霹靂菩薩

石慕雲軍功赫赫，在戰場上殺人無數，自感罪孽深重，希望剃度出家，不料住持不願意收他為弟子，石慕雲只好自行剃度，改稱石頭和尚。

隋末朝廷黑暗，貪官污吏數不勝數。一日，一名黑衣女子刺殺坐轎而行的一個貪官，被其手下刺傷，石頭和尚出手救了她，並表示如此怎殺得盡貪官。黑衣女子卻道，她無父無母，無牽無掛，對這些貪官能殺一個是一個。石頭和尚被感動。後精通醫術的石頭和尚又救了一個身懷絕症的女子。兩名女子堅持要拜石頭和尚為師，石頭和尚無奈只得答應了，但他要求兩人放棄俗家名字，改名為阿舍、阿得，然後教阿舍武功，教阿得醫術。

石慕雲昔日好友——大將江成峯逐年老去，膝下有一子一女。兒子江小樓初掌兵權，得意非凡，犯下了一個致命的錯誤——濫殺無辜，屠殺趙村的所有村民，只有趙根死裏逃生，發誓要為全村人報仇。

江小樓自以為憑此戰功牢牢掌握了兵權，但威遠侯石濤暗中佈置一切要報復當年撤兵權之仇。石濤找來石驚天，請他去法場將趙根救出來，此時阿舍也同樣前去救趙根。在法場上，石驚天認出阿舍，協助她帶走趙根。

阿得救治趙根身上的傷，趙根向阿舍學習武術立志報仇。後來石驚天想查看趙根情況，遇上阿舍，與其比武。

由於趙根失蹤，江成峯被罷免兵權。

江小樓前去苦竹精舍看趙根，趙根與江小樓定下三個月之約，三個月後決一死戰。在與阿舍見面後，江小樓喜歡上阿舍。由於兵權落入石濤手上，石濤負有抓回趙根的責任，於是他讓石驚天抓回趙根。之後與阿舍在一起，表明自己所做並非自願，而是與石濤之間的三個約定。而後，石驚天向阿舍表白自己的心意，不料阿舍因為害怕受到傷害而居然拒絕。

石驚天誤以為阿舍對趙根有情而愁眉不展。苗疆兄妹冷炎、冷雨，雖是石驚天的手下，實情同兄妹，尤其是冷雨早已對主人暗生情愫。

石濤放了趙根，並讓他集合一隊人馬，要求他起義報仇，其真正目的是要打擊江成峯一家，並添加自己的軍功。

江小樓找阿舍並告白，但被阿舍拒絕，令江小樓受到相當大的打擊。

石頭和尚回憶當初在軍隊並放下屠刀的事。

被阿舍拒絕的江小樓認為一個黃毛丫頭都不把他放在眼裏，隨隨便便就拒絕了他，回家自暴自棄。小妹江小嬋勸他不能輕言放棄，要讓阿舍慢慢感覺他的好。

趙根找到同伴組成了義軍起義。

江小嬋找到趙根，表示願意犧牲自己，請求他放過兄長。不料趙根得到了她卻翻臉不認人，轉將江小嬋送給石濤。石濤拒絕，並留下江小嬋，請江成峯上門利用江小嬋失身的事羞辱江成峯。

江小嬋回到家裏，卻被父親江成峯以破壞家風為由趕了出去。江小嬋無處可去，本想自盡，後決定要報復於是活下來。江小嬋到苦竹精舍，聆聽石頭和尚講述佛理。最後留下自己的頭髮離開。

江小嬋找石濤，假意要找趙根報仇，做他的妾。江小樓找江小嬋，得知江小嬋不在，看到小妹留下的頭髮，誓要趙根報仇。石頭找趙根，責罵他。

管家要石濤利用江小樓試探小嬋的心。

江小樓因心繫大將軍之職，事事聽石濤之命。

趙根進攻縣城，江小樓想上石府商談戰事，意外發現小妹江小嬋竟在府上做妾。鬱悶的江小樓回到江府，告知父母。江成峯上門要女，石濤拒絕。

石濤派江小樓去平息戰事，江成峯細細囑咐。

趙根為保命，搶阿得做人質，防阿舍和石頭對自己下手。

石濤耍心機，派管家到江府謊稱江小樓已經戰死，江成楓被活活氣死，夫人徇情。石頭和尚氣憤至極，與阿舍夜闖侯爺府。三個月期限未到，石驚天不得不阻止了阿舍進侯府，卻阻擋不住武功高強的石頭和尚。但礙於普渡眾生的和尚身份，石頭和尚打傷了石濤，卻下不了手殺他。石濤大笑：阿舍可以殺他，卻被石驚天阻擋接近不了他；石頭和尚可以接近他，卻下不了手殺他。

惡戰終於開始，江小樓與趙根一一對決，約好決不牽聯手下。在兩敗俱傷以前，江小樓與趙根的仇恨終於化解，趙根決定隱居，不問世事；江小樓決定投奔李世民，真正幹一番大事業。

江小嬋假稱給石濤買藥，到了阿得所開的藥店內，終於得知自己雙親的慘死。她將一副祖傳的藥方交給阿得，阿得看出有一味藥不對，不願害人，但提醒江小嬋可去別處補上最後一味。江小嬋佩服阿得的醫術，抓完藥，回侯爺府煎藥。生性多疑的石濤並不接受江小嬋的藥，江小嬋自己先嚐了一口，石濤才終於喝下了毒藥。臨死之前，江小嬋穿上孝服，為父母發喪。狡猾多端的石濤怎麼也想不到自己竟死在一個不懂武功的弱女子手上。

阿舍與石驚天交往日深，併到了石驚天的家慕雲山莊，見過了石驚天的母親白玉。時下血玉觀音作祟，常常半夜外出抓了童男童女取其血練玄功。

白玉與阿舍十分投緣，希望兒子快點迎娶阿舍。但宋青雲和郭放因各自的私心不想白玉順遂心願，聯合密謀。郭放為調查阿捨身世，做救下小孩的戲博得阿舍阿得的敬意。從鐵蛋處得知石頭師父是石慕雲。

宋青雲找到冷雨，想利用冷雨分開阿舍與石。

阿得想去山莊看白玉，阿得想去，阿舍無奈同意。宋青雲勸冷炎放冷雨坦白感情，並令郭放成功被白玉打傷，中了血冥玄掌。

郭放得石頭和尚所救。

白玉的弟子郭放對阿舍一見鍾情，要求與石驚天公平競爭，三個月內不能得到阿舍芳心，石驚天才能迎娶阿舍。阿舍對石驚天遲遲不肯迎娶自己感到十分不解，繼而痛苦萬分。

白玉先是對兒子的“負心”行為十分痛恨，不知該以母親的身份對待還是以血玉觀音的身份來處理。

作為一個母親，她該寬恕孩子的過錯；可是作為血玉觀音，她最不能容忍負心漢。

郭放向阿舍坦白自己的感情，但被阿舍拒絕。

阿舍告訴白玉自己的師父俗名石慕雲時，白玉驚呆了——石慕雲正是她負心的丈夫，慕雲山莊的主人。因此，她拒絕石驚天再與阿舍來往。石驚天驚呆，對母親出爾反爾的態度不明所以。

石驚天與郭放決鬥，郭放失敗，但他告訴石驚天關於白玉的秘密。

石驚天依郭放所説到秘室證實了母親的身份。石頭因為不想因為自己導致阿舍錯過真愛，於是上門查明原因。但見到的女主人是白玉，明白了癥結所在。

由於白玉要重練武功，所以又抓小孩。在過程中，被阿舍與郭放遇上。當白玉處於下風時，石驚天出現救了白玉。阿舍責罵石驚天。

郭放雖為白玉弟子，其實從未練過玄功。慕雲山莊管家宋青雲偷偷抄錄一份玄功秘籍給郭放，要求他殺了石頭和尚。

白玉把所有事情都告訴了石驚天。

石頭把當年的往事告訴了阿舍與阿得。石驚天找石慕雲時打了一場架，並受了傷。白玉得知是石慕雲下的手，便找他算賬。

事後，白玉述説自己很後悔當初練武的事。宋青雲找給武功秘籍的郭放，查看練功情況。但武功大進的郭放卻一改往日的姿態，無法無天。

白玉與石頭和尚相見，實則兩人皆餘情未了。十多年的愛恨情仇交加，白玉見石頭和尚便大打出手，意外發現了石頭和尚懷中所藏的自己的木梳。石頭和尚表示當年毅然決定出家時並不知道白玉已經懷孕，真心請求白玉原諒。

宋青雲最不願意看到的事發生了：白玉與石頭和尚冰釋前嫌。郭放練成玄功，要殺石頭和尚，白玉犧牲了自己，與郭放同歸於盡。

石驚天堅持認為石頭和尚害死了母親，拒絕與他父子相認。他與阿舍的感情只好再度擱下。

阿得在給一家富貴人家看完病回家途中，目睹了一個女殺手從一户人家走出來，而她身　　後盡是屍體。阿得害怕會遭滅口，對一個不相識的過路男子叫了一聲“大哥”。

那人臉上有一條淺淺的疤痕，手拿佩劍，應該是一個武林高手。他似乎很不理解有個陌生女子開口叫他大哥，看到了女殺手才明白過來，便假裝和阿得非常熟　　悉。女殺手蒙着面，用很懷疑的目光看了男子一眼，才離開。

那名男子自稱“駱日”，向阿得介紹了許多江湖中的事情。他從小被師父收養，稱作落日，後來覺得自己應該有自己的姓，所以改稱駱日。阿得與相貌非凡的駱日一見傾心。

阿舍意外邂逅從前作為女飛賊時的師父於二娘，她已經嫁給了大善人張萬里。

當晚，殺手組織主人召集四大殺手——追風、逐月、駱日、向陽。由於五個人都蒙着面，殺手之間從來互不相識。為了避免互　　相打殺，殺手主人要求四個人摘下面紗。逐月的直覺沒有錯，那日遇見的男子果然是駱日。

逐月明知作為一個殺手，是不該有感情的，但她還是不可自拔地愛上了駱日。她告訴阿得駱日是一個殺手，以為這樣就可以讓阿得死心。

阿得發現了駱日其實是一個殺手的事實，傷心不已，她要求駱日為了她不要再當一個殺手，不要再殺人。駱日同意，阿得帶他離開。

逐月瞞着主人找到苦竹精舍，勸駱日迴歸組織，不然被主人找到是沒有好下場的。主人命令追風找出駱日。阿舍回苦竹精舍找到了下落不明的阿得，並發現了駱日，也發現阿得喜歡上了他，阿舍為阿得的身體有些擔憂，怕承受不住感情的起落。阿得向阿舍隱瞞了駱日的真實身份，阿舍離開。石頭告訴阿舍他猜測於二娘是殺手首領，阿舍不願相信。

石頭找張萬里，告之其懷疑對象，張萬里表示不可能。事後，張萬里化身為主人派向陽認於二娘為主人，在石頭及眾人面前讓大家相信於二娘是殺手組織的主人，令心高氣傲的於二娘負氣出走。

阿舍回苦竹精舍，發現駱日卻時時有警惕之心，環顧四周，讓阿舍懷疑他是殺手組織派來的奸細。阿舍對駱日三番四次試探，確認駱日對阿得是真心的，她要求駱日供出殺手組織主人，駱日卻回答從未見過主人的面容，更不知道他的身份，只知道主人是男人，並非女人。阿舍便要他去見師父。

石頭和尚告訴阿舍，其實案件毫無頭緒，所以才暫時委屈於二娘，不料張萬里的舉動露出了馬腳。於是殺手主人毫無疑問便是張萬里。殺手主人挾持了阿得，由逐月看管，要求駱日重回組織。駱日無奈之下答應。

駱日迴歸組織後，請逐月保護阿得。

於二娘撞見殺手主人，瞧着背影有些眼熟，想再仔細看，不料驚動了組織，在殺手主人命令下，手下沒有下殺手。之後阿舍告訴於二娘，石頭和尚懷疑是張萬里。於是於二娘回到家裏，質問張萬里，但張萬里矢口否認。深信不疑的於二娘向丈夫坦陳自己對曾經懷疑張萬里才是殺手主人的想法慚愧不已，張萬里聽了表情意味深長。

阿舍決定查出真相，於是跟蹤駱日，不料追風假扮成一個叫花子，纏住阿舍。追風用阿舍施捨的銀子買酒買肉，阿舍毫不客氣地喝完了酒。追風不由得欣賞起這個充滿豪情的女子。 　　殺手主人要求追風、向陽和駱日把阿舍引入樹林滅口，追風和駱日詐敗，放了阿舍一條生路。駱日瞧出端倪，和追風苦中作樂，把酒言歡，成了彼此生平第一個好友。

隨後殺手主人要追風、駱日、向陽聯手，殺了張萬里、於二娘一家。此時石頭和尚與阿舍也在，合力打敗三大殺手，但阿舍還是放了他們，還追風一個人情，並告訴師父：追風與駱日一樣，有向善之心。

受了重傷的向陽告訴追風、駱日，他發現張萬里與師父有着一雙一模一樣的眼睛。追風、駱日明白過來，殺手主人這次任務的目的是要殺人滅口，一舉殺死他們三個，於是決定反抗到底。但愚忠的向陽偷偷回到了主人身邊繼續賣命。

受到阿得善良的心的感染，逐月放了阿得。而向陽認主人為義父。駱日突然想起一件事，師父可能是殺人兇手，並從石頭和尚知道了漠北雙鷹，張萬里是金鷹。駱日執意去報仇，石頭和尚也沒有辦法讓他放下仇恨。

駱日替追風向阿舍表達感情，阿舍表示驚訝。阿舍找於二娘，引導話題到鷹形圖案，問她是否見過有這樣圖案的人。於二娘説不出話，隨後找張萬里質問，而張萬里的向善令於二娘原諒。

逐月接受主人的指令去殺石頭，被阿舍制服。逐月覆命，被主人控制，並用逐月的生命威脅駱日、追風等人找他。阿舍找於二娘，指責張萬里的種種惡行，卻暗中被張萬里下藥控制做其護身符，避免被石頭和尚殺死。於二娘同樣中了藥，極力想阻止張萬里。向陽帶着主人的命令通知了駱日和追風。當駱日與追風告訴向陽關於仇家是張萬里的事，但向陽仍效忠張萬里。

駱日和追風找主人，經過一番打鬥，但不敵前來的石頭和尚，張萬里逃走前擊傷了逐月。逐月傷重過世。

追風、駱日在劍上淬上劇毒，要與張萬里同歸於盡，但無奈功力相差太遠，毒劍連張萬里的衣角都沾不到，駱日和追風都被打傷。之後石頭和尚趕來，打傷了張萬里，但因不殺的信念，沒有下殺手。但於二娘痛苦地撿起駱日的劍，殺了張萬里，然後自殺。

駱日因中毒救治無效，與阿得做最後的話別。追風為了救自己深愛的阿舍，身中長槍而死。

石頭和尚在慕雲山莊外頌經百日，為白玉超度。石驚天始終不與他説話，也不准他踏進慕雲山莊半步。宋青雲一心要為白玉報仇，處心積慮要殺石頭和尚。僥倖逃生的向陽逃到漠北，找到“金鷹”張萬里的師兄——“赤鷹”莫如風，也要找石頭和尚報仇。

夾在師父與石驚天中間，阿舍倍感為難，而自從駱日死後，身患絕症的阿得病情日益嚴重，但為了不讓大家擔心強作鎮定。

宋青雲擔心血濃於水，石驚天與石頭和尚遲早要相認，希望早些下手除掉石頭和尚，暗中與莫如風聯手。

一日，冷炎、冷雨離開山莊採購日常用品，宋青雲要向陽殺了他們，以剪除石驚天的雙翼。

冷炎、冷雨聯手，向陽怎會是對手。眼看就要落敗，莫如風出現，驚異的冷氏兄妹叫了一聲“師父”。宋青雲得知這些關係，改變計劃，便以石驚天的生死為要挾，　　要求冷炎、冷雨配合。冷炎、冷雨只要求主人安全，不違抗師父，便答應下來。

宋青雲一邊讓自己的侄女巧兒混進苦竹精舍，監視石頭和尚，一邊又讓莫如風易容成　　石頭和尚，利用石頭和尚頌經、懺悔的時間差在阿舍、阿得面前為非作歹，一劍穿心殺死向陽。

巧兒感受到阿舍、阿得的關懷，對兩位姐姐真心相待。

阿得看到石頭和尚殺死向陽，病情更加嚴重。阿舍傷心之下，把阿得內心埋藏的事全都説出來，由此打開了阿得的心結，身體奇蹟般地好了很多。

宋青雲問巧兒為何對阿舍和阿得產生感情，巧兒表示不明白，因為當初宋青雲沒有告訴她全盤計劃，目的是什麼，宋青雲仍然不説，巧兒只得按照宋青雲指示去做。

當阿得的病好了，回醫館做生意。

冷雨穿着漢服向石驚天表白，但被石驚天拒絕。石頭和尚見此，道出感情不可勉強的事。石驚天慢慢冷靜下來，終於放下架子，允許石頭和尚進慕雲山莊，但一聲“爹”始終無法叫出口。

石頭和尚離開回到苦竹精舍，而假和尚莫如風在石頭和尚還未到達、阿得回來時強暴了巧兒，阿得看到之後十分震驚，跑了出去直説不相信，等到她回來發現巧兒已死。此事令阿舍阿得對師父存有芥蒂。

宋青雲要冷炎兄妹殺老禪師，正巧石頭和尚出現捉住了二人，石頭和尚問他們為何要這麼做，可二人偏偏不回答。石頭和尚追查真相，於是綁着二人到玉雲山莊問石驚天。

阿舍、阿得誤會師父走火入魔，自己犯下的錯還不知道。阿得怕師父再幹下什麼錯事，終於下手，給石頭和尚下了化功散。石頭和尚幾十年內力灰飛煙滅。

石頭髮現自己無力動彈，明白了是阿舍阿得下的手。於是問原因，才知道自己離開的時候，有人假扮他做了許多不該做的事。但阿舍和阿得不相信石頭和尚的話。但阿得看到師父的虛弱，深感內疚。

由於石驚天站在石頭和尚一方，莫如風計劃去除掉他，但被打敗。

阿舍看到石驚天留下的書信，回到玉雲山莊見石驚天，才知道事情的真相，錯怪了師父。

而石驚天被莫如風抓住軟禁，逃離的冷炎兄妹到苦竹精舍想請石頭幫忙出手救石驚天。

阿得為了恢復石頭的武功，埋下心病。冷炎兄妹知道武功恢復不了，於是回頭自己去救石驚天。

為了救石驚天，冷雨把石頭失去武功的事告訴師父莫如風，但莫如風怕被騙，強迫冷炎吃下毒藥，讓他留下，帶走了冷雨。莫如風發現石頭不見，打傷了冷雨，而此時冷炎帶走了石驚天，由於沒有解藥，冷炎不治身亡。

經過阿得的全力施救，毒藥雖解，功力卻無法再恢復了。阿得後悔莫及，石頭和尚卻看得很開。

在極度壓抑之下，阿得舊病復發，交代完後事，終於安然地走了。

冷炎、冷雨不再相信宋青雲的詭計，不願加害石頭和尚，冷炎被害死，冷雨逃了出來，想為兄長報仇，終究還是死於宋青雲的機關之下。

石驚天分析之下，得出宋青雲才是殺害白玉的兇手的結論：因為只有宋青雲才有可能將玄功秘籍抄給郭放。宋青雲大失驚色，多年愛慕白玉的念頭表露無遺，陰謀詭計也隨之敗露。石頭和尚失去功力之後，阿舍、石驚天聯手仍不是莫如風的對手。

關鍵時刻，莫如風想先殺了宋青雲這個詭計多端的人為自己的師侄向陽報仇，不料還是晚了，宋青雲早已誘他喝下有劇毒的酒，宋青雲一吹簫，莫如風精神失常而亡。

宋青雲自己也因為被石驚天指責為害死白玉真兇而精神錯亂。石頭和尚帶着宋青雲離開了。阿舍與石驚天有情人終成眷屬。

經過了一切，感受了親情、友情、愛情、師徒之情，石頭和尚終於真正跳出三界外，不在五行中，修得正果。