高達Reconguista in G

世界進入宇宙世紀結束後開始的下一個世紀，謎之少女突然搭乘未知的機動戰士出現在地球，失去記憶的她被首都衞隊所保護。候補隊員貝爾利和夥伴們進行宇宙實習，聖花學院的女生鼓舞隊前來鼓勵他們，卻被德蘭森上尉趕了回去。貝爾利駕駛機動戰士時遭遇宇宙海盜。貝爾利對海盜展開攻擊，他的初次作戰能勝利麼？

宇宙海盜艾達所駕駛的機體被稱作“G-Self”，貝爾利、魯因·李和夥伴們決定調查這部神秘機體。迷之少女拉萊雅進入了聖花學院，和諾蕾德她們成為同學。隨後貝爾利和魯因·李擔任晚宴守衞，此時海盜再次襲擊，軍隊一片混亂。諾蕾德和馬妮帶着慌亂的拉萊雅遇到貝爾利等人，他們一同趕往艾達的關押地，發現了準備逃走的艾達……

海盜襲擊事件平息，艾達仍舊被困首都圈。貝爾利希望母親能救助艾達，母親發現貝爾利能夠駕駛G-Self，對此十分擔憂。貝爾利和艾達接受上校的盤問，原來艾達的目的是奪取被首都塔獨佔的能源。拉萊雅突然衝進來，一臉驚慌。海盜成員裏的克寧中尉決定再次出擊，威脅首都圈釋放艾達，否則他就要毀掉首都塔。

貝爾利、諾蕾德、拉萊雅三人作為人質和艾達一同來到海盜的基地。首都圈開始籌建軍隊，以拯救人質為藉口，打算趁機把海盜們一網打盡。克寧中尉逼着貝爾利駕駛G-Self，此時首都軍發起攻擊，貝爾利決定駕駛G-Self阻止這場戰鬥。德蘭森帶領機動戰士圍攻貝爾利，貝爾利擊退了德蘭森等人。

首都軍派出新機體作戰，海盜打算用飛船當誘餌，趁機佔領首都塔。貝爾利想阻止海盜的計劃。之後他決定和海盜們一起保護這艘飛船，與首都軍為敵。克寧和艾達駕駛機動戰士迎敵，貝爾利駕駛核心戰機參與戰鬥，幫助克寧脱困。貝爾利成功和G-Self對接，駕駛它擊退了首都軍，海盜們認可了他的實力。

作為首都衞隊的候補生，貝爾利打算駕駛G-Self偵查亞美利亞軍在地球環繞軌跡上的宇宙艦隊，於是他和海盜們一同前往首都塔。在另一邊，首都軍派出更多的兵力，德蘭森駕駛新機體親自出戰，想要一雪前恥。海盜團遭遇首都軍的突然襲擊，貝爾利與德蘭森展開激烈大戰，貝爾利能取得勝利嗎？

貝爾利的母親來到第一中繼站，趁機駕駛滑翔機進入宇宙，前去尋找貝爾利。在另一邊，海盜團打算讓艦隊提前進入衞星軌道，於是佯裝作戰，用仿真氣球騙過首都軍。魯因·李率領部隊，突襲宇宙海盜。克寧蠱惑拉萊雅操縱G-Self作戰，儘管拉萊雅駕駛順利，但並不熟練，險些遇害。貝爾利駕駛其它機體救了拉萊雅，此時戰鬥仍在繼續……

海盜軍與首都軍激烈對戰時，貝爾利見到了艾達的父親，艾達的父親對貝爾利十分熱情，這讓貝爾利吃了一驚。在G-Self能出擊前，由克寧撐住整個戰場，魯因·李駕駛的機動戰士最終被貝爾利駕駛的G-Self打敗。艾達的MS機翼故障陷入危機，貝爾利前去救援，此時他母親乘坐的滑翔機正在向他們駛來。

貝爾利和母親希望能用“梅格法納”戰艦進入首都圈，探查宇宙是否存在威脅。眾人意見達成一致，“梅格法納”改變航線，進入伊薩尼爾大陸，逐漸接近首都圈。貝爾利與艾達等人陪母親外出打電話，諾蕾德將貝爾利是養子的秘密告訴了艾達。母親聯繫了首都衞隊負責接應的人，“梅格法納”能否順利突破首都軍的警戒線呢……

卡爾貝斯中尉帶貝爾利等人逃走，原來首都軍不僅想要梅格法納和G-Self，還想奪走拉萊雅。貝爾利和艾達他們嘗試讓梅格法納逃離首都圈，但是卻受到駕駛新型機動戰士“巫夏”的部隊的阻撓。梅格法納遭到圍攻，艾達陷入苦戰，貝爾利前去援助。此時拉萊雅逐漸清醒，她所知曉的宇宙威脅到底是什麼呢？

海格法納進入衞星軌道，此時從太空中的加蘭典戰艦出擊的假面上尉為了奪取G-Self和拉萊雅而攻擊海格法納，從而展開了宇宙戰爭。混戰狀態下，克寧與米克·傑克在前線迎擊，貝爾利與艾達負責阻擊逃出戰場的敵人。貝爾利駕駛的G-Self被假面部隊圍攻，無奈之下貝爾利只能脱離機體，與假面正面對決。

G-Self為增強攻擊力，安裝突擊揹包，但這一行為遭到了拉萊雅的反感。貝爾利作為大家的希望，認真學習如何使用揹包。在另一邊，克寧等人決定佔據首都塔，計劃讓加比亞爾戰艦偽裝成遇難船隻侵入聖波特。此時加蘭典出動假面部隊，突襲沙羅曼達戰艦。G-Self與G-奧秘配合出動，貝爾利打算用揹包狙擊對手……

從月球來的迷之艦隊把亞美利亞的補給艦擊沉，在同是地球人的意識下克寧和假面上尉組成共同戰線，齊力對抗月球艦隊。拉萊雅意識逐漸清醒，這使她陷入慌亂之中。貝爾利與假面上尉等人駕駛機動戰士來到首都塔，與克寧會合。克寧計劃假裝投降，靠近後伺機攻擊敵方母艦，他的計劃能成功麼？

拉萊雅恢復了記憶，貝爾利一行人來到聖域。假面與昆帕大佐計劃讓克寧和宇宙戰艦一同被擊沉，製造克寧光榮戰死的假象。由於亞美利亞軍艦隊的出擊，各國召開臨時緊急會議。為了弄清楚事情真相，貝爾利、拉萊雅、艾達、諾蕾德四人前往永賀，卻碰到了打算回到加蘭典艦船參戰的馬妮……

梅格法納向位於月球背面的永賀進發，拉萊雅告訴貝爾利等人故鄉的現狀。此時宇宙中，地球人與宇宙人的戰鬥仍在繼續，克寧和假面上尉以各自的艦隊向月球進軍，梅格法納遭到沙羅曼達戰艦的飛彈反擊，克寧和貝爾利等人積極應戰。貝爾利建議與德瑞特艦隊結盟，此時梅格法納終於進入月球了。

貝爾利等人來到拉萊雅的故鄉，沒想到貝爾利和艾達竟是雷漢頓家的王子和公主，這個消息讓眾人大吃一驚。看到舊照片和信物的兩人終於相信了自己的身世，而G-Self上的機關也只有他們能夠解開。得知了出生秘密的貝爾利，聽聞假面在太空中的加蘭典裏出現，便私自駕駛G-Self出擊。

永賀的外壁被打破，為了不讓瓦礫飄往大棧橋方向，梅格法納和艾達等人幫忙收集宇宙垃圾，艾達提議以隕石氣球為掩護逃出永賀。由於爆發泥石流，梅格法納得以出航。在另一邊，假面讓芭拉拉駕駛實驗機體接觸梅格法納，克寧則阻止首都軍對海格法納和G-Self出手，雙方展開戰鬥……

香芝神轎要到聖波特去舉行降臨祭，由於它的出港所以禁用光束來福。地球人並未聽從命令，執意出戰要一雪前恥。假面上尉假裝進行飛行訓練，克寧上尉則利用總統兒子的身份將沙拉曼達開出。此時敵軍從正面進攻，假面和瑪尼進入梅格法納內部，企圖奪走G-Self，遭到貝爾利的反擊。

貝爾利等人登上弦月船，為了對抗金星圈的宇宙射線，大家開始每天進行高強度訓練。艾達等人幫忙修理梅格法納，隨着長時間的相處，貝爾利與諾蕾德和拉萊雅的關係更加親密。弦月船發射光束狙擊流星，來到永賀的金星地球圈，而地球人逐漸接近軌道，並打算佔領弦月船？！

基特團正將弦月船駛向他們在羅薩里奧10的實驗室，貝爾利等人則計劃利用這次機會去見拉古。為了揭開弦月船高性能的秘密，基特團的艦長決定讓G-Self和波里基特相撞來確認弦月船引擎的共振反應。弦月船與10警衞的戰鬥開始，貝爾利駕駛G-奧秘出戰，並搶回了G-Self。

基特團的艦長奇亞與貝爾利激戰時，不慎將海底打出一個洞。貝爾利孤身作戰陷入困境，就在此時梅格法納聯繫到他，並發現了他的位置。被奇亞挾持的人質身上所謂的炸彈，竟然只是魔術表演的道具。梅格法納登陸基特實驗室，並未遭到襲擊。基特團準備攻擊梅格法納，而海底的洞仍未被填上……

滿月船趁羅莎里奧10的擾亂增強前出航，打算強行突破，地球迴歸行動終於開啓了。艾達見到了拉古，但拉古並不打算將製作宇宙電池的技術傳給地球人。梅格法納緊追滿月船，發現滿月船進入了地球軌道。地球人派出德瑞特艦隊和亞美利亞軍，宇宙中即將迎來一場大戰。

假面掏空了香芝神轎，企圖讓滿月船的戰力歸首都軍所有。克寧決定擊沉假面的戰艦，但首都軍派出機動戰士來阻撓他們。在梅格法納上，得知身世的艾達拒絕了父親求和的請求。假面嘗試接觸滿月船，貝爾利前來支援，為了阻止他們而出動的亞美利亞軍和瑞德特軍卻和對方開始了艦隊戰。

基特團提供的世界樹若能夠投入實戰，就能輕而易舉殲滅亞美利亞的殘存戰力。馬妮向假面提出請求，希望他能和貝爾利成為朋友，但假面認定貝爾利將變成獨裁者。艾達的父親，亞美利亞總監古辛突然要求停戰，並向克寧堅決表明要和德瑞特艦隊合力擊倒首都軍，讓德瑞特艦隊率先到達地球……

加蘭典、沙羅曼達和克諾索斯三方展開滿月船爭奪戰。假面帶領基特團接近地球，永賀的戰艦克諾索斯緊跟着假面等人，想要避開加蘭典衝入地球圈。在另一邊，克寧看穿了克諾索斯的企圖，他打算趁梅格法納落後之際一舉獲得勝利。面對父親的死，艾達決定駕駛梅格法納完成父親的遺志。