鐵證懸案~真實之門~

1996年，19歲少年工藤順一抱着寫有“爸爸、我是自由的”的書信在自家門前斃命。當時搜查遇到了困難，這個案件就成了未解決事件。直到現在，神奈川縣警捜査一課刑警石川百合接到一名外國人女性的訪問，她坦白説“1996年我看到了殺人的場面”。百合與代理課長本木、立川、金子和剛調職不久的高木一起，開始為搜查尋找新的證據。

2015年，一對母女從位於鶴見區的公寓窗户墜落，6歲的女兒當場死亡，母親比嘉瞳雖然保住了性命，卻陷入了昏迷狀態。玄關的門被推開，有人目擊到案發後從公寓跑出去的南米系男子的身影。雖然以搶劫犯罪的方式進行了調查，但沒有任何進展，最終還是未能破案。但在此後的1年，以母親比嘉奇蹟般地醒來為契機，事件再次開始調查。

1995年8月，神户地方檢察廳的檢察官西尾智人在距離神户300多公里的橫濱被刺殺。西尾當時負責作為阪神淡路大地震的復興志願者來到災區的女大學生，被17歲不良少年殺害的事件。在那之後過了21年，西尾的妻子現在才因對丈夫被懷疑貪污一事抱有疑問，來到本木的身邊。

2004年6月，小川理紗在神奈川縣郊外的便利店工作，因丈夫的暴力而痛苦不堪，她對女兒説，如果爸爸來了就躲到櫃子裏，之後就這樣失蹤了。過了12年之後的2016年，鳥獸保護區的森林裏發現了無頭屍體，她就是發出搜索請求的小川理紗。在同一地點又發現了8具無頭屍體，看到前所未聞的獵奇野蠻殺人事件，百合等人高度緊張起來。

搜查一課收到寫有“計劃”的紙張，上面寫着“開央學院”、“1無視、2獎勵、3秘密、4測試、5升級、6破壞”、“2012年7月16日內藤貴一”。開央學院是一所全寄宿制精英男子學校，創立至今未發生過一起殺人事件。但是在2012年7月16日，發生了教師內藤貴一因醉酒而溺死的事故，百合等人沿着“計劃”的情報線索展開調查。

1950年8月，在橫濱本牧的車屋內發現了韓國人女性高秀珍的屍體，死因是被毆打後窒息死亡。她在以美國佔領軍士兵為服務對象的妓院工作，推測是被來往的客人殺害，但因沒能確定犯人成為未解決事件。之後的66年，她的孫女金井美紀在母親的遺物中發現了祖母的信，信上寫着一句話。

1997年，一名就讀於名門女子中學校的少女在郊外的蓮花池被發現，她的屍體上寫着叉印。19年之後，在同一個地點，發現了同樣寫有叉印的女性屍體。就在這時，一名自稱殺害了該女性的男子被警方逮捕，他是19年前被發現的少女的哥哥瀨谷聖。該男子否認19年前殺害少女的事實，但他開始講述一個秘密。

1999年除夕夜，每個人都興高采烈。在慶祝千禧年煙花綻放的過程中，要與妻子和親友們舉行倒計時派對的柏原隆介因肇事逃逸事故而死亡。16年之後，去參加戒酒會的女性坦白説，在千禧年的夜晚酒會駕駛撞死了人。為了調查案件的關聯性，百合等人找到並拜訪了被害者的妻子真由美，真由美現已與被害者的好友三島武司再婚了。

神奈川縣內發生了3名男女兒童被裝箱遺棄屍體的事件，百合等人根據本木的指示決定重新調查46年前與本案件類似的未解決事件。在森林中發現身份不明的少年被裝箱遺棄屍體的該事件，當時轟動了全世界。這時，搜查一課收到了寄件人不明的箱子，裏面有一張46年前身份不明少年的尋人啓事傳單和照片，照片上印有“聖母兒童之家”的字樣。

在佇立郊外的房屋庭院中發現了9個頭蓋骨，百合看着嵌在頭蓋骨眼窩裏的玻璃球，想起了2個月前連環殺人事件的嫌疑犯赤松，他因證據不足而被釋放後失蹤。30年前在這所房屋裏被射殺的是赤松的母親靜子，這些頭蓋骨都抬頭望着母親被殺的房間，讓百合感到很奇怪。這時，一個電話打來了。