足跡法

用於檢測與特定蛋白質結合 的DNA序列的部位,可展示蛋白質因子同特定DNA片段之間的結合區域。其原理為：DNA和蛋白質結合以後便不會被DNase分解，在測序時便出現空白區(即蛋白質結合區)，從而瞭解與蛋白質結合部位的核苷酸對數目。再用酶移除蛋白質，又可測出結合處的DNA序列。

全稱為DNA footprinting ,又稱DNA足跡法或DNA足紋技術，能鑑定啓動子區域特殊位點的功能。