男鹿站

島式月台1面2線的地上車站。基本列車於2號線進入。2號線有列車時則進入1號線。

終日社員配置站。管理站、負責船越站・脅本站・羽立站管理。站舎內設有“もしもし券賣機Kaeruくん”（營業時間:6:25 - 18:40）、自動售票機、候車室、Kiosk。

周邊為男鹿市和男鹿市船川地區的中心地。男鹿半島先端部附近有男鹿水族館 GAO、往羽立站需坐巴士約60分鐘。

秋田縣立男鹿海洋高等學校

秋田縣道59號男鹿半島線

男鹿市役所

男鹿市文化會館

男鹿郵局

秋田銀行男鹿支店

北都銀行男鹿支店

秋田信用金庫船越支店男鹿出張所

男鹿港市民病院

秋田ト一屋男鹿店

男鹿市立男鹿南中學校

男鹿市立船川第一小學校

男鹿市立圖書館

男鹿幼稚園

船川神明社

LAWSON男鹿船川海岸通店

秋田縣船川港灣事務所

Daily YAMAZAKI船川海岸通店

1916年（大正5年）12月16日 - 船川輕便線・羽立 - 船川間延伸全線開通時為船川站（ふなかわえき）開業。

1937年（昭和12年）6月10日 - 船川線（貨物線）・船川 - 船川港間延伸開業。

1968年（昭和43年）4月1日 - 線名改名“男鹿線”、同時改名男鹿站。

1987年（昭和62年）4月1日 - 國鐵分割民營化成為JR東日本車站。

2002年（平成14年）1月1日 - 男鹿 - 船川港間廢止、男鹿線內貨物列車全廢止。

2006年（平成18年）3月16日 - “もしもし券賣機Kaeruくん”開始使用。