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迴文序列
鎖定
- 中文名
- 迴文序列
- 外文名
- Palindromic sequence
- 存在位置
- DNA、RNA、多肽
迴文序列釋義
如果一個(單鏈)核苷酸的序列和它的反向互補鏈的序列一樣,那麼這個核苷酸序列就是迴文序列。迴文序列結構不僅在DNA中存在,在RNA中也常因鹼基的互補而常出現類似的結構,有利於穩定RNA的結構和行使功能
[1]
。迴文序列也經常出現在組成蛋白質的肽序列中,但它們在蛋白質功能中的作用尚不清楚
[2]
。
迴文序列特徵與功能
迴文序列特徵
有對稱中心。例如,DNA序列ACCTAGGT之所以是迴文序列,是因為它的互補序列是TGGATCCA,而反向互補序列是ACCTAGGT,和其原來序列一致。
迴文序列功能
(1)是限制性內切酶的識別位點;
(2)具有調節基因的表達作用,如色氨酸操縱子的前的弱化子;
(3)轉錄終止時的識別結構;
(4)基因工程的"手術刀"。
迴文序列例子
迴文序列限制性酶切位點
迴文序列在分子生物學中起着重要的作用。許多限制性內切酶能識別特定的迴文序列並切割它們。比如,限制性內切酶EcoR1識別以下回文序列:
5'- G A A T T C -3'
3'- C T T A A G -5'
迴文序列甲基化位點
迴文序列也可能有甲基化位點。這些是甲基可以附着在迴文序列上的位點
[3]
。
迴文序列T細胞受體中的迴文核苷酸
T細胞受體(TCR)基因的多樣性是通過從其生殖系編碼的V、D和J段重新排列後的插入核苷酸而產生的。在V-D和D-J連接處的核苷酸插入是隨機的,但其中的一些小的子集插入是例外,一到三個鹼基對反向重複生殖系DNA的序列。這些短的互補的迴文序列稱為P核苷酸
[4]
。
- 參考資料
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- 1. Larionov, S., Loskutov, A., Ryadchenko, E .Chromosome evolution with naked eye: palindromic context of the life origin :Chaos,2008:18 (1), 013105
- 2. Giel-Pietraszuk, M., Hoffmann, M., Dolecka, S., Rychlewski, J., Barciszewski, J .Palindromes in proteins. :J. Protein Chem,2003:22 (2), 109–113
- 3. Elhai, J. Highly iterated palindromic sequences (HIPs) and their relationship to DNA methyltransferases:Life,2015:5(1), 921-948
- 4. Srivastava, S.K., Robins, H.S .Palindromic nucleotide analysis in human T cell receptor rearrangements: PLOS ONE, 2012:7 (12), e52250