CHARMM

CHARMM是一個被廣泛承認並應用的分子動力學模擬程序，用於生物大分子的模擬，包括能量最小化，分子動力學和蒙特卡羅模擬等。程序採用由哈佛大學的Martin Karplus教授建立的CHARMM力場，可以為用户提供處理各種小分子、大分子（包括蛋白質、核酸和糖）的經驗化能量計算，包括：相互作用能及構象能量、局域最小化、旋轉勢壘、與時間相關的動力學行為、振動頻率等。模擬過程提供了有關分子結構、相互作用、能量等信息。CHARMM包含具有專家特點的標準最小化和分子動力學方法，包括正則模式計算、相關性分析、量子力學與分子力學相結合的方法等。CHARMM開發項目包括一個與Martin Karplus及其在哈佛的研究小組合作的開發者網絡，這個網絡包含了美國等地的開發者，協同開發及維護CHARMM軟件包。這個軟件允許進行學術研究的個人及小組在支付一定費用之後得到使用許可。 ^[1] 

商業版本的CHARMM，名稱為CHARMm（請注意此處的小寫'm'），可以從Accelrys公司處得到。