知識，在加上兒女的配合，幫哈利做了手術，把他從鬼門關救了回來，獲得了變種人們的信任。而裏德為了補償之前對變種人們犯下的過錯，主動提出自己成為誘餌，走到街上把特勤局的人引到錯誤的方向。行動尚算成功，裏德把特勤局的人引到錯誤的地點後，其他同伴便把特納帶到那裏，外加索尼婭的能力把特納的記憶改動了，這樣便成功地把基地的位置隱藏起來。克拉麗絲對索尼婭的能力耿耿於懷，在行動後終於忍不住問她，到底自己和約翰的感情是不是真的。紙包不住火，索尼婭知道再瞞下去對大家都不好，只好把自己的苦衷告訴克拉麗絲。克拉麗絲知道後十分生氣，認為索尼婭無視自己的感受，只會利用自己。特納的記憶被改回了四年前，格蕾絲還在的日子。但他回到家後，想找自己的女兒，卻被妻子告知了女兒已死的真相。聽見真相後的特納，對變種人的恨比以往更深了。

約翰想着四年前的往事，獨自陷入了沉思。曾經事美國軍人的他，冒着生命危險，為國前往伊拉克駐兵，然而回國後，不僅沒有得到應有的重視，還因為他那變種人的身份，而遭到路人的謾罵。就在他向同伴訴苦時，突然間發生了一場爆炸，是變種人大戰就此展開。變故之後，變種人從此淪為被追捕的對象，約翰連僅有的尊嚴——自由都失去了。克拉麗絲知道索尼婭改了自己的記憶後，心裏一直耿耿於懷，她質問約翰到底心裏是怎麼想的，約翰回答得十分模稜兩可。克拉麗絲本來心裏對約翰就有好感，她問約翰，之前救自己的時候，是利用她的能力，把她當作萬能開鎖器，還是真心有為她着想。約翰的回答再一次讓克拉麗絲傷透了心，約翰對克拉麗絲充滿愧疚，卻沒有一絲情意。克拉麗絲一怒之下，離開了變種人地下基地。脈衝的叛變讓變種人組織十分在意，特勤局有能力讓他們產生內訌，這當中一定有什麼秘密。裏德在脈衝的手臂上紋了一個圖案，他認出了這個圖案在巴頓魯日的聯邦大樓中看見過。為了查明真相，他決定聯手和馬可斯一起去一趟巴頓魯日，找出特勤局讓變種人內訌的秘密。裏德的兒子安德魯表示想跟着一起去，他的能力可以助馬可斯和爸爸一臂之力。三人結伴，坐上了一輛偽裝成運輸農產品的卡車，向巴頓魯日出發。路上雖然遇到特勤局的臨時檢查，但三人合力，最後還是順利到達了聯邦大樓。他們成功潛入變種人對策負責人的辦公室，把變種人的檔案資料都拿到了手。然而，事情並未就此結束，特納鍥而不捨地追蹤他們，根據蛛絲馬跡，追到了巴頓魯日。三人帶着資料連忙逃跑，但在路上，特勤局火力全開，三人陷入了險境。就在千鈞一髮之際，勞拉突然施展了控制空氣的超能力，幫馬可斯三人的卡車擋走了全部攻擊。裏德和兒子安然無恙地回到了凱特琳身邊，馬可斯也回到了洛娜身邊，美美地睡了一覺。然而，真正的戰爭現在才開始。特勤局讓變種人叛變的真相尚未查清，克拉麗絲離開變種人組織後，去向不明。馬可斯在結束了一連串的逃忙和戰鬥後，想着能平靜一番，卻接到了前女友、販毒集團首領卡門的電話。卡門要求馬可斯要還之前欠她的人情，她幫馬可斯救了磁鐵女，馬可斯現在要替她辦事，不然的話，卡門便把變種人組織的信息告訴特勤局。

馬可斯之前為了救洛娜，不得不求助自己的前女友兼前僱主、現任毒販頭領卡門。過了一段時間安靜的日子後，卡門一個電話，打破了馬可斯和洛娜沉靜而又幸福的夜晚。是時候還卡門一個人情了，縱使馬可斯前白般不願意，還是隻能遵守諾言，幫卡門在警察追查的路上製造事故。勞拉來到地下變種人組織後，和一位叫韋斯的超能力者產生了感情。然而，裏德卻從之前在巴頓魯日偷回來的變種人間諜資料中，發現有一個變種人的描述，跟韋斯非常相似，而且韋斯有不少犯罪前科。作為一名前執法人員，裏德擔心自己的女兒被欺騙了，非常焦急地想讓女兒看清楚韋斯的真面目。然而自己並未確定韋斯是否就是檔案中那名超能力者，勞拉再次對父親的自以為是感到反感。司法部來了一名官員，找到特勤局特工特納，就利用變種人實驗一事質問特勤局。然而，特納被司法部質問時，才意識到，原來特勤局被坎貝爾教授利用了。坎貝爾教授一直在用變種人做實驗，然後把他們訓練成間諜，混進變種人組織中，從內部瓦解變種人組織。這種做法並未獲得政府認可，但特納腦子一轉，這其實也是一種瓦解變種人組織的好方法。坎貝爾教授似乎聊到特納的意圖，於是向他拋出了橄欖枝。馬可斯不想讓洛娜多想，於是謊稱自己去瑪麗埃塔的聯合變種人組織地拿補給品。但洛娜給新人做訓練後，還未見馬可斯回來，於是打電話到瑪麗埃塔，卻發現馬可斯根本沒有去。洛娜瞬間又氣又怒，她發現馬可斯以前給販毒集團工作時的守護項鍊不見後，便知道他的去向。她找了索尼亞一起，陪自己直接找到卡門那裏，逼守衞講出卡門和馬可斯的去向。但馬可斯已經跟卡門出去了，兩人無功而返。司法部的官員給特勤局開了會議，斥責他們的做法，並打算終止第三方軍事公司特拉斯克公司的合作。突然間，主持會議的官員七孔流血，表情痛苦，似是突然發病。特納觀察了在場的人，其中一名安保人員正看着痛苦不堪的官員，露出得意的笑容。坎貝爾訓練出來的變種人已經滲入到特勤局了，這讓特納又驚喜又擔憂。地下組織中，負責破解檔案的變種人把檔案都破解出來了。她發現了一個奇怪的地方，就是這些間諜變種人組織都不是來自政府，而是來自一個第三方軍事公司，特拉斯克。裏德對這個名字十分熟悉，他的父親在這個公司做了半輩子的工作。

在1952年的英國倫敦，有一對變種人姐弟匿藏在這裏。這對姐弟利用自己的異能力，在世界各地製造了多個大型的恐怖襲擊，正在東躲西藏逃避國際刑警的追捕。裏德看見特拉斯克這個公司名字後，發現自己的命運和變種人從一開始便似乎冥冥中有所關聯。他的父親在這個公司工作了35年，和自己從小聚少離多，關係不好。裏德對妻子和兒女都稱自己的父親已經死了，其實不然，他的父親奧托還活着，開着一個古董店安享晚年。約翰終於找到克拉麗絲，向她表示了歉意，勸她回變種人組織。克拉麗絲這時雖然對約翰還有牴觸，但她想回自己以前待的地方看看。那裏是一對好心的夫婦經營的地方，收養了很多變種人孤兒。然而，克拉麗絲回到舊時住處時，發現這裏一片狼藉，還滿地血跡。約翰通過現場重現的異能，看見這裏被人搜查過，克拉麗絲的養父母也喪了命。經過一番追查，克拉麗絲還是找到了從舊處逃掉的變種人兄弟姐妹。他們被一位好心的牧師收留了，目前藏在永恆恩典教堂。就在地下組織打算去把這些同類人接回基地時，其中一位有讀心術能力女孩指着一個婦女，説她的想法有點奇怪。果然，約翰他們靠近這位女性，對方便激烈反抗。大夥兒費了九牛二虎之力終於把她制服了。回到基地後，這位女性情緒失控，到處亂撞，狀態還十分奇怪，想犯了毒癮。檔案顯示，她叫克洛伊，因為自己的女兒被特勤局的人傷害，在反抗時造成了破壞，於是被帶走了。凱特琳想起她這種犯毒癮的現象，跟變種人被打了“基克”後的反應一樣。“基克”是一種變種人毒品，能讓變種人迅速變強，但會上癮。可想而知，特拉斯克對克洛伊做了多麼可怕的事。裏德向家人坦白了一切後，便提出要親自去找父親談談，看看能不能在他口中問出些有用的情報。約翰則和裏德結伴，陪他走這一趟。再次見到父親，裏德百感交集。裏德把屈藏在心中多年的委屈傾訴出來，並把自己一對變種人兒女的情況告訴了父親奧托。奧托聽到這裏，突然覺得應該讓兒子知道真相，於是把他帶了上樓。原來，裏德的爺爺、姨婆，就是上世紀中時期，臭名昭著的變種人姐弟“芬利斯雙子”——安德利亞·斯特拉克、安得利亞斯·斯特拉克。他們的能力和勞拉還有安迪的能力如出一轍。奧托本身也是變種人，但從父親安德利亞手中逃脱了，自此之後便潛心研究剋制變種人的基因X，希望減少變種人的危害。這時奧托坦言，裏德本來也是變種人，但是奧托希望他能過正常人的生活，於是在他身上植入抑制基因。但那次，裏德生病了，自此之後，奧托便覺得自己沒有臉見兒子，於是斷絕了往來。原來父子間多年的隔閡都是因為誤會，裏德頓時感慨命運是多麼會捉弄人。父子相聚沒過多久，坎貝爾教授便帶着一隊人馬來到奧托的古董店外。此時，能屏蔽變種人能力的“脈衝”按照坎貝爾的命令，施展了能力，隨後坎貝爾便帶着搜查令，要求搜查奧托的房子。裏德和約翰在二樓帶着坐以待斃的心情，等着怎麼去迎戰，突然間，奧托不受“脈衝”的阻礙，施展了自己的能力。古董店瞬間產生了毀滅性的爆炸，坎貝爾也受了傷離去。大夥兒合力制服了克洛伊後，總算能在她垂死之際，讓讀心女孩把特拉斯克對她做的行為讀了出來。特拉斯克公司對變種人做的的各種非人手段，實在讓人毛骨悚然。

二十多年沒有見面，再見竟是永別，父親就在自己的眼前死去，裏德一直久久不能釋懷。他回到基地，把事情告訴了家人。妻子凱特琳聽見裏德説起自己的家族史，還有他的爺爺、姑奶奶的超能力和自己一對兒女的超能力一模一樣後，不禁擔心起來。更讓凱特琳感到困惑的是，為什麼裏德沒有遺傳到超能力。裏德思量了一下，決定把真相告訴凱特琳。裏德本身也是超能力者，只是他父親有意不讓他認為自己擁有超能力。而且奧托為了阻止自己家族中的X基因，他窮盡一生研究X抑制因子，並在裏德身上獲得了成功。凱特琳知道真相後，似是責怪裏德一直不把真相告訴她。凱特琳認為一家人不應該對彼此有所隱瞞，她決定把他們祖爺爺和祖姑奶奶的能力真相告訴安迪和勞拉。在父母的監護下，安迪和勞拉嘗試拉手，重現他們祖先的能力。結果讓安迪和勞拉大為震驚，他們兩人的能力，一個聚合，一個分離，兩人的能力結合，足以造成極端的毀壞。安迪和勞拉既開心又害怕，他們從未感受過如此強大的力量，但又很怕會傷害別人。讀心術女孩埃斯梅被安置在變種人基地，但她似乎另有所圖。她懇求基地的變種人能聯合起來，幫她救走還被困在特拉斯克的其他變種人。起初洛娜和索尼婭都很抗拒這個提議，但埃斯梅似乎操控了洛娜的夢境，讓洛娜看見，假如現在不出手，後果將會是變種人們被軍隊控制，她和馬可斯的孩子將會有危險。最後，變種人組織決定接受埃斯梅的提議，開始部署特拉斯克的變種人營救計劃。勞拉和安迪的能力非同尋常，在同伴們的勸説底下，凱特琳和裏德同意讓一雙兒女參與這次行動。他們看準時機，先是克拉麗絲幫忙製造空間缺口，把安迪、勞拉和索尼婭和自己送進監獄，然後找機會弄壞電力安保設備，約翰、洛娜等人則在特拉斯克外圍準備撤離的工作。然而，特納很快便察覺到他們的闖入，隨即帶着武裝部隊和哨兵機器人去追趕幾位闖入者。克拉麗絲和索尼婭先後被抓住了，安迪和勞拉只好落荒而逃。凱特琳和裏德透過監控錄像看見兒女被一羣攜帶殺傷力武器的人追着，心裏別提多擔心了。姐弟兩被追至窮途末路，這時，兩人還剩最後一個自救方法——重現祖先“芬利斯雙子”的超能力。安迪和勞拉手拉手，開始施展彼此的能力。就在兩人看見了建築分崩離析的景象時，安迪突然鬆開了手。他不希望這棟大廈的人會因為他倆的能力而死亡。特納帶着武裝部隊趕到了，把兩人團團圍住。

凱特琳和裏德親眼看着一對兒女被人活捉，別提多揪心了。勞拉、安迪、索尼婭和克拉麗絲被捉進特勤局的監獄後，變種人們紛紛為裏德和凱特琳出謀劃策，但組織中有些反對的聲音，不想插手這家族的事情。熱心的馬可斯自然是救人行動的主力軍，但洛娜懷着孩子，她不想馬可斯因為救人而把自己搭進去，無論是為了她自己好，還是為了腹中兒好。剛剛被組織救回基地的讀心術女孩埃斯梅，看見特拉斯克的負責人坎貝爾博士似乎想對安迪他們出手，正派人前往特勤局。埃斯梅知道安迪他們去到特拉斯克便會被當成白老鼠般的實驗對象，但凱特琳和裏德在埃斯梅的勸説下，試着去求助特納。特納雖然是特勤局的人，現在也因喪女之痛而對變種人懷有私仇，但在裏德心目中他是目前唯一靠得住，能合作的人。在捉回來的變種人中，特納尤其討厭索妮亞，因為她奪走了自己關於女兒離世前的記憶。就在特納打算尋求方法逼索妮亞把記憶還給自己時，坎貝爾博士的人便來到特勤局，把幾名變種人帶走了。安迪等人來到特拉斯克公司，他和姐姐勞拉便被關在一個奇怪的實驗室，而索妮亞和克拉麗絲則被關在另一個地方。坎貝爾博士知道這對姐弟的能力，對他們十分感興趣，加上他們家族的基因，因此要對他倆進行特殊的實驗，要求他們在封閉的實驗室中重現芬里斯雙子的能力。安迪和克拉麗絲起初想反抗，但道高一尺魔高一丈，坎貝爾博士透過屏幕，在他們面前開槍打死了索妮亞。姐弟倆忍無可忍，終於牽了手。一瞬間，被設計得毫無破綻的實驗室被扭開了一大塊，而外面的辦公室也遭到了損毀。雖然兩人還未能破壞實驗室，但他們的能力足以讓坎貝爾歎為觀止。凱特琳和裏德勸服了特納幫忙，特納派了一隊特勤局的人員，以非法實驗的名義，把安迪他們帶走了。洛娜見狀，也不説什麼，於是讓馬可斯按自己的想法行事。變種人組織主動了一隊人馬，埃斯梅也跟着前去。凱特琳和裏德在組織中和後援人員聊天時，發現了埃斯梅的謊言。大夥兒一直以為凱特琳和裏德去找特納幫忙是自己的想法，沒想到是埃斯梅的提議。與此同時，在特勤局押送犯人的行車路線中進行埋伏，也是埃斯梅的提議。原來埃斯梅並不是真心想幫馬可斯他們，因為她自己有想救的人。她要救的人，是自己的另外兩位姐妹。三人的力量，不僅僅是讀心術，還能控制別人的思維。三人聚在一齊，立即控制了特勤局的特工們，讓他們自相殘殺。在囚車中的變種人們，包括勞拉、安迪，看見眼前景象後都傻了眼。

在埃斯梅的介入之下，變種人們擺脱了特勤局的控制。儘管他們重獲自由，但對埃斯梅三胞胎並無太多感激之情。因為她們造成的傷亡太慘重了，哪怕那些是敵人，但他們很多也只是為了工作，罪不至死。這次的事件，讓裏德好不容易爭取回來特納的信任，再次瓦解了。特勤局方面，在特納的主持下，給命喪埃斯梅隻手的特工們都給予了厚葬。變種人基地的成員也陷入了一片愁雲慘霧，自從世界大規模地屠殺變種人後，他們的成員便一直在減少，每天都在提心吊膽地活着。這次的事件，索尼婭犧牲了，約翰在人前強忍悲痛，自己獨處時，悲傷一發不可收拾，男兒淚流之不盡。克拉麗絲看在眼裏，為他感到難過和惋惜。這次的襲擊，埃斯梅三胞胎早有預謀。她們回到自己的組織，地獄火俱樂部，和接頭人會面。地獄火俱樂部是歷史悠久的一個組織，成員都是一些有社會地位的變種人。作為變種人，地獄火俱樂部一直密謀着與普通人類進行對抗，但他們和地下基地的成員不一樣，他們採取的方式，往往更兇殘，更極端。埃斯梅這次的任務，是拉攏歷史上有名望的變種人家族與俱樂部結盟，比如勞拉和安迪。很多人都猜出了埃斯梅的心思，並知道她們背後有強大的勢力。漸漸地，地下基地變產生了兩個持有不同觀點的派別。一方認為埃斯梅另有所圖，另一方面則強烈要求與埃斯梅合作，保住基地。地下基地人心各異，這次的事件，安迪和勞拉有不可推卸的責任，斯特拉克一家決定暫時離開基地，尋找其他自衞的方法。勞拉把家人帶到費爾伯恩職業學院，她的男朋友韋斯在此處進行接應。勞拉與韋斯分隔多日，剛見面便如膠似漆。裏德看見女兒的臉上出現了久未綻放的笑容，也不再對韋斯有所偏見，認為只要女兒快樂，其他事都可以放在一旁。地獄火俱樂部的高層催促埃斯梅儘快完成拉攏重要盟友的事情，三胞胎別分別找到安迪和洛娜，勸説他們作為代表，加入自己的陣營。洛娜對埃斯梅懷有戒心，但心底裏卻是希望尋找有實力的盟友，對抗特勤局和實驗室的人。埃斯梅為了勸説洛娜，把她一直三緘其口的身世拿出來談。原來洛娜的父親是變種人名門，不僅是地獄火俱樂部的成員，還是一位出色的領軍人物。洛娜自從懷孕後，她的能力變越發地出眾，她體內流着深厚的變種人基因血脈，維護變種人，是她的使命。特納不知從哪裏收到變種人基地的消息，帶上一支擁有高科技和大量被馴化的變種人軍團，一起攻打了變種人基地。大夥兒又得一邊逃跑一邊對抗，流離失所。就在大夥兒被特勤局的人追殺時，安迪他們和馬可斯匯合後，便一起逃跑，突然間，安迪聽見了一個聲音，隨便讓大家跟着他指去的方向逃跑。事已至此，大家被逼進末路，只好信任安迪。果然，埃斯梅早已控制了特勤局的人的思想，在路上挾持了車輛，帶大家撤離。大夥兒再一次欠了埃斯梅的人情，但他們不知道，這一切都是埃斯梅計劃之內的事。

斯梅三姐妹再次介入特勤局和變種人基地之間的衝突，讓基地的同伴們，產生了意見的分歧。有人意識到普通人類世界要把他們趕盡殺絕，他們必須奮起對抗才能生存。另一派的人卻認為過激的反抗只會讓雙方的關係越演越烈，只有通過和平的解決方法，才能讓雙方在地球上和諧共存。洛娜、安迪聽了埃斯梅對地獄火俱樂部的介紹後，雖然對這三姐妹有所顧忌，但這個強大神秘的組織，對他們有着致命的吸引力。最近的幾場衝突，在人類社會一石激起千層浪。在坎貝爾教授的推動下，夏洛特市即將舉行一場名為“人類權益峯會”，實為探討對變種人趕盡殺絕的集會。會議上，眾多政要、富豪都會出席，他們這次不分膚色、不分階層，只為同一個目的，為了自己的種族而去滅絕另一個種族。基地的同伴們收到這個消息後，決定採取行動。他們認為裏德的父親奧托研究了抑制X基因的課題這麼久，一定有一些具有價值的東西。就在斯特拉克一家努力回想家裏發生的事時，坎貝爾教授也跟他們想着一樣的東西。裏德的母親被坎貝爾盯上了，大夥兒發現時，裏德他們立即趕去。在向老母親解釋一番後，總算讓老母親瞭解清楚奧托的所作所為，還有裏德、安迪和勞拉的真正身世。然而特勤局並未仁慈地讓這家人多享受一會兒天倫之樂，很快，他們便追到保險公司門口。自從索尼婭死後，安迪便恨透了特勤局，他覺得索尼婭的死是自己的錯，如果那天他和勞拉施展能力，那麼索尼婭就不用死。特勤局的人追來時，安迪對他們下了狠手，幸得勞拉及時阻止並拉走他，才沒有讓無辜的特勤局職員喪命。另一邊廂，洛娜和埃斯梅還有約翰、克拉麗絲他們結伴，先是利用超能力挾持了一名擁有參會資格但行動不便的富翁，讓他以換保鏢的方法，把洛娜和埃斯梅換走原來的保鏢，讓他們混進會場。這位目標富翁是曾經參與了折磨變種人的實驗，埃斯梅對他恨之入骨，在達成目的後，打算痛下狠手，可是被克拉麗絲阻止了。克拉麗絲看在眼裏，覺得埃斯梅即使幫助變種人組織，但她跟大夥兒不是一路的。裏德一家依依不捨地和老母親分別，離別時，老母親告訴了裏德他們一個重要的消息，就是奧托曾經和一位叫瑪德琳的舊同事經常聯繫，找到她可能會獲取一些有用的資料。洛娜他們混進會議後，在會場裏製造了混亂。特勤局的人毫不留情，約翰在一片混亂中受了傷。變種人的闖入並未讓坎貝爾受挫，反而讓更多的政要富豪看見了變種人的殘暴，讓雙方的關係更加緊張了。

對於安迪來説，索尼婭就如良師益友，但他本來有能力救走索尼婭，卻眼白白地看着這位良師益友就此被打死。安迪心中壓抑着太多的憤怒卻無從發泄，漸漸地，他的心理產生了變化。之前的幾次事件，勞拉和安迪也起了不少衝突，突然間，勞拉覺得弟弟越來越陌生，甚至有點可怕。特納這時調用了新的“獵犬”，兩名擅長跟蹤的變種人。特勤局局長這時也因為人類權益峯會遇襲一事，給特納施壓。幸好，兩位“獵犬”並未讓特納失望，不一會兒，便通過情景再現和線索跟蹤，找到了變種人基地目前的位置。經歷了許多事件後，洛娜幾乎總是在九死一生的邊緣上行走。自從懷孕後，她覺得自己的能力越來越強，加上埃斯梅老是在她身邊吹耳邊風，提起她的父親，她的能力，還有人類以前對她的折磨。她愛着馬可斯，愛着他們的孩子，也正因為如此，她意識到，只有反抗，才能讓自己的孩子生存下去。坎貝爾教授和華盛頓議員遇襲後，便轉移地點，繼續協商着擴展對抗變種人的項目計劃。殊不知，他們的性命早已危在旦夕。馬可斯和約翰發現洛娜不見了，他們質問了埃斯梅幾句後，便瞬間明白了。洛娜和埃斯梅的另外兩個姐妹已經在趕往機場的路上了。特納帶着特勤局和“獵犬”對變種人基地發起了猛烈的進攻。大夥兒立即雞飛狗走地東躲西藏，裏德和凱特琳身為普通人類，卻沒有貪生怕死，而是積極地疏散大夥兒，還出謀劃策，為大家尋找新的出口。變種人們能力各異，但只要他們通力合作，便很容易就創造出新的出口。然而特勤局和“獵犬”也不是省油的燈，他們的速度慢慢趕上了基地的變種人，眼看就快要追上了。安迪和勞拉看着身後的追兵，他們作出了一個決定。裏德、凱特琳和其他變種人儘快遠離基地建築物，安迪和勞拉在特勤局始料未及之時，牽着手，家族天賦幫他們毀滅了一整座建築物。被毀滅的除了建築物，還有“獵犬”們，和特勤局的精英。馬可斯他們好不容易追上洛娜，可是洛娜心意已決，她使盡全力，載着議員和坎貝爾的飛機在他們頭頂炸開了。特納失去了眾多手足，但換來的卻是局長的一陣謾罵，説他沒有盡職盡責。這麼多特勤局職員的性命，抵不過權貴們的名譽和權術遊戲。特納恨着變種人，可是他累了。把證件在桌面上一擱，他就此離開自己一直堅守的崗位。洛娜回到了變種人基地，可是她沒打算留下。她回來是為了召集和自己有共同想法的變種人，勞拉、克拉麗絲看着洛娜，都感到不可思議。可是在組織中，有不少人走向了洛娜，決定追尋那種以暴制暴的生存方式。安迪在是其中之一，他以自己的能力，對家人説不。變種人和普通人類之間新一輪的戰役，就此開啓。（第一季本季終）

亞特蘭大事件後，核心圈便對變種人們的牴觸更加強烈。以往談好的和平共存，無論在底層變種人、軍隊之間，還是高層會議中，也不復存在。現在地獄火俱樂部的負責人瑞瓦，在之前的亞特蘭大事件發生後，在會議中與核心圈的成員們決裂。她堅持招募北極星洛娜、安迪等人，卻遭到高層們的拒絕。瑞瓦做出了一個破釜沉舟的決定，她把有份決議的成員們，都殺死在會議室中，開創一個屬於自己的時代。轉眼間，六個月過去了，洛娜也臨盆在即。變種人基地的成員們不斷轉移自己的根據地，一邊躲避軍方的追捕，一邊尋找自己的其他同伴。在一次營救行動中，馬可斯、約翰和裏德等人裏應外合，救了一批被追殺的青少年。一位被帶回基地的女孩克里斯蒂娜被凱特琳救治後，便一直想找回自己失散的妹妹賈絲敏，哪怕是變種人組織們安排轉移他們，她也堅持不跟着大部隊轉移，堅持留守在這個臨時根據地，等找到妹妹再説。洛娜每次胎動，都會引起附近金屬物的反應。儘管她和安迪歸順了瑞瓦後，瑞瓦為她提供了很好的環境和措施，避免所有金屬物在附近，但卻依舊難以評估洛娜臨盆時，會產生任何巨大的反應。裏德在自己獨立的一個房間中，用科技儀器對大夥兒進行調度，偶爾會發現自己身體出現些什麼問題。從小到大，他都以一個普通人的身份生活着，直到最近，他察覺到自己體內有着來自血脈的巨大能量。或許，裏德不去面對，屬於斯特拉克家族的宿命。凱特琳這段時間，都一直在機會，試圖能聯繫安迪。她認為自己，失去了安迪，但勞拉卻看清了事實。他們不是失去了安迪，是安迪選擇了離開他們。在安迪跟着洛娜轉身離開大夥兒的時候，凱特琳就該看清事實了。勞拉做了一個夢，她在夢中和安迪相聚，但未享受到片刻姐弟聚舊的愉悦，安迪便拉着她的手，想要施展毀天滅地的能力。勞拉知道，安迪已經變了，她找到凱特琳，想勸她清醒一點。馬可斯擔心着洛娜，和她肚子裏孩子的安危，他和同伴們一直在進行能量監察，一方面希望找出洛娜的下落，另一方面希望追蹤瑞瓦等人的所在地。時機到了，洛娜開始出現臨盆反應，周圍的金屬物、電能都出現了巨大波動。洛娜產生的反應，影響了方圓數公里的電力，還有金屬物。馬可斯知道，這是洛娜造成的，估算了時間，洛娜現在要生了。約翰他們立即施展能力，試圖通過追蹤電能找出源頭，從而找到洛娜。電力波及的面積太廣泛，要找起來十分費勁，洛娜這邊，似乎受到了心理壓力，差點要難產。瑞瓦不能失去北極星這個武器，她讓三胞胎幫忙控制洛娜的心智，讓她看見孩子出生後的美好畫面。在三胞胎的幫助下，洛娜誕下了一名健康女嬰。電網陷入了癱瘓，馬可斯無法再追蹤洛娜的所在地了。孩子出生的瞬間，作為父親的他，就此錯過。

三年前，約翰被人發現了變種人身份後，便失去了海軍陸戰隊的軍人身份，只能靠着在黑市打拳為生。拳賽一場接一場，約翰在賽事的間隙歇息時，一位優雅的女士找上了他。這是一位律師，也是一位變種人，叫伊凡潔琳。自此之後，約翰便受到伊凡潔琳的幫助，加入了變種人地下組織。瑞瓦侵佔了一處軍事建築，給洛娜用於生孩子。洛娜生產過後，福斯特三姐妹給了負責人一筆錢，當作掩口費。但瑞瓦並不是這個意思，一向心狠手辣的她，要求福斯特三姐妹“處理乾淨”。三姐妹中，在變種人地下組織待過一段時間的埃斯梅，漸漸地對瑞瓦的殘忍指令都留了手，她的不妥引起了另外兩名姐妹的懷疑。約翰和馬可斯再次斷掉了核心圈的線索，經過一番查探，他們發現核心圈正在進行很多筆大額資金的轉移。為了接近核心圈，約翰想起了一位可靠的舊友——伊凡潔琳。伊凡潔琳對於約翰來説，不僅有知遇之恩，還有複雜的情感。在約翰深受藥物困擾時，是她幫助約翰度過難關。他帶着馬可斯等人拜訪了伊凡潔琳，讓她感到既驚又怕。今時不同往日，如今變種人的地位比以往更難立足了，伊凡潔琳好不容易沒被軍隊的人盯上，面對約翰的求助，她顯得有點猶豫。安迪最近做夢，在夢裏能遇見勞拉，並看見自己主動拉着勞拉的手，希望她加入自己。但勞拉的樣子，好像十分懼怕自己，甚至為了掙脱自己的手，不惜跳樓。安迪從夢中醒來，心思絮亂。第二天訓練時，他的狀態十分不佳，這讓瑞瓦十分在意。安迪隨意編了個理由搪塞過去，但瑞瓦豈是等閒之輩，她安排了一名會隱身的部下“隱藏”跟蹤安迪，看他葫蘆裏賣什麼藥。果然，安迪想念勞拉和家人了，他打電話到凱特琳的診所，想跟勞拉聊聊，但接電話的是父親裏德。安迪在電話另一頭不敢作聲，最後毅然把電話掛掉後，毀掉了手機。但此舉動被“隱藏”看了在眼裏，安迪的舉動立即被上報至瑞瓦那裏。瑞瓦再次看見安迪訓練失利，認為他心裏對自己的忠誠度不夠純粹，立即對他動起了殺心。瑞瓦以一臉知心姐姐的姿態，來到安迪房間，想跟他聊聊，看他是否對自己坦白。安迪知道自己最近的表現讓瑞瓦十分不滿意，但他萬萬沒想到，自己只是想家了，會引來瑞瓦的殺心。在瑞瓦轉身，準備對安迪施展異能時，安迪不知怎地，想袒露自己想念家人的事，於是便把他打電話給勞拉的舉動，告訴了瑞瓦。瑞瓦聽後，念在安迪還是肯對自己坦白，於是收了手，恢復了知心姐姐的模樣。伊凡潔琳自己不便出手幫助約翰，但她向約翰提供一個名字——爾格。這是一個住在華府地下隧道的獨立變種人，他手上有很多隱秘的情報，希望能幫到約翰。

馬可斯回想起自己父親臨終前的事，讓他覺得既抱憾又悲哀。他的父親患了癌症，臨終前，都不願接受馬可斯的資助，因為他不願用馬可斯幫黑幫販毒賺回來的髒錢。但馬可斯卻為自己的生涯感到自豪，因為他今時今日，都是因為父親對他的拋棄所做成的。他的父親嘴裏把上帝、仁愛放在嘴邊，但心底裏卻嫌棄着自己的變種人兒子。洛娜的孩子“晨曦”患了黃疸，這讓瑞瓦等人十分焦急。黃疸在新生兒中很普遍，也很容易治療，但洛娜的孩子卻不同，因為她是變種人，必須以非常的手法去治療，這或許得藉助孩子的父親——馬可斯的能力。在醫生的建議下，瑞瓦積極配合洛娜，派福斯特三姐妹去聯繫馬可斯，讓他過來核心圈的基地一趟。如此同時，約翰在伊凡潔琳的指引下，和克拉麗絲來到下水道，希望聯繫“爾格”。克拉麗絲一直對此事存有疑惑，她想不通為什麼約翰會對伊凡潔琳的線索毫不懷疑，在下水道中轉悠了一陣子，克拉麗絲便顯得有點不耐煩，勸約翰離開。但約翰卻十分投入，他還察覺到，下水道中有人用異能打了一些牆，故意讓他們繞圈。爾格就在這下水道中的事實八九不離十了，接下來就看怎麼能打破這異能造成的迷宮，讓他們找到爾格。克拉麗絲轉着轉着，實在拿約翰沒辦法，她只好施展自己的異能，打破空間的限制，連通了爾格可能會在的空間。果然，他們通向了正確的地方，但也被爾格的手下們團團圍住。兩人表明來意後，卻未能獲得爾格的認同。約翰不想作無謂的鬥爭，只好先按照爾格的意思靜觀其變。克拉麗絲跟爾格提出了一些請求後，卻獲得了爾格的認可，被他帶走了。約翰感到既無奈又無力，原本要尋求爾格幫助的人是他，現在反倒他成了局外人。克拉麗絲在爾格的帶領下，來到一個讓人歎為觀止的地下世界。這裏生活着不被社會接受，不被人類世界所接受的變種人。他們不相信什麼和平共處的信條，如果有一天，這些紛爭可以停止，那必定是雙方之間必有一敗。克拉麗絲遭到爾格認可，是因為她那穿越空間的能力，爾格似乎有意拉克拉麗絲入夥，希望她能運用自己的能力，和自己的地下變種人弟兄們並肩作戰。克拉麗絲回到約翰身邊，簡單地告訴約翰，説自己和爾格談攏了。剛才看見的地下世界，克拉麗絲卻閉口不談。馬可斯被帶到了洛娜那兒，夫妻再見，竟是相見無言。洛娜剋制着自己內心的衝動，讓馬可斯幫晨曦治好黃疸。馬可斯激動地想要抱住洛娜，卻無奈地被瑞瓦、福斯特三姐妹、甚至洛娜勸止了。福斯特三姐妹知道馬可斯想什麼，她們試圖着一直控制馬可斯的思想，讓他不要亂來，沒想到馬可斯的意識和能力不是那麼容易控制，他對洛娜的執念超乎瑞瓦她們的想象。在福斯特對他的意識侵入時，馬可斯突然想反觀一樣，得知了福斯特三姐妹的秘密。為何洛娜會如此死心塌地跟在瑞瓦身邊，答案昭然若見。福斯特三姐妹對洛娜的意識做了手腳，控制了她的心。

馬可斯去過核心圈後，發覺洛娜和安迪已經對瑞瓦歸心了，而且瑞瓦最近的資金、技術動向，讓地下組織的大夥兒很在意。他們不想坐以待斃，決定先發制人，先想辦法找個突破口，阻止瑞瓦一行人的活動。他們得知安迪等人正在吸納資金、招攬變種人加入他們的組織，於是得想辦法找到他們的定位。馬可斯、約翰和克拉麗絲先結伴出發，去找黑客變種人“連線”幫忙。就在出發時，裏德突然叫住了約翰，把自己最近異能顯現的事告訴了他，希望他給點建議。裏德希望通過藥物或情緒，控制住自己的異能，但約翰卻覺得這不可能。想要抑制異能的最佳方法，就是學會怎麼控制它。馬可斯等人來到“連線”的工作室，卻遭到一陣槍火的“歡迎”禮。原來“連線”因為幫助馬可斯他們，被瑞瓦滅口了，現在工作室只剩下他的弟弟圖表。圖表一看見這羣間接害死自己哥哥的人，便用槍火來招呼他們。但他們要突破瑞瓦的行動，黑客技術是必要的，他們只好與圖表打起來，隨後把他制服，帶回地下組織。圖表醒來後，不願幫助他們，凱特琳一心想要回自己的兒子，於是想了個極其不道德的方法，就是用緊急戒斷毒癮的藥物，注射到圖表體內，讓他瞬間感受戒毒的痛苦，逼他幫黑入安迪所在位置的攝像頭。圖表苦不堪言，只好乖乖就範，調取了攝像頭的位置，發現瑞瓦她們正在一個監禁變種人的中心。洛娜以前也在那裏被關押過一段時間。馬可斯、克拉麗絲、約翰立即來到安迪、洛娜所在的研究中心，勞倫也加入。勞倫不希望弟弟和同伴們兵戎相見，她也知道，只有自己才能勸説得了弟弟。約翰和克拉麗絲先轉移進入中心裏面，馬可斯和勞倫則在外圍接應。兩人進入後，看見到處一片狼藉，很多變種人都受到非人的對待。他們一邊慨嘆着，一邊通過凱特琳在指揮中心看着圖標調取出來的監控，追蹤着洛娜他們的蹤跡。突然，圖表發現自己的黑客代碼被擋住了，瑞瓦那邊應該發現了端倪，有人抵抗了圖表的入侵。與此同時，約翰和克拉麗絲也遇到了洛娜。他們大聲叫喚着洛娜，洛娜卻以冷若冰霜的臉龐，施展了異能後，便轉頭離開。洛娜的異能，解開了約翰他們面前的一片門鎖，一羣被囚禁的變種人瞬間釋放。被囚禁多日的變種人就如猛獸般，自相殘殺，隨意施展異能。約翰他們的去路被擋住了，此時還有不少性格和善的變種人在混亂中受了傷，約翰他們不能坐視不理，只好選擇先救人。他們把洛娜和安迪帶走了一名變種人的事告訴了在外接應的勞倫和馬可斯，讓他們儘快出手阻止。而另一邊廂，圖表打算放棄時，凱特琳繼續故技重施，對着忍受戒癮折磨的圖標，亮出一瓶興奮藥品，以此作條件讓他再好好想辦法。癮君子圖表受不住這樣的誘惑，施展了渾身解數，再次調取了監控錄像。凱特琳在攝像頭中，看見了安迪，她高興壞了，兒子安然無恙，但裏德在一旁看着凱特琳瘋狂的行為，感到十分不妥，而且安迪他笑着幹這些事，他是樂意的，是自願的。

12年前，傑西剛加入哨兵特勤處，和一個前輩在巡邏。當時的他，一副畢恭畢敬的樣子，跟着前輩在街上尋找目標。前輩遠遠地看見了一個模樣有點怪的男孩，便二話不説斷定了他就是變種人。最終，這個男孩什麼事都沒做，就被帶走了。傑西回想起自己的工作、生活，彷彿處處都被變種人影響着。自己的女兒被殃及犧牲了，哪怕這並不是變種人一方的錯，而是人類和變種人之間互相不理解，互相矛盾造成的混亂，傑西也把錯怪到變種人的頭上。勞拉被安迪打傷後，被帶回凱特琳所在的診所。凱特琳看見女兒這副模樣，不由地自責起來。她總是考慮着安迪，但安迪並不需要她的擔心，反而是勞拉，勞拉差點命喪於弟弟的手裏。安迪打傷勞拉後，心裏也很不好受。此時，在瑞瓦的基地中，剛剛他們費了九牛二虎之力從精神病院帶回來的女孩正躺在房間裏瑟瑟發抖。這個女孩一直不願開口，顯得十分自閉。洛娜也有着同樣的經歷，她認為這個女孩麗貝卡已經廢了，提議着大夥兒不用浪費時間。但安迪看着她的背影，覺得她十分可憐，一定有着悲慘的經歷，而且安迪對她的能力也產生了好奇，於是提出讓他試一試。安迪和麗貝卡年齡相仿，很快便搭上了話。沒過一會兒，麗貝卡便信任了安迪，跟他玩了起來。麗貝卡走到基地的落地玻璃窗旁邊，看着一望無際的天空看出了神。安迪想到麗貝卡被關了這麼久，對外面一定十分嚮往，於是便帶她出去玩了一天。兩人在外頭吃喝玩樂，還對警察做了惡作劇。安迪沒想到，一開始給他們自閉印象的麗貝卡，原來是這麼野的女孩。麗貝卡不抗拒安迪他們組織的行動，甚至還頗有興趣，和安迪出去玩了一圈回來後，像變了個人似的，成了活躍份子，立即便投入到訓練中。另一邊廂，約翰從精神病院救了一些被關押的變種人回地下組織的基地中。但人多的話，很容易引起注意，克拉麗絲便提出，試試讓爾格幫忙收留這些變種人。他們來到莫洛克隧道，找爾格商量。爾格給他們出了些難題後，還是同意收留他們，但提出了一個條件，就是要在臉上烙下烙印，向世人宣示他們變種人的身份。從精神病院逃出的變種人同意了，因為他們無家可歸，只好寄人籬下。

洛娜正在和女兒享受天倫之樂，卻被一陣敲門聲打擾。安迪找洛娜，一起去訓練，説埃斯梅三姐妹在催了。洛娜對此十分不爽，她發現最近的訓練十分頻繁，讓她都沒有辦法和女兒好好待上一陣子。在安迪的勸説下，洛娜還是妥協了，和他一起去了訓練場。然而，洛娜的怒火都在訓練中發泄着，隨後她質問埃斯梅姐妹，最近訓練為何這麼頻繁，瑞瓦最近為何不見蹤影，到底她們在盤算着什麼。埃斯梅知道，洛娜不是一般人，要讓她合作，就必須讓她打從心底裏認同核心圈的理念，讓她身同感受。埃斯梅是姐妹中最感性的一位，她來到洛娜的房間門口，想找她聊一聊，希望用言語説服她。但此時，洛娜正在安撫着哭泣的女兒晨曦，埃斯梅為了晨曦儘快停止哭泣，她可以和洛娜談話，於是對晨曦施展了異能，讓她立即睡着了。經過一番談話後，埃斯梅決定把她們的計劃告訴洛娜，於是邀請洛娜和自己外出一趟。她們來到一處銀行外，埃斯梅説，這銀行就是她們的目標。但這不是為錢，是為了這個銀行的檢測器，和摧毀這家銀行資助的那些殘害變種人的項目，還有屬於埃斯梅的個人因素。埃斯梅三姐妹小時候被關在一所由這家銀行主導的實驗室，一方面受盡折磨，另一方面被迫為他們工作，利用異能傷害別的變種人。洛娜聽了埃斯梅的一番肺腑之言，也暫時放下了對核心圈的戒備，繼續以建立變種人為主的世界作為目標。與此同時，裏德受着自己異能覺醒的困擾，他的異能被抑制了多年，現在人到中年才出現，自然是有點難以控制。他求助約翰幫他進行訓練，但卻收效甚微。此時，肅清者的活動越來越離譜，約翰他們不得不聯合起其他地下變種人組織，一起對抗肅清者的瘋狂行徑。他們找到巴爾的摩地下組織，和他們聯手，一起打這場硬仗。一位變種人看見裏德的情況，便出言給他引導。他讓裏德不要牴觸自己的異能，要接受它，才能控制它。肅清者很快便趕到，雙方隨即陷入了一番惡戰。激戰中，肅清者和變種人雙方都各有死傷，約翰不希望造成重大傷亡，於是打算撤退。但他們前無去路，後有追兵，只好拜託裏德施展異能，打破牆面為他們開路。裏德沒讓大夥兒失望，總算是踏出了成功的第一步。洛娜和埃斯梅回到基地，埃斯梅心情極好地哼着歌謠。洛娜突然臉色一沉，問埃斯梅怎麼在哼這首歌，這首歌只有她在和晨曦獨處的時候才會唱。洛娜立即發現，埃斯梅入侵了她女兒的意識，隨即暴怒起來，甚至想置埃斯梅於死地。幸好瑞瓦及時出手制止，洛娜才鬆開埃斯梅。但埃斯梅下午的努力算是白費了，洛娜現在對她們充滿戒心。就在瑞瓦責備埃斯梅的時候，埃斯梅堅持着，要再對洛娜動之以情曉之以理。她厚着臉皮找洛娜，向她道歉，隨後對她敞開心扉，把自己和姐妹們的悲慘經歷對洛娜全盤托出。洛娜也經歷過被人關起來折磨的歲月，埃斯梅的話似乎讓她有了共鳴。

曾經，瑞瓦也是一位希望和人類和平共處的變種人，直到她失去了好友兼摯愛本妮。當年，本妮作為反對人類的變種人，經常在集會時説出一些激進的言語，時不時和瑞瓦引起爭執。一天，兩人在路上爭執時，巧遇一些普通人的激進份子。在面對他們的惡言相向，甚至動粗時，瑞瓦依舊想制止本妮對他們施展異能。沒想到，瑞瓦想要留手，這些激進的普通人卻沒這個打算。最終，本妮在瑞瓦面前被槍殺，從此，也改變了瑞瓦對這個世界的態度。裏德的異能開始失控，家人和朋友們都想幫他，但無奈，他的異能太強大，只要觸屏到的任何東西，都會瞬間粉碎。妻子凱特琳作為普通人類，也只看在一旁看着乾焦急，女兒勞拉在父親身邊用異能築起氣牆，算是暫時阻隔了父親毀壞周圍的東西。為了幫助裏德，克拉麗絲提出，可以讓他暫時住進爾格的地下組織，那裏沒有被發現，活動起來也更方便。但約翰和其他人卻對此產生了異議。約翰和馬克覺得克拉麗絲有點不對勁，儘管爾格和他們都是地下組織，但觀念並不一樣，為什麼克拉麗絲會如此相信爾格?這讓約翰感到費解，且不安。瑞瓦為了搶走銀行的錢，部署了很長的時間，包括出賣感情。她施展自己的勾搭功夫，搭上了目標銀行的高層奎因。奎因一直和瑞瓦約會，付出着真感情，卻沒料到這一切都是一個局。搶劫銀行的前一天，瑞瓦實現了她的臨門一腳，把奎因綁架，用他的孩子作為威脅，讓他配合自己。當奎因問瑞瓦，他們的感情是不是真的時，瑞瓦動起了惻隱之心。但瑞瓦很快便恢復到自己的冷血性格，她有更重要的事情要做，不能被這些無關重要的兒女私情阻礙。搶劫銀行的大日子到來，埃斯梅在大本營中守着，洛娜把女兒晨曦託付給她照顧。奎因在被威脅之下，為他們打開了重要的防線，關閉了異能檢測系統。訓練有素的洛娜、安迪和麗貝卡順利闖入了銀行，在福斯特姐妹的幫助下，一路過關斬將，長驅直達銀行的保險庫。洛娜他們制服了銀行職員後，還逼他們説出“認罪”的話語，承認為了殘害變種人，提供了不少資金。瑞瓦看見錢到手、認罪視頻也錄了，便打算帶隊離開。但這期間，麗貝卡的舉動一直十分不妥。瑞瓦隊伍的人，基本都是求財和罪證，並不打算拿人命，但麗貝卡一直想殺人，她認為這些人都是該死的，在離開時，她直接用行動，表達了她的想法。瑞瓦沒想要見血的，但在麗貝卡的任性下，銀行職員全被殺害。

異能失控的裏德，在妻女的陪同下，找到他父親奧托舊時的搭檔——瑪德琳·加貝爾教授求助。瑪德琳一眼便認出了裏德，她立即把被困於前台的裏德帶回自己辦公室，瞭解完詳情後，便開始斟酌對策。凱特琳在瑪德琳的實驗室中四處觀望，看見瑪德琳一直致力於幫助超能力者控制自己的異能，讓異能往好的方向發展，並未這些超能力者提供就業的機會，讓他們對社會作出貢獻。如此一來，連日來的精神緊張也稍微讓這一家子放鬆不少，至少讓他們覺得，總算有一處值得投靠的地方了。另一邊廂，麗貝卡屠殺了銀行職員後，洛娜開車帶着她和安迪離開現場。突然間，洛娜停下了車子，她言簡意賅地告訴麗貝卡，説她不屬於“這裏”。洛娜説的“這裏”，指的是核心圈，也是指他們這撥為了創造新世界的超能力者。麗貝卡不是為了創造新事業而施展異能，而是為了殘忍地復仇，發泄。麗貝卡僅僅猶豫了一會兒，便和安迪匆匆道別，下了車。安迪還沒反應過來，洛娜便告訴安迪，麗貝卡自己作出了選擇，隨後便頭也不回，帶着安迪回到瑞瓦的基地覆命。戰鬥越來越多，洛娜看着自己的女兒，不僅擔憂着她會不會被各種各樣的危險殃及到。此時，埃斯梅也提出，為了晨曦好，最好還是將她轉移，不要讓她捲入這些紛爭中。在洛娜掙扎着，要送走晨曦的時候，她突然頓悟了一些事。那是12年前，她還是一名少女。母親離世，父親多年來一直不在她面前露面，洛娜自暴自棄，隨意玩弄着自己那操控金屬的異能。丹恩姑媽成為了她唯一的家人，姑媽看着洛娜如此這般暴躁，既心痛又無奈。但丹恩無法解答洛娜的疑問，到底她的父親是誰，為什麼不來見她，只在她13歲生日的時候，留下一個深紅色的圓鐵塊。洛娜長大成人後，和馬可相愛，剛懷上了晨曦。她把玩着這來自父親那陳舊的“生日禮物”，向馬可吐槽父親對自己的不聞不問，還跟馬可發誓，他們不要成為這樣的父母。今天，洛娜突然明白了父親的用心良苦。父親的離開不是不愛，而是因為要保護她。埃斯梅提議，讓洛娜把晨曦送到瑞士一個基地，洛娜沒好氣地迴應着埃斯梅，答案自然是拒絕的。她連夜來到馬可家中，向他説了自己的想法。大人世界的紛爭，不能殃及他們的女兒，她要送走晨曦，把她送到一個自認為最安全最正常的地方。馬可敢怒不敢言，和洛娜爭吵過後，還是忍了下來，同意了洛娜的提議。洛娜把晨曦帶到丹恩姑媽那兒，懇求她幫自己照顧女兒晨曦，並把自己當初對父母的誤會向丹恩姑媽訴説一番。洛娜心無旁騖地回到瑞瓦的基地，她拿出父親留給她的禮物，施展自己的磁場。圓鐵塊突然變成了一個鐵頭箍。這個鐵頭箍，與多年前與X戰隊大戰、地獄火俱樂部的創始人萬磁王的頭箍如出一轍。

麗貝卡原以為能離開瑞瓦所在核心圈，走不一樣的道路，可惜瑞瓦的爪牙和遍佈各處，情報甚廣，麗貝卡沒逃夠一天，便被抓了回去。瑞瓦把她關在特製的一個黑色密室中，但麗貝卡在裏頭伸手不見五指，不知道自己身在何處，只得不段奔跑叫喊，異能也無法施展開來。安迪在外頭看着，心裏甚是心痛，可惜瑞瓦冷冰冰地拒絕了安迪的求情，其他人也別無他法。傷心的安迪找到洛娜，希望和她好好聊聊。此前，安迪得知洛娜的女兒被送走了，他問洛娜，到底現在所做的一切值不值得。洛娜對自己的目標十分明確，她認為只要能創造新世界，新秩序，現在的犧牲都是值得的。然而安迪心裏不是這麼想的，隨着最近的幾次行動，且和麗貝卡互生情愫，加上與勞拉經常在夢景中交流，安迪漸漸對瑞瓦和核心圈產生了牴觸的情緒。特納在抵制變種人的極端組織中混得風生水起，不一會兒便成為了抵抗組織中的名人，還上了電視。此前，他和變種人多次交鋒，讓各大地下組織和核心圈都對他嗤之以鼻。埃斯梅和姐妹一邊看着電視，一邊討論着這個惹人煩厭的男人。另一邊廂，馬可、約翰和克拉麗絲知道無論是清除者還是核心圈的行動都越來越活躍了，他們這邊也不能怠慢。幾位結伴，劫持了一名生產殘害變種人設備的系統分析師。在劫持的過程中，並不順利，他們的行動暴露在清除者的眼皮底下，儘管喬了裝，但危險依舊步步逼近。他們把系統分析師綁走盤問，問出他的研發項目到底是什麼。答案比他們預料中的更為震驚。這個男人研發的東西正是讓不少變種人苦不堪言的異能抑制頸圈。這個頸圈的普及性比他們預期中還要廣，每一個變種人監獄都已經安排上了。裏德一家在馬德琳的研究院中休養生息。然而他們漸漸發現馬德琳的研究有點不妥。儘管馬德琳不像其他組織那般，要抹殺變種人，但她的研究，對於抑制X基因可謂十分極端。這不僅僅是抑制，還是永久消除，不管超能力者同不同意，只要拿到了適合的DNA和血清，便能把一個異能者變成普通人。裏德一家都不願這樣，因為他們還需要能力去幫助自己的同伴。安迪和瑞瓦商談無果，洛娜也表示安迪應該接受現實，這對於安迪來説，把他的牴觸情緒激至最高點。入夜後，安迪換好了裝備，來到緊閉麗貝卡的密室面前，利用異能扯裂了這讓麗貝卡苦不堪言的大球，這也讓安迪當了一回拯救公主的騎士。

約翰在抵抗肅清者的突襲中，為了掩護馬可他們，獨自留下來殿後，從而成為了特納和一眾肅清者們的俘虜。數年前，那會兒洛娜和馬可剛在一起，約翰和兩人也因為志同道合而走到一塊兒，一起共商建立地下基地的大計。那會兒，他們就彼此約定好，大家要同甘共苦，一方有難，定必出手支援。馬可十分擔心約翰的安危，他知道肅清者都是極端份子，在迫不得已之下，他只好暗中找到洛娜，把這事告訴她，讓她配合自己，一起救出約翰。馬可找到洛娜，一方面是因為洛娜所在的核心圈組織，也是與肅清者為敵，可以藉助瑞瓦的力量，出手打擊肅清者；另一方面，馬可也是懷有一點私心，希望籍此機會，勸洛娜回頭是岸，和自己再續前緣。只是事與願違，洛娜開門見山地告訴馬可，瑞瓦不會出手幫忙，自己也不願碰這趟渾水。但在馬可的勸説下，洛娜也想起當初三人的種種美好回憶，眼看着約翰落入壞人之手，洛娜實在不願袖手旁觀，於是答應和馬可暫時放下彼此間的恩怨情仇，一起救出約翰。另一邊廂，安迪和勞倫也在夢中見面，但每次兩姐弟的談話，都以互相揶揄和吵架結束。安迪加入了洛娜，瞞着瑞瓦一起接觸了馬可他們。當洛娜帶着安迪出現在馬可、裏德和凱特琳他們面前時，安迪和父母都激動相擁，唯獨勞倫感到有點不妥。她很久沒有在現實中見到安迪了，這種感覺讓她很不安。很多次，勞倫想勸安迪回到家人身邊時，安迪都露出不屑的表情，甚至想拉攏勞倫入夥，勞倫對安迪的所作所為感到擔心，又感到恐懼。大夥兒暫時冰釋前嫌，一起驅車前往肅清者的基地，救出約翰。此時，約翰正在基地中，脖子上套了能力抑制圈，被特納施以極刑，要他説出地下基地的相關信息。但約翰是個真正的硬漢子，無論怎樣的痛楚他都忍了下來，一絲出賣同伴的念頭都沒有。馬可等人很快便趕到，普通人類的火力和異能者之間的強大能力相比，實在是不足為懼。很快，他們便闖入了約翰被囚禁的房間，把約翰救走了。這會兒，大夥兒理應速戰速決，救了人就儘快撤退，然而，安迪看見這些意圖對自己家人、姐姐圖謀不軌的肅清者們時，卻燃起了怒火，打算對這些普通人類趕盡殺絕。在安迪那滿懷恨意的目光中，勞倫看見了難以控制的邪惡和未知的將來。

瑞瓦從變種人監獄中，放走了一大批的變種人，其中，不乏一些暴力殘忍的恐怖分子。裏德和馬可等人擔心這些壞心眼的變種人被流放出來後，會帶來十分嚴重的後果，果然，他們的擔心被應驗了。瑞瓦在變種人恐怖分子中，挑選了一些合適的新人，拉攏進核心圈組織。不知道後果嚴重性的安迪，認為他們的隊伍越來越強大後，便興奮地叫洛娜去訓練場看一看這些新“同伴”。然而，洛娜一看這些人，卻高興不起來。瑞瓦挑選了兩男一女，他們三人之前襲擊了一艘遊輪，害死了三百多名無辜的市民。洛娜加入核心圈是為了營造一個新世界，而不是濫殺無辜。她感覺越來越看不透瑞瓦了，瑞瓦的行為越來越離經叛道，與她一開始説好的有悖，洛娜不得不找到馬可求助，希望他伸出援手，阻止瑞瓦。勞倫自從獲得了芬利斯雙子遺留下來的音樂盒後，性情逐漸轉變。她變得沉默寡言，且一天到晚沉迷訓練。裏德擔心是安迪與她夢中相見時，影響了她，但凱特琳卻認為這是好事。因為要對抗核心圈，勞倫必須成長起來。裏德雖然也贊同妻子的看法，但對女兒這種性格轉變，卻依舊擔心着。芬利斯雙子的音樂盒，隱藏着強大而有邪惡的力量。勞倫雖然未能察覺，到底這個音樂盒有什麼可怕的能量，但在不知不覺中，已經被音樂盒影響了心智。以前她睡覺時，最多就是因為和安迪對抗而手舞足蹈，但這會兒睡夢中的打鬥，她開始夢見了芬利斯雙子，並施展了他們的異能。勞倫的異能，直接反映到現實中。勞倫不知不覺間，把房間的枱燈、櫃子都毀了。鄰居投訴裏德他們家裏半夜擾人清夢，房東察覺到異常，於是找到裏德，想探知他們家裏到底有沒有變種人。裏德找理由搪塞過去，但對方卻未能安心。沒過幾天，突然一羣特警闖入裏德家中，不用猜也知道，鄰居報警來捉他們了。裏德讓妻女躲在房間裏，自己去應付這些人，沒想到剛開門，特警便二話不説拿槍指着他，房間的動靜被特警聽見了，凱特琳眼看瞞不住了，於是想了一個計策，就是讓勞倫往另一個地方製造混亂，用聲東擊西的方希，引開這些特警。勞倫按照按照母親的提議，成功引走了這些特警。裏德見沒發生什麼大事，於是希望繼續能保持現在這樣低調的生活。然而，勞倫卻覺得，這樣的生活太忍辱負重了，明明她有能力把對他們一家不友善的人一舉殲滅，卻被迫苟且偷生。勞倫一邊心心不忿，一邊把玩着芬利斯雙子的音樂盒，無意中開了一個暗格。暗格中，藏着一封信，和兩束糾纏在一起的頭髮。信是芬利斯雙子的哥哥寫下的，在失去胞姐後，悲痛的弟弟摘下自己的頭髮，和姐姐的頭髮，合着兩人的能量，放在音樂盒中。他們希望這個盒子的力量和他們的邪惡理念能有人繼承，延續他們家族的信念。人不為己，天誅地滅。勞倫忍無可忍，衝進那個多嘴的鄰居家中，給了他一場教訓。

洛娜和馬可斯跟蹤瑞瓦，發現她和肅清者組織的首領之一、著名新聞記者本尼迪·瑞恩竟然在深夜見面，兩人還似乎交易了什麼不得了的文件。洛娜和馬可斯十分震驚。核心圈和肅清者都是屬於十分極端的組織，跟處於中立位置、支持反戰的地下基地同伴們不一樣。但這兩個極端組織的首領，竟然有着骯髒的交易，洛娜突然覺得自己有點愚蠢，一直被瑞瓦的花言巧語矇騙了。肅清者組織的火力越來越大，對變種人的行為也越來越狠。而核心圈一方的動作也越來越大，眼下，在這片土地上即將迎來一個又一個的恐怖襲擊。就在馬可斯、約翰他們束手無策之際，伊凡潔琳聯繫了他們。肅清者正常清理城中各處的秘密組織，伊凡潔琳目前拉攏着各方勢力共同對抗這些殘暴的普通人類。伊凡潔琳的聯繫對於約翰他們來説正如雪中送炭，加上洛娜現在對瑞瓦也存有異心，正好是與洛娜重新合作的好機會。眼下，他們勢力依舊未足，馬可斯提出，讓爾格的組織也加入，讓隊伍更加龐大。正當克拉麗絲擔心爾格不願出手時，伊凡潔琳開口説，只要她出面，爾格就會答應。爾格受過伊凡潔琳的恩惠。果然，伊凡潔琳親自叫到，爾格難得地從不見天日的地底鑽到地面，與地下基地的人一起進行計劃部署。勞倫痴迷着芬利斯雙子遺留下的音樂盒，她摸出了藏在盒中的紙條，然後把德文翻譯成英文，內容讓勞倫觸目驚心。芬利斯雙子的力量，有着光明和黑暗兩面。本是對立的兩面，卻有辦法融合，並變得更加強大。要讓兩股力量施展得好，必須要兩人互相接受對方的能力，才能成功。勞倫彷彿領悟到了祖先的一些異能技巧，當晚，她在睡夢中，對安迪進行了反擊。安迪在夢中被勞倫重重地擊中，驚醒過來，滿嘴都是血。埃斯梅姐妹聞聲後立即查看安迪的情況，聽安迪的形容後，三人面面相覷。他們感覺勞倫的力量，比起安迪的有過之而無不及，勞倫要麼拉攏進核心圈，要麼就得趕盡殺絕。

莫洛克人在之前的抵抗中，被肅清者打得傷亡慘重。克拉麗絲眼見同伴就快失血過多而死，而他們的地底組織也沒有人懂醫術，於是向爾格提議讓她聯繫基地的人，把凱特琳帶到這裏，為同伴治療。但爾格以前被普通人類欺騙多次，再也不願相信人類，於是駁回了克拉麗絲的請求。然而，在同伴們的再三請求下，爾格假若再堅持下去，他們便會失去一個同伴，爾格無可奈何，同意了克拉麗絲的做法。勞倫沉迷着芬利斯雙子的魔音盒無法自拔，很快引起了裏德的注意。他勸説勞倫，不要再聽這個音樂，這裏面的聲音會讓勞倫沉淪於黑暗的力量中。但勞倫實在控制不住自己，她感覺父親不懂自己的感受，擁有力量是一件十分美妙的事，她可以利用這股力量警惡鋤奸，哪怕這股力量藴藏着黑暗的一面。安迪在福克斯三姐妹的慫恿下，試圖通過夢境把勞倫拉入夥。勞倫知道芬利斯雙子的強大力量，她和安迪缺一不可，她雖然沉迷力量，但也不願就此沉淪，於是想通過失眠去逃避和安迪的夢中相見。但疲倦襲來，勞倫還是禁不住進入了夢鄉。安迪在夢中，讓福克斯三姐妹控制着思緒，不斷説着拉攏勞倫的言辭。勞倫好不容易醒過來後，再被父親剛才責備一番，在看着那鋪天蓋地的變種人被人類趕盡殺絕的消息，心態漸漸發生了改變。洛娜正在和馬可斯里應外合傳遞消息。核心圈剛加入的信任最近加緊了訓練，洛娜也趁機加入訓練，找機會套瑞瓦的秘密行動。洛娜在訓練時，故意弄傷自己，隨後找藉口説處理傷口，從訓練場溜進新人的房間，發現了瑞瓦最近的襲擊目標。襲擊目標全都是著名的建築物，假若動武，一定造成十分慘重的傷亡。勞倫感覺自己越來越不對勁，她獨自出門，一方面想一個人冷靜一下，另一方面前往和安迪約好的地點，考慮着加入核心圈。約翰利用異能追蹤到勞倫的行蹤，但此時傳來了洛娜的消息。洛娜把最近的一個襲擊地點向馬可斯通風報信，讓馬可斯和約翰、裏德等人及時行動，阻止了一場戰爭慘劇的發生。勞倫就在裏德他們附近，約翰看着裏德的樣子，認為他們父女好像有話説不清楚，才導致今天的狀況。裏德聽後，也想通了，決定敞開心扉。他拉住勞倫，把自己小時候的事告訴勞倫。其實裏德不是不懂勞倫的感受，他在小時候也差點遭受魔音盒的影響，但是他的父親用故事勸住了裏德，裏德心裏那份光明沒有被黑暗吞噬。安迪夜裏，來到和勞倫約定的地方。但是勞倫沒有出現。勞倫終究沒有受安迪影響，安迪想念着家人，還有未來赴約的勞倫，陷入了沉思。

如今在人類組織中呼風喚雨的瑞恩，在四年前還是一個地方網絡電台的小主持。他的投資多次失利，聲名也每況愈下。就在這時，瑞瓦來到他身邊，與瑞恩談合作。瑞恩本想着不願跟變種人合作，但他是個生意人，面對名利雙收的誘惑，瑞恩只意思意思地考慮了一下，便答應了瑞瓦。洛娜查到了麥克斯的行蹤後通知馬可斯，馬可斯便來到麥克斯經常惠顧的便利店，待他出來時，偷襲麥克斯。馬可斯原來只是想威脅他，沒想到麥克斯卻反殺了一下。馬可斯情急之下，只得使出異能，在車內混戰時，麥克斯命喪馬可斯手下，馬可斯也受了傷。麥克斯徹夜未歸，引起瑞瓦等人的懷疑。洛娜強作鎮定，不能在瑞瓦面前暴露一點兒不自然的地方。福斯特三姐妹在瑞瓦的指示下，開始進行內部調查。麥克斯的失蹤，不禁讓他們懷疑，核心圈中出現了內鬼。瑞瓦給了瑞恩一個新的任務，清理住在地下的莫洛克人。瑞恩知道莫洛克人一直處於中立地位，他也不便出手，瑞瓦看着瑞恩這個慫樣，便給了他一個提議，可以讓他的新傀儡“特納”替他幹這個髒活。單純的特納很快便聽了瑞恩的話，和“肅清者”團隊的人一起闖入了莫洛克人的地盤。然而，爾格他們也不是吃素的主，在特納等人剛闖入時，便開始準備着迎戰。但有戰火，就必定有傷亡，克拉麗絲加入莫洛克人後，原以為能安安穩穩地過日子，但自己不找別人麻煩，麻煩倒總是找上門來。她知道特納一夥人的武力十分強大，不得已之下，只好求助約翰他們。約翰和馬可斯收到通知後，立即前往救援。特納和爾格雙方也開始了激烈的交火。克拉麗絲不想強行對抗，她知道，躲在地下的莫洛克人有很多都是像她這樣希望過着與世無爭日子的變種人，他們的對抗能力都不高，還大多都是老弱婦孺。約翰等人很快便前來接駕，克拉麗絲利用自己的異能，把同伴們運走。特納等人以肉身之軀迎擊，很快便有人犧牲了。雙方都殺紅了眼，對抗越演越烈，幸好克拉麗絲在約翰的幫助下，越來越多的莫洛克人得以逃脱。特納等人很快破門而入，直搗莫洛克人的大本營。爾格等人死守最後一道防線，待克拉麗絲運送着最後一批同伴後，爾格才離開。約翰原以為大功告成，迎接克拉麗絲，沒想到，特納突然從後狙擊，克拉麗絲背對着特納，面對着約翰，就這樣中彈倒地。克拉麗絲打開的空間隨即消失，只在約翰面前留下幾滴克拉麗絲的血。福斯特三姐妹查出了問題所在，是監控出了問題。核心圈的監控一直由莎吉操控，莎吉自稱這系統有99%以上的防禦力，如今出了問題，莎吉自然責無旁貸。找出問題所在後，瑞瓦和福斯特立即審問了莎吉，但莎吉除了否認，卻沒有任何證據證明監控不是被自己篡改的，瑞瓦再福斯特三姐妹面前，把莎吉就地正法。安迪知道消息後，便找到洛娜，把這事告訴了她。洛娜知道真相，卻不能在安迪面前表現一二，她害死了莎吉，愧疚得有點不知所措。

凱特琳和勞拉的行蹤被發現後，便在路上亡命奔跑着。母女倆躲進了一棟廢棄大樓裏暫時避開警方的線眼。勞拉想了很多，終於忍不住開口問母親，她是不是計算好了莫洛克人會被肅清者追捕的時間，才讓她們母女倆從另一邊逃脱。面對勞拉的側面，凱特琳沒有正面回答。她知道自己很自私，但她的自私也是為了能護女兒周全，對於勞拉的不理解，她也認了。約翰看着克拉麗絲從自己眼前消失後，一蹶不振，戰意全無。眼下肅清者一戰未足，肯定回奮力回擊，這絕不是能任意悲傷的時候。但馬可斯作為約翰的好兄弟，看見他這副意志消沉的模樣，恐怕也勉強不了，他只好把配合對抗的希望寄託在尚未能控制自己異能的裏德身上。裏德的異能難以控制，雖然不能隨意釋放，但釋放的時候他自己也控制不了。在與肅清者一戰那會兒，他逃跑時不小心被抓住了，裏德的異能只要他情緒激動便會隨之而產生，裏德控制不住便殺了人。洛娜連累了莎吉，她十分內疚。這下也證明了瑞瓦並不是她想要追隨的領袖。她殘暴，還勾結肅清者的首領去剷除其他變種人勢力，想借刀殺人，把核心圈變成變種人中唯一的組織。她的野心已經超出了洛娜原來加入核心圈的初衷，她後悔極了。洛娜想要逃離瑞瓦，於是她偷偷找到安迪商量，把瑞瓦暗地裏乾的髒事告訴了安迪。安迪聽後有點難以置信，且安迪的內心如今逐漸被黑暗吞噬，他覺得他無法再待在父母身邊，他這樣黑暗的人，就該和瑞瓦這些邪惡份子在一起。與此同時，勞拉和凱特琳的藏身點再次暴露了。約翰、馬可斯也收到了警方傳出的通訊語音，説發現了勞拉她們的蹤跡。裏德和馬可斯立即前往凱特琳那兒，在馬可斯使用了激將法，裏德總算施展出異能，打碎了牆壁，把勞拉和凱特琳從廢棄大樓中救出。洛娜即將按照自己的計劃，離開瑞瓦的基地。她放不下安迪，於是再次勸説。她和馬可斯打電話時，也把電話給了安迪，讓他和在馬可斯旁邊的裏德好好談一談。父子倆很久沒有談話，安迪心情既激動又難過，他覺得自己幹了很多壞事，想殺人，還十分嗜血，他沒有臉回家見父母。裏德身上也有家族的血脈，安迪經歷的黑暗他又何嘗未經歷過，甚至，他現在也處於黑暗當中。當安迪稱自己是殺人魔的時候，裏德説，他不久前殺了一個人，如果安迪是的話，那麼他也是。裏德説出這話，不是為了讓安迪繼續殺人，而是希望安迪學會接受這份宿命，並控制自己的宿命，不要讓這黑暗的命運把自己控制了。安迪解開心結，流下了釋懷的淚水。

安迪和洛娜一起，敲開了馬可斯他們暫住的家門。洛娜和馬可斯冰釋前嫌，安迪也和家人團聚。現在正是閤家歡聚的時刻，可惜社會形勢沒有時間讓他們好好依偎寒暄。瑞瓦的野心越來越大，當務之急，是要剷除核心圈的勢力，不讓瑞瓦和瑞恩再胡作非為。大夥兒商量着，怎樣最好地抵抗瑞瓦。洛娜等人都認為，既然安迪和勞倫再度合體，靠他們便可以施展芬利斯雙子的異能，摧毀瑞瓦的大樓。但凱特琳本着保護小孩的心情，希望能不讓兒女出手便不讓兒女出手。勞倫聽後，便安撫了母親的情緒，她認為既然有自己和安迪在，就應該發揮他們的作用。而且他們之前作了這麼多準備，感覺就是為了這一刻。就在大夥兒達成共識，制定了摧毀核心圈大樓的計劃後，約翰突然感覺到異樣。原來，瑞瓦發現洛娜和安迪的叛變後，她便聯繫了瑞恩，讓瑞恩趕緊派出他的肅清者手下，為地下組織的人制造一場驚喜。約翰感受到一大堆卡車和重裝士兵距離他們越來越近。原來是肅清者追蹤到他們的行蹤，未等約翰他們反應過來，肅清者便包圍了他們居住的大樓。這下子，他們的計劃也被打亂了。面對肅清者的闖入，他們也只能選擇硬碰硬的的形式。凱特琳之前買了一批槍支藏了在地下室，裏德和凱特琳一起去取槍抵抗。房間裏只剩下勞倫和安迪。突然間，勞倫看見房門有點不對勁，剛才媽媽出去時明明把門關了，但這時，門卻是開的。話音剛落，福斯特三姐妹和“隱藏”便現了身。原來這是瑞瓦聲東擊西的方法，他們故意讓肅清者製造騷動，把地下組織的變種人的注意力都集中在肅清者那邊，從而讓勞倫和安迪放鬆警惕，好讓福斯特三姐妹乘虛而入。福斯特三姐妹入侵了姐弟兩人的心智，控制他們摧毀了一棟人類大樓。哪怕勞倫和安迪意志一直在抵抗，但這隻會讓他們增加內傷。裏德他們發現勞倫失蹤後十分焦急，在約翰的探知能力下，找出了安迪他們的行蹤。這下子，瑞瓦的計謀也呼之欲出。一旦勞倫和安迪兩人被帶到瑞瓦那裏，遭瑞瓦利用，這一定會為世界帶來十分慘重的傷亡。為了給裏德他們爭取拯救勞倫和安迪的時間，約翰身先士卒，主動走出道路，引開特納的注意。裏德他們趁機駕車逃走，隨後便往安迪他們那裏趕去。他們找到福斯特三姐妹後，雙方對峙起來。洛娜看見三姐妹中的埃斯梅，知道她不是壞人，於是動之以情曉之以理，總算讓埃斯梅動搖了，放開了自己的異能，讓馬可斯他們能擊暈另外兩個福斯特姐妹。安迪和勞倫被帶到安全區暫時休息，但是他們已經沒有動力再去執行摧毀核心圈的精力了。