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肽鍵
鎖定
- 中文名
- 肽鍵
- 外文名
- peptide bond
- 作 用
- 連接氨基酸
- 表示方法
- —CO—NH一
肽鍵簡介
肽鍵肽鍵平面
多肽分子中構成多肽鏈的基本化學鍵是肽鍵,肽鍵與相鄰的兩個碳原子所組成的基團(—C—CO—NH—C—)稱為肽單元。肽鏈就是由許多肽單元連接而成的,它們構成多肽鏈的主鏈骨架。通過對一些簡單的肽和蛋白質肽鍵的X射線晶體衍射法分析,證明肽單元的空間結構具有以下3個顯著的特徵:
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2. 肽鍵具有局部雙鍵性質,不能自由旋轉。肽鍵中的C一N鍵長為0.132nm,比相鄰的C一N單鍵(0.147nm)短,而較一般的C=N(0.127nm)長,介於兩者之間。這表明羰基的x電子發生離域現象,使肽鍵局部具有雙鍵性質,因此C一N之間的旋轉受到一定的阻礙。
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肽鍵平面中除C一N鍵不能旋轉外,兩側的C一N和C一C。鍵均為鍵,因而相鄰的肽鍵平面可圍繞C。旋轉,肽鏈的主鏈骨架也可視為由一系列通過C。原子銜接的肽鍵平面所組成。肽鍵平面的旋轉所產生的立體結構可呈現多種狀態,從而導致蛋白質分子呈各種不同的構象。
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天然存在的肽分子大小不等,有些是蛋白質降解的片斷,有些是具有特殊的生理和藥理作用的活性物質。就目前所知的多肽而言,多數是開鏈肽,少數為分支開鏈肽,環狀的多肽則非常少見。肽的化學性質在某些方面與氨基酸類似,而各種氨基酸殘基的R基團則對肽的性質有較大影響。肽與氨基酸一樣,也含有一COO和一NH等酸性和鹼性基團,因此也以偶極離子形式存在,具有各自的等電點。在水溶液中的酸鹼性質,主要取決於側鏈可電離的R基團的數目和性質。
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肽鍵形成原理
肽鍵具有特殊性質。從鍵長看,肽鍵鍵長(0.132nm)介於C—N單鍵(0.146nm)和雙鍵(0.124mm)之間,具有部分雙鍵的性質,不能自由旋轉;從鍵角看,肽鍵中鍵與鍵的夾角均為120°。因此,與肽鍵相連的6個原子(Cn、C、O、N、H、Ca)始終處在同一平面上,構成剛性的“肽鍵平面”,又稱“酰胺平面”或肽單元。肽單元中,與C—N相連的氫和氧原子與兩個碳原子呈反向分佈。
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由於肽鍵中的原子處於共振狀態,所以肽鍵具有高度穩定性在肽鍵中,C一N單鍵具有約40%雙鍵性質,C=O雙鍵也具有約40%單鍵性質。由此產生了兩個重要的結果:①肽鍵的亞氨基(NH)在pH0~14的範圍內沒有明顯的解離或質子化的傾向;②肽鍵中的C―N鍵具有雙鍵性質,不能自由旋轉,從而使組成肽鍵的原子大致固定在一個平面上,常稱為“肽鍵平面”,對於限制多肽鏈的構象數目起着重要作用。
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最簡單的肽是由兩個氨基酸組成的二肽,其中含有一個肽鍵;含有三個、四個、五個等氨基酸殘基的肽分別稱為三肽、四肽、五肽等。肽鏈中的氨基酸由於形成肽鍵已經不是完整的分子,因此稱為氨基酸殘基。一般稱多肽鏈有自由氨基的一端為肽鏈的氨基末端或N端;稱有自由羧基的另一端為肽鏈的羧基末端或C端,肽的命名是根據其組成氨基酸殘基確定的,通常從肽鏈的N端開始,例如,下列的五肽可命名為絲氨酰甘氨酰酪氨酰丙氨酰亮氨酸。
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肽鏈中的自由氨基、羧基及殘基側鏈的其它基團可發生與氨某酸中相應基團相類似的化學反應。N端氨基酸殘基也能與茚三酮發生呈色反應。雙縮脲反應通常是用以測量肽和蛋白質的種顏色反應:一般含兩個或更多肽鍵的化合物即可與鹼性CuSO4溶液生成紫紅色或藍紫色的複合物,稱為雙縮脲反應。利用這個反應可測定蛋白質的含量。應用雙縮脲反應、紅外光譜分析及X線衍射法等均可證明蛋白質分子中肽鍵的存在,蛋白質分子中的多肽鏈可被酸、鹼或蛋白酶水解成為氨基酸或分子較小的肽段,此方法在研究蛋白質的一級結構時常被採用。
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除了蛋白質部分水解可以產生各種簡單的肽之外自然界還有各種長短不等的肽類物質存在,它們具有各種特殊的生理功能。谷胱甘肽(γ-谷氨酰半胱氨酰甘氨酸)是廣泛存在的一種三肽,因其含有SH基,常以GSH表示。此三肽可能在體內氧化還原過程中起重要作用。
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肽鍵水解
形成肽鍵需消耗能量,在生物體內,會由ATP提供。藉由水解便可讓肽鍵斷裂,分解並釋放8–16千焦耳/摩爾(2–4卡/摩爾)[4]的自由能,但這過程相當緩慢。肽鍵在水溶液中的壽命約為1000年。在沒有酶的情況下水解肽鍵非常困難,因此該過程通常由一種稱為蛋白酶的酶介導,例如枯草桿菌蛋白酶,它經常添加到洗衣粉中以切割許多蛋白質污染物。
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肽鍵酰胺鍵和肽鍵的區別
酰胺鍵(—CO—NH—)中的C和N原子均為sp2雜化,具有平面結構,氮原子上的孤對電子與羰基之間形成p-π共軛體系。由於N原子上電子對的離域化,CN鍵的鍵長比胺中C—N鍵的鍵長要短,具有部分雙鍵的性質。另外,氧的吸電子作用也使氮上電子雲密度降低,從而使氮的鹼性減弱。
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- 參考資料
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- 1. 鄭裏翔主編.生物化學:中國醫藥科技出版社,2015.01:第39頁
- 2. 王雪燕,師文釗編.蛋白質化學及其應用:中國紡織出版社,2016.01:第26頁
- 3. 張付利主編.有機化學 第2版:河南大學出版社,2017.12:238-239
- 4. 中國醫學百科全書編輯委員會編輯;張昌穎主編,.中國醫學百科全書 生物化學:上海科學技術出版社,1989.01:39-40
- 5. 付堯,宗志遠,王丹丹主編.有機化學 理論 實驗與習題選編:北京理工大學出版社,2018.08:第134頁
- 6. 周公度.化學辭典:化學工業出版社,2010
- 7. Peptide Bond .Peptides Guide[引用日期2023-10-17]