軍府制

1644年，滿清入主中原，定都北京。東北是滿族故鄉，是皇朝的“肇邦之地”，在統治上採取有別於中原地區“行省制”的“軍府制”，以軍府建制統治東北。 ^[1]  設有黑龍江將軍，吉林將軍和盛京將軍。

清政府在烏魯木齊設都統，都統與將軍品級相當。在伊犁、塔城、喀什設參贊大臣。喀什參贊大臣全稱“總理回疆事務參贊大臣”，其駐地曾一度從喀什遷往烏什和葉爾羌。清政府在新疆的軍事指揮系統分為北路、南路、東路三部分。在北部的伊犁、塔城；在南路的葉爾羌（今莎車）、喀喇沙爾（焉耆）、和田、喀什、阿克蘇、庫車、英吉沙、烏什；在東路的吐魯番、哈密、鎮西（今巴里坤）、古城（今奇台）、庫爾喀喇烏蘇（今烏蘇）等城，設立領隊大臣、辦事大臣或協辦大臣。各級大臣負責統率各地駐防清軍，監督管理各地政權。北路各級大臣受伊犁、塔城參贊大臣節制；南路各級大臣受喀什參贊大臣節制；東路各級大臣受烏魯木齊都統節制。全疆各級大臣都受伊犁將軍統轄。 ^[2] 

清朝在外蒙古設立烏里雅蘇台將軍（定邊左副將軍）管轄喀爾喀蒙古（外蒙古）。

軍府制在新疆的設立，對於鞏固西北邊防，抵抗沙俄侵略，穩定社會秩序，防止分裂割據，維護國家統一，發揮了重大作用。