VNTR

VNTR基本原理與RFLP大致相同，只是對限制性內切酶和DNA探針有特殊要求：(1)限制性內切酶的酶切位點必須不在重複序列中，以保證小衞星或微衞星序列的完整性。(2)內切酶在基因組的其他部位有較多酶切位點，則可使衞星序列所在片段含有較少無關序列，通過電泳可充分顯示不同長度重複序列片段的多態性。(3)分子雜交所用DNA探針核苷酸序列必須是小衞星序列或微衞星序列，通過分子雜交和放射自顯影後，就可一次性檢測到眾多小衞星或微衞星位點，得到個體特異性的DNA指紋圖譜。　小衞星標記的多態信息含量較高，在17一19之間。缺點是數量有限，而且在基因組上分佈不均勻，這就極大限制其在基因定位中的應用。VNTR也存在實驗操作繁瑣、檢測時間長、成本高的缺點。