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馬闖
（西北農林科技大學生命科學學院黨委副書記、院長）
鎖定
- 中文名
- 馬闖
- 出生地
- 湖北隨州
- 出生日期
- 1982年6月
- 畢業院校
- 華中科技大學
- 學位/學歷
- 博士
- 職 業
- 教師
- 專業方向
- 植物學
- 任職院校
- 西北農林科技大學
馬闖人物經歷
2000年9月至2004年6月華中科技大學，學士；
2004年9月至2007年3月華中科技大學，碩士；
2007年3月至2010年3月華中科技大學，博士；
2010年7月至2011年6月美國南加州大學，博士後；
2011年7月至2014年6月 美國亞利桑那大學，博士後；
2014年7月至今 任西北農林科技大學教授。
馬闖研究方向
以近年來高度發展的“生物學大數據”為契機，針對植物領域大數據建立適應多平台、面向多應用的生物信息學數據處理方法、算法和軟件體系，切實推動植物學大數據分析技術的發展；將植物學大數據分析技術與植物逆境生物學、農作物分子輔助育種相結合，發展具有國際先進水平的農作物重要功能基因的大規模挖掘算法，建立重要性狀的基因組及蛋白質組等多組學整合的數據庫，構建高效精準的分子輔助育種的生物信息技術體系，促進以大數據為支持的現代育種理論與技術的發展。
研究重點：（1）人工智能（深度學習，機器學習）在生物學大數據中的應用研究；（2）農作物抗逆機制的系統生物學研究。
[1]
馬闖科研項目
主持中組部“國家青年人才項目”、國家自然科學基金面上項目、陝西省“百人計劃”項目、陝西省創新人才推薦計劃-青年科技新星項目以及西北農林科技大學優青培育專項等多個項目。
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馬闖學術成果
1. 研發了PEA，RAP等多款生物信息學軟件.
2. 參與編著《生物信息學》教材一部.
3. 在Trends in Plant Science, The Plant Cell, Plant Physiology以及Bioinformatics等植物領域和生物信息學國際知名期刊上發表SCI論文20餘篇。
[1]
馬闖主要論文
[1] | Zhai JJ, Song J, Cheng Q, Tang YJ, Ma C, PEA: an integrated R toolkit for plant epitranscriptome analysis. Bioinformatics, 2018. |
[2] | Song J, Zhai JJ, Bian EZ, Song YJ, Yu JT, Ma C. Transcriptome-wide annotation of m5C RNA modifications using machine learning. Frontiers in Plant Science, 2018, 9:519. |
[3] | Tan JF, Miao ZY, Ren CZ, Yuan RX, Tang YJ, Zhang XR, Han ZX, Ma C. Evolution of intron-poor clades and expression patterns of the glycosyltransferase family, Planta, 2018, 247(3): 745-760 |
[4] | Miao ZY, Han ZX, Zhang T, Chen SY, Ma C. A systems approach to a spatio-temporal understanding of the drought stress response in maize. Scientific Reports, 2017, 7(1): 6590. |
[5] | Zhai JJ, Tang YJ, Yuan H, Wang LT, Shang HL, Ma C. A meta-analysis based method for prioritizing candidate genes involved in a pre-specific function. Frontiers in Plant Science, 2016, 7: 1914. |
[6] | Ma C, Zhang HH, Wang XF. Machine learning for Big Data analytics in plants. Trends in Plant Science , 2014, |
[7] | Ma C, Xin MM, Feldmann KA, Wang XF. Machine learning-based differential network analysis: a study of stress-responsive transcriptomes in Arabidopsis. The Plant Cell , 2014, 26(2): 520-537. |
[8] | Ma C, Wang XF. Application of the Gini correlation coefficient to infer regulatory relationships in transcriptome analysis. Plant Physiology , 2012, 160(1): 192-203. |
[9] | Ma C, Chen H, Xin MM, Yang RL, Wang XF. KGBassembler: A karyotype-based genome assembler for Brassicaceae species. Bioinformatics , 2012, 28(23): 3141-3143. |
