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物理作圖
鎖定
物理作圖,是指以物理尺度(如鹼基對的基因)標明各種遺傳標記在基因組上的位置和距離。
- 中文名稱
- 物理作圖
- 英文名稱
- physical mapping
- 定 義
- 以物理尺度(如鹼基對的基因)標明各種遺傳標記在基因組上的位置和距離。
- 應用學科
- 遺傳學(一級學科),基因組學(二級學科)
以上內容由全國科學技術名詞審定委員會審定公佈
- 中文名
- 物理圖譜
- 外文名
- physical map
物理作圖定義
以物理尺度(如鹼基對的基因)標明各種遺傳標記在基因組上的位置和距離。
物理作圖構建途徑
基因組物理圖譜的構建不需要經過減數分裂的世代羣體,可直接利用DNA分子分析,主要有以下三種構建途徑:
- 限制性酶圖譜。利用限制性內切酶構建圖譜,對於DNA分子長度在50kb以下的片段,一般沒有什麼困難。而對於大於50kb的DNA分子,可選用稀有切點的內切酶酶切DNA。(1)用識別較多核苷酸的內切酶,如NotI。(2)選用其酶切位點在基因組中出現頻率低的內切酶。
- 熒光原位雜交。熒光原位雜交技術(fluorescent in situ hybridization, FISH)是另一種物理圖譜的構建方法。它通過熒光標記的探針與DNA分子雜交,使染色體上的雜交信號在顯微鏡下可直接觀察。原位雜交中的探針可用熒光或同位素標記。染色體上出現雜交信號的位置,就是探針DNA在染色體上的圖譜位點。方法是取有絲分裂中期的細胞製片,將染色體變性成單鏈,再講變性的DNA探針變性後加到染色體上,保温及處理後記錄結果。在FISH中,一個克隆的DNA片段就可作為雜交的探針。
- 序列標籤位點。利用某一已知序列為標籤的位點(sequence tagged site, STS)作探針,與基因組DNA雜交,繪製物理圖譜。作為STS,需要具備兩個條件:一是其序列是已知的,以便用PCR檢測;二是在基因組中僅一個位點,沒有重複。
物理作圖應用
可與遺傳圖譜相互借鑑,相互補充,作為基因組圖譜利用。