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CTCF

鎖定
CTCF（CCCTC binding factor），是CTCF基因編碼的轉錄因子 [1]  ，與絕緣子的活性相關。
中文名
轉錄阻抑物
簡    稱
CTCF
又叫1
1-鋅指蛋白或CCCTC-結合因子
功    能
通過與H-19印記控制區域

目錄

  1. 1 作用
  2. 2 實驗研究

CTCF作用

CTCF蛋白在印記調控區域（imprinting control region，ICR）和分化甲基化區域1（differentially-methylated region-1，DMR1）和MAR3結合抑制胰島素樣生長因子2（Igf2）基因的過程中起重要作用 [2]  。CTCF與靶順序因子的結合可阻斷增強子和啓動子的相互作用。從而將增強子的活性限制在一定的功能區域。除了阻斷增強子外，CTCF還可作為染色質屏障阻止異染色質的傳播。人類基因組有將近一萬五千個CTCF絕緣體位點，説明CTCF在基因調控方面的功能廣泛。而且CTCF結合位點還可作為核小體定位錨。

CTCF實驗研究

CTCF是廣泛存在於真核生物中的多功能轉錄因子.利用細胞瞬時表達實驗在HeLa細胞系中研究CTCF各結構域的轉錄活性.方法:借用CheckMate哺乳動物雙雜交系統的2個質粒pBIND和pG5LUC,將CTCF的N、M、C段及全長編碼序列克隆至pBIND質粒的GALA DNA結合結構域編碼序列後的多克隆位點,將表達GALA DNA結合結構域-CTCF融合蛋白的pBIND重組質粒與由腺病毒晚期主要啓動子控制的報告基因質粒pG5LUC共轉染HeLa細胞系,檢測CTCF各結構域對報告基因表達水平的影響.結果:轉染含CTCF N段的質粒可使報告基因的表達量增長至3.5倍以上;轉染含CTCF其他片段的質粒對報告基因的表達沒有明顯的影響.結論:在HeLa細胞中,對啓動子具有轉錄激活活性的主要是CTCF的N段,而M段和C段幾乎沒有轉錄激活活性.
參考資料
  • 1.    Filippova GN, Fagerlie S, Klenova EM, Myers C, Dehner Y, Goodwin G, Neiman PE, Collins SJ, Lobanenkov VV． An exceptionally conserved transcriptional repressor, CTCF, employs different combinations of zinc fingers to bind diverged promoter sequences of avian and mammalian c-myc oncogenes：Mol. Cell. Biol.，1996
  • 2.    Ohlsson R, Renkawitz R, Lobanenkov V．CTCF is a uniquely versatile transcription regulator linked to epigenetics and disease：Trends Genet.，2001