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異常剪接
鎖定
指對序列庫中異常剪接mRNA的鑑定和分析。
- 中文名
- 異常剪接
- 定 義
- 指對序列庫中異常剪接mRNA的鑑定和分析
- 隸屬領域
- 生物領域
- 主要功能
- 處理多順反子性轉錄單元,調控轉錄效率和mRNA的穩定性,同時可以增加產物蛋白的多樣性
本文設計了一套策略:來找出數據庫中存在的chromosome translocation、mRNA trans-splicing、multi-locus transcription、antisense transcription等異常剪接的mRNA 。
一方面自然潛在的這種異常剪接方式有重要的生物學作用。比如chromosome translocation可以下調某種基因的表達或者產生致癌基因,誘導癌細胞的生長選擇優勢;反式剪接的主要功能是處理多順反子性轉錄單元,調控轉錄效率和mRNA的穩定性,同時可以增加產物蛋白的多樣性。antisense transcription眾所周知有下調某基因表達的作用。所以鑑定出目前數據庫存在的這些異常剪接mRNA有重要的功能意義。
另一方面,由於試驗中的錯誤聯配和反向轉錄,會造成許多人為的異常剪接情況,比如嵌套基因、基因組污染等。這些序列必須從庫中遴選出改正或拋棄。
本文重要的借鑑意義在於它的策略流程:
每一條過濾規則都有其意義,需深入理解
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