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鄭基深

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鄭基深，博士生導師，中國科學技術大學生命科學與醫學部 教授，合肥微尺度物質科學國家研究中心 研究員，中國科學技術大學第一附屬醫院 特聘專家。主要研究方向是蛋白質合成生物學。基於化學、生物學與信息學等學科交叉，發展人工化學、生物系統和人工智能輔助的蛋白進化新技術，突破天然限制，製造新功能蛋白質（抗體、酶、蛋白材料等）， 應用於基礎生物學、生物醫學、生物製造與材料學等。近年來以通訊作者在J Am Chem Soc、Angew Chem Int Ed、Nature Protocols、Acc Chem Res等期刊發表研究成果50餘篇，作為課題負責人獲得國家基金委優秀青年基金、基金委重大研究計劃培養項目和科技部重點研發計劃課題等基金資助。 [1] 
中文名
鄭基深
國    籍
中國
民    族
漢族
出生地
廣西桂林
畢業院校
中國科學技術大學
學位/學歷
博士
專業方向
蛋白質合成生物學

目錄

  1. 1 個人經歷
  2. 2 主要研究方向
  3. 3 發表論文

鄭基深個人經歷

教育經歷：
2002年-2006年，中國科學技術大學化學與材料科學學院，本科；
2006年-2012年，中國科學技術大學化學系，博士；
工作經歷：
2012年-2014年，清華大學生命科學聯合中心，博士後；
2014年-2016年，中國科學院合肥物質科學研究院，副研究員；
2016年-2020年，中國科學技術大學生命科學與醫學部，研究員；
2021年-，中國科學技術大學生命科學與醫學部，教授。

鄭基深主要研究方向

（1）綜合生物/化學合成以及人工智能等學科交叉，發展噬菌體輔助的功能蛋白質進化新技術；
（2）基於蛋白質進化新技術，快速獲得多肽/蛋白類藥物分子（例如環肽和抗體分子）和新型工業酶；
（3）開發基於功能化蛋白質的仿生、生物醫用、信息存儲等材料。

鄭基深發表論文

1. Shi, W. W.; Shi, C.; Wang, T. Y.; Li, Y. L.; Zhou, Y.K.; Zhang, X. H.; Bierer, D.; Zheng,J. S.*; Liu, L.*, TotalChemical Synthesis of Correctly Folded Disulfide-Rich Proteins Using aRemovable O-Linked beta-N-Acetylglucosamine Strategy. J Am Chem Soc 2022, 144 (1), 349-357.
2. Li, Y.;Heng, J.; Sun, D.; Zhang, B.; Zhang, X.; Zheng, Y.; Shi, W. W.; Wang, T. Y.;Li, J. Y.; Sun, X.; Liu, X.; Zheng,J. S.*; Kobilka, B. K.; Liu, L.*, Chemical Synthesis of aFull-Length G-Protein-Coupled Receptor beta2-Adrenergic Receptor with DefinedModification Patterns at the C-Terminus. J Am Chem Soc 2021, 143(42), 17566-17576.
3. Huang,D.-L.; Li, Y.; Liang, J.; Yu, L.; Xue, M.; Cao, X.-X.; Xiao, B.; Tian, C.-L.;Liu, L.; Zheng, J. S.*, TheNew Salcylaldehyde S,S-Propanedithioacetal Ester Enables N-to-C SequentialNative Chemical Ligation and Ser/Thr Ligation for Chemical Protein Synthesis. J Am Chem Soc 2020, 142 (19), 8790-8799.
4. Huang,D. L.; Montigny, C.; Zheng, Y.; Beswick, V.; Li, Y.; Cao, X. X.; Barbot, T.;Jaxel, C.; Liang, J.; Tian, C. L.; Jamin, N.; Zheng, J. S.*.Chemical Synthesis of Native S-palmitoylated Membrane Proteins throughReversible Backbone Modification Assisted Ser/Thr Ligation. Angew Chem Int Ed 2020, 59(13), 5178-5184.
5. Qu, Q.;Gao, S.; Wu, F. M.; Zhang, M. G.; Li, Y; Zhang, L. H., Donald Bierer, Tian, C.L.*, Zheng, J. S.*; Liu, L.*, Synthesisof disulfide surrogate peptides incorporating large-span surrogate bridgesthrough a native chemical ligation-assisted diaminodiacid strategy. Angew Chem Int Ed 2020, 59 (15), 6037-6045.
6. Zhang,B.; Deng, Q.; Zuo, C.; Yan, B.; Zuo, C.; Cao, X. X.; Zhu, T. F.; Zheng, J. S.*; Liu, L.*,Ligation of Soluble but Unreactive Peptide Segments in the Chemical Synthesisof Haemophilus Influenzae DNA Ligase. Angew Chem Int Ed 2019, 58, 12231-12237.
7. Qi,Y.-K.*; Si, Y.-Y.; Du, S.-S.; Liang, J.; Wang, K.-W.*; Zheng, J. S.*, Recent advances in thechemical synthesis and semi-synthesis of poly-ubiquitin-based proteins andprobes. Science China Chemistry 2019, 62 (3), 299-312.
8. Guo,Q. Y.; Zhang, L. H.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Wang, Z. A.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.*,Channelactivity of mirror-image M2 proton channel of influenza A virus is blocked byachiral or chiral inhibitors.Protein Cell 2019, 10, 211-216.
9. Tang, S.; Liang, L. J.; Si, Y. Y.; Gao, S.; Wang, J. X.; Liang, J.; Mei, Z.; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Practical Chemical Synthesis of Atypical Ubiquitin Chains by Using an Isopeptide-Linked Ub Isomer. Angew Chem Int Ed 2017, 56, 13333-13337.
10. Tang, S.; Zuo, C.; Huang, D. L.; Cai, X. Y.; Zhang, L. H.; Tian, C. L.*; Zheng, J. S.*; Liu, L.* Chemical Synthesis of Membrane Proteins via the Removable Backbone Modification Method. Nature Protocols 2017, 12, 2554-2569.
11. Li, J. B.; Tang, S.; Zheng, J. S.*; Tian, C. L.*; Liu, L.* Removable Backbone Modification Method for the Chemical Synthesis of Membrane Proteins. Acc Chem Res 2017, 50, 1143-1153.
12. Li, J.; He, Q.; Liu, Y.; Liu, S.; Tang, S.; Li, C.; Sun, D.; Li, X.; Zhou, M.; Zhu, P.; Bi, G.; Zhou, Z.; Zheng, J.-S.*; Tian, C.* Chemical Synthesis of K34-Ubiquitylated H2B for Nucleosome Reconstitution and Single-Particle Cryo-Electron Microscopy Structural Analysis. ChemBioChem 2017, 18, 176-180.
13. Zheng, J.-S.; He, Y.; Zuo, C.; Cai, X. Y.; Tang, S.; Wang, Z. A.; Zhang, L.-H., Tian, C.-L.*; Liu, L.* Robust Chemical Synthesis of Membrane Proteins through a General Method of Removable Backbone Modification. J Am Chem Soc 2016, 138, 3553-3561.
14. Zuo, C.; Tang, S.; Si, Y.-Y.; Wang, Z. A.; Tian C.-L.; Zheng J.-S.* Efficient synthesis of longer Aβ peptides via removable backbone modification. Org Biomol Chem 2016, 14, 5012-5018.
15. Qi Y.-K.; Tang S.; Huang Y.-C.; Pan M.; Zheng J.-S.*; Liu, L.* Hmb(off/on) as a switchable thiol protecting group for native chemical ligation. Org Biomol Chem 2016, 14, 4194-4198.
16. Chen, X. Tang, S.; Zheng, J. S.; Zhao, R.; Wang, Z. P.; Shao, W.; Chang, H. N.; Cheng, J. Y.; Zhao, H.; Liu, L.*; Qi, H.* Chemical Synthesis of a Two-Photon-Activatable Chemokine and Photon-Guided Lymphocyte Migration in vivo. Nature Commun 2015, 6, 7220-7228.
17. Qi Y.-K.; Chang H.-N.; Pan K.-M.; Tian C.-L.; Zheng J.-S.* Total Chemical Synthesis of the Site-Selective Azide-Labeled [I66A]HIV-1 Protease. Chem Commun 2015, 51, 14632.
18. Zheng, J.-S.; Yu, M.; Qi, Y.-K.; Tang, S.; Shen, F.; Wang, Z.-P.; Xiao, L.; Zhang, L.; Tian, C.-L.*; Liu, L.* Expedient Total Synthesis of Small to Medium-Sized Membrane Proteins via Fmoc Chemistry. J Am Chem Soc 2014, 136, 3695-3704.
19. Zheng, J.-S.; Tang, S.; Qi, Y.-K.; Wang, Z.-P.; Liu, L.* Chemical Synthesis of Proteins Using Peptide Hydrazides as Thioester Surrogates. Nature Protoc 2013, 8, 2483-2495.
20. Zheng, J.-S.; Tang, S.; Huang, Y.-C.; Liu, L.* Development of New Thioester Equivalents for Protein Chemical Synthesis. Acc Chem Res 2013, 46, 2475–2484.
21. Zheng, J.-S.; Chang, H.-N.; Wang, F.-L.; Liu, L.* Fmoc Synthesis of Peptide Thioesters without Post-Chain-Assembly Manipulation. J Am Chem Soc 2011, 133, 11080-11083. [1] 
參考資料
  • 1.    師資隊伍  ．中國科學技術大學生命科學學院．2022-01-05[引用日期2022-05-29]