英雄第二季

　　在埃及一所大學演講的Mohinder得到了一個工作機會，提供他這個工作的人擁有把物體變成黃金的能力。Claire父女隱姓埋名開始了新的生活。洪都拉斯，一對兄妹正在逃避追蹤，他們妹找了人蛇，企圖偷渡到美國，他們的命運又將如何呢。Hiro穿梭時空回到1671年的日本，利用時間停止的能力帶走了一個拿着聖劍的武士，但他並非劍聖，正在Hiro為自己可能已經改變歷史而感到恐慌時，鑄劍師的女兒又在此時出現了。Matt用了讀心術順利通過警察考試，得到了新的警徽。Molly最近噩夢不斷，Molly畫得的圖更是讓人驚心。Ando拿着報紙去見 Hiro的父親，Hiro的父親打開報紙，一張他的照片翩然落下，照片中他的臉上已經被印上了那個反覆出現的標記，他説自己活不到24小時。Nathan為Peter的死而頹廢，他也收到了和Hiro父親同樣的照片。Bennet一家的晚餐，被一個電話打擾了，打電話的人居然是遠在開羅的Mohinder，到底他們設了怎樣的圈套，又抱着什麼目的呢。Claire的新同學擁有飛行的能力，並且知道Claire與眾不同。失去記憶的Peter被縮在集裝箱裏面，他連自己是誰都不知道。

　　皮特被那三個想偷MP3播放器的人囚禁了起來。那三個人沒有偷到MP3無法向上面的老大交貨，老大派人來想搶走三個小偷其中一個的妹妹。皮特運用超能力擊退了他們，但小偷不僅一點不感激，還用一個裝着記錄着皮特身份資料的盒子威脅皮特幫他們再偷一批貨物好讓他們交差。克萊爾永遠都無法抑制對自己擁有的超能力的好奇。她在生物課上的發言使得她的那位男同學又纏上了她。看過老師在課堂上演示的蜥蜴腿再生錄像以後，克萊爾回到家剪斷了自己的腳趾，幾秒鐘後腳趾又長回來了，不妙的是這一幕剛好被她的同學看到。馬特在調查中村謀殺案的時候傳訊了佩麗的母親，佩麗的母親察覺到馬特有讀心的能力。佩麗到警察局來保釋母親的時候，他母親突然開始發狂，平靜下來以後手上握着一張自己的照片，上面被標上了那個神秘的符號。莫希德接受了公司的工作，前往海地救一個被病毒感染的人(第一季中的海地人)。莫希德給海地人注入自己血清救好了他，最後卻被洗腦。逃難的兄妹準備偷渡到墨西哥，找到他們以前的一個朋友幫忙。但在偷渡的過程中瑪雅不受控制的能力又開始發揮作用，差點害死了他們的朋友。中村回到古代日本代替劍聖完成了他的使命，並説服了劍聖戒酒創造屬於自己的歷史，卻發現劍聖有和克萊爾一樣的能力。痊癒後的海地人回到克萊爾父親的身邊，準備去找到伊薩克所有的畫。

　　賽拉(Sylar)的迴歸，可是我們的惡魔王子非但沒有從上一季的劍傷中恢復過來，而且失去了所有的超能力，包括他竊取其他超能力的學習能力。彼得(Peter)因為那個存有他的身份及過去的木盒為黑幫賣命，搶劫了賭球中心的運鈔車，並在叛徒的槍口下救得小頭目的性命。但我們也看到了彼得身上存在的陰暗一面，這也讓他選擇了迴避自己的過去。中村寬幫助劍聖迴歸了正統歷史，同樣因愛上了鑄劍師的女兒而放棄了迴歸現代。莫欣德(Mohinde)又回到了茉莉(Moli)的身邊，而且組織給他設置的實驗室居然是在預言畫家的家中，他幫助本內特(眼鏡男)找到了最後一幅畫的內容。DL已經死了，尼基(Niki)患上了海地人一樣的病，她將麥加寄養在陌生人的家中，向組織求醫。克萊爾(Clair)延續上一集的“蜥蜴”腳趾甲事件繼續和Wist糾纏，而Wist也向她展示了飛翔能力，原來他們都是超能力者。Wist脖子上的傷口和莫欣德發現的圖畫內容讓克萊兒一家陷入陰影的籠罩之中。

　　克萊爾的養父知道了第八幅畫中的內容——他被殺死，畫的陰暗處克萊爾與一位男子在擁吻。因此他知道只有阻止克萊爾約會，才能阻止這件事情的發生。當養父暗示克萊爾這個時候不應該交男友時，克萊爾答應了。但是愛情的力量是偉大的，在貝弗利山上的浪漫一夜後，克萊爾決定暗地約會。瑪婭一行還在奔往美國的路上，途中他們遇到一個暈倒在地的男子——賽拉！塞拉發現Maya和她弟弟的能力後，又開始醖釀陰謀了。出現了一個新的能力者，是麥加所寄養的那户人家中的大女兒，她只要看一眼，就可以學會她想學的東西。馬特來到內森的家中，找到了那兩張碎照片的完整版。馬特驚訝的發現，在他十三歲時就離開他的父親竟然也在照片中。他讓茉莉幫忙找到他的爸爸，誰知茉莉一看到照片就驚叫了起來，原來馬特的爸爸就是一直出現在茉莉夢中那個人。茉莉最後還是決定要幫助馬特，剛找到就被他爸爸發現了，茉莉陷入了昏迷中。

　　茉莉被馬特的父親用超能力困在了夢境中，情況非常危險。這一集一開始，馬特就和內森一起找到了馬特的父親，卻被其欺騙，困在了可怕的幻境中。彌迦幫助莫妮卡發現了自己的能力，莫妮卡開始進行有針對性地訓練，她希望能夠做一番事業。遠在愛爾蘭的彼得仍然沉浸在愛河裏，但是好景不長，公司派出了一個狠角——擁有電能力的艾勒來找彼得。艾勒一出場就殺死了彼得情人的大哥，看來後面免不了有場惡仗。莫欣德發現茉莉的身體正在衰竭，萬般無奈之下只好求助公司，公司答應照顧好茉莉，但要求莫欣德繼續執行任務。中村繼續在古時代的日本幫助劍聖，這一集中，他們即將開始對抗白鬍子軍團。

　　彼得與女友決定一起到加拿大蒙特利爾把事情弄清楚。他們來到了彼得畫中的地方，一進去就發現了一張留給彼得的字條，上面説世界正處於危險中，彼得抱着女友，心中非常希望知道未來到底發生了什麼，結果他就身體內的時空轉移能力讓他倆到了2008年6月14日的紐約，這時的紐約早已是空城。克萊爾希望能加入啦啦隊，但是啦啦隊隊長黛比卻故意刁難，不讓她加入。克萊爾的男友幫她出了主意，兩人聯手讓黛比當眾出醜，結果黛比被撤掉了啦啦隊隊長的職位，克萊爾順利進入啦啦隊。貝內特先生與海地人來到了莫斯科，找到了伊凡，用消除他的記憶威脅他，從他那裏逼供出了那八幅預言畫的所在地。最後貝內特更是狠毒的把伊凡槍殺。在古時候的日本，中村寬所愛的女人發現了之前救她的人都是中村，他們倆在森林裏擁吻，卻被劍聖撞見，劍聖一怒之下投靠了白鬍子陣營。莫欣德不肯幫助公司在人體試驗病毒，本想離開公司，但是公司突然轉變態度，向莫欣德道歉，以新的計劃來誘使他留下來。結果卻派了妮基與他合作，其實是想用妮基來試探莫欣德的忠誠。　　賽拉與兩兄妹來到了美國邊境處，碰到了當地巡檢人員，賽拉一直用言語慫恿着瑪雅，讓她殺死了所有的巡檢人員，還是的兄妹倆關係惡化。

　　彼得和女友來到了一年後的未來，這時候香(Shanti)病毒已經在全世界範圍內傳染開了，世界上百分之九十三的人都死掉，就連未來的彼得和內森都沒能倖存。女友凱琳(Caitlin)即將被遣送回國，彼得卻無力阻止。彼得的母親讓他回想起了一些事情，但是彼得仍然不能很好的控制自己的能力，無意間又回到了現在的時間，還碰到了整個陰謀的策劃者——亞當(Adams)。克萊爾的男友威斯特(West)沒有與她商量就來到她家中，告訴她那天晚上捉弄啦啦隊長的事情上了報。克萊爾知道事態嚴重了，但是又無法告訴威斯特事情的真相。貝內特先生突然回家，威斯特看到了他，知道了克萊爾是他的女兒，一怒之下就飛走了。貝內特也看了報紙，知道了克萊爾有了男朋友，便説要搬家，但克萊爾説什麼也不肯。馬特的父親穆利(Maury)來到了公司，企圖搗亂。公司主管告訴馬特只有他能夠阻止穆利。馬特剛開始以為自己做不到，但是在看到為了他而躺在病牀上的茉莉，他鼓起了勇氣，用能力把穆利關在了他自己的噩夢裏。阿寬雖然非常希望能與愛人在一起，但是為了不改變歷史，他還是選擇回到現在，但是一回來，他就得知自己的父親已經被謀殺。

　　彼得從未來又回到了現在的時間，回到了蒙特利爾那個房間裏，亞當出現了，他讓彼得拿着內森的照片進行回憶修復，彼得真的做到了，四個月以前發生的重要事件在這一集一一揭曉。四個月前彼得即將核爆，內森抱着彼得飛到空中，彼得硬是把內森推開，但是內森已經受了嚴重的外傷，被灼傷得面目全非。彼得核爆後成功進行自我修復，把內森帶到了醫院。公司新主管鮑勃説服了彼得進行治療，讓他學會控制能力，並由閃電女艾拉監督彼得吃藥。彼得在被關期間認識了亞當，並被亞當説服，一起逃出公司，並用亞當的血救了內森，讓其恢復原來的容貌。在出逃過程中，海地人抓住了彼得，但是他決定不把彼得交出去，只是消除了他的記憶，把他關在那個貨箱裏，希望彼得會有新的生活。瑪雅也是在四個月前才發現自己的能力。那時她弟弟舉行婚禮，瑪雅發現弟弟的妻子竟然在婚禮上就背叛丈夫，瑪雅一怒之下能力迸發，殺死了整個婚禮上的人，結果成為了通緝犯人。四個月前D.L.霍金躲過了死亡，活了下來，原以為可以和家人過上安定的生活，誰知道妮基另一重人格出現，一個叫做吉娜(Gina)的風騷女子。霍金從一個流氓手中救回了失控的妮基，自己卻中彈身亡。

　　貝內特先生開始準備搬家，預備晚上就走，但是克萊爾此時非常生氣，決心要留在這裏。她找到了威斯特，希望他原諒自己，但是威斯特還是不敢相信克萊爾，他找到了貝內特先生，把他抓到空中，詢問貝內特他是否利用克萊爾來給他設陷阱，貝內特先生告訴威斯特她對他是真心的，正在這個時候，貝內特先生接到莫欣德的電話，他知道克萊爾有危險了。貝內特找到了莫欣德，艾勒手握着閃電走向貝內特，正在這危急關頭，威斯特撞飛了艾勒，這個閃電女當場暈倒。鮑勃還是抓到了克萊爾，不過貝內特也抓到了鮑勃的女兒艾勒，兩人決定一換一。經過一場激烈的打鬥，貝內特用槍指着鮑勃要殺了他，莫欣德卻像貝內特開了槍，使畫中的預言實現了。馬特很想把照片上的人都找出來，他發現自己的讀心能力比以前更強大了，他現在已經從被動的讀心變成主動的把意志植入他人腦中，他用這個方法來詢問彼得的媽媽，但是還是無法詢問出照片中一個神秘女子的下落。阿寬想回到過去救父親，但是父親告訴他，大家都不是神，不應該隨意改變命運，阿寬經過一番內心掙扎，決定聽父親的話，不過阿寬利用時間暫停，找出了殺死父親的真兇。

　　莫欣德用克萊爾的血救回了貝內特先生。但是克萊爾一家都以為貝內特已經死了。一家人決定要搬到鹽湖城，克萊爾在海邊拋灑骨灰的時候看到了艾勒，她走上前去與她對質，並告訴艾勒，她會搞垮公司的。麥卡把父親的獎章放在書包裏，卻被幾個流氓搶走，莫妮卡想幫麥卡拿回獎章，卻被流氓發現而綁走。彼得以為亞當是要消滅病毒，就與亞當一起找到了當年公司的女生物學家維多利亞，彼得用讀心術得知了病毒的藏匿地點。阿寬回到了過去知道了亞當就是放出病毒的人，他決定用劍聖的劍替父親復仇。賽勒讓瑪雅學會了控制自己的能力，接下來他便誘使瑪雅離開她的弟弟，但是阿里安多卻回來逼賽勒離開，賽勒拿起刀殺死了他。

　　彼得和亞當來到了得克薩斯州，阿寬要阻止彼得繼續錯下去，但是彼得仍是堅定的站在亞當一邊。內森和馬特決定也要前往得克薩斯州阻止彼得和亞當的行動，他們趕到時，彼得已經打開了倉庫的大門，內森曉之以情動之以理，勸住了彼得，及時的解決了危急。妮基與麥卡要去就會莫妮卡，可是妮基生病無法使用能力，來到關押莫妮卡的倉庫時，妮基不顧一切地衝進去，莫妮卡逃了出來，可妮基卻不知生死。賽勒逼莫欣德給他治病，艾勒發現了賽勒，想通過抓住他向父親邀功，結果賽勒趁亂拿了要救妮基的血清逃走了，正當艾勒懊惱的時候，莫欣德告訴艾勒要不是她趕到，他們都會死，艾勒第一次感覺到救人的快樂。正當克萊爾決定把自己的超能力公佈於眾時，貝內特先生為了保護克萊爾免受公司的傷害，以與公司合作為代價回家勸説克萊爾。