無能

有一部分自身反應性T細胞可以在胸腺逃避陰性選擇而進入外周免疫器官。但由於某些器官特異性自身抗原表達於不攜帶MHCⅡ類分子的細胞表面，不能形成T細胞可識別的抗原-MHC分子複合物，T細胞就不被激活而呈現無能。

此外，某些自身抗原雖然已同MHC分子結合成複合物，但處於無協同刺激因子的環境中而仍使T細胞處於無能狀態。有資料表明，當口服高劑量抗原時，可出現克隆無能（亦能出現克隆排除），但當免疫無能的克隆與重組IL-2一起培養，可以逆轉其無應答狀態。

無能有的是功能性的，有的同T、B細胞表面膜蛋白分子的表達受阻有關。在B細胞發育早期，膜表面只表達mIgM，此時若與抗原接觸，可對B細胞發生抑制信號，阻斷mIgM的進一步表達，從而對抗原物質不能應答；但此時仍可被LPS等多克隆刺激劑激活。B細胞抗原受體表達的抑制機制也稱為克隆流產（clonal abortion）。