高達創形者

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高達模型戰隊錦標賽是一項在GBN舉辦的年度盛會。冠軍九條響也率領的“阿瓦隆”，即將與智將隆美爾率領的精鋭部隊“第七裝甲師”在決賽一較高下。響也的愛機“高達AGE II瑪格南”等多種高達模型於戰場交戰，爭奪最強戰隊的殊榮！

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三上陸與好友日高勇夫，在觀看過冠軍九條響也的高達模型對戰之後，決心投入GBN的世界。對於第一次成為潛行者的小陸與小勇而言，計算機虛空間（次元世界）裏的一切都超乎想象、新奇刺激。小陸和小勇在瑪姬的指導下第一次駕駛各自高達的執行任務，期間突然收到一個求救信號。他們到達信號發出地點時，遇到了神秘少女莎拉。並且有一位潛行者正躲在附近窺視着他們兩人。

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小陸與小勇正在回顧第一次的GBN體驗。想要拉攏他們兩個加入足球社的桃華卻在此時出現,不過還是沒能阻止小陸他們進入GBN。兩人再度潛行進入計算機虛空間（次元世界）,與莎拉再度碰面。這次他們不是要進行高達模型對戰,而是要挑戰以收集關鍵道具為目的的收集任務。就在他們採集到花朵而返程的途中，遇到了上次偷襲他們的潛行者多傑，以及多傑的哥哥“食人魔”。

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小陸目睹了高達模型分組淘汰賽的激戰，更加確定自己對冠軍充滿着憧憬。於是與勇夫一起測試他們分別準備的新武器。桃華受到他們兩人的熱誠感召，終於決定要參加GBN。三人潛行到次元空間之後，遇見一位自稱“響也”的青年潛行者要求他們協助進行連戰任務。就在他們執行任務的途中，突然遇到了幾名“大潛行者”的攔截，而且任務系統也因“大潛行者”的出現變得異常，作為任務最終關卡的BOSS惡魔高達突然暴走起來。

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九條響也説出他想保護GBN世界的心情，讓小陸明白自己同樣身為潛行者，水平相差太多了。這讓小陸煩惱不知道該怎麼做才能拉近與冠軍的距離，於是瑪姬就介紹熟識的潛行者給小陸。小陸為了找到自己該走的路，和小勇以及取得正式賬號的桃桃，連同莎拉一行四人，要潛行進入充滿中國風情的世界埃斯坦西亞區（エスタニア・エリア）了。在那裏，他們遇到了戰隊“虎武龍”的潛行者虎狼。在虎狼的指導下，小陸他們進行了訓練。

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小陸一行人下一個目的地是聚集了全球製作者，未經許可不得駕駛高達模型進入的中立地帶波斯區（ペリシア・エリア）。四人走在一望無際的大砂漠，然而不管再怎麼走都是會浮現海市蜃樓的相同風景，終於讓他們累垮了。就在此時出現一輛吉普車。駕駛者是一位自稱“菖蒲”的女性潛行者。在菖蒲的協助下，小陸他們終於到達了波斯，在那裏看到了展示着的各種各樣的優秀高達模型。其中就有鼎鼎有名的高達模型製作者沙赫里亞爾的作品，不過小陸説從這作品感受不到製作者的“愛心”。菖蒲揭穿了那名“沙赫里亞爾”是冒牌貨後，惱羞成怒的他襲擊小陸等人，並且那人還是一名“大潛行者”。這時，出手相助小陸的人是……

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小陸等人下定決心要自己成立戰隊。雖然他們很想透過成立戰隊找到自我的風格與力量，卻找不到適合的新成員。沙赫裏建議如果想往上爬，就應該找一個高手加入，並提到了桃桃租借的那架製作精良的卡布爾的製造者。小陸他們詢問奈奈美，得知那架卡布爾的製造者正是奈奈美的哥哥七瀨光一。小陸邀請光一加入他的戰隊，光一卻表示自己已經“退休”了。但是，經不住小陸的糾纏的光一暗地裏登陸GBN，然後遇到了少女莎拉，以及跟小陸相識的瑪姬、虎狼、沙赫裏等著名潛行者們。光一也漸漸地對小陸產生興趣。另一方面，小陸從奈奈美那裏得知光一“退休”的原因。

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小陸終於成立了新部隊「創制潛行者（Build Divers/ビルドダイバーズ）」，而初戰就選了只限戰隊參加的團體戰「戰隊對決」。為了應付一個星期之後的對戰，隊員們在KO-1的建議下強化高達模型。正當一切進展順利時，卻突然發現意想不到的問題——莎拉沒有高達模型。這樣就沒有五對五比賽了。這個時候，小陸再次遇到之前在波斯相會的女性潛行者菖蒲，並邀請她加入戰隊“創形者”。比賽那天，他們得知的跟他們比賽的戰隊竟然是隆美爾教導下的新兵戰隊，而瑪姬、虎狼、沙赫裏，甚至九條響也也為小陸他們的首次“戰隊對決”助威。小陸他們到底能夠獲勝？

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因為“創制潛行者”亮眼的出道戰讓人留下強烈的印象，來自其他部隊的對戰申請蜂擁而至。於是隊員們想要趕快決定下一個對手，趁勝追擊。這時候瑪姬出現了，告訴他們組隊之後除了戰鬥還有其他事可以做，比如參加期間舉辦的限定戰隊參加的戰隊節慶典“霸熊節”。就在他們愉快地參與“霸熊大挑戰”活動任務期間，卻出現了一名出乎意外的女性“大潛行者”。

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「創制潛行者」決定參加隨機決定對戰內容的隨機對戰任務。而對手就是小陸第一次戰勝的對手多傑，以及讓他第一次嚐到敗北滋味的食人魔所屬的戰隊「百鬼」。為了驗證自己的成長，小陸期待着運用累積至今的經驗以及所得到的力量，與食人魔正面對決。而另一方面，多傑也為了對小陸報仇，燃起熊熊鬥志，甚至藉助於外掛貼紙的力量。

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非官方工具的外掛貼紙，以及使用它們的大潛行者的威脅未見停息。那股力量進化後，甚至連隆美爾的戰隊都敗在他們手上。冠軍九條響也為了守護GBN，試圖跟GBN運營官方人員“遊戲大師”接觸，官方卻表示系統沒留下外掛貼紙存在的證據而不作出處理。於是，九條決定私下組建“志願者聯盟”對抗大潛行者，並開始了以揪出散佈外掛貼紙的幕後黑手的真實ID為目的的大作戰。

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冠軍率領的志願者聯盟與大潛行者的戰爭，正處於白熱化階段。菖蒲卻突然妨礙小陸的前進，開始説出她加入創制潛行者隊的真正原因。而那個原因與她的過去有很深的關係——過去菖蒲加入某個全員熱愛SD高達的戰隊，隨着戰隊的排名提升，他們遇到的對手也越來越強。面對屢戰屢敗的狀況他們的隊長決定放棄SD高達，改用寫實型高達；作為代價，他將象徵隊員們友情的某部SD高達模型換給了某位供應商。但是狀況得不到改觀，隊員們也一個個地離去，最後連隊長本人離開，只剩下菖蒲一個人。菖蒲認為只要取回那部象徵友情的SD高達模型，大家就會回來。結果菖蒲當了那位供應商的手下，幫他散佈外掛貼紙，作為間諜瓦解各種妨礙到他們的戰隊，越陷越深。

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小陸與莎拉終於對上了控制大潛行者的幕後黑手，柴司。即使柴司全身散發出對GBN的強烈憎恨，他們還是試圖與柴司對話。另一方面，在主戰場的資源衞星附近的宇宙空間，靠着外掛貼紙的力量得到更強威力的巨大MA大扎姆已經啓動了，其引起程序錯誤向其他服務器蔓延，GBN面臨全面崩毀的危機。冠軍九條、隆美爾等人試圖阻止大扎姆，可是無論是遠程攻擊還是近戰都對其無效。小陸決心守護GBN，啓動了高達00潛行者的Trans-AM系統，並在莎拉的神秘力量下化出“光之翼”，消除了所有外掛貼紙及其帶來的影響。

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與大潛行者的戰鬥結束了，在志願者聯盟的努力下，把外掛貼紙從GBN完全剷除了。潛行者們在阿瓦隆的戰隊據點舉行的慶功會上互相稱頌。然而卻不見小陸等人的創制潛行者隊員的身影，原來他們正為菖蒲內疚而不肯歸隊一事而煩惱着。就在小陸思考怎麼迎回菖蒲的時候，一名陌生人出現出現在他面前。那人給小陸口信，以給回那台菖蒲一直想要的那台SD高達模型為條件，要求登出GBN的小陸帶着高達00潛行者單刀赴會，而會面者是正是柴司。柴司用他的無名異端高達，跟小陸進行一場GPD——現實世界的高達模型對戰。

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在實機對戰「GP對戰（GPD）」上與柴司展開的一場生死鬥中，小陸的高達00潛行者王牌受到重創。由於GPD和GBN不同，可能會讓重要的夥伴在現實世界中受創，光一擔心小陸會因此而受到打擊，所以設法鼓勵他。可是小陸的反應卻讓人非常意外。小陸想製造一個繼承高達00潛行者靈魂的新機體模型，卻又沒有靈感。光一建議他嘗試迴歸原點，於是小陸帶着莎拉重遊GBN，回想其至今遇到的人和事。看着破損的高達00潛行者胸前的傷口，感受到高達00的小陸眼前出現了新機體的姿態。於是，在創制潛行者眾隊員的幫助，小陸開始了新機體的製作。

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「蓮花挑戰」是必須在限定時間內攻陷易守難攻的蓮花要塞，堪稱頂級難度的創建任務。創制潛行者隊在小陸得到了高達00天翔型後，決心挑戰這項就連冠軍戰隊阿瓦隆都感到棘手的難關。任務之初，憑着KO-1自制的航天飛機，小陸他們比預知時間還快地到達蓮花要塞所在的宇宙空間外圍，這讓其他隊伍大吃一驚。最終，創制潛行者能否攻破蓮花任務，高達00天翔型。

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創制潛行者隊突破了難關任務的蓮花挑戰，得到了GBN世界的獎金。小陸等成員們正在思考要如何利用獎金達成各自的夢想時，桃桃提議買下某個島嶼作為戰隊巢穴。但沒想到，那島嶼卻有另一個戰隊同時競買，於是賣家提出搶奪旗幟的戰隊比賽，由勝利一方者買得島嶼。而與創制潛行者競爭的戰隊，是菖蒲的以前夥伴希羅帶領的SD高達戰隊，其名為“新生夏諾瓦”。

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創制潛行者隊的成員們正在盡情享受新的戰隊巢穴的一流設施。小勇認為都是多虧小陸的潛行者實力大幅提升，他們才能得到這個與知名戰隊相比也毫不遜色的環境。然而在他心中，同時間也萌發了一個想法。為了增強自己的實力，在瑪姬的建議下，小勇決定參加鏡子任務，這時遇到了同樣要報名參加的“百鬼”的多傑。

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作為一名潛行者，小陸已經成長到可以在GBN的限時搶攻任務進入前十名。在創制潛行者隊的夥伴與各位潛行者前輩的祝福聲中，虎武龍戰隊的虎狼也不再把曾跟隨他修練的小陸視為徒弟，而是一名勁敵了。於是，虎狼來到創制潛行者的戰隊巢穴，邀請小陸參加“虎武龍”召開的對戰活動“龍虎祭”，在那裏和小陸進行一對一的對戰。

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頭目戰的宣傳活動之一，只限女性參賽的撫子競技即將舉行。只要奪冠就可以獲選為招募女性潛行者活動的形象女郎，讓女性潛行者都趨之若鶩。這個消息也傳到了GBN外的奈奈美耳中。想當形象女郎的奈奈美第一次登陸GBN。參加撫子競技，除了奈奈美、菖蒲、桃桃、莎拉外，還有“阿瓦隆”的艾米莉亞、“百鬼”的玫瑰、“新生夏諾瓦”的成員等潛行者。就在她們進行比賽的時候，某個原因不明的程序錯誤正悄悄地逼近。

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奈美因為撫子競技這個契機，加入了創制潛行者隊。她還把哥哥也拖了下水，幫助她進行高達模型對戰出道計劃。奈美想裝潢自己的房間，列舉了一個道具清單，要大夥人陪她一起參加各種遊戲任務，感受GBN的樂趣。就在大家休息的時候，GBN的防衞機突然出現，並襲擊莎拉。這時出來幫助大家脱困的自稱是GBN研發人員的鳥型潛行者。她告訴創制潛行者眾成員，莎拉是誕生於GBN電子空間的電子生命體的真相，近期GBN發生的大量程序錯誤都是源自莎拉。另一方面，同樣查到程序錯誤源頭的BGN官方管理員遊戲大師，開始了抹殺莎拉的行動。

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GBN官方公開宣佈莎拉是電子生命體「EL潛行者」，而且她就是產生程序錯誤的原因，同時他們也着手搜索她的行蹤。另一方面，小陸跟創制潛行者成員們也開始尋找不辭而別的莎拉。食人魔對小陸在配對戰中的棄權行為感到不滿，於是駕駛他的新機體阻攔在尋找着莎拉的小陸面前，挑起了戰鬥。而獨自行動的光一為了找出拯救莎拉的辦法，在現實世界中約了柴司見面。另一方面，冠軍響也找到了逃亡中的莎拉。

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莎拉被響也重建的志願者同盟囚禁起來，等待官方完成刪去莎拉的修補程序。光一向創制潛行者的成員發來訊息，説找到了同時拯救莎拉和GBN的方法，那就是藉助創制貼紙（原外掛貼紙）把莎拉的人格數據輸送到現實世界的GBD用高達模型，可是成功率只有5%，失敗的話不僅莎拉會消失，整個BGN也會崩毀。官方不屑地否決了這一提議。小陸闖進“阿瓦隆”的基地，跟響也見面，通過響也的話得到啓示。官方終於完成補丁舉手相慶的當天，小陸向響也提出了高達模型對戰。這是由寥寥幾人的創制潛行者及其盟友對抗數萬人組成的志願者同盟的旗幟爭奪戰，幾乎不可能勝出的挑戰。

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創制潛行者隊為了救回莎拉，提出以戰隊對決分勝負。而率領志願者聯盟的九條響也亦為了守護GBN，決定接受挑戰。這場賭上雙方信念的決戰，終於拉開帷幕。小陸他們採用閃電戰兼誘導作戰的戰術，偽裝高達00的墜機，其人成員正面突破敵軍，暗地裏小陸、桃桃分別利用水路和下水道接近城堡。攻防戰中，虎狼遭遇到了宿命的對手沙赫里亞爾。虎狼駕駛激炎雙頭龍高達全力地挑戰沙赫里亞爾的熾天使高達舍赫拉查德。另一方面，察覺到對方戰術的響也，採取行動並駕駛他的新機體出擊。

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第二次志願者聯盟戰也進入高潮，小陸與九條響也終於對峙。小陸回想起曾經與作為目標的冠軍約下的承諾，變得猶豫不決。然而響也只是以一個潛行者的身份，義正詞嚴地向小陸説話。就在創制潛行者隊日陷入苦戰之際，食人魔率領着“百鬼”出現在戰場……

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頭目機在程序錯誤的影響下變得兇暴起來，同時間異變體也在各地出現。盤據在極東基地大廳高塔的異變體更是急速地侵蝕着主系統，這樣下去將會讓整個GBN世界崩潰。彙集了小陸與夥伴們，以及所有潛行者力量的頭目戰即將揭幕。