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DNA序列數據庫
鎖定
DNA序列數據庫是集合所有已知核酸的核苷酸序列，單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述，包括它們的科學命名、來源物種分類名稱、參考文獻等信息的資料庫。基因和基因組的資料也包含在DNA序列數據庫中。
- 中文名
- DNA序列數據庫
- 外文名
- DNA sequence database
- 類 型
- 計算機科學
- 學 科
- 跨學科
- 性 質
- 數據庫
- 內 容
- 核酸序列、蛋白質序列等
目錄
- 1 介紹
- 2 常用數據庫
- ▪ NCBI主要基因序列數據庫
- ▪ Entres-Gene數據庫
- ▪ PROSITE
DNA序列數據庫介紹
DNA序列數據庫是集合所有已知核酸的核苷酸序列，單核苷酸多態性、結構、性質以及相關描述，包括它們的科學命名、來源物種分類名稱、參考文獻等信息的資料庫。基因和基因組的資料也包含在DNA序列數據庫中。
1、核酸序列數據庫
國際三大核酸序列數據庫：GenBank, EBML, DDBJ
RefSeq: The Reference Sequence Database
dbEST: Expressed Sequences Tags數據庫
UniGene等
2、蛋白質序列數據庫
UniProt (Swiss-prot & TrEMBL, PIR)
3、基因組數據庫: Ensembl
DNA序列數據庫常用數據庫
DNA序列數據庫NCBI主要基因序列數據庫
GenBank：包含了所有已知的核酸序列和蛋白質序列，以及與它們相關的文獻著作和生物學註釋。其數據直接來源於測序工作者提交的序列，為原始數據積累的開放數據庫，數據可能存在重複以及不準確。
RefSeq：提供非冗餘的，高質量的，經檢驗校正的序列信息；包括染色體、基因組（細胞器、病毒、質粒）、蛋白質、RNA等。
DNA序列數據庫Entres-Gene數據庫
序列來源於Refseq數據庫；
詳盡的註釋信息，包括基因在基因組的定位，基因名稱、蛋白質名稱，基因結構等；
基因的命名主要來自權威命名委員會的官方符號以及Refseq記錄中的基因名，由NCBI工作人員進行數據收集並註釋。NLM的索引部門對基因功能進行闡述。
沿用人類孟德爾遺傳網（OMIM）中的疾病名稱並與NCBI其他數據庫形成交互鏈接。
DNA序列數據庫PROSITE
收集了生物學有顯著意義的蛋白質位點和序列模式；
根據這些位點和模式快速和可靠地鑑別一個未知功能的蛋白質序列應該屬於哪一個蛋白質家族；
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