陸上總隊司令部

5個方面隊中，防衞省計劃取消負責關東地區防衞的東部方面隊，把陸上總隊司令部設在關東。防衞省設想把東部方面隊的第1師團（司令部位於東京都練馬區）升格為獨立的“首都防衞集團”，負責東京一帶的防禦，應對恐怖活動及游擊隊攻擊。相關人士表示，陸上總隊將受防衞相的指揮，統籌首都防衞集團與4個方面隊的行動。原屬東部方面隊的第12旅團（羣馬縣榛東村）將併入東北方面隊（仙台市）。北部（札幌市）、東北、中部（兵庫縣伊丹市）和西部（熊本市）4個方面隊將維持現狀。

按照指揮流程，防衞相在緊急情況下指揮陸海空三個自衞隊時，針對航空自衞隊和海上自衞隊分別通過“航空總隊司令部”和“自衞艦隊總隊司令部”下達命令。