-
AFSM
（重測序專利）
鎖定
AFSM是我國科研人員（熱帶生物技術研究所 夏志強等）2014年開發的國際領先的重測序專利，AFSM方法是全世界可以在全基因組高通量檢測SNPs和indels的同時檢測甲基化位點的唯一的方法。
- 中文名
- AFSM
- 外文名
- Amplified-fragment single nucleotide polymorphism and methylation
樣品處理和數據分析步驟更簡便經濟。利用該方法可同時檢測96個木薯樣品的SNPs, indels和甲基化位點，還特別適用於高通量全甲基化和半甲基化檢測。
前期開發的AFSM技術已成功用於對木薯非近交親本雜交F1羣體（KU50×SC124）85個株系羣體的基因型分析，採用HighSeq2500測序一個lane，獲得278,737 個SNPs, 23,941 個indels 和13,598 甲基化位點標記，並將3,032 個AFSM標記（包括2,331 個SNPs, 537 個indels和164 個甲基化標記）定位到遺傳圖譜上。 其基因型分析成本遠低於同類技術的成本，證明該方法的高效與實用性。
方法已發表於Nature旗下雜誌Scientific Reports（Xia et al., 2015; IF: 5.078），並申請了國家發明專利一項。
Xia Z, Zou M, Zhang S, Feng B, Wang W. AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping,Scientific Reports,2014,4:7300,DOI:10.1038/srep07300
[1]
- 參考資料
-
- 1. AFSM sequencing approach: a simple and rapid method for genome-wide SNP and methylation site discovery and genetic mapping ．Natrue．2014-12[引用日期2015-06-22]
