蜥鳥亞綱

蜥鳥亞綱的提出目的旨在包含始祖鳥並將其與其它已知鳥類區分。Ernst Haeckel將其它鳥類分入姊妹羣扇尾亞綱（Ornithurae，意為“鳥的尾部”）。Haeckel在命名中參照的區別是始祖鳥擁有一條長的爬行動物式尾巴，而他所知的所有其他鳥類都是短尾，尾椎數目很少，末端融合成尾綜骨。這個分類單元再無其它參照，並且當漢斯·弗里德里希·加德（Hans Friedrich Gadow）於1893年依據基本相同的化石建立古鳥亞綱（Archaeornithes）時，古鳥亞綱成為了早期類似爬行動的鳥類的通用名稱。 ^[1] 

季強和拉里·馬丁（Larry Martin）繼續將蜥鳥亞綱視為有效的自然類羣。 ^[2]  然而，Jacques Gauthier（2001）和Julia Clarke（2002）等研究者發現，海克爾時代之後發現的化石已經彌合了長尾與短尾鳥類之間的差距。 ^[3-4]  這使得任何針對長尾鳥類建立的類羣都必須排除它們的部分後代，使蜥鳥亞綱成為了一個並系羣。因此，在現時的系統發育命名體系下，蜥鳥亞綱是一個無效的類羣。